Анализ транксрипционных паттернов, ассоциированных с клеточным репрограммированием, и их взаимосвязи с возрастными изменениямикурсовая работа (Специалист)
Аннотация:Плюрипотентные стволовые клетки являются перспективными объектами исследований в регенеративной медицине и биологии старения. Было показано, что многие типы дифференцированных клеток можно репрограммировать в плюрипотентное состояние с помощью факторов OSKM. Репрограммирование клеток с помощью OSKM снижает уровень метилирования ДНК, который, в свою очередь, является важным биомаркером старения. Вместе с тем, связь процесса репрограммирования со старением на уровне других молекулярных процессов на данный момент неясна. Основной целью нашей работы было получение надежных профилей генной экспрессии, связанных с репрограммированием клеток млекопитающих, путем мета-анализа доступных данных, а так же сравнение полученных профилей с паттернами, ассоциированными со старением и эффектом воздействий, продлевающих жизнь. В ходе нашего исследования было проанализировано 40 наборов данных по изменению экспрессии генов в ходе репрограммирования с помощью нескольких систем, среди различных тканей и организмов. В ходе анализа были получены профили общего изменения экспрессии, профили репрограммирования с помощью OSKM системы, профили изменения экспрессии у мышей и человека, а также профиль удачно прошедших репрограммирований. Найденные профили демонстрировали положительную корреляцию друг с другом. Полученные в ходе анализа зависимости сравнивались с паттернами старения и продления жизни на уровне функциональных процессов.