|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИПМех РАН |
||
Изучение региоспецифичности трансгликозилирования ферментами семейства альфа-галактозидаз методами биоинформатики и молекулярного моделированиядипломная работа (Специалист)
- Научные руководители: Суплатов Д.А., Швядас В.К.
- Автор: Кирилин Е.М.
- Тип: Специалист
- Организация, в которой проходила защита: МГУ имени М.В. Ломоносова
- Год защиты: 2012
- Аннотация: Проведен сравнительный анализ ферментов α-галактозидаз на уровне организации активных центров. С этой целью был разработан алгоритм для получения структурно- опосредованного множественного выравнивания аминокислотных последовательностей активных центров, основанный на использовании структур белков из банка PDB, алгоритмов структурного выравнивания и баз данных геномной информации. Полученное выравнивание было использовано для поиска специфических позиций, которые, как предполагается, могут определять проявление различных свойств внутри группы ферментов. Для моделирования реакции трансгликозилирования на уровне узнавания субстратов ферментами была получена модель ковалентного ферент-галактозильного комплекса α-галактозидазы из Thermotoga maritima (TMGalA). На основании in silico эксперимента связывания лактозы вблизи активного центра мутантного по специфическим позициям фермент-галактозильного интермедиата, предложен мутант Phe328Ala в качестве наиболее перспективного для изменения региоспецифичности реакции трансгликозилирования ферментом TMGalA. Предполагается, что данная специфическая позиция может играть ключевую роль в определении региоспецифичности ферментов клана GH-D.
- Добавил в систему: Суплатов Дмитрий Андреевич