Описание:Молекулярные методы являются эффективным экспериментальным подходом в исследовании проблем гидробиологии и экологии. Эти методы помогают идентифицировать видовое разнообразие и дать количественный анализ микроорганизмов в различных природных сообществах в морских и пресноводных экосистемах.
Данная программа предлагается аспирантам, тем, кто намерен работать, используя методы генетической инженерии.
Программа рассчитана на 24 часа в весеннем семестре и делится на 2 блока.
Первый блок посвящен методу клонирования, который позволяет определить не только видовое (иногда определить до штамма) таксономическое положение организма, но и показать филогенетическое отношения между родственными организмами. Метод основан на манипуляции с молекулами ДНК in vitro, которые клонируются в векторе для разделения смеси этих молекул ДНК. Получение нуклеотидной последовательности и последующего анализа этой последовательности.
Но этот метод используется для идентификации культивируемых микроорганизмов.
Второй блок посвящен методу FISH (флуоресцентная гибридизация in situ) с рРНК- специфичными олигонуклеотидными зондами. Этот метод широко используется для идентификации некультивируемых микроорганизмов по нуклеотидной последовательности генов 16S рРНК , а также для определение численности отдельных филогенетических групп в различных природных микробных сообществах.
Этот метод включает в себя следующие этапы:
– фиксация образцов, гибридизация фиксированных образцов с генными олигонуклеотидными зондами и анализ гибридизированных образцов с использованием люминесцентного микроскопа.
Каждое занятие начинается с соответствующей теоретической части (в виде семинара), в которой излагается материал, включающий знакомство с методами, использующимися для проведения данной практической части, и само лабораторное занятие.