![]() |
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИПМех РАН |
||
Причина роста заболеваемости агрессивным пародонтитом (АП) в последние годы остается неизвестной, предполагается участие в этом микроорганизмов. Цель работы: с помощью NGS-секвенирования выявить различия в составе бактерий, населяющих пародонт у здоровых лиц и пациентов с АП. В исследовании участвовало 5 здоровых доноров и 5 пациентов с АП. Банки рДНК были получены с помощью праймеров к гипервариабельной области V4 гена 16S. Они анализировались на приборе Illumina MiSeq. Для 10 образцов было определено 1017669 последовательностей: от 69566 до 139385 на образец. Анализ последовательностей проводился с помощью пакета QIIMME и базы NCBI GenBank. Полученные последовательности были сгруппированы в таксономические единицы ранга рода и вида. В результате было получено около 350 таксономических группировок (OUT), представленность которых в выборках исследовалась методом параметрического статистического анализа. Было выявлено доминирование у больных АП 8 родов бактерий: Porphyromonas, Treponema, Synergistes, Tannerella, Filifactor, Ruminococcus, Parvimonas, Mycoplasma, из которых только Porphyromonas, Treponema и Tannerella традиционно рассматриваются как пародонтопатогены. У лиц со здоровым пародонтом выявлено доминирование рода Veillonella. Существенное различие между выборками показали виды рода Prevotella. Доминирование вида P. intermedia ассоциировано с АП, а комплекса Р. nigrescens, P. oris, P. veroralis - со здоровым пародонтом. Опасный пародонтопатоген Aggregatibacter actonomycetemcomitans не был выявлен ни у одного из пациентов, что не позволяет считать его причиной роста заболеваемости АП в г. Москва. Выявлены комплексы бактерий, ассоциированных со здоровым пародонтом. В состав основного комплекса входят виды рода Veillonella и непатогенные виды Prevotella. В качестве альтернативного «защитного комплекса», способного замещать главный комплекс, может рассматриваться группа видов Streptococcus sanguinis, Kingella oralis, Granulicatella paradiacens и Bergeyella sp.