|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИПМех РАН |
||
Распределение структур стебель-петля вблизи сплайс-сайтовдипломная работа (Бакалавр)
- Научный руководитель: Попцова М.С.
- Автор: Клинов Артем Павлович
- Тип: Бакалавр
- Организация, в которой проходила защита: МГУ имени М.В. Ломоносова
- Год защиты: 2016
- Аннотация: Дипломная работа Клинова Артема Павловича посвящена изучению роли вторичных структур РНК в процессе сплайсинга. Было показано, что РНК-структуры могут ингибировать или наоборот способствовать связыванию компонент сплайсосомы с предшественником мРНК. Они также могут увеличить эффективность сплайсинга, способствуя локализации важных последовательностей. Для поиска закономерностей распределения вторичных структур РНК вблизи сплайс-сайтов перед Артемом Клиновым были поставлены задачи выделения элементарных элементов вторичной структуры, которые встречаются как в крупных группах генов, так и в ортологах. Артем успешно справился с поставленной задачей, разработав и реализовав метод кластеризации профилей покрытия окрестностей сплайс-сайтов вторичными структурами РНК. Тестирование алгоритма было произведено на сплайс-сайтах генома человека, а также на ортологичных сплайс-сайтах семи геномов млекопитающих. В результате тестирования были выявлены определенные проблемы, связанные со структурой данных. Выявленные проблемы обсуждаются А.П. Клиновым в работе. Недостатки работы алгоритма с такими данными обосновываются.
- Добавил в систему: Попцова Мария Сергеевна