|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИПМех РАН |
||
Вариабельность митохондриальной и ядерной ДНК у ряда близкородственных видов семейства Лососевые (Salmonidae) и различные подходы к ее оценке.дипломная работа (Специалист)
- Научные руководители: Павлов С.Д., Холодова М.В.
- Автор: Свердлова М.А.В.
- Тип: Специалист
- Организация, в которой проходила защита: МГУ имени М.В. Ломоносова
- Год защиты: 2010
- Аннотация: Целью данной работы стало исследование вариабельности митохондриальной и ядерной ДНК у 8 близкородственных видов семейства Лососевые и сравнительный анализ разрешающей способности использованных молекулярных маркеров. Поставленная цель определила следующие задачи: 1. Исследовать уровень внутри- и межвидового полиморфизма гена цитохрома b митохондриальной ДНК внутри семейства Лососевые на основании самостоятельно полученных нуклеотидных последовательностей. 2. Сравнить разрешающую способность полной последовательности гена цитохрома b мтДНК с его фрагментами (с 5' и 3' конца). 3. На основании взятых из GeneBank последовательностей исследовать уровень внутри- и межвидового полиморфизма I субъединицы митохондриального гена цитохром С оксидазы у исследуемой группы. 4. Исследовать уровень внутри- и межвидового полиморфизма фрагментов ядерного гена 18S рРНК - ITS1 и ITS2 – внутри семейства Лососевые на основании самостоятельно полученных нуклеотидных последовательностей. 5. Исследовать применимость SCAR-маркеров для межвидового сравнения семейственных групп на примере семейства Лососевые. 6. Провести сравнительную оценку данных, полученных по митохондриальным и ядерным маркерам. 7. На основании вновь полученных и литературных данных оценить родственные отношения между 8 исследованными видами Лососевых рыб. Заключения дипломной работы: 1. Ген цитохрома b мтДНК внутри семейства Лососевые показал высокий уровень межвидового полиморфизма – взвешенная генетическая дистанция составляла от 6% (горбуша/кета) до 17% (мальма/кижуч и мальма/горбуша). 2. Сравнение разрешающей способности полной последовательности гена цитохрома b мтДНК и его фрагментов показало более высокую эффективность использования полной последовательности гена для изучения генетического полиморфизма исследуемой группы. 3. Уровень межвидового полиморфизма I субъединицы митохондриального гена цитохром С оксидазы у исследуемой группы оказался в целом несколько ниже полиморфизма по гену цитохрома b, составляя от 4% (кета/кижуч) до 16% (благородный лосось/горбуша). 4. Характер полиморфизма фрагментов ядерного гена 18S рРНК - ITS1 и ITS2 – внутри семейства Лососевые существенно отличался от такового митохондриальных генов. По обоим ядерным фрагментам генетические дистанции между видами внутри родов были меньше, чем по митохондриальным генам; генетические дистанции между родами были наибольшими по ITS1 и наименьшими по ITS2 среди всех исследованных маркеров. 5. Разрешающая способность SCAR-маркеров на межвидовом уровне оказалась ограниченной. 6. В целом данные, полученные по Мт и ядерным последовательностям дают сходную топологию деревьев с высокой в большинстве случаев бутстреп-поддержкой, что свидетельствует о достоверности полученных данных. 7. Полученные небольшие различия по разным маркерам коррелируют с ранее проводившимися исследованиями и демонстрируют важность использования комплекса молекулярно-генетических методов для построения филетических линий.
- Добавил в систему: Павлов Сергей Дмитриевич