ИСТИНА

Среди класса методов DFTD подобран оптимальный вариант (BHHLYPD2, 631 G*) для описа ния связывания в системе Xe–фенол, с целью последующего расчета КМ/ММ сложных Xeсодер жащих белковых систем. Показано, что устойчивость системы Xe–фенол обеспечивается за счет слабых дисперсионных взаимодействий, не описываемых в традиционных подходах функционала электронной плотности. В качестве эталона сравнения выбран метод MP2 с базисом (aug)ccpVTZ и псевдопотенциалом Stuttgart, обеспечивающий наилучшее воспроизведение характеристик диме ра ксенона Xe2. Отмечено, что методы DFTD3 (версия 2010) недооценивают энергию связывания примерно втрое, тогда как методы DFT без дисперсионной поправки вообще не воспроизводят устойчивость Xe2 и системы Xe–фенол. Установлено, что в наилучшем варианте расчета, BHHLYP D2 энергия связывания в комплексе Xe–фенол оценивается как 2.7 ккал/моль против 3.1 ккал/моль в методе сравнения. Также, вариант BHHLYPD2 неплохо воспроизводит разницу двух конформе ров комплекса Xe–фенол и тенденцию к увеличению энергии связывания в ряду ароматических аминокислот (фенилаланин, тирозин, триптофан). Вместе с тем, DFTD может указывать на суще ствование избыточных конформеров, отсутствующих в системах, согласно более точному описа нию (MP2/(aug)ccpVTZ).