|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИПМех РАН |
||
Подавление репарации мисматчей в клетках патогенных видов Neisseria усиливает антигенную вариабельность пилинакурсовая работа (Бакалавр)
- Научные руководители: Савицкая В.Ю., Кубарева Е.А.
- Автор: Стрекаловских В.В.
- Тип: Бакалавр
- Организация, в которой проходила защита: МГУ имени М.В. Ломоносова
- Кафедра: Факультет биоинженерии и биоинформатики
- Год защиты: 2023
- Курс: 2
- Аннотация: Патогенные виды Neisseria используют различные способы для того, чтобы избежать иммунный ответ организма-хозяина. Один из них – антигенная вариация пилина PilE – основного компонента пилей IV-го типа, которые являются важнейшим фактором вирулентности этих патогенов. Антигенная вариация PilE реализуется с помощью белков гомологичной рекомбинации, однако этот процесс связан с работой системы репарации «мисматчей» (MMR), которая исправляет неканонические пары нуклеотидов, а также однонуклеотидные вставки или делеции. У видов Neisseria эта система включает в себя два основных белка, которые кодируются генами mutS и mutL. MutS сканирует ДНК в поисках «мисматча», а затем привлекает MutL, который вносит одноцепочечный разрыв в дочернюю цепь ДНК, инициируя репарацию. Показано, что нокауты mutS или mutL в клетках Neisseria оказывают положительное влияние на антигенную вариацию PilE, но механизм этой регуляции неизвестен. В настоящий момент также отсутствуют исследования, связанные с анализом способности природных штаммов Neisseria целенаправленно подавлять MMR для повышения изменчивости гена pilE. Объект исследования — последовательности геномов ~30 тыс. изолятов N. meningitidis и ~15 тыс. изолятов N. gonorrhoeae, выделенных из биологического материала пациентов со всего мира и опубликованных в международной базе данных PubMLST. Целью нашей работы стало выявление зависимости между наличием неповреждённых генов белков MutS/MutL и степенью изменчивости pilE в геномах исследуемых патогенов с помощью методов биоинформатики. С помощью функционала базы данных PubMLST была обнаружена высокая степень консервативности и «сохранности» генов белков MMR в популяциях обоих видов бактерий. Однако анализ полиморфизмов pilE, проведённый для различных групп изолятов, показывает, что значительные повреждения или отсутствие генов mutS или mutL приводят к выраженной вариабельности белка PilE. Таким образом, продемонстрирован повышенный уровень антигенной вариации пилина в клетках природных MMR-дефицитных штаммов как N. gonorrhoeae, так и N. meningitidis. Можно предположить, что это явление происходит не случайно, а является результатом целенаправленной эволюции. Механизм регуляции антигенной вариации PilE белками системы MMR остается неизученным. Однако его понимание важно для разработки новых лекарственных препаратов и подходов к борьбе с инфекционными заболеваниями, вызванными N. gonorrhoeae и N. meningitidis.
- Добавил в систему: Кубарева Елена Александровна
Прикрепленные файлы
| № | Имя | Описание | Имя файла | Размер | Добавлен |
|---|---|---|---|---|---|
| 1. | Стендовый_доклад | Poster_final.pdf | 2,2 МБ | 23 апреля 2023 [KubarevaEA] |