ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
|
ИПМех РАН |
||
Являясь одним из наиболее распространённых белков в природе, актин был найден почти во всех эукариотических клетках. Актин принимает участие во множестве ключевых клеточных процессов, таких как мышечное сокращение, поддержание клеточной формы, деление клеток, транспорт веществ. Большинство имеющихся к настоящему времени представлений о структуре, стабильности и фолдинге актина, а также о процессе его полимеризации сформировались в результате его исследования in vitro в разбавленных буферных растворах. Тем не менее, в действительности, белки функционируют внутри клетки, в среде, содержащей большое количество различных биологических макромолекул, в условиях, которые принято называть условиями молекулярного краудинга. Для моделирования таких краудинг сред in vitro мы использовали концентрированные растворы инертных полимеров Декстрана-70к и Полиэтиленгликоля-8000 (ПЭГ-8000), обладающих различными гидродинамическими размерами. Размер молекулы ПЭГ-8000 (29.2 Å) сравним с размером молекулы глобулярного актина (55 × 55 × 35 Å), в то время как размер молекулы Декстрана-70к (64.9 Å) близок со значением радиуса инактивированного актина (74 Å) (расчет гидродинамического радиуса инактивированного актина выполнен по формуле: log (Rs) = (0.357 ± 0.005) × log (MW) – (0.204 ± 0.023) [1]). В данной работе методом собственной флуоресценции было показано, что что Декстран-70к не влияет на структуру глобулярного актина, в то время как увеличение концентрации ПЭГ-8000 приводит к значительному возрастанию параметра А и поляризации флуоресценции. Такие изменения параметров собственной флуоресценции могут быть косвенным признаком полимеризации актина, которая происходит даже при низкой ионной силе растворителя. Выбранные краудинг агенты стабилизируют структуру наивного актина, замедляя процесс его денатурации, но не останавливают его.