Аннотация:Цель работы:
Проверка гипотезы о присутствии рецепторов мелатонина в клетках голого землекопа
Методы:
На сайте Biocompare.com были отобраны антитела против рецепторов MT1 и MT2. С помощью программы TCofee для каждого антитела были построены выравнивания последовательности иммуногена с соответствующей последовательностью голого землекопа. С помощью программы RaptorX на основе гомологии с адренорецептором была построена возможная трехмерная структура предполагаемых белков. При этом предполагаемые места прерывания трансляции, где в гене располагаются стоп-кодоны, в первичной последовательности гипотетического белка были заменены на аминокислоту аланин. С помощью программы Vina был произведен докинг наиболее часто используемых лигандов. Для оценки пространственного положения аминокислот, различных для последовательности иммуногена и соответствующего участка последовательности голого землекопа, а также для визуализации результатов докинга была использована программа Jmol.
Результаты:
В ходе работы были подобраны поликлональные антитела с наибольшим сродством к мелатониновым рецепторам