ИСТИНА

Дьяконова Александра Никитична пользователь

МГУ имени М.В. Ломоносова, Биологический факультет, Кафедра биофизики, Проблемная лаборатория космической биологии, ассистент, с 11 ноября 2009

Соавторы: Ризниченко Г.Ю., Коваленко И.Б., Хрущев С.С., Рубин А.Б., Абатурова А.М., Плюснина Т.Ю., Федоров В.А., Устинин Д.М., Беляева Н.Е., Антал Т.К., Маслаков А.С., Зленко Д.В., Князева О.С. показать полностью..., Фурсова П.В., Маторин Д.Н., Байжуманов А.А., Браже А.Р., Браже Н.А., Булычев А.А., Горячев С.Н., Грачев Е.А., Давлетшина Л.Н., Красильников П.М., Кренделева Т.Е., Крупенина Н.А., Кукарских Г.П., Ловягина Е.Р., Лунева О.Г., Максимов Е.Г., Мамонов П.А., Нестеренко А.М., Паршина Е.Ю., Розенкранц А.А., Страховская М.Г., Сёмин Б.К., Храмцов Ю.В., Черкашин А.А., Юсипович А.И., Bogatyreva N., Garbuzynskiy S., Gorokhov V.V., Korepanova E.A., Uzdenski A., Багров Д.В., Бадретдинов А.Я., Балацкая М.Н., Барсегов В.А., Беленикина Н.С., Белецкая Т.А., Бинги В.Н., Бонарцев А.П., Бочкарева С.С., Ванаг В.К., Ванин А.Ф., Вершубский А.В., Волгушева А.А., Воронова Е.Н., Галзитская О.В., Громов П.А., Гулак П.В., Дурнева А.П., Ефремов Р.Г., Конюхов И.В., Корватовский Б.Н., Кузнецов М.Б., Кутузов Н.П., Локтюшкин А.В., Максимов Г.В., Немченко О.Ю., Нечипуренко Ю.Д., Новоселецкий В.Н., Нокс П.П., Осипов В.А., Платонов А.Г., Погосян С.И., Полежаев А.А., Попинако А.В., Ременников С.М., Тимофеев К.Н., Тодоренко Д.А., Трифонов И.Т., Туровецкий В.Б., Тёрлова Л.Д., Финкельштейн А.В., Шайтан К.В., Шахматова Е.М., Шумарина А.О., Яковлева О.В.

23 статьи, 4 книги, 13 докладов на конференциях, 31 тезисы докладов, 21 НИР, 1 членство в редколлегии журнала, 2 членства в программных комитетах, 1 диссертация, 3 учебных курса

Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 22, Scopus: 33

IstinaResearcherID (IRID): 467688

Деятельность

• Статьи в журналах

  • 
    • 2020 Models of Photosynthetic Electron Transport
    • Riznichenko G.Yu, Belyaeva N.E., Diakonova A.N., Kovalenko I.B., Maslakov A.S., Antal T.K., Goryachev S.N., Plyusnina T.Yu, Fedorov V.A., Khruschev S.S., Rubin A.B.
    • в журнале Biophysics, издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation), том 65, № 5, с. 754-768 DOI
  • • 2020 Модели фотосинтетического электронного транспорта
    • Ризниченко Галина Юрьевна, Беляева Наталья Евгеньевна, Дьяконова Александра Никитична, Коваленко Илья Борисович, Маслаков Алексей Сергеевич, Антал Тарас Корнелиевич, Горячев Сергей Николаевич, Плюснина Татьяна Юрьевна, Федоров Владимир Андреевич, Хрущев Сергей Сергеевич, Рубин Андрей Борисович
    • в журнале Биофизика, издательство Наука (М.), том 65, № 5, с. 886-902 DOI
  • • 2018 Кинетические и многочастичные броуновские модели переключения потоков в микроводорослях, выделяющих молекулярный водород Актуальные вопросы биологической физики и химии
    • Ризниченко Г.Ю., Плюснина Т.Ю., Дьяконова А.Н., Хрущев С.С., Коваленко И.Б., Рубин А.Б.
    • в журнале Актуальные вопросы биологической физики и химии, издательство Севастопольский государственный университет (Севастополь), том 3, № 4, с. 763-772
  • 
    • 2016 Influence of pH and ionic strength on electrostatic properties of ferredoxin, FNR, and hydrogenase and the rate constants of their interaction
    • Diakonova A.N., Khrushchev S.S., Kovalenko I.B., Riznichenko G.Yu, Rubin A.B.
    • в журнале Physical Biology, издательство IOP Publishing ([Bristol, UK], England), том 13, № 5, с. 056004 DOI
  • • 2016 Pоль электростатических взаимодействий при образовании комплексов ферредоксин-ферредоксин-НАДФ+-редуктаза и ферредоксин-гидрогеназа
    • Дьяконова А.Н., Хрущев С.С., Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б.
    • в журнале Биофизика, издательство Наука (М.), том 61, № 4, с. 677-685
  • 
    • 2016 The role of electrostatic interactions in the formation of ferredoxin–ferredoxin NADP+ reductase and ferredoxin–hydrogenase complexes
    • Diakonova A.N., Khruschev S.S., Kovalenko I.B., Riznichenko G.Yu, Rubin A.B.
    • в журнале Biophysics, издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation), том 61, № 4, с. 572-579 DOI
  • 
    • 2015 Brownian-dynamics simulations of protein–protein interactions in the photosynthetic electron transport chain
    • Khruschev S.S., Abaturova A.M., Diakonova A.N., Fedorov V.A., Ustinin D.M., Kovalenko I.B., Riznichenko G.Yu, Rubin A.B.
    • в журнале Biophysics, издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation), том 60, № 2, с. 212-231 DOI
  • 
    • 2015 Моделиpование взаимодейcтвий белков фотоcинтетичеcкой электpон-тpанcпоpтной цепи фотоcинтеза методом бpоуновcкой динамики
    • Хрущев Сергей Сергеевич, Абатуpова А.М., Дьяконова А.Н., Федоpов В.А., Уcтинин Д.М., Коваленко И.Б., Pизниченко Г.Ю., Pубин А.Б.
    • в журнале Биофизика, издательство Наука (М.), том 60, № 2, с. 270-292
  • 
    • 2013 Моделирование белок-белковых взаимодействий с применением программного комплекса многочастичной броуновской динамики ProKSim
    • Хрущев С.С., Абатурова А.М., Дьяконова А.Н., Устинин Д.М., Зленко Д.В., Федоров В.А., Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б.
    • в журнале Компьютерные исследования и моделирование, издательство Автономная некоммерческая организация Ижевский институт компьютерных исследований (Ижевск), том 5, № 1, с. 47-64
  • 
    • 2011 Computer Simulation of Protein-Protein Association in Photosynthesis
    • Kovalenko I.B., Abaturova A.M., Diakonova A.N., Knyazeva O.S., Ustinin D.M., Khruschev S.S., Riznichenko G.Yu, Rubin A.B.
    • в журнале Mathematical modelling of natural phenomena, издательство EDP Sciences (France), том 6, № 7, с. 39-54
  • 
    • 2011 Multiparticle computer simulation of protein interactions in the photosynthetic membrane
    • Riznichenko G.Iu, Kovalenko I.B., Abaturova A.M., D'iakonova A.N., Kniazeva O.S., Ustinin D.M., Khrushchev S.S., Rubin A.B.
    • в журнале Biophysics, издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation), том 56, № 5, с. 775-786
  • 
    • 2010 Direct computer simulation of ferredoxin and FNR complex formation in solution
    • Kovalenko I.B., Diakonova A.N., Abaturova A.M., Riznichenko G.Yu, Rubin A.B.
    • в журнале Physical Biology, издательство IOP Publishing ([Bristol, UK], England), том 7, № 2
  • 
    • 2010 New direct dynamic models of protein interactions coupled to photosynthetic electron transport reactions
    • Riznichenko G.Yu, Kovalenko I.B., Abaturova A.M., Diakonova A.N., Ustinin D.M., Grachev E.A., Rubin A.B.
    • в журнале Biophysical Reviews, издательство Springer Verlag (Germany), том 2, № 3, с. 101-110 DOI

• Статьи в сборниках

  • • 2018 Зачем публиковаться в русскоязычных журналах: взгляд ученого
    • Дьяконова А.Н.
    • в сборнике Научное издание международного уровня – 2018: редакционная политика, открытый доступ, научные коммуникации. Материалы 7-й международной научно-практической конференции, место издания Ваше цифровое издательство Москва, том 7, с. 44-47 DOI
  • • 2018 Модели клеточной и молекулярной регуляции фотосинтетической цепи водород-выделяющих микроводорослей
    • Ризниченко Г.Ю., Дьяконова А.Н., Коваленко И.Б., Плюснина Т.Ю., Хрущев С.С., Федоров В.А.
    • в сборнике Доклады Международной конференции «Математическая биология и биоинформатика», место издания ИМПБ РАН Пущино, том 7, с. e66 DOI
  • • 2017 pH regulation of hydrogen-generating microalgae photosynthetic chain. Kinetic and multiparticle brownian models. Chapter 8
    • Riznichenko G.Yu, Plyusnina T.Yu, Diakonova A.N., Kovalenko I.B., Khruschev S.S., Rubin A.B.
    • в сборнике Nonlinearity: Problems, Solutions and Applications, место издания Nova Science Publishers, Inc United States, том 2, с. 181-202
  • • 2017 Механизмы pH-регуляции электронных потоков в фотосинтетической цепи водородвыделяющих микроводорослей. Кинетические и многочастичные броуновские модели
    • Ризниченко Г.Ю., Плюснина Т.Ю., Дьяконова А.Н., Коваленко И.Б., Хрущев С.С.
    • в сборнике Физико-химические механизмы и регуляция процессов транс-формации энергии в биологических структурах, место издания Институт компьютерных исследований Москва-Ижевск, с. 420-443
  • • 2015 Protein–protein interaction in photosynthetic electron transfer chain: computer simulation
    • Коваленко И.Б., Абатурова А.М., Дьяконова А.Н., Устинин Д.М., Хрущев С.С., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б.
    • в сборнике Computational Materials and Biological Sciences, серия Materials Science and Technologies, издательство Nova Science Publishers (Hauppauge, NY, United States)
  • • 2015 Кинетические, Монте-Карло и многочастичные модели первичных процессов фотосинтеза
    • Ризниченко Г.Ю., Беляева Н.Е., Дьяконова А.Н., Коваленко И.Б., Маслаков А.С., Плюснина Т.Ю., Устинин Д.М., Хрущев С.С.
    • в сборнике Материалы Х международной научно-технической конференции Актуальные вопросы биологической физики и химии., БФФХ – 2015.. г. Севастополь, 17-21 августа 2015 г, место издания Севастополь, том 10, с. 60-64
  • • 2014 Кинетические и многочастичные модели фотосинтетического электронного транспорта
    • Ризниченко Г.Ю., Беляева Н.Е., Коваленко И.Б., Дьяконова А.Н., Абатурова А.М., Князева О.С., Устинин Д.М., Хрущев С.С., Рубин А.Б.
    • в сборнике Современные проблемы фотосинтеза, место издания Институт Компьютерных исследований Ижевск - Москва, том 2, с. 41-100
  • • 2011 Исследование поведенческих реакций головастиков серой жабы (Bufo bufo) и травяной лягушки (Rana temporaria) на сигналы группы
    • Белецкая Т.А., Дурнева А.П., Дьяконова А.Н., Мозговая М.Н., Попинако А.В., Шахматова Е.М.
    • в сборнике Флора и фауна Западного Подмосковья, серия 6, место издания МГУ, Москва, том 6, с. 110-126
    • редактор Анисимова Ольга Викторовна
  • • 2008 Direct computer simulation of ferredoxin and FNR complex formation in solution
    • Kovalenko I., Diakonova A., Abaturova A., Riznichenko G.
    • в сборнике Proceedings of the 16th International Symposium on Flavins and Flavoproteins, место издания Prensas Universitarias de Zaragoza Jaca, Spain, с. 437-442
  • • 2008 Прямое компьютерное моделирование образования комплекса ферредоксина и ферредоксин:НАДФ+ - оксидоредуктазы
    • Дьяконова А.Н., Коваленко И.Б., Абатурова А.М., Ризниченко Г.Ю.
    • в сборнике Математика. Компьютер. Образование, место издания Научно-издательский центр «Регулярная и хаотическая динамика» М.-Ижевск, том 3, с. 79-84

• Книги

  • • 2021 Математические модели в биологии: учебное пособие
    • Плюснина Т.Ю., Фурсова П.В., Дьяконова А.Н., Тёрлова Л.Д., Ризниченко Г.Ю.
    • издательство Автономная некоммерческая организация Ижевский институт компьютерных исследований (Ижевск) , ISBN 978-5-4344-0922-3, 174 с.
  • • 2017 Практикум по биофизике в 2 частях. Ч.2
    • Абатурова А.М., Антал Т.К., Байжуманов А.А., Беленкина Н.С., Беляева Н.Е., Браже А.Р., Браже Н.А., Булычев А.А., Воронова Е.Н., Давлетшина Л.Н., Дьяконова А.Н., Зленко Д.В., Коваленко И.Б., Конюхов И.В., Корватовский Б.Н., Красильников П.М., Кренделева Т.Е., Крупенина Н.А., Кукарских Г.П., Ловягина Е.Р., Лунева О.Г., Максимов Е.Г., Мамонов П.А., Маторин Д.Н., Нестеренко А.М., Паршина Е.Ю., Платонов А.Г., Плюснина Т.Ю., Погосян С.И., Ременников С.М., Ризниченко Г.Ю., Розенкранц А.А., Сёмин Б.К., Страховская М.Г., Тимофеев К.Н., Тодоренко Д.А., Туровецкий В.Б., Устинин Д.М., Храмцов Ю.В., Хрущев С.С., Черкашин А.А., Юсипович А.И., Яковлева О.В.
    • место издания Лаборатория знаний Москва, ISBN 978-5-906828-27-9, 512 с.
  • • 2017 Физико-химические механизмы и регуляция процессов трансформации энергии в биологических структурах (Под редакцией Г.Ю.Ризниченко, А.Б.Рубина)
    • Кузнецов А.С., Ефремов Р.Г., Нокс П.П., Горохов В.В., Твердислов В.А., Финкельштейн А.В., Бадретдинов А.Я., Галзитская О.В., Иванков Д.Н., Богатырева Н.С., Гарбузинский С.А., Нечипуренко Ю.Д., Давлетшина Л.Н., Ловягина Е.Р., Сёмин Б.К., Антонов В.Ф., Корепанова Е.А., Немченко О.Ю., Булычев А.А., Маторин Д.Н., Ванин А.Ф., Максимов Г.В., Бочкарева С.С., Кутузов Н.П., Узденский А.Б., Красильников П.М., Кренделева Т.Е., Антал Т.К., Кукарских Г.П., Волгушева А.А., Вершубский А.В., Тихонов А.Н., Ризниченко Г.Ю., Плюснина Т.Ю., Дьяконова А.Н., Коваленко И.Б., Хрущев С.С., Бинги В.Н., Полежаев А.А., Кузнецов М.Б.
    • место издания Москва-Ижевск: Институт компьютерных исследований, ISBN 978-5-4344-0420-4, 522 с.
  • • 2012 Нанобиотехнологии практикум
    • Абатурова А.М., Багров Д.В., Байжуманов А.А., Бонарцев А.П., Браже А.Р., Браже Н.А., Ванаг В.К., Гулак П.В., Дьяконова А.Н., Зленко Д.В., Коваленко И.Б., Крупенина Н.А., Локтюшкин А.В., Лунева О.Г., Максимов Е.Г., Мамонов П.А., Маторин Д.Н., Нестеренко А.М., Новоселецкий В.Н., Осипов В.А., Паршина Е.Ю., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б., Розенкранц А.А., Страховская М.Г., Храмцов Ю.В., Черкашин А.А., Шайтан К.В., Шумарина А.О., Юсипович А.И.
    • место издания Бином. Лаборатория знаний Москва, ISBN 978-5-9963-0627-5, 384 с.

• Доклады на конференциях

  • • 2019 Влияние НАДФ+ на стабилизацию комплекса ФД-ФНР. Молекулярно-динамическое исследование (Стендовый)
    • Авторы: Федоров В.А., Хрущев С.С., Дьяконова А.Н., Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б.
    • VI СЪЕЗД БИОФИЗИКОВ РОССИИ (Сочи, 2019), г. Сочи, Россия, 15-21 сентября 2019
  • • 2019 Информационные технологии в университетских курсах «Математические модели в биологии» и «Биофизика» (Устный)
    • Авторы: Дьяконова А.Н., Плюснина Т.Ю., Ризниченко Г.Ю., Хрущев С.С., Фурсова П.Ю.
    • VI СЪЕЗД БИОФИЗИКОВ РОССИИ (Сочи, 2019), г. Сочи, Россия, 15-21 сентября 2019
  • • 2019 Методы математического моделирования в задачах малого практикума по курсу “биофизика” на биологическом факультете МГУ имени М.В. Ломоносова (Устный)
    • Авторы: Фурсова П.В., Плюснина Т.Ю., Дьяконова А.Н.
    • VI СЪЕЗД БИОФИЗИКОВ РОССИИ (Сочи, 2019), г. Сочи, Россия, 15-21 сентября 2019
  • • 2019 Многочастичное броуновское моделирование взаимодействий между ферредоксином и его белковыми партнерами (Стендовый)
    • Авторы: Дьяконова А.Н., Федоров В.А., Рубин А.Б., Ризниченко Г.Ю., Хрущев С.С.
    • VI СЪЕЗД БИОФИЗИКОВ РОССИИ (Сочи, 2019), г. Сочи, Россия, 15-21 сентября 2019
  • • 2019 Modeling of interactions of proteins participating in hydrogen production (Стендовый)
    • Авторы: Diakonova Alexandra N., Ризниченко Г.Ю., Федоров В.А., Хрущев С.С.
    • 10th International Meeting «Photosynthesis and Hydrogen Energy Research for Sustainability – 2019», Санкт-Петербург, Россия, 23-25 июня 2019
  • • 2019 Применение интернет-технологий в учебном курсе “Математические модели в биологии” (Устный)
    • Авторы: Фурсова П.В., Плюснина Т.Ю., Хрущев С.С., Дьяконова А.Н., Ризниченко Г.Ю.
    • XXVI международная конференция «Математика. Компьютер. Образование» (Пущино, 28 января — 2 февраля 2019 г.)., Пущино, Россия, 28 января - 2 февраля 2019
  • • 2018 Модели клеточной и молекулярной регуляции фотосинтетической цепи водород-выделяющих водорослей (Пленарный)
    • Авторы: Ризниченко Г.Ю., Дьяконова А.Н., Федоров В.А., Плюснина Т.Ю., Хрущев С.С., Коваленко И.Б.
    • VII Международная конференция "Математическая биология и биоинформатика", г.Пущино, Россия, 14-19 октября 2018
  • • 2018 Зачем публиковаться в русскоязычных журналах: взгляд ученого (Устный)
    • Автор: Дьяконова Александра Никтична
    • Научное издание международного уровня – 2018: редакционная политика, открытый доступ, научные коммуникации, Москва, Россия, 24-27 апреля 2018
  • • 2016 Многочастичное броуновское моделирование взаимодействия ферердоксина, ФНР и гидрогеназы Chlamydomonas reinhardtii (Устный)
    • Автор: Дьяконова А.Н.
    • МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ. МКО-2016, Дубна, Россия, 25-30 января 2016
  • • 2015 Моделирование взаимодействия ферредоксина, ФНР и гидрогеназы методом многочастичной броуновской динамики (Стендовый)
    • Авторы: Дьяконова Александра Никитична, Ризниченко Г.Ю., Хрущев С.С.
    • V СЪЕЗД БИОФИЗИКОВ РОССИИ, Ростов-на-Дону , Россия, 4-10 октября 2015
  • • 2013 Direct Computer Modeling of Ferredoxin Interactions with FNR and Hydrogenase
    • Автор: Diakonova A.N.
    • 1st International Symposium on Computational Materials and Biological Sciences , Waseda University, Tokyo, Japan, Япония, 2013
  • • 2013 Direct multiparticle simulation of ferredoxin interactions with FNR and hydrogenase. Dependence upon ionic strength and pH
    • Автор: Diakonova A.N.
    • International Workshop. Computational and Theoretical Modeling of Biomolecular Interactions., Dubna. Russia., Россия, 3-8 июня 2013
  • • 2013 Исследование взаимодействия ферредоксина и ФНР методом молекулярной динамики (Стендовый)
    • Авторы: Зленко Д.В., Дьяконова А.Н., Рубин А.Б., Коваленко И.Б., Хрущев С.С.
    • Математика Компьютер Образование, Пущино, Россия, 28 января - 4 февраля 2013

• Тезисы докладов

  • • 2021 Processes in photosynthetic membrane as an object of systems biology
    • Riznichenko G.Yu, Abaturova Anna, Antal Taras, Belyaeva Natalya, Dyakonova Alexandra, Kovalenko Ilia, Maslakov Alexey, Plusnina Tаtyana, Khruschev Sergey, Fedorov Vladimir, Rubin Andrey
    • в сборнике Systems Biology and Systems Physiology: Regulation of Biological Networks (devoted to the 75th Anniversary of Fazly Ataullakhanov), 2nd Hybrid Conference Proceedings. Hosted by: Centre For Theoretical Problems of Physicochemical Pharmacology RAS, Moscow,, серия Hybrid Conference Proceedings, издательство Globustar Formaat (Tallinn, Estonia), том 2, тезисы, с. 40-41 DOI
  • • 2021 Молекулярные, броуновские, кинетические модели и Монте Карло модели процессов в фотосинтетической мембране высших растений и микроводорослей
    • Ризниченко Г.Ю., Антал Т.К., Беляева Н.Е., Дьяконова А.Н., Коваленко И.Б., Маслаков А.С., Плюснина Т.Ю., Федоров В.А., Хрущев С.С., Рубин А.Б.
    • в сборнике IX Съезд Российского фотобиологического общества Всероссийская конференция “Современные проблемы фотобиологии” пос. Шепси, 12–19 сентября 2021 г. Материалы съезда, место издания Пятый формат г. Серпухов, тезисы, с. 61-61
  • • 2020 Идентификация мутаций ферредоксина, потенциально увеличивающих выход водорода у фотосинтезирующих организмов
    • Дьяконова А.Н., Хрущев С.С., Федоров В.А., Ризниченко Г.Ю.
    • в сборнике МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ. XXVII международная конференция / R&G Dynamics Москва. Ижевск Москва Ижевск / Тезисы / 2020г. / том 27 / тезисы, серия МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ, издательство Автономная некоммерческая организация Ижевский институт компьютерных исследований (Ижевск), том 27, тезисы, с. 43-43
  • • 2019 Modeling of interactions of proteins participating in hydrogen production
    • Alexandra Diakonova, Sergey Khruschev, Vladimir Fyodorov, Galina Riznichenko
    • в сборнике 10th International Conference “Photosynthesis and Hydrogen Energy Research for Sustainability-2019", June 23 – 28, 2019, Saint Petersburg, Russia, Abstracts, ISBN 978-5-4386-1743-3, место издания Komarov Botanical Institute of the Russian Academy of Sciences St. Petersburg, тезисы, с. 183-183
  • • 2019 Влияние НАДФ+ на стабилизацию комплекса ФД-ФНР. Молекулярно-динамическое исследование
    • Федоров В.А., Хрущев С.С., Дьяконова А.Н., Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б.
    • в сборнике Сборник научных трудов VI Съезда биофизиков России (16.09.2019 - 21.09.2019), место издания ООО Полиграфическое объединение "Плехановец" Краснодар, том 1, тезисы, с. 96-96 DOI
  • • 2019 Информационные технологии в университетских курсах «Математические модели в биологии» и «Биофизика»
    • Дьяконова А.Н., Плюснина Т.Ю., Фурсова П.Ю., Хрущев С.С., Ризниченко Г.Ю.
    • в сборнике Сборник научных трудов VI Съезда биофизиков России (16.09.2019 - 21.09.2019), место издания ООО Полиграфическое объединение "Плехановец" Краснодар, том 1, тезисы, с. 337-338 DOI
  • • 2019 Кинетические и многочастичные модели нелинейной регуляции процессов в водород выделяющих микроводорослях
    • Ризниченко Г.Ю., Плюсниина Т.Ю., Дьяконова А.Н., Федоров В.А., Хрущев С.С., Коваленко И.Б., Рубин А.Б.
    • в сборнике Моделирование нелинейных процессов и систем. Сборник тезисов 4 международной научной конференции, место издания Янус-К Москва, тезисы, с. 164-166
  • • 2019 МЕТОДЫ МАТЕМАТИЧЕСКОГО МОДЕЛИРОВАНИЯ В ЗАДАЧАХ МАЛОГО ПРАКТИКУМА ПО КУРСУ “БИОФИЗИКА” НА БИОЛОГИЧЕСКОМ ФАКУЛЬТЕТЕ МГУ ИМЕНИ М.В.ЛОМОНОСОВА
    • Фурсова П.В., Дьяконова А.Н., Плюснина Т.Ю.
    • в сборнике Сборник научных трудов VI Съезда биофизиков России (16.09.2019 - 21.09.2019), место издания ООО Полиграфическое объединение "Плехановец" Краснодар, том 1, тезисы, с. 343-343 DOI
  • • 2019 Многочастичное броуновское моделирование взаимодействий между ферредоксином и его белковыми партнерами
    • Дьяконова А.Н., Федоров В.А., Хрущев С.С., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б.
    • в сборнике Сборник научных трудов VI Съезда биофизиков России (16.09.2019 - 21.09.2019), место издания ООО Полиграфическое объединение "Плехановец" Краснодар, том 1, тезисы, с. 64-64 DOI
  • • 2019 Моделирование взаимодействия ферредоксина и ферредоксин-НАДФ-редуктазы из разных фотосинтезирующих организмов
    • Дьяконова А.Н., Федоров В.А., Хрущев С.С., Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю.
    • в сборнике МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ 26: Сборник научных тезисов, серия МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ, место издания Регулярная и хаотическая динамика Москва - Ижевск Ижевск, том 26, тезисы, с. 35-35
  • • 2019 Применение интернет-технологий в учебном курсе “Математические модели в биологии”
    • Фурсова П.В., Плюснина Т.Ю., Хрущев С.С., Дьяконова А.Н., Ризниченко Г.Ю.
    • в сборнике МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ 26: Сборник научных тезисов, серия МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ, место издания Регулярная и хаотическая динамика Москва - Ижевск Ижевск, том 26, тезисы, с. 298-298
  • • 2016 Kinetic and computer modeling of photosynthetic regulation
    • Riznichenko G., Plusnina T., Dyakonova A., Kovalenko I., Ustinin D., Rubin A.
    • в сборнике International symposium KSCMBS-2016. Khudjant symposium on computational materials and biological sciences, серия SCMBS symposiums, место издания Khujand Khujand, том 10, тезисы, с. 43-43
  • • 2016 Kinetic and computer multiparticle modeling of photosynthetic regulation
    • Galina Riznichenko, Tatyana Plusnina, Alexandra Dyakonova, Dmitry Ustinin, Andrew Rubin
    • в сборнике 7th International Conference. Photosynthesis Research for Sustainability-2016. Abstracts, место издания Пущино, тезисы, с. 118-118
  • • 2016 Анализ механизмов взаимодействия фотосинтетических белков методами молекулярного моделирования
    • Рубин А.Б., Хрущев С.С., Дьяконова А.Н., Федоров В.А., Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю.
    • в сборнике Сборник тезисов Первого российского кристаллографического конгресса, Москва, ВДНХ, 21-26 ноября 2016 г, место издания ООО "НП-Принт" СПб, тезисы, с. 257-258
  • • 2015 Кинетические, Монте-Карло и многочастичные модели первичных процессов фотосинтеза
    • Ризниченко Г.Ю., Беляева Н.Е., Дьяконова А.Н., Коваленко И.Б., Маслаков А.С., Плюснина Т.Ю., Устинин Д.М., Хрущев С.С., Рубин А.Б.
    • в сборнике Материалы докладов V съезда биофизиков России, серия Пленарные доклады, место издания Ростов на Дону, Южный федеральный университет Ростов на Дону, том 1, тезисы, с. 42-42
  • • 2014 Multiparticle Brownian Modeling of Ferredoxin Association with FNR and Hydrogenase
    • Diakonova A.N.
    • в сборнике International Biophysics Congress (IUPAB), место издания Brisbane, Australia, тезисы
  • • 2013 Direct computer modeling of ferredoxin interactions with FNR and hydrogenase
    • Diakonova A.N., Kovalenko I.B., Khrushchev S.S.
    • в сборнике 1st International Symposium on Computational Materials and Biological Sciences, место издания Waseda University Токио, Япония, тезисы, с. 10-12
  • • 2013 Direct multiparticle simulation of ferredoxin interactions with FNR and hydrogenase. Dependence upon ionic strength and pH
    • Diakonova A.N., Khrushchev S.S., Kovalenko I.B., Riznichenko G.Yu
    • в сборнике International Workshop "Computational and Theoretical Modeling of Biomolecular Interactions", место издания Institute of Computer Science Moscow-Izhevsk, тезисы, с. 18-20
  • • 2013 Simulation of the processes in photosynthetic membrane
    • Riznichenko G.Yu, Abaturova A.M., Beljaeva N.E., Khrushchev S.S., Diakonova A.N., Kovalenko I.B., Rubin A.B.
    • в сборнике 1st International Symposium on Computational Materials and Biological Sciences, место издания Waseda University Токио, Япония, тезисы, с. 10-12
  • • 2013 Исследование взаимодействия ферредоксина и ФНР методом молекулярной динамики
    • Зленко Д.В., Дьяконова А.Н., Хрущев С.С., Коваленко И.Б., Рубин А.Б.
    • в сборнике Математика. Компьютер. Образование, место издания Регулярная и хаотическая динамика М. - Ижевск, тезисы, с. 20-20
  • • 2013 Моделирование зависимости скорости взаимодействия ферредоксина с ФНР и гидрогеназой от pH и ионной силы
    • Дьяконова А.Н., Хрущев С.С., Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б.
    • в сборнике Математика. Компьютер. Образование, место издания Регулярная и хаотическая динамика М. - Ижевск, тезисы, с. 16-16
  • • 2013 Оценка роли электростатических взаимодействий в образовании диффузионно-столкновительных комплексов белков методом многочастичной броуновской динамики
    • Хрущев С.С., Абатурова А.М., Дьяконова А.Н., Устинин Д.М., Зленко Д.В., Федоров В.А., Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б.
    • в сборнике Современные проблемы биофизики сложных систем.информационно-образовательные процессы. Материалы докладов Международной научно-методической конференции, место издания г.Воронеж, тезисы, с. 84-87
  • • 2013 Прямое моделирование белков ферредоксина, ФНР и гидрогеназы
    • Дьяконова А.Н., Коваленко И.Б., Хрущев С.С.
    • в сборнике Тезисы докладов Молодежной научно-практической конференции «Биофизика биоэнергетических процессов», посвященная столетию академика А.А. Красновского, г. Звенигород, 24–27 октября 2013 г, тезисы, с. 21-21
  • • 2012 Computer simulation of protein-protein complex formation
    • Kovalenko I., Diakonova A., Khrushchev S., Abaturova A., Riznichenko G., Rubin A.
    • в сборнике Сборник тезисов 5-й Российско-японской международной конференции «Молекулярно-динамическое моделирование в науках о веществе и биологии», место издания Дубна, тезисы, с. 17.-17.
  • • 2011 Computer Simulation of Plastocyanin Diffusion and Interaction with Its Reaction Partners
    • Коваленко И.Б., Дьяконова А.Н., Князева О.С., Абатурова А.М., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б.
    • в сборнике Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, издательство Adenine Press (United States), том 28, тезисы, с. 978-978
  • • 2011 Computer Simulations of Protein–Protein Complex Formation on Graphics Processing Units
    • Коваленко И.Б., Дьяконова А.Н., Хрущев С.С., Абатурова А.М., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б., Трифонов С.И., Барсегов В.А.
    • в сборнике Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, издательство Adenine Press (United States), том 28, тезисы, с. 977-977
  • • 2010 Computer simulation of ferredoxin-FNR interaction in solution
    • Diakonova A.N., Kovalenko I.B., Abaturova A.M., Riznichenko G.Yu
    • в сборнике Abstracts of the Seventh international conference of bioinformatics of genome regulation and structure, место издания Novosibirsk, Russia, тезисы
  • • 2010 Прямое компьютерное моделирование взаимодействия ферредоксина и ферредоксин:НАДФ+-оксидоредуктазы
    • Дьяконова А.Н., Коваленко И.Б., Абатурова А.М., Ризниченко Г.Ю.
    • в сборнике Международная конференция «Математика. Компьютер. Образование.», место издания РХД Ижевск, том 17, тезисы
  • • 2009 Моделирование процесса образования комплекса ферредоксина и ферредоксин:НАДФ+оксидоредуктазы
    • Дьяконова А.Н., Коваленко И.Б., Абатурова А.М., Ризниченко Г.Ю.
    • в сборнике Математика. Компьютер. Образование, место издания НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика» М. - Ижевск, тезисы, с. 245-245
  • • 2008 Computer simulation of Ferredoxin-FNR complex formation
    • Diakonova A.N., Abaturova A.M., Kovalenko I.B., Riznichenko G.Yu
    • в сборнике Abstracts of the 16th International Symposium on Flavins and Flavoproteins, место издания Prensas Universitarias de Zaragoza Jaca, Spain, тезисы, с. 57-57
  • • 2008 Роль точечных зарядов во взаимодействии белков ферредоксина и ферредоксин:НАДФ+-оксидоредуктазы
    • Дьяконова А.Н., Абатурова А.М., Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю., Громов П.А., Грачев Е.А.
    • в сборнике Математика. Компьютер. Образование, место издания Регулярная и хаотическая динамика М. - Ижевск, тезисы, с. 165-165

• НИРы

  • • 1 января 2021 - 31 декабря 2026 Молекулярно-кинетические механизмы и математическое моделирование биологических процессов
    • Кафедра биофизики
    • Руководитель: Ризниченко Г.Ю. Ответственные исполнители: Коваленко И.Б., Плюснина Т.Ю. Участники НИР: Абатурова А.М., Беляева Н.Е., Гусева В.В., Дьяконова А.Н., Маслаков А.С., Соколов Д.В., Федоров В.А., Фролов А.Е., Фурсова П.В., Холина Е.Г., Хрущев С.С.
  • • 27 февраля 2020 - 31 декабря 2022 Системный анализ динамики воздействия тяжелых металлов на фотосинтетический электронный транспорт у высших растений
    • Кафедра биофизики
    • Руководитель: Рубин А.Б. Участники НИР: Антал Т.К., Дьяконова А.Н., Коваленко И.Б., Маторин Д.Н., Плюснина Т.Ю., Ризниченко Г.Ю., Тодоренко Д.А., Федоров В.А., Хрущев С.С.
  • • 14 января 2019 - 31 декабря 2021 Взаимодействие подвижных белков-переносчиков электрона: от структуры к функции
    • Кафедра биофизики
    • Руководитель: Коваленко И.Б. Участники НИР: Абатурова А.М., Антал Т.К., Дьяконова А.Н., Федоров В.А., Холина Е.Г., Хрущев С.С.
  • • 1 января 2018 - 31 декабря 2018 Проект организации симпозиума "Биофизика сложных систем: вычислительная и системная биология, молекулярное моделирование, медицинская биофизика" в рамках XXV Международной конференции "Математика. Компьютер. Образование"
    • Кафедра биофизики
    • Руководитель: Рубин А.Б. Участники НИР: Дьяконова А.Н., Коваленко И.Б., Нестеренко А.М., Плюснина Т.Ю., Ризниченко Г.Ю., Федоров В.А., Фурсова П.В., Хрущев С.С.
  • • 17 июля 2017 - 31 декабря 2019 «Разработка научно-технических основ гибридной биотехнологии для конверсии отходов в биоудобрения с использованием микроводорослей»
    • Биологический факультет
    • Руководитель: Соловченко А.Е. Ответственные исполнители: Лобакова Е.С., Лукьянов А.А. Участники НИР: Абатурова А.М., Алипкина С.И., Антал Т.К., Ахаев Д.Н., Васильева С.Г., Ганина О.Г., Горелова О.А., Дьяконова А.Н., Зайцева А.А., Калабушев С.Н., Конюхов И.В., Королев Д.Е., Кривобокова Е.А., Кузнецов А.Г., Налобин Д.С., Никельшпарг Э.И., Орлова А.А., Петушкова Ю.А., Погосян С.И., Пугачева Т.Т., Рубин А.Б., Семенова Л.Р., Скулачев К.В., Тодоренко Д.А., Ульянов Д.К., Чеканов К.А., Шапиро Т.Н., Шибзухова К.А., Щербаков П.Н.
  • • 1 января 2017 - 31 декабря 2019 Анализ разнонаправленных электронных потоков в микроводорослях при производстве водорода
    • Кафедра биофизики
    • Руководитель: Рубин А.Б. Участники НИР: Антал Т.К., Волгушева А.А., Дегтерева Н.С., Дьяконова А.Н., Коваленко И.Б., Плюснина Т.Ю., Ризниченко Г.Ю., Федоров В.А., Хрущев С.С.
  • • 1 января 2017 - 31 декабря 2017 Проект организации Симпозиума с международным участием «Биофизика сложных систем. Молекулярное моделирование. Системная биология. Процессы самоорганизации» в рамках XXIV Международной конференции «Математика. Компьютер. Образование» г.Пущино, 23 -28 января 2017 г
    • Кафедра биофизики
    • Руководитель: Рубин А.Б. Ответственные исполнители: Плюснина Т.Ю., Ризниченко Г.Ю., Хрущев С.С. Участники НИР: Дьяконова А.Н., Зленко Д.В., Коваленко И.Б., Устинин Д.М., Федоров В.А., Фурсова П.В.
  • • 1 января 2016 - 31 декабря 2020 Физико-химические механизмы и математическое моделирование биологических процессов
    • Кафедра биофизики
    • Руководитель: Ризниченко Г.Ю. Участники НИР: Абатурова А.М., Беляева Н.Е., Гусева В.В., Дьяконова А.Н., Коваленко И.Б., Маслаков А.С., Плюснина Т.Ю., Соколов Д.В., Устинин Д.М., Федоров В.А., Фролов А.Е., Фурсова П.В., Холина Е.Г., Хрущев С.С.
  • • 1 января 2016 - 31 декабря 2016 Проект организации симпозиума с международным участием «Биофизика сложных систем. Молекулярное моделирование. Системная биология.»
    • Кафедра биофизики
    • Руководитель: Рубин А.Б. Участники НИР: Дьяконова А.Н., Коваленко И.Б., Нестеренко А.М., Плюснина Т.Ю., Ризниченко Г.Ю., Терлова Л.Д., Устинин Д.М., Хрущев С.С.
  • • 9 февраля 2015 - 31 декабря 2017 Создание иерархической молекулярной модели взаимодействий между белками переносчиками электрона в цианобактериях, водорослях и высших растениях.
    • Кафедра биофизики
    • Руководитель: Коваленко И.Б. Участники НИР: Абатурова А.М., Воронова Е.Н., Дьяконова А.Н., Зленко Д.В., Конюхов И.В., Лукашев Е.П., Сьянова Д.П., Федоров В.А., Хрущев С.С.
  • • 6 марта 2014 - 31 декабря 2015 Изучение влияния ионного состава среды и водного окружения на скорость взаимодействия белков фотосинтетического аппарата методами броуновской и молекулярной динамики
    • Кафедра биофизики
    • Руководитель: Дьяконова А.Н. Участники НИР: Зленко Д.В., Сьянова Д.П., Федоров В.А.
  • • 1 января 2014 - 31 декабря 2016 Механизмы переключения процессов переноса электрона и темновых метаболических потоков при выделении водорода фотосинтезирующими организмами
    • Кафедра биофизики
    • Руководитель: Рубин А.Б. Участники НИР: Антал Т.К., Дьяконова А.Н., Коваленко И.Б., Кренделева Т.Е., Кукарских Г.П., Плюснина Т.Ю., Ризниченко Г.Ю., Яковлева О.В.
  • • 27 июня 2013 - 15 ноября 2013 Разработка научно-технических основ фотобиологических процессов в биоэнергетике» по теме: «Разработка научно-технических основ получения биоэнергоносителей из фототрофных микроорганизмов в фотобиореакторе
    • Кафедра биофизики
    • Руководитель: Рубин А.Б. Участники НИР: Антал Т.К., Воронова Е.Н., Горячев С.Н., Дьяконова А.Н., Коваленко И.Б., Конюхов И.В., Кренделева Т.Е., Кукарских Г.П., Маторин Д.Н., Плюснина Т.Ю., Погосян С.И., Ризниченко Г.Ю., Устинин Д.М., Федоров В.А., Яковлева О.В.
  • • 1 ноября 2012 - 31 декабря 2013 Программный комплекс для параллельного моделирования белок-белковых взаимодействий.
    • Кафедра биофизики
    • Руководитель: Устинин Д.М. Участники НИР: Абатурова А.М., Дьяконова А.Н., Зленко Д.В., Князева О.С., Коваленко И.Б., Мамонов П.А., Маслаков А.С., Федоров В.А., Хрущев С.С.
  • • 8 октября 2012 - 31 декабря 2013 Изучение кинетических характеристик белок-белкового взаимодействия методами компьютерного моделирования
    • Кафедра биофизики
    • Руководитель: Коваленко И.Б. Участники НИР: Абатурова А.М., Дьяконова А.Н., Зленко Д.В., Федоров В.А.
  • • 26 июня 2012 - 15 ноября 2013 Исследование механизмов фотозависимого производства водорода микроводорослями для увеличения их продуктивности
    • Кафедра биофизики
    • Руководитель: Рубин А.Б. Участники НИР: Антал Т.К., Волгушева А.А., Горячев С.Н., Дьяконова А.Н., Кренделева Т.Е., Кукарских Г.П., Плюснина Т.Ю., Ризниченко Г.Ю., Яковлева О.В.
  • • 1 января 2011 - 31 декабря 2013 Исследование механизмов взаимодействия альтернативных фотосинтетических электронных потоков в акцепторной части ФСI методами спектроскопии и прямого многочастичного моделирования
    • Кафедра биофизики
    • Руководитель: Рубин А.Б. Участники НИР: Булычев А.А., Волгушева А.А., Додонова С.О., Дьяконова А.Н., Князева О.С., Коваленко И.Б., Кренделева Т.Е., Кукарских Г.П., Ризниченко Г.Ю.
  • • 1 января 2011 - 31 декабря 2013 Сравнительный анализ регуляторных механизмов первичных процессов фотосинтеза микроводорослей и высших растений с использованием кинетических и многочастичных компьютерных моделей
    • Кафедра биофизики
    • Руководитель: Ризниченко Г.Ю. Участники НИР: Беляева Н.Е., Дьяконова А.Н., Коваленко И.Б., Кузнецова А.В., Маслаков А.С., Патрин М.М., Плюснина Т.Ю., Терлова Л.Д., Хрущев С.С.
  • • 1 июня 2010 - 30 ноября 2011 Биофизические механизмы и регуляция элементарных процессов трансформации энергии и переноса зарядов в биологических мембранах
    • Кафедра биофизики
    • Руководители: Антал Т.К., Браже А.Р., Браже Н.А., Булычев А.А., Горячев С.Н., Дьяконова А.Н., Загидуллин В.Э., Зленко Д.В., Коваленко И.Б., Конюхов И.В., Красильников П.М., Кренделева Т.Е., Крупенина Н.А., Лукашев Е.П., Максимов Г.В., Мамонов П.А., Маторин Д.Н., Нокс П.П., Паршина Е.Ю., Пащенко В.З., Погосян С.И., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б., Яковлева О.В.
  • • 1 января 2008 - 31 декабря 2010 Роль белок-белковых взаимодействий в регуляции первичных процессов фотосинтеза
    • Кафедра биофизики
    • Руководитель: Рубин А.Б. Участники НИР: Абатурова А.М., Антал Т.К., Волгушева А.А., Дьяконова А.Н., Коваленко И.Б., Кренделева Т.Е., Кукарских Г.П., Ризниченко Г.Ю., Чемерис Ю.К.
  • • 1 января 2006 - 31 декабря 2015 Физико-химические механизмы и математическое моделирование биологических процессов
    • Кафедра биофизики
    • Руководитель: Ризниченко Г.Ю. Участники НИР: Абатурова А.М., Беляева Н.Е., Булгаков Н.Г., Дьяконова А.Н., Жилкина Е.Е., Коваленко И.Б., Левич А.П., Лившиц М.А., Лукьянченко Т.М., Маслаков А.С., Плюснина Т.Ю., Свердлова Е.А., Соколов Д.В., Терлова Л.Д., Устинин Д.М., Хрущев С.С.

• Участие в редколлегии журналов

  • • с 1 апреля 2017 Biointerphases
    • издательство American Vacuum Society (United States)

• Участие в программных комитетах конференций

  • • 25-30 января 2016 МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ. МКО-2016
    • Член организационного комитета
    • Дубна, Россия
  • • 3-8 февраля 2014 XXI Международная конференция «Математика. Компьютер. Образование»
    • Член организационного комитета
    • Дубна, Объединенный институт ядерных исследований

• Диссертация

  • • 2016 Молекулярные механизмы переключения электронных потоков от ферредоксина на ФНР и гидрогеназу. Прямое многочастичное моделирование
    • Кандидатская диссертация по специальности 03.01.02 - Биофизика (биол. науки)
    • Автор: Дьяконова Александра Никитична, МГУ имени М.В. Ломоносова
    • Научный руководитель: Ризниченко Галина Юрьевна, д.ф.-м.н., проф., МГУ имени М.В. Ломоносова
    • Защищена в совете Д 501.001.96 при МГУ имени М.В. Ломоносова, Биологический факультет
    • Ведущая организация: Институт математических проблем биологии РАН - филиал Федерального государственного учреждения "Федеральный исследовательский центр Институт прикладной математики им. М.В. Келдыша Российской академии наук" г. Пущино
    • Оппоненты: Иванов Б.Н., Чугунов А.О.

• Авторство учебных курсов

  • • 2009 Летняя практика по молекулярному моделированию
    • Авторы: Абатурова А.М., Дьяконова А.Н., Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю., Устинин Д.М., Хрущев С.С.

• Преподавание учебных курсов

  • • с 1 сентября 2011 Биофизика (практикум по биофизическим методам)
    • МГУ имени М.В. Ломоносова, Биологический факультет, Кафедра биофизики
    • обязательная, базовой части, лабораторные занятия, 54 часов
  • • с 7 февраля 2010 Биоинформатика и математическое моделирование
    • МГУ имени М.В. Ломоносова, Биологический факультет
    • обязательная, базовой части, семинары, 96 часов