|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИПМех РАН |
||
Изучение мутаций в сигналах разрывной транскрипции, регулирующих образование субгеномных РНК коронавирусов.дипломная работа (Специалист)
- Научный руководитель: Алексеевский А.В.
- Автор: Черкашина Анастасия Андреевна
- Тип: Специалист
- Организация, в которой проходила защита: МГУ имени М.В. Ломоносова
- Год защиты: 2022
- Аннотация: Геном коронавирусов состоит из единственной РНК положительной полярности. У коронавирусов и, более широко, вирусов порядка Nidovirales, трансляция поздних генов происходит с субгеномных матричных РНК (sgmRNA). Для каждого позднего гена sgmRNA своя. Поздний ген закодирован в (+) РНК вируса на 3'-конце после гена полипротеина. (-) sgRNA синтезируются с (+) РНК вируса в процессе транскрипции, т.е. синтеза (+) RNA вируса с пропуском огромного участка (своего для каждого гена). (-) sgRNA реплицируется в sgmRNA и снабжается кэпом. Таким образом sgmRNA состоит из короткой лидерной цепи РНК, содержащей кэп, первый ген в ней - ген соответствующего позднего белка, на 3’ конце поли(A), закодированная в РНК вируса. В большинстве нидовирусов разрывная транскрипция регулируется сигналами,называемыми TRS. В работе создана программа для детектирования сигналов регуляции транскрипции (TRS) в геномах коронавирусов. Программа правильно нашла коровые последовательности (CS) в сигнала TRS для семи видов коронавирусов, для которых CS определены экспериментально. На материале 371812 геномов коронавируса SARS-Cov-2 обнаружены, описаны и исследованы мутации в последовательностях CS и TRS.
- Добавил в систему: Алексеевский Андрей Владимирович