|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИПМех РАН |
||
Поиск случаев дифференциальной трансляции мРНК в тканях млекопитающихкурсовая работа (Специалист)
- Научные руководители: Дмитриев С.Е., Анисимова А.С.
- Автор: Макарова Надежда Евгеньевна
- Тип: Специалист
- Организация, в которой проходила защита: МГУ имени М.В. Ломоносова
- Кафедра: Факультет биоинженерии и биоинформатики
- Год защиты: 2019
- Курс: 5
- Аннотация: Биосинтез белка - один из ключевых процессов, происходящий в клетках всех живых организмов. В ходе трансляции согласованная работа рибосом и многих других клеточных компонентов обеспечивает декодирование информации, заключенной в мРНК, в последовательность аминокислот. В рамках классической догмы молекулярной биологии ДНК - мРНК - Белок можно выявить различные уровни регуляции белкового синтеза. Процесс трансляции вносит существенный вклад в регуляцию и поддержание гомеостаза клеток млекопитающих путем дифференциальной трансляции мРНК. Однако очень мало известно о тканеспецифичных особенностях трансляции, которые приводят к тому, что один и тот же транскрипт в разных органах и тканях транслируется с разной эффективностью. Знание особенностей пост-транскрипционной регуляции экспрессии генов и ее тканевой специфичности может быть использовано при разработке новых методов таргетного лечения широкого круга заболеваний, связанных с нарушением трансляционного аппарата, а также при создании специфических ингибиторов трансляции - противоопухолевых, противовоспалительных и противовирусных препаратов. В ходе работы были проанализированы данные рибосомного профайлинга (Ribo-Seq), а также данные по количественному анализу транскриптома (RNA-Seq) печени и почки мыши, полученные Александрой Анисимовой в 2017 году. На основе анализа дифференциальной экспрессии на уровне транскрипции и трансляции в двух органах, печени и почке, были отобраны несколько генов, чья экспрессия отличалась за счет трансляционных эффектов. Далее были созданы репортерные конструкции на основе люциферазы светлячка, содержащие 5’-нетранслируемые области (5’-НТО) или 3’-нетранслируемые области (3’-НТО) выбранных генов. На базе созданных конструкций были синтезированы in vitro соответствующие РНК, которыми затем были трансфицированы клеточные линии HEK293T, HepG2 и Huh7. Также было проведено исследование дифференциальной экспрессии генов, кодирующих компоненты трансляционного аппарата клетки, путём биоинформатического анализа имеющейся в открытом доступе транскриптомной базы данных GTEx. В ходе работы были обнаружены как уже известные примеры тканеспецифичной экспрессии трансляционных факторов, так и не описанные в литературе случаи.
- Добавил в систему: Дмитриев Сергей Евгеньевич