Аннотация:Актуальность работы: Нуклеотид-связывающие CBS-домены являются универсальными функциональными регуляторами, найденными во многих белках, в том числе в участвующих в патогенезе наследственных заболеваний. CBS-домены имеют высокое сродство к производным аденозина и опосредуют аллостерическую регуляцию активности ферментов и транспортных белков. Молекулярный механизм регуляции посредством CBS-доменов не установлен, поскольку сложная многодоменная структура и характерная конформационная подвижность большинства CBS-содержащих белков затрудняет получение структурной информации. CBS-РРаза, имеющая разнообразие путей регуляции, относительно широкую эффекторную специфичность и налаженную методику выделения является удобным модельным объектом для установления и дальнейшего изучения механизма регуляции CBS-содержащих белков. Исходя из выдвинутой ранее модели тетрамерной организации CBS-PPазы и информации о конформационной подвижности частей белка, нами была предложена гипотеза, согласно которой, связывание CBS-доменами эффекторов формирует регуляторный сигнал, финальным акцептором которого выступает DHHA2-домен – чья значимая для активности подвижность модулируется в процессе регуляции конформационными перестройками тетрамера.
Цель работы: проверка гипотезы о роли DHHA2-домена в механизме регуляции нуклеотидами CBS-РРаз.
Задачи: 1. Удалить DHHA2-домен и охарактеризовать мутантный белок; 2. Предсказать третичную структуру полноразмерного и мутантного белков. Объектом исследования была бактериальная CBS-РРаза из Desulfitobacteruim hafniense.
Выводы: в результате выполнения работы полностью подтверждена роль DHHA2-домена, как ключевого структурного элемента в механизме регуляции CBS-РРазы. Показано участие DHHA2-домена в формировании напряженной тетрамерной структуры CBS-РРазы.