ИСТИНА

Исследования ДНК занимают все большее место в арсенале клинической лабораторной диагностики. ДНК-тесты широко используют для выявления бактериальных и вирусных инфекций, определения маркеров антибиотикоустойчивости и фармакогенетических маркеров, идентификации генетических предрасположенностей к развитию как моногенных, так и полигенных наследственных заболеваний, онкомаркеров. Подавляющее большинство выполняемых анализов основано на использовании полимеразной цепной реакции (ПЦР) или количественной ПЦР (ПЦР в реальном времени, кПЦР), что обусловлено, с одной стороны, высокой чувствительностью метода, а с другой — относительно низкой стоимостью коммерческих тест-систем, произведенных в РФ. Выбор целевых последовательностей ДНК, используемых в тест-системах как биомаркеры, является прерогативой производителя. При этом контрольные материалы, поставляемые в составе набора, включают, как правило, генноинженерную конструкцию с целевым фрагментом ДНК. Несопоставимость контрольных материалов различных тест-систем, нацеленных на выявление одного и того же возбудителя или мутации, обусловливает ограниченную прослеживаемость результатов ДНК-диагностики. Количественные исследования, такие как определение вирусной нагрузки или уровня бактериальной обсемененности методом кПЦР, основаны на использовании калибраторов, входящих в состав тест-системы. Различия в составе ДНК калибраторов, в её структуре (геномная ДНК; суперскрученная, релаксированная или линеаризованная ДНК плазмиды) обусловливает различную эффективность амплификации, что далеко не всегда учитывается при анализе результатов кПЦР и может приводить к различиям в результатах исследований в разных лабораториях. Решение настоящей проблемы связано с созданием доступных стандартных образцов геномной ДНК, аттестованных по показателю счетной концентрации нескольких целевых последовательностей. Данные СО должны включать как ДНК клинически значимых бактерий и вирусов, так и ДНК человека с охарактеризованными наборами мутаций, в том числе вариантами числа копий. Создаваемый во ВНИИМ им. Д.И. Менделеева опытный образец государственного эталона счетной концентрации ДНК позволит разработать и аттестовать образцы ГСО для использования в качестве калибраторов для ДНК-диагностики, обеспечивая прослеживаемость и воспроизводимость выполняемых измерений.