ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
|
ИПМех РАН |
||
Большинство модифицированных оснований, обнаруживаемых в РНК, идентифицировано в некодирующих РНК, таких как тРНК и рРНК. Применение методических подходов, ставших доступными в последние годы, позволило выявить, что в эукариотических мРНК широко распространен ряд модифицированных оснований, включая 5-метилцитозин (m5C). Использование бисульфитной конверсии в сочетании с высокопроизводительным секвенированием позволило картировать остатки m5C на уровне транскриптомов. В частности, было показано, что в мРНК из клеток HeLa имеется более 10000 сайтов, в которых обнаруживается m5C. Есть данные, показывающие, что паттерн распределения сайтов m5C является динамическим и может различаться в зависимости от ткани и стадии развития. Белок DNMT2, одна из двух известных РНК метилтрансфераз, метилирующих остатки цитозина, структурно и эволюционно близок ДНК-метилтрансферазам, но способен метилировать только РНК. Основным субстратом DNMT2 являются тРНК, однако этот фермент может метилировать остатки цитозина и в мРНК. Функции DNMT2 важны для ответа на различные формы РНК-стресса, индуцируемого избытком эндогенных РНК, таких как РНК ретротранспозонов, или экзогенных РНК, таких как РНК вирусов. Помимо этого, в некоторых системах показано участие DNMT2 в ответы на стрессы другой природы. Показано, в частности, что инфекции HIV-1 индуцирует ре-локализацию DNMT2 из ядра в стрессовые гранулы и метилирование РНК HIV-1. В настоящее время показано, что участие DNMT2 в контроле вирусной инфекции может быть также непрямым и задействовать систему РНК-интерференции. Будут обсуждены различные аспекты роли метилирования остатков цитозина в РНК в ответе на стрессы и вирусную инфекцию, а также в эпигенетической регуляции. Работа поддержана грантом Российского Научного Фонда 17-14-01032.