ИСТИНА

В России существует много коллекций микроорганизмов, самая обширная из них это коллекция ВКМ, где собрано 20000 штаммов бактерий, архей и грибов, однако на данный момент нет специализированных коллекций, фокусом которых являлись бы не сами штаммы, а продуцируемые ими биологически-активные субстанции – антибиотики, пигменты, ферменты. Для нужд трансляционной медицины было бы удобно иметь каталог субстанций, которые могли бы быть наработаны «по запросу» и предоставлены для исследовательских целей. Особую ценность подобная коллекция в России приобретает в свете необходимости импортозамещения. В связи с этим, нами создается уникальная биоресурсная коллекция на основе штаммов, отобранных в результате широкомасштабного скриннинга и продуцирующих различные биологически-активные вещества, обладающие потенциалом для разработки на их основе в лекарственных средств. Для создания коллекции мы ищем штаммы-продуценты в разнообразных природных источниках наземных и водных экосистемах, экстремальных местообитаниях от полярных областей до тропических экосистем. Мы проводим первичные посевы, на основе фенотипических признаков отбираем бактерии порядка актиномицеты, т.к. они являются наиболее перспективными продуцентами. Скрининг отобранных объектов проводится на двойной репортерной системе pDualrep2© с помощью которой мы идентифицируем не только сам феномен антибактериальной активности, но и предполагаем механизм его действия. Все штаммы проходят тестирование на ферментативную активность, а именно целлюлазнную, амилазную и проетазную. В результате работы в нашу коллекцию помещены продуценты 50 биологически-активных малых молекул, 3 из которых оказались новыми, ранее не исследованными. Еще 170 штаммов, антимикробные вещества которых находятся на стадии идентификации, а вместе с продуцентами гидролаз их число превышает 300 единиц хранения. На сегодняшний день прорабатываются методики, критерии отбора микроорганизмов в коллекцию. Продуцируемые вещества тестируются на цитотоксичность, минимальные ингибирующие концентрации, чтобы расширить список полезных свойств. Наша коллекция может помочь ученым в области трансляционной медицины широким выбором интересных молекул и их изомеров, которые можно изучать, модифицировать и превращать в лекарственные средства, или использовать генетический материал этих бактерий для более фундаментальных исследований для получения суперпродуцентов. Работа частично выполнена при поддержке гранта РНФ 22-24-00278