ИСТИНА

RelaxFit – программа, предназначенная для обработки результатов релаксационных измерений ЯМР, скоростей обмена протонов на дейтерий и анализа сопутствующих экспериментальных данных с целью получения информации о характере молекулярных движений биомолекул, протекающих в шкале времени от пикосекунд до часов. При анализе быстрых молекулярных движений используются приближение Липари-Сзабо с рассмотрением нескольких моделей спектральной плотности. Молекулярные движения рассматриваются в приближении как изотропной, так и анизотропной диффузии. Имеется возможность анализа более медленных конформационных переходов, протекающих в шкале времени от микросекунд до миллисекунд на основании экспериментов ЯМР по измерению дисперсии релаксации. Анализ скоростей обмена протонов на дейтерий позволяет получить информацию о величинах свободной энергии процессов высокоамплитудного раскрытия-закрытия белковой глобулы. Реализована возможность теоретического предсказания указанных величин на основании трехмерной структуры белка. Модули программы охватывают весь цикл расчетов – от считывания экспериментальных данных и вычисления скоростей релаксации методом нелинейной регрессии до оптимизации параметров движения методом сопряженных градиентов и расчета возможных ошибок по методу Монте-Карло. Программа имеет удобный интерфейс, возможности теоретического анализа параметров релаксации, их зависимости от моделей движения, параметров, характеризующих эти модели, корреляцию всех указанных параметров. Программа имеет возможности импорта экспериментальных данных и экспорта рассчитанных значений в файлы заданного формата.