Использование для диагностики рака легкого пептидного и белкового состава конденсата выдыхаемого воздуха, определяемого на основании анализа программой Mascot данных, полученных методами масс-спектрометриикурсовая работа (Специалист)
Аннотация:Рак легкого – наиболее часто встречающаяся злокачественная опухоль с очень высокой смертностью. В отличие от многих других видов рака, для него еще не разработаны эффективные скрининговые программы. Анализ пептидного и белкового состава проб конденсата выдыхаемого воздуха (КВВ) – перспективный метод ранней диагностики рака легкого. Процедура сбора проб КВВ отличается неинвазивностью, легкостью проведения и возможностью многократного воспроизведения без выявления каких-либо побочных эффектов. В составе КВВ на сегодняшний день обнаружено более 200 соединений, однако большинство из этих веществ можно определить только с помощью высокоточных аналитических методов. От инструментов идентификации зависит конечный результат анализа, поэтому использование той или иной методики или программы должно быть обоснованным. Выбор оптимального алгоритма работы с таким сложным объектом, как КВВ, является актуальной научной задачей, решение которой существенно повлияет на скорость внедрения метода в клиническую практику.
Целью исследования является изучение возможностей и ограничений программы Mascot на примере работы с данными масс-спектрометрического анализа белкового и пептидного состава конденсата выдыхаемого воздуха (КВВ).
Были поставлены следующие задачи:
1. изучить алгоритм работы программы;
2. изучить особенности работы программы Mascot при анализе белкового и пептидного состава КВВ;
3. на основании литературных данных сопоставить плюсы и минусы работы Mascot с наиболее распространенными аналогами (SEQUEST, X!Tandem).