|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИПМех РАН |
||
Транскриптомный анализ взаимодействия облигатно-паразитического растения повилика (Cuscuta campestris) с растениями-хозяевамидипломная работа (Специалист)
- Научный руководитель: Ашапкин В.В.
- Автор: Игумнов Даниил Сергеевич
- Тип: Специалист
- Организация, в которой проходила защита: МГУ имени М.В. Ломоносова
- Год защиты: 2023
- Аннотация: Ранее было известно, что растения способны приобретать и передавать через поколения регуляторные изменения с помощью эпигенома, в том числе и повышенную устойчивость к стрессам, но воспитание устойчивости к паразитическим растениям ранее не исследовалось. В дипломной работе была получена матрица экспрессии для образцов контрольных и зараженных повиликой растений арабидопсиса исходного чувствительного к ней поколения и третьего поколения, в котором была воспитана частичная устойчивость к повилике. Проведен анализ дифференциальной экспрессии. Полученные DEG были разделены на группы с общим экспрессионным профилем с помощью мягкой кластеризации и модули коэкспрессирующихся генов методом WGCNA. Ключевые гены определены по максимальному числу белок-белковых взаимодействий внутри кластеров. Установлено, что воспитание повышенной резистентности в исходно чувствительном к заражению повиликой растениях связано с изменениями экспрессии генов двух типов: 1) заблаговременная активация или ингибирование генов, экспрессия которых изменяется в том же направлении при заражении (гены ответа на кислородное голодание, окислительный стресс, гены транспорта и ответа на защитные гормоны, сегрегации АФК); 2) изменение экспрессии генов, которые не являются дифференциально экспрессирующимися непосредственно при заражении (гены циркадного ритма и фотоморфогенеза).
- Добавил в систему: Ашапкин Василий Васильевич