|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИПМех РАН |
||
Сборка и анализ генома Bacillus sp. D6 на основе данных методов секвенирования нового поколениякурсовая работа (Специалист)
- Научные руководители: Кубарева Е.А., Алексеевский А.В.
- Автор: Боровикова И.И.
- Тип: Специалист
- Организация, в которой проходила защита: МГУ имени М.В. Ломоносова
- Кафедра: Факультет биоинженерии и биоинформатики
- Год защиты: 2022
- Курс: 3
- Аннотация: Бактерия Bacillus species D6 была изолирована из образца песка пустыни Сахара и секвенирована с помощи технологии Illumina в нашем отделе. Получена сборка генома с N50 = 48 508. Интерес к этой бактерии объясняется, в частности, тем, что из нее была выделена гетеродимерная эндонуклеаза рестрикции R.BspD6I, большая субъединица которой Nt.BspD6I (она же BspD6A) способна функционировать как независимая никующая эндонуклеаза, что проверено in vivo. Сайт узнавания никазы Nt.BspD6I и место расщепления одной цепочки ДНК относительно сайта узнавания были определены. Новые никазы представляют большой интерес для биотехнологии. Малая субъединица BspD6A вне комплекса с большой не активна. Для улучшения сборки генома и его анализа выполнено секвенирование с помощью технологии Oxford Nanopore. В данной работе была улучшена сборка генома бактерии Bacillus sp. D6 на основе данных двух технологий.
- Добавил в систему: Алексеевский Андрей Владимирович