|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИПМех РАН |
||
Разработка нового метода химической модификации белков по остаткам аргининакурсовая работа (Специалист)
- Научный руководитель: Королев С.П.
- Автор: Мансурходжаев А.Ф.
- Тип: Специалист
- Организация, в которой проходила защита: МГУ имени М.В. Ломоносова
- Кафедра: Факультет биоинженерии и биоинформатики
- Год защиты: 2014
- Курс: 4
- Аннотация: Взаимодействия белков с нуклеиновыми кислотами очень важны для функционирования клетки. Существуют методы изучения таких взаимодействий и in vivo, и in vitro. Одним из базовых методов биоорганической химии является химическая модификация белков, позволяющая определять аминокислотные остатки, важные для взаимодействия с лигандом быстро и эффективно. Химические модификации белков позволяют изучать разные белковые взаимодействия методом футпринтинга с точным определением положения и типа модифицированной аминокислоты. Наиболее распространенными являются разнообразные реагенты селективно и эффективно модифицирующие белки по остаткам лизина (например N-гидросукцинимидные эфиры) [ , ] и по остаткам цистеина (например, малеимиды и иодацетамиды)[ , ]. Данные модификации позволяют изучать взаимодействия этих остатков с нуклеиновыми кислотами (НК). Помимо остатков лизина и цистеина во взаимодействии белков с нуклеиновыми кислотами активно участвуют остатки аргинина. Тем не менее методы белкового футпринтинга остатков аргинина разработаны на настоящий момент недостаточно для решения таких задач. Существуют реагенты, модифицирующие остатки аргинина, но проблема заключается в том, что при этом образуются необратимые побочные продукты. Одним из таких реагентов является п-оксифенилглиоксаль, который применялся для изучения РНК-белковых комплексов [ ]. Помимо аргинина он также взаимодействует с гуанином, что изменяет структуру НК и влияет на взаимодействие с белком. Поэтому разработка метода селективной химической модификации остатков аргинина для футпринтинга является важной и актуальной задачей. В рамках данной работы было решено разработать метод белкового футпринтинга остатков аргинина, который можно использовать изучения НК-белковых взаимодействий. В качестве реакционно-способной группировки, взаимодействующей с гуанидиновой группой аргинина, нами было решено использовать 1,3-дикетоны. Старшим научным сотрудником лаборатории химии белка кафедры химии природных соединений химического факультета МГУ имени М.В. Ломоносова к.х.н. Зацепиным Тимофеем Сергеевичем был предложен и осуществлен синтез 1,3-дикетона с электронакцепторной фенильной группой, позволяющей увеличить реакционную способность по отношению к остаткам аргинина в составе белков по сравнению с малореакционноспособными алифитическими 1,3-дикетонами. Для этого было впервые синтезировано производное флуоресцентного красителя родамина 6Ж, содержащее 1,3-дикетогруппу.
- Добавил в систему: Королев Сергей Павлович