ИСТИНА

Быстров Владимир Сергеевич пользователь

доктор физико-математических наук

Институт математических проблем биологии РАН - филиал ФГУ Федеральный исследовательский центр ИПМ им. М.В. Келдыша РАН, Отдел перспективных информационных технологий, Группа комьютерного моделирования молекулярных наноструктур и биосистем, Главный научный сотрудник, Руководитель группы

Соавторы: Kopyl S.A., Kholkin A.L., Бдикин И.К., Зеленовский П.С., Coutinho J.M., Жулябина О.А., Твердислов В.А., Pullar R.C., Seyedhosseini E., Nuraeva A.S., Shur V.Y., Белова Е.В., Будикин И.Е. показать полностью..., Луценко А.О., Парамонов Е.С., Попов (Popov) А.И., Шпигун Д.К., Bystrova A.V., Coutinho J., Gevorkyan V.E., Goncalves G., Meng X., Neumayer S.M., Wang S., Авакян Л.А., Карпинский Д.В., Парамонова Е.В., Сидорова А.Э., Alan B., Ayani, Budhendra S., Bystrova A., CASTRO P., Dekhtyar Y.D., Dekhtyar Y.D., Dekhtyar Y., Dindune A., Durucan C., Ghermani N.E., Gracia J., Heredia A., Hosseini E., Ian B., Ivanov M.H., MARQUE P., Neumayer S.M., Neumayer S.M., Palcevskis E., Piccirillo C., Rodriguez B., Sapronova A., Seyedhosseini E., Seyedhosseini E., Sigov A.S., Silibin M., Silibin M.V., Solnyshkin A.V., Tobaldi D.M., Tran B., Васильев С.Г., Васильева Д.М., Воронин А.Г., Гаврилин И., Мишина Е.Д., Салехи Ф., Турченков Д.А., Филиппов С.В., Филиппов С.В.

27 статей, 2 доклада на конференциях, 1 тезисы доклада, 1 научный отчёт, 2 диссертации

Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 283, Scopus: 278

IstinaResearcherID (IRID): 92360774

ResearcherID: O-1587-2013

Scopus Author ID: 56253075300

Деятельность

• Статьи в журналах

  • • Conductance simulation of the purinergic P2X2, P2X4, and P2X7 ionic channels using a combined Brownian dynamics and molecular dynamics approach
    • Turchenkov D.A., Bystrov V.S.
    • в журнале J Phys Chem B – 2014. – V, том 118, № 31, с. 9119-9127
  • • Molecular modeling of the piezoelectric effect in the ferroelectric polymer poly(vinylidene fluoride) (PVDF
    • Bystrov V.S., Paramonova E.V., Bdikin I.K., Bystrova A.V., Pullar R.C., Kholkin A.L.
    • в журнале J Mol Model – 2013. – V, том 19, № 9, с. 3591-3602
  • • Piezoelectricity and ferroelectricity in biomaterials: Molecular modeling and piezoresponse force microscopy measurements
    • Bystrov V.S., Seyedhosseini E., Kopyl S., Bdikin I.K., Kholkin A.L.
    • в журнале J. Appl. Phys – 2014. – V, том 116, № 6, с. 066803-066803
  • • 2022 Метод оценки хиральности белков и фенилаланиновых нанотрубок как эффективный инструмент нанобиоинженерии
    • Сидорова А.Э., Быстров В.С., Луценко А.О., Шпигун Д.К., Белова Е.В.
    • в журнале Наноиндустрия, издательство АО "Рекламно-издательский центр "Техносфера" (Москва), том 15, № 2, с. 96-104 DOI
  • 
    • 2021 Modeling and physical properties of diphenylalanine peptide nanotubes containing water molecules
    • Bystrov V.S., Coutinho J., Zhulyabina O.A., Kopyl S.A., Zelenovskiy P.S., Nuraeva A.S., Tverdislov V.A., Filippov S.V., Kholkin A.L., Shur V.Ya
    • в журнале Ferroelectrics, издательство Taylor and Francis (United States), том 574, № 1, с. 78-91 DOI
  • 
    • 2021 Modeling of Self-Assembled Peptide Nanotubes and Determination of Their Chirality Sign Based on Dipole Moment Calculations
    • Bystrov V., Sidorova A., Lutsenko A., Shpigun D., Malyshko E., Nuraeva A., Zelenovskiy P., Kopyl S., Kholkin A.
    • в журнале Nanomaterials, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 11, № 9 DOI
  • 
    • 2021 Quantitative Assessment of Chirality of Protein Secondary Structures and Phenylalanine Peptide Nanotubes
    • Sidorova A.E., Bystrov V., Lutsenko A., Shpigun D., Belova E.V., Likhachev I.
    • в журнале Nanomaterials, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 11, № 12, с. 3299 DOI
  • 
    • 2020 Structures and Properties of the Self-Assembling Diphenylalanine Peptide Nanotubes Containing Water Molecules: Modeling and Data Analysis
    • Bystrov V., Coutinho J., Zelenovskiy P., Nuraeva A., Kopyl S., Zhulyabina O., Tverdislov V.
    • в журнале Nanomaterials, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 10 DOI
  • 
    • 2019 Chiral peculiar properties of self-organization of diphenylalanine peptide nanotubes: modeling of structure and properties
    • Bystrov V.S., Zelenovskiy P.S., Nuraeva A.S., Kopyl S., Zhulyabina O.A., Tverdislov V.A.
    • в журнале Mathematical Biology and Bioinformatics, том 14, № 1, с. 94-124 DOI
  • 
    • 2019 Molecular modeling and computational study of the chiral-dependent structures and properties of self-assembling diphenylalanine peptide nanotubes
    • Bystrov V.S., Zelenovskiy P.S., Nuraeva A.S., Kopyl S., Zhulyabina O.A., Tverdislov V.A.
    • в журнале Journal of Molecular Modeling, издательство Springer Verlag (Germany), том 25, № 7, с. 199 DOI
  • 
    • 2018 Investigation of physical properties of diphenylalanine peptide nanotubes having different chiralities and embedded water molecules
    • Bystrov V.S., Kopyl S.A., Zelenovskiy P., Zhulyabina O.A., Tverdislov V.A., Salehli F., Ghermani N.E., Shur V.Ya, Kholkin A.L.
    • в журнале Ferroelectrics, издательство Taylor and Francis (United States), том 525, № 1, с. 168-177
  • 
    • 2017 Local mechanical and electromechanical properties of the P(VDF-TrFE)-graphene oxide thin films
    • Silibin M.V., Bystrov V.S., Karpinsky D.V., Nasani N., Goncalves G., Gavrilin I.M., Solnyshkin A.V., Marques P.A.A.P, Budhendra Singh, Bdikin I.K.
    • в журнале Applied Surface Science, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 421, с. 42-51
  • 
    • 2017 Molecular modeling of the piezoelectric properties of ferroelectric composites containing polyvinylidene fluoride (PVDF) and either graphene or graphene oxide
    • Bystrov V.S., Bdikin I.K., Silibin M., Karpinsky D., Kopyl S., Paramonova E.V., Goncalves G.
    • в журнале Journal of Molecular Modeling, издательство Springer Verlag (Germany), том 23, № 4, с. 128-10
  • 
    • 2017 Polarization switching in ultrathin polyvinylidene fluoride homopolymer ferroelectric films
    • Paramonova E.V., Filippov S.V., Gevorkyan V.E., Avakyan L.A., Meng X.J., Tian B.B., Wang J.L., Bystrov V.S.
    • в журнале Ferroelectrics, издательство Taylor and Francis (United States), том 509, с. 143-157
  • 
    • 2016 Glycine nanostructures and domains in betaglycine: Computational modeling and PFM observations
    • Bystrov V.S., Seyedhosseini E., Bdikin I.K., Kopyl S., Kholkin A.L., Vasilev S.G., Zelenovskiy P.S., Vasileva D.S., Shur V.Ya
    • в журнале Ferroelectrics, издательство Taylor and Francis (United States), том 496, с. 28-45
  • 
    • 2016 Oxygen vacancies, the optical band gap (Eg) and photocatalysis of hydroxyapatite: comparing modelling with measured data
    • Bystrov V.S., Piccirillo C., Tobaldi D.M., Castro P.M.L, Coutinho J., Kopyl S., Pullar R.C.
    • в журнале Applied Catalysis B: Environmental, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 196, с. 100-107
  • 
    • 2015 Analysis of the computational and experimental studies of the polarization switching in the PVDF and P(VDF-TrFE) ferroelectric films at the nanoscale
    • Bystrov V.S., Paramonova E.V., Bystrova A.V., Gevorkyan V.E., Meng X.J., Tian B.B., Wang J.L., Avakyan L.A.
    • в журнале Mathematical Biology and Bioinformatics, том 10, № 2, с. 372-386
  • 
    • 2015 Bioferroelectricity in Nanostructured Glycine and Thymine: Molecular Modeling and Ferroelectric Properties at the Nanoscale
    • Bystrov V.S., Seyedhosseini E., Bdikin I., Kopyl S., Neumayer S.M., Coutinho J., Kholkin A.L.
    • в журнале Ferroelectrics, издательство Taylor and Francis (United States), том 475, № 1, с. 107-126
  • 
    • 2015 Bioferroelectricity in Nanostructured Glycine and Thymine: Molecular Modeling and Ferroelectric Properties at the Nanoscale
    • Bystrov V.S., Seyedhosseini E., Bdikin I., Kopyl S., Neumayer S.M., Coutinho J., Kholkin A.L.
    • в журнале Ferroelectrics, издательство Taylor and Francis (United States), том 475, № 1, с. 107-126
  • 
    • 2015 Bioferroelectricity in Nanostructured Glycine and Thymine: Molecular Modeling and Ferroelectric Properties at the Nanoscale
    • Bystrov V.S., Seyedhosseini E., Bdikin I., Kopyl S., Neumayer S.M., Coutinho J., Kholkin A.L.
    • в журнале Ferroelectrics – V, том 475, № 1, с. 107-126
  • 
    • 2015 Computational study of hydroxyapatite structures, properties and defects
    • Bystrov V.S., Coutinho J., Bystrova A.V., Dekhtyar Yu D., Pullar R.C., Poronin A., Palcevskis E., Dindune A., Alkan B., Durucan C., Paramonova E.V.
    • в журнале J. Phys. D: Appl. Phys – V, том 48, с. 195302-195302
  • 
    • 2015 Local piezoresponse and polarization switching in nucleobase thymine microcrystals
    • Bdikin I., Heredia A., Neumayer S.M., Bystrov V.S., Gracio J., Rodriguez B.J., Kholkin A.L.
    • в журнале Journal of Applied Physics, издательство AIP Publishing (United States), том 118, с. 072007-072007
  • 
    • 2015 Modified Hydroxyapatite structure and properties: Modeling and synchrotron data analysis of modified Hydroxyapatite structure
    • Bystrova A.V., Dekhtyar Yu D., Popov A.I., Coutinho J., Bystrov V.S.
    • в журнале Ferroelectrics – V, том 475, № 1, с. 135-147 DOI
  • 
    • 2014 Growth and Nonlinear Optical Properties of betaGlycine Crystals Grown on Pt Substrates
    • Seyedhosseini E., Ivanov M., Bystrov V., Bdikin I., Zelenovsky P., Shur V.Ya, Kudryavtsev A., Mishina E.D., Sigov A.S., Kholkin A.L.
    • в журнале Crystal Growth and Design, издательство American Chemical Society (United States), том 14, № 6, с. 2831-2837
  • 
    • 2014 Modeling and Synchrotron Data Analysis of Modified Hydroxyapatite Structure
    • Bystrova A.V., Dekhtyar Y.D., Popov A.I., Bystrov V.S.
    • в журнале Mathematical Biology and Bioinformatics, том 9, № 1, с. 171-182 DOI
  • 
    • 2014 Molecular modeling and molecular dynamic simulation of the polarization switching phenomena in the ferroelectric polymers PVDF at the nanoscale
    • Bystrov V.S.
    • в журнале Physica B: Condensed Matter, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 432, с. 21-25

• Статьи в сборниках

  • 
    • 2013 Study of polar and electrical properties of Hydroxyapatite: Modeling and data analysis
    • Bystrova Anna, Dekhtyar Yuri, Sapronova Alla, Bystrov V.S., Pullar R.C., Hosseini E., Kholkin A.L., Bdikin I., Kopyl S., Popov A.I.
    • в сборнике 2013 Joint IEEE International Symposium on Applications of Ferroelectric and Workshop on Piezoresponse Force Microscopy (ISAF/PFM), место издания IEEE, с. 6748702 DOI

• Доклады на конференциях

  • • 2020 Молекулярное моделирование структур и свойств дифенилаланиновых пептидных нанотрубок, содержащих молекулы воды (Устный)
    • Авторы: Быстров В.С., Филиппов С.В., Жулябина О.А., Твердислов В.А.
    • XV Международная научная конференция "Актуальные вопросы биологической физики и химии" (БФФХ-2020), Севастополь, Россия, 14-16 сентября 2020
  • • 2017 Investigation of Physical Properties of Diphenylalanine Peptide Nanotubes Having Different Chirality (Стендовый)
    • Авторы: Bystrov V.S., Kopyl S.A., Kholkin A.L., Zhulyabina O.A., Tverdislov V.A.
    • International conference SCANNING PROBE MICROSCOPY, Екатеринбург, Россия, 28-30 августа 2017

• Тезисы докладов

  • • 2020 Молекулярное моделирование структур и свойств дифенилаланиновых пептидных нанотрубок, содержащих молекулы воды
    • Быстров В.С., Филиппов С.В., Жулябина О.А., Твердислов В.А.
    • в сборнике Актуальные вопросы биологической физики и химии. БФФХ-2020: материалы XV международной научной конференции,, издательство Севастопольский государственный университет (Севастополь), тезисы, с. 70-70

• Отчеты

  • • 2018 Разработка и применение математических методов в биологических исследованиях. Биоинформатика.
    • Авторы: Баулин Е.Ф., Бобровский М.В., Быстрова А.В., Быстров В.С., Грохлина Т.И., Иванова Н.В., Исаев Е.А., Куликова Л.И., Лунин В.Ю., Лунина Н.Л., Лыжко Е.В., Махортых С.А., Москаленко А.В., Назипова Н.Н., Ольшевец М.М., Панкратов А.Н., Панюков В.В., Парамонова Е.В., Петрова Т.Е., Пятков М.И., Романов М.С., Смирнов В.Э., Тетуев Р.К., Устинин М.Н., Филиппов С.В., Флоринский И.В., Фурлетова Е.Ф., Ханина Л.Г., Шашков М.В., Яковлев В.В.
    • #18/А-2, 160 с.

• Руководство диссертациями

  • • 2015 Моделирование проводимости ионных каналов на основе методов молекулярной и броуновской динамики
    • Кандидатская диссертация по специальности 03.01.02 - Биофизика (физ.-мат. науки)
    • Автор: Турченков Дмитрий Александрович
    • Научный руководитель: Быстров Владимир Сергеевич, д.ф.-м.н.
    • Защищена в совете Д 501.002.11 при МГУ имени М.В. Ломоносова, Физический факультет
    • Организация, в которой выполнялась работа: группа компьютерного моделирования наноструктур и биосистем отдела перспективных информационных технологий ФГБУН Института математических проблем биологии РАН
    • Ведущая организация: ФГБУН Институт биофизики клетки РАН
    • Оппоненты: Соколов Валерий Сергеевич, Алиев Рубин Ренатович
  • • 2008 Моделирование процессов поляризации фосфатов кальция
    • Кандидатская диссертация по специальности 03.01.02 - Биофизика (физ.-мат. науки)
    • Автор: Парамонова Екатерина Владимировна
    • Научный руководитель: Быстров В.С., д.ф.-м.н.
    • Защищена в совете Д 501.002.11 при МГУ имени М.В. Ломоносова, Физический факультет
    • Организация, в которой выполнялась работа: Институт математических проблем биологии РАН
    • Ведущая организация: Институт биофизики клетки РАН
    • Оппоненты: Караваев В.А., Дмитриев А.В.