Отправляющая организация:МГУ имени М.В. Ломоносова
Принимающая организация:Leiden University Medical Center, Нидерланды
Отправляющее
подразделение:
Факультет биоинженерии и биоинформатики
Направление:Стажировка сотрудника подразделения во внешней организации
Дата начала:1 июля 2015 г.
Дата окончания:31 июля 2015 г.
Цель стажировки:Научная работа и сотрудничество студентов факультета биоинженерии и биоинформатики с ведущими лабораториями одного из крупнейших научно-исследовательских университетов в Европе.
Во время стажировки был разработан программный комплекс для помощи врачам в лечении пациентов в зависимости от их генотипа. В рамках проекта «CYP2D6 genotyping using the single-molecule real-time PacBio RSII» под руководством куратора Seyed Yahya Anvar, Systems Biology, Bioinformatics at Leiden University Medical Center, Leiden.
Был написан комплекс программ на python, bash, R, php/html/css/js для автоматического нахождения лучших генотипов для последовательностей генов пациентов. Результаты выводятся в графическом представлении в виде нескольких html страниц. Автоматизированность позволяет пользоваться программами не вникая в технические подробности, графическое отображение – легче анализировать полученные результаты.