|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИПМех РАН |
||
Характеристика интегразы вируса иммунодефицита человека нового генетического варианта CRF63_02A1дипломная работа (Специалист)
- Научный руководитель: Юлия Юрьевна Агапкина
- Автор: Мария Алексеевна Пустоварова
- Тип: Специалист
- Организация, в которой проходила защита: МГУ имени М.В. Ломоносова
- Год защиты: 2018
- Аннотация: В настоящее время одним из наиболее опасных и все еще неизлечимых заболеваний является синдром приобретенного иммунодефицита человека (СПИД), который вызывается вирусом иммунодефицита человека (ВИЧ). Известны два типа ВИЧ: ВИЧ-1 и ВИЧ-2. Эпидемию ВИЧ-инфекции вызывает вирус первого типа, тогда как вирус второго типа является менее вирулентным и встречается гораздо реже. В свою очередь, ВИЧ-1 делится на четыре группы: M (main), O (outlier), N (non-M, non-O) и P. Главная группа M включает в себя 10 подтипов (A – K), а также несколько десятков циркулирующих (CRF) и уникальных (URF) рекомбинантных форм. Такое широкое разнообразие генетических вариантов ВИЧ-1 обеспечивается за счет высокой скорости репликации, ошибок в работе обратной транскриптазы, а также за счет рекомбинации во время репликативного цикла вируса. Важно отметить, что различные подтипы ВИЧ-1 имеют определенное географическое распределение. Так, наиболее распространенным в мире является подтип B. На территории бывшего Советского Союза, однако, преобладающим является подтип А, а также циркулирующая рекомбинантная форма CRF02_AG, возникшая в результате рекомбинации геномов вирусов подтипов A и G. В 2012 году на территории Сибирского региона из образцов плазмы крови людей, инфицированных ВИЧ, был выделен новый генетический вариант вируса CRF63_02A1, представляющий собой циркулирующую рекомбинантную форму. Она возникла в результате рекомбинации между геномами циркулирующей рекомбинантной формы CRF02_AG и вируса подтипа A. Данная форма вируса в настоящее время преобладает на территории Сибирского региона: ей заражено 42,3 % больных. Однако о ней мало что известно, поэтому важной задачей является изучение и характеристика вируса этого подтипа. Важным этапом характеристики нового генетического варианта вируса является определение каталитической активности его важнейших ферментов, одним из которых является интеграза, катализирующая встраивание вирусной ДНК в геном зараженной клетки. Важно отметить, что в человеческих клетках нет прямых аналогов интегразы, поэтому этот вирусный фермент является привлекательной мишенью для создания ингибиторов. В настоящий момент в клинической практике используют три ингибитора интегразы: ралтегравир, элвитегравир и долутегравир. Однако, как и во всех остальных случаях, у ВИЧ-1 развивается устойчивость к ингибиторам, особенно к ралтегравиру и элвитегравиру. Известно, что мутации лекарственной устойчивости у вирусов различных подтипов могут различаться. Также могут различаться и механизмы возникновения данных мутаций. Таким образом, цель данной работы заключалась в характеристике интегразы ВИЧ-1 нового генетического варианта CRF63_02A1, а также в его сравнении с интегразой ВИЧ-1 подтипа А, также широко распространенного на территории РФ. Работа включает исследование влияния различий между интегразами вариантов CRF63_02A1 и А на ДНК-связывающую и каталитическую активность данных ферментов. Кроме того, важно было изучить влияние мутаций устойчивости к применяемым на практике ингибиторам интегразы на каталитическую и ДНК-связывающую активности интегразы CRF63_02A1, а также на ее восприимчивость к этим препаратам и их аналогам. Работа включает обзор литературы, посвященный генетическому разнообразию ВИЧ и его влиянию на развитие устойчивости к ингибиторам интегразы.
- Добавил в систему: Агапкина Юлия Юрьевна