ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
|
ИПМех РАН |
||
Доля ДНК, выделяемая опухолевыми клетками, претерпевшими неопластическую трансформацию (опухолевая ДНК) или появляющаяся при их гибели, часто является чрезвычайно малой частью общей циркулирующей бесклеточной ДНК. Это обстоятельство затрудняет ее обнаружение в жидкостях организма. Понимание свойств опухолевой ДНК является ключом для разработки подходов к мониторингу процессов развития онкологических заболеваний. Специфические структурные особенности опухолевой ДНК, отличные от ДНК генома и от ДНК, циркулирующей в биологических жидкостях человека в норме, являются основой для совершенствования технологий неинвазивного выявления и возможного селективного лечения рака. Специфические структурные особенности опухолевой ДНК представлены на первичном и вторичном структурных уровнях. В качестве примера специфической опухолевой ДНК нами выбрана геномная область с мутациями в промоторе гена каталитической субъединицы теломеразы. Изменения этой геномной области высокоспецифичны для опухолевых клеток (близко к 90%) в случае некоторых видов рака (мочевой пузырь, кожа, мозг, щитовидная железа) и отмечены как возможные «драйверные» мутации с потенциалом для неинвазивной диагностики рака (Avogbe et al., EBioMedicine, 2019, 44, 431; Zvereva et al., Int. J. Mol. Sci., 2020, 21 (17), 6034). В настоящее время молекулярно-биологические механизмы, способствующие специфическому появлению и фиксации таких "драйверных" точечных мутаций для канцерогенеза, до конца не ясны. Промоторная область гена TERT богата G. Она может формировать несколько G-квадруплексов (G4), структура которых не совсем ясна. С помощью биоинформатических методов было проведено моделирование структуры нативного промотора и его мутантных вариантов, а также выполнен контекстуальный анализ соматических мутаций. Мы дискриминировали предполагаемые модели с помощью химического пробинга in vitro. Изучен специфический процесс, приводящий к фиксации структуры G4 путем стабилизации С-цепи в геноме. Исследуется механизм появления онкогенных мутаций, базирующийся на изменении работы си-стем репарации на геномном участке с G4-структурой, предварительно охарактеризованный на модельной системе