|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИПМех РАН |
||
Окислительный стресс в E. coli: роль 6S РНК в регуляции экспрессии геновкурсовая работа (Специалист)
- Научный руководитель: Елкина Дарья Александровна
- Автор: Трефилов Вадим Станиславович
- Тип: Специалист
- Организация, в которой проходила защита: МГУ имени М.В. Ломоносова
- Кафедра: Кафедра химии природных соединений
- Год защиты: 2019
- Курс: 1
- Аннотация: Известно, что, наряду с РНК, участвующими в процессе биосинтеза белка, в клетках существуют малые некодирующие РНК (нкРНК), длина которых не превышает 300 н. о. Количество нкРНК в клетка про- и эукариот существенно различается: 2 и 98% соответственно [1]. нкРНК выполняют различные функции, например, участвуют в процессах ответа клетки на стресс или изменение окружающих условий. Так, OxyS РНК транскрибируется в клетке E. coli в ответ на окислительный стресс и блокирует трансляцию транскрипционного активатора FhlA [2]. Одной из наиболее известных нкРНК бактерий является 6S РНК – глобальный регулятор транскрипции, связывающийся с РНК полимеразой и блокирующий ее доступ к промоторам ДНК. Также известны работы, в ходе которых было выявлено участие 6S РНК в регуляции экспрессии некоторых генов, кодирующих стрессовые белки [4]. Целью этой работы было изучение роли 6S РНК в клетках E. coli в условиях перекисного стресса. Для этого мы определяли уровень экспрессии генов soxS (кодирует транскрипционный регулятор, отвечающий за адаптацию клетки к окислительному стрессу), ssrS (ген, кодирующий 6S РНК) и gapA (кодирует белок “домашнего хозяйства”, играющий ключевую роль в процессах гликолиза и гликогеногенеза; использовался в качестве нормировочного гена) в клетках E. coli в обычных условиях и при перекисном стрессе. В ходе работы мы сравнивали количества мРНК белка SoxS и 6S РНК в клетках E. coli двух штаммов: дикого типа и с делецией гена ssrS (Δ6S). В результате работы с помощью метода ОТ-кПЦР (количественная полимеразная цепная реакция с обратной транскрипцией) было выявлено, что в присутствии H2O2 количество 6S РНК увеличивается. Также было установлено, что в этих условиях количество мРНК белка SoxS сильно возрастает, причем в клетках дикого типа мРНК сильнее, чем в мутантных клетках. Эти данные могут свидетельствовать о том, что 6S РНК принимает участие в регуляции транскрипционного активатора, который в свою очередь регулирует транскрипцию многих генов в условии окислительного стресса. Список литературы 1. Буренина О. Ю. и др. Малые некодирующие 6S РНК бактерий. // Биохимия. 2015. Т. 80. №. 11. С. 1641. 2. Wang, L. et all. Structural insights into the recognition of the internal A rich linker from OxyS sRNA by Escherichia coli Hfq. // Nucleic Acids Res., 2015, V. 43, P. 2400. 3. Wehner, S., Damm, K., Hartmann, R.K., and Marz, M. Dissemination of 6S RNA among bacteria. // RNA Biol., 2014, V. 11, P. 1467. 4. Trotochaud, A.E., and Wassarman, K.M. 6S RNA regulation of pspF transcription leads to altered cell survival at high pH. // J. Bacteriol., 2006, V. 188, P. 3936.
- Добавил в систему: Елкина Дарья Александровна