Аннотация:Изоформа М лактатдегидрогеназы (ЛДГ-М) – фермент, катализирующий восстановление пировиноградной кислоты (пирувата) – конечного продукта аэробного гликолиза в молочную кислоту (лактат). Изоформа Н (ЛДГ-Н) также может осуществлять данное превращение, однако более склонна к обратной реакции.
Принимая во внимание особенности энергетического метаболизма раковых клеток, связанные с активацией гликолиза и снижением работы митохондриальной дыхательной цепи, ЛДГ-М рассматривается как важный фермент для пролиферации опухолей.
Несмотря на то, что структуры и свойства изоформ ЛДГ хорошо изучены, большинство описанных ингибиторов обладает невысокой активностью [3]. Наличие же кристаллических структур изоформ M и H ЛДГ делает возможным разработку новых селективных ингибиторов ЛДГ-М с привлечением методов молекулярного моделирования. Так, целями представленной работы являлось:
1)построение полноатомной модели изоформы М для проведения виртуального скрининга;
2)построение полноатомной модели изоформы Н для оценки возможности создания ингибиторов селективных к изоформе М;
3)компьютерный скрининг ингибиторов ЛДГ-М в библиотеке Vitas-M;
4)создание библиотеки органических соединений, имеющихся в отделе биокинетики НИИ ФХБ имени А.Н. Белозерского МГУ имени М.В. Ломоносова и ее виртуальный скрининг;
5)экспериментальная оценка ингибирующей способности соединений, отобранных после скрининга созданной библиотеки.