Аннотация:Эукариотические геномы транскрибируются в различные типы
кодирующих и некодирующих РНК. Однако, механизмы регуляции
некодирующих транскриптов, таких как длинные некодирующие РНК
(длнкРНК) изучены слабо. Особенный интерес вызывает регуляция
транскрипции длнкРНК, содержащие транслирующиеся короткие рамки
считывания, кодирующие функциональные пептиды. Одним из значимых
молекулярных механизмов регуляции качества мРНК, является
эукариотическая система нонсенс-опосредованной деградации мРНК (NMD,
nonsense-mediated mRNA decay), которая деградирует транскрипты,
содержащие преждевременный стоп кодон. Предполагается, что, таким
образом, система NMD может останавливать синтез абберантных белков,
которые могут быть токсичными для клетки. Оказалось, что система NMD
также регулирует около 10% всех мРНК, позволяя клетке тонко подстраивать
экспрессию генов под внешние воздействия. При этом, мало известно о
регуляции системой NMD длинных некодирующих РНК (длнкРНК), которые
содержат короткие открытые рамки считывания, способные потенциально
кодировать пептиды. В данной работе было изучено влияние механизма
NMD на транскрипцию длнкРНК, используя мутантные линии модельного
объекта -мха Physcomitrium patens.