Аннотация:Грипп часто влечёт за собой осложнения и приводит не только к многочисленным госпитализациям, но и к летальным исходам. В настоящее время для борьбы с вирусом гриппа применяются препараты из группы ингибиторов нейраминидазы: озельтамивир и занамивир. Нейраминидаза является белком капсида вируса гриппа. Её механизм действия заключается в отщеплении концевого остатка сиаловой кислоты в составе полисахаридов на поверхности клеток хозяина. Это необходимо для проникновения вируса через слизистые оболочки и высвобождения вновь образованных вирионов для заражения других клеток. Применение конкурентных ингибиторов нейраминидазы снижает частоту ассоциированных с гриппом осложнений и смертность. Кроме того, препараты этой группы могут оказаться необходимыми для снижения смертности в первые месяцы в случае пандемии, так как на разработку вакцины требуется не менее 6 месяцев с момента появления нового штамма. Однако в связи с высокой скоростью возникновения новых штаммов ранее указанные препараты становятся всё менее эффективными.
Целью работы стало выявление оптимального способа соединения функциональных частей в составе потенциального ингибитора нейраминидазы, взаимодействующих с участком сиаловой кислоты и полостью-430. Были поставлены следующие задачи. 1) Провести моделирование связывания известных производных ингибиторов нейраминидазы, в структуре которых представлен предшественник возможного линкера, проанализировать взаимодействия таких соединений с участком сиаловой кислоты и полостью-430. 2) Создать сфокусированные компьютерные библиотеки низкомолекулярных соединений, содержащих новые варианты линкерных предшественников, получить соответствующие модели комплексов соединений с нейраминидазой. 3) На основе анализа структуры и молекулярных взаимодействий определить, какие типы линкера являются наиболее оптимальными для создания химически-устойчивого и эффективно связывающегося бифункционального ингибитора.