Описание:Учебный курс предназначен для магистров каф. вирусологии Биологического факультета.Курс включает следующие темы:
Отличия систем трансляции у прокариот и эукариот. Экспрессия геномов РНК бактериофагов семейства Leviviridae, регуляция узнавания последовательностей Шайн-Дальгарно за счет РНК-РНК и РНК-белковых взаимодействий.
Эукариотические системы. Роль 5’ и 3’ концевых структур в трансляции вирусных РНК. Циклизация молекул вирусной мРНК за счет РНК-белковых взаимодействий (тогавирусы, тобамовирусы, бромовирусы) и РНК-РНК взаимодействий (томбусвирусы и лютеовирусы).
Роль 5’-НТО в трансляции вирусных мРНК. Сканирование и контекст инициаторного кодона. Роль малых ОРТ в регуляции трансляции. Использование нестандартных инициаторных кодонов. Слабое сканирование.
Механизм шунтирования у параретровирусов. "Рибосомальный прыжок" при трансляции мРНК гена 60 бактериофага Т4.
Доступ к внутренним AUG кодонам - реинициация у параретровирусов, калицивирусов и вируса гриппа А. Молекулярные механизмы реинициации.
Неканонические механизмы инициации трансляции - использование IRES-элементов (пикорнавирусы, вирус гепатита С, дицистровирусы) и 3'-CITE (тобмусвирусы, кармовирусы, лютеовирусы).
Доступ к внутренним OРТ с помощью неортодоксальных механизмов элонгации и терминации. Супрессия слабого терминатора, рибосомальный сдвиг рамки считывания, механизм "остановка - продолжение" (stop - carry on).
Посттрансляционные события - процессинг вирусных полипетидов протеиназами. Типы вирусных протеиназ - аспартиловые, трипсин-подобные и папаин-подобные. Механизмы и схемы процессинга у различных групп РНК-содержащих вирусов.