Аннотация:Короткие открытые рамки считывания (кОРС) являются общей чертой всех геномов, но в настоящее время известно лишь несколько функциональных пептидов, кодируемых кОРС в другой, отличной от «материнского» гена, рамке, но в ее пределах. В своей работе мы обнаружили 53-Пеп кОРС, которая не только направляет синтез в клетке пептида длиной 53 аминокислоты, но так же оказывает влияние на экспрессию «материнского» гена ФАНЛ.
Мы показали, что при естественных условиях, когда листья не подвергаются стрессовому воздействию, уровень мРНК ФАНЛ очень низкий. Однако при заражении растения ВТМ или при длительном нахождении в темноте в листьях происходит повышение содержания мРНК ФАНЛ более чем в 10 раз. Блокирование трансляции 53-Пеп с «материнской» мРНК ФАНЛ приводит к увеличению накопления этой мРНК в естественных условиях, сравнимому с ее накоплением при стрессовых воздействиях. Инфекция ВТМ и длительная темнота негативно влияют на функции хлоропластов. По-видимому, есть некий фактор, ассоциированный с активностью хлоропластов, который «включает» и «выключает» синтез 53-Пеп, тем самым влияя на экспрессию самого гена ФАНЛ.
Совсем недавно Dominique Lauressergues с коллегами обнаружили кОРС в нескольких некодирующих РНК (предшественниках микроРНК) растений Medicago truncatula и Arabidopsis thaliana. Для пяти пептидов, кодируемых кОРС они доказали трансляцию в растениях, а также их влияние на транскрипцию «материнских» некодирующих РНК (Lauressergues et al., 2015). 53-Пеп кОРС представляет собой другой, но также первый пример, когда короткая внутренняя ОРС контролирует активность «материнского» гена в растениях.