Аннотация:Работа посвящена изучению взаимодействия потенциал-зависимого натриевого канала NavAb из бактерии Arcobacter butzleri с модулирующими пептидами.
В работе проводится обзор литературных данных по натриевым потенциал-зависимым каналам, описываются теоретические основы компьютерного молекулярного моделирования в рамках классических силовых полей.
Практическая часть работы состоит в применении методов моделирования по гомологии, докинга и классической молекулярной динамики для построения и изучения взаимодействия потенциал-зависимого ионного канала NavAb и модулирующих пептидов. На основе полученных данных были сделаны выводы о положении сайта связывания пептидов, о характере их взаимодействий с каналом и были предложены ключевые аминокислотные остатки, играющие большую роль в образовании контактов.