ИСТИНА

Парадокс несоответствия уровней мРНК и их белковых продуктов в клетках эукариот, включая растения, направляет усилия исследователей на изучение тонких механизмов трансляции. Известно, что мРНК имеют регуляторные коды, которые определяют судьбу индивидуальной мРНК в трансляции. Для выявления таких регуляторных кодов применяют in silico анализ разных областей мРНК - CDS, 5’-UTR и 3’-UTR. С целью выявления регуляторных кодов у мРНК растений и их взаимосвязи с трансляционной эффективностью нами создан ресурс JetGene (https://jetgene.bioset. org/). Этот ресурс имеет инструменты для сравнительного анализа последовательностей и позволяет (i) оценить вариации длины, нуклеотидного состава, частота использования кодонов, окружение стартового кодона трансляции; (ii) выявить и определить статистически значимую представленность потенциальных регуляторных контекстов у мРНК с разной эффективностью трансляции. Одно из ключевых преимуществ JetGene – это возможность сравнения двух выборок мРНК (по запросу исследователя), что позволяет использовать omics данные для поиска потенциальных регуляторных кодов у мРНК.