|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИПМех РАН |
||
Аминокислотные и пептидные производные алкалоидов группы цефалотаксина: синтез и изучение свойствдипломная работа (Специалист)
- Научные руководители: Сумбатян Н.В., Терещенков А.Г.
- Автор: Хайруллина Зимфира Загитовна
- Тип: Специалист
- Организация, в которой проходила защита: МГУ имени М.В. Ломоносова
- Год защиты: 2015
- Аннотация: За полтора десятилетия, прошедших с момента опубликования рентгеноструктурных данных высокого разрешения и построенных на их основе атомных моделей рибосомы, ее субчастиц и ряда функциональных комплексов рибосомы с белковыми факторами трансляции, субстратами и антибиотиками, огромное количество работ, стимулированных этим открытием, позволило сильно продвинуться в понимании механизмов трансляции и процессов ее ингибирующих. Тем нее менее, многие фундаментальные вопросы, касающиеся механизма работы рибосомы как молекулярной машины, остаются без ответа. В первую очередь это относится к динамическим аспектам ее функционирования. На кафедре химии природных соединений химического факультета МГУ имени М.В. Ломоносова были предложены и успешно применяются молекулярные инструменты для изучения взаимодействий растущей при биосинтезе пептидной цепи со стенками рибосомного туннеля. Эти соединения представляют собой конъюгаты рибосомных антибиотиков, которые служат «якорем» для связывания соединения в специфическом участке рибосомы, с аминокислотами или пептидами, моделирующими растущую цепь белка. Экспериментальные данные по связыванию такого рода соединений с рибосомой, ингибированию ими биосинтеза белка, в сочетании с данными компьютерного моделирования комплексов этих соединений с рибосомой методами молекулярного докинга и молекулярной динамики, а также структурные данные, позволяют определять контакты между аминокислотными остатками и элементами рибосомного туннеля. Сопоставление найденных контактов с известными биохимическими данными, в свою очередь, позволяет делать выводы о наличии сенсорных участков рибосомы, устанавливать их структурные перестройки и предлагать возможные пути передачи информации от одного функционального центра рибосомы в другой. Алкалоиды группы цефалотаксина, такие как гомохаррингтонин и харрингтонин, выделяемые из коры растения Cephalotaxus harringtonia и использующиеся в медицинской практике как противоопухолевые препараты, ингибируют биосинтез белка в эукариотических клетках, связываясь с 60S субъединицей рибосомы. Недавние исследования показали, что остановка трансляции при действии харрингтонина происходит только в том случае, когда в P-сайте рибосомы находятся кодоны, соответствующие определенным аминокислотам. Эти данные непосредственно указывают на роль растущей полипептидной цепи в ингибировании пептидилтрансферазной реакции. Для более детального изучения процесса остановки трансляции под действием антибиотиков группы цефалотаксина, в настоящей работе предложены производные этого алкалоида, содержащие аминокислотные и пептидные остатки. Целью данной работы являлись компьютерное моделирование методом молекулярного докинга и синтез аминокислотных и пептидных производных алкалоида цефалотаксина, предназначенных для дальнейшего изучения взаимодействия этих соединений с бактериальными и эукариотическими рибосомами.
- Добавил в систему: Сумбатян Наталия Владимировна
Прикрепленные файлы
| № | Имя | Описание | Имя файла | Размер | Добавлен |
|---|---|---|---|---|---|
| 1. | Полный текст | Hajrullina_Z.Z._Diplom.pdf | 2,9 МБ | 22 сентября 2015 [sumbatyan] |