Аннотация:Методом количественной ПЦР показано, что количество генов прокариот максимально в агрегатах целинного чернозема, а грибов – в агрегатах дерново-подзолистой почвы под пашней. По результатам секвенирования тотальной ДНК в пахотной дерново-подзолистой почве, по сравнению с другими почвами, максимальна доля Firmicutes и Cyanobacteria, а в целинном черноземе - Verrucomicrobia и Taumarchaeota. Во всех исследуемых образцах доминирующим филумом является Proteobacteria. На основе анализа прокариотных генов не выявлено существенных различий в альфа-разнообразии и структуре микробиомов внутренней и внешней частей почвенных агрегатов, что подтверждает наличие внутри агрегатов аэробных микроорганизмов, а, следовательно, и аэробных зон. По результатам кластерного анализа тип почвы и система землепользования являются более сильными детерминантами структуры микробиомов, чем различия внутренней и внешней частей почвенных агрегатов.