ИСТИНА

Коц Екатерина Дмитриевна пользователь

кандидат физико-математических наук с 2018 года

Прежние места работы (Нажмите для отображения)

Соавторы: Немухин А.В., Хренова М.Г., Лущекина С.В., Варфоломеев С.Д., Кулакова А.М., Masson P., Григоренко Б.Л., Моногарова О.В., Осколок К.В., Петров К.А., Krylov A., Marielle V., Nachon F. показать полностью..., Nikitashina A.D., Nikolsky E., Petrov K.A., Petrov K., Zobov V.V., Алания Е.Л., Аникина Е.Ю., Бабчук И.В., Брехов А.Т., Вербецкий В.Н., Гиниятуллин Р.Х., Делакур Э., Киенская К.И., Кусмаев А.М., Локридж О., Лычко Л.А., Махаева Г.Ф., Новичкова Д.А., Петрик М.М., Поляков И.В., Резник В.С., Сардушкин М.В.

22 статьи, 24 доклада на конференциях, 14 тезисов докладов, 9 НИР, 2 награды, 1 диссертация, 2 дипломные работы, 2 курсовые работы, 3 учебных курса

Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 147, Scopus: 154

IstinaResearcherID (IRID): 7342515

ResearcherID: P-1997-2017

ORCID: 0000-0002-7139-7098

Деятельность

---

• Статьи в журналах

  • 
    • 2019 Allosteric Control of N-Acetyl-Aspartate Hydrolysis by the Y231C and F295S Mutants of Human Aspartoacylase
    • Kots Ekaterina D., Khrenova Maria G., Nemukhin Alexander V.
    • в журнале Journal of Chemical Information and Modeling, издательство American Chemical Society (United States), том 59, № 5, с. 2299-2308 DOI
  • 
    • 2019 Diversity of mechanisms in Ras–GAP catalysis of guanosine triphosphate hydrolysis revealed by molecular modeling
    • Grigorenko Bella L., Kots Ekaterina D., Nemukhin Alexander V.
    • в журнале Organic and Biomolecular Chemistry, издательство Royal Society of Chemistry (United Kingdom), том 17, № 19, с. 4879-4891 DOI
  • 
    • 2019 Modeling of the glycine tripeptide cyclization in the Ser65Gly/Tyr66Gly mutant of green fluorescent protein
    • Grigorenko B.L., Kots E.D., Krylov A.I., Nemukhin A.V.
    • в журнале Mendeleev Communications, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 29, № 2, с. 187-189 DOI
  • 
    • 2019 Reconstructing the electron density of intermediates of the hydrolysis of N-acetylaspartate by aspartoacylase
    • Khrenova M.G., Kots E.D., Kulakova A.M., Nemukhin A.V.
    • в журнале Russian Journal of Physical Chemistry A, издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 93, № 10, с. 1470-1477 DOI
  • 
    • 2019 Аспартоацилаза - фермент центральной нервной системы: структура, каталитическая активность, механизмы регуляции
    • Коц Е.Д., Хренова М.Г., Немухин А.В., Варфоломеев С.Д.
    • в журнале Успехи химии, издательство АНО «Успехи химии» (Москва), том 88, № 1, с. 1-26 DOI
  • • 2018 Molecular modeling of dynamic properties of the carrier protein from the yellow mealworm Tenebrio molitor
    • Kusmaev A., Kots E., Kienskaya K., Sardushkin M.
    • в журнале Journal of Physics: Conference Series, издательство IOP Publishing ([Bristol, UK], England), том 1141 DOI
  • • 2018 Механизмы регуляции каталитической активности аспартоацилазы по результатам компьютерного моделирования
    • Коц Е.Д., Хренова М.Г., Лущекина С.В., Немухин А.В.
    • в журнале Вестник Московского университета. Серия 2: Химия, издательство Издательский дом МГУ (Москва), том 59, № 4, с. 257-260 DOI
  • 
    • 2017 Role of Acetylcholinesterase in β-Amyloid Aggregation Studied by Accelerated Molecular Dynamics
    • Lushchekina S.V., Kots E.D., Novichkova D.A., Petrov K.A., Masson P.
    • в журнале BioNanoScience, том 7, № 2, с. 396-402 DOI
  • 
    • 2017 Role of the Protein Dimeric Interface in Allosteric Inhibition of N-Acetyl-Aspartate Hydrolysis by Human Aspartoacylase
    • Kots Ekaterina D., Lushchekina Sofya V., Varfolomeev Sergey D., Nemukhin Alexander V.
    • в журнале Journal of Chemical Information and Modeling, издательство American Chemical Society (United States), том 57, № 8, с. 1999-2008 DOI
  • 
    • 2017 Supercomputer Technologies for Structural-Kinetic Study of Mechanisms of Enzyme Catalysis: A Quantum-Chemical Description of Aspartoacylase Catalysis
    • Varfolomeev S.D., Kots E.D., Khrenova M.G., Lushchekina S.V., Nemukhin A.V.
    • в журнале Doklady Physical Chemistry, издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation), том 474, № 4, с. 444-447 DOI
  • 
    • 2017 Three Faces of N-Acetylaspartate: Activator, Substrate and Inhibitor of Human Aspartoacylase
    • Khrenova Maria G., Kots Ekaterina D., Varfolomeev Sergey D., Lushchekina Sofya V., Nemukhin Alexander V.
    • в журнале Journal of Physical Chemistry B, издательство American Chemical Society (United States), том 121, № 40, с. 9389-9397 DOI
  • 
    • 2016 Modeling the complete catalytic cycle of aspartoacylase
    • Kots E.D., Khrenova M.G., Lushchekina S.V., Varfolomeev S.D., Grigorenko B.L., Nemukhin A.V.
    • в журнале Journal of Physical Chemistry B, издательство American Chemical Society (United States), том 120, № 18, с. 4221-4231 DOI
  • 
    • 2016 Reaction Mechanism of the Guanosine Triphosphate Hydrolysis by the Vision-Related Protein Complex Arl3-RP2
    • Khrenova Maria G., Kots Ekaterina D., Nemukhin Alexander V.
    • в журнале Journal of Physical Chemistry B, издательство American Chemical Society (United States), том 120, № 16, с. 3873-3879 DOI
  • 
    • 2016 Slow-binding inhibition of acetylcholinesterase by a 6-methyluracil alkyl-ammonium derivative: mechanism and advantages for myasthenia gravis treatment
    • Kharlamova Alexandra D., Lushchekina Sofya V., Petrov Konstantin A., Kots Ekaterina D., Nachon Florian V., Marielle Villard-Wandhammer, Zueva Irina V., Eric Krejci, Reznik Vladimir S., Zobov Vladimir V., Nikolsky Evgenyi E., Patrick Masson, Patrick Masson
    • в журнале Biochemical Journal, издательство Portland Press, Ltd. (United Kingdom), том 473, № 9, с. 1225-1236 DOI
  • • 2016 Моделирование реакции гидролиза гуанозинтрифосфата белковом комплексе RAS GAP
    • Хренова М.Г., Коц Е.Д., Кулакова А.М., Поляков И.В.
    • в журнале Вестник Московского университета. Серия 2: Химия, издательство Издательский дом МГУ (Москва), том 57, № 1, с. 7-10 DOI
  • 
    • 2016 Молекулярный полиморфизм ферментов человека — основа индивидуальной чувствительности к лекарствам. Суперкомпьютерное моделирование как метод анализа структурных изменений белка и его каталитической активности
    • Варфоломеев С.Д., Лущекина С.В., Немухин А.В., Кулакова А.М., Коц Е.Д., Махаева Г.Ф., Делакур Э., Локридж О., Массон П.
    • в журнале Известия Академии наук. Серия химическая, издательство ФГБУ "Издательство "Наука" (Москва), № 6, с. 1592-1607 DOI
  • • 2015 Molecular modeling of mechanism of action of anti-myasthenia gravis slow-binding inhibitor of acetylcholinesterase
    • Lushchekina S., Kots E., Kharlamova A., Petrov K., Masson P.
    • в журнале International Journal of Risk and Safety in Medicine, издательство I O S press (Netherlands), том 27, с. 74-75 DOI
  • 
    • 2014 Macrocyclic derivatives of 6-methyluracil as ligands of the peripheral anionic site of acetylcholinesterase
    • Semenov V.E., Giniyatullin R.Kh, Lushchekina S.V., Kots E.D., Petrov K.A., Nikitashina A.D.
    • в журнале MedChemComm, издательство Royal Society of Chemistry (United Kingdom), том 5, № 11, с. 1729-1735 DOI
  • 
    • 2012 DIRECT X-RAY FLUORESCENCE DETECTION OF MERCURY ON POLYURETHANE FOAM SORBENTS
    • Oskolok K.V., Monogarova O.V., Devyatkina E.D.
    • в журнале Moscow University Chemistry Bulletin, издательство Allerton Press Inc. (United States), том 67, № 2, с. 78-81 DOI
  • • 2012 Прямое рентгенофлуоресцентное определение ртути на пенополиуретановом сорбенте
    • Осколок К.В., Моногарова О.В., Девяткина Е.Д.
    • в журнале Вестник Московского университета. Серия 2: Химия, издательство Издательский дом МГУ (Москва), том 53, № 2, с. 115-118

• Статьи в сборниках

  • • 2017 Совместное использование суперкомпьютерного моделирования и экспериментальных методов для решения биохимических и биомедицинских задач
    • Лущекина С.В., Коц Е.Д., Немухин А.В., Masson Р., Варфоломеев С.Д.
    • в сборнике Суперкомпьютерные технологии в науке, образовании и промышленност, издательство Изд-во Моск. ун-та (М.), с. 81-92
  • • 2017 Суперкомпьютерное моделирование молекулярного полиморфизма белков
    • Хренова М.Г., Коц Е.Д., Кулакова А.М., Лычко Л.А., Немухин А.В.
    • в сборнике Суперкомпьютерные технологии в науке, образовании и промышленности, серия 7, место издания Издательство Московского университета Москва Москва, с. 45-54

• Доклады на конференциях

  • • 2019 Application of Markov State Model to Discovery of Potential Allosteric Sites on the Surface of RAS Protein (Устный)
    • Авторы: Brekhov A.T., Kots E.D., Kulakova A.M.
    • XXVI международная конференция «Математика. Компьютер. Образование» (Пущино, 28 января — 2 февраля 2019 г.)., Пущино, Россия, 28 января - 2 февраля 2019
  • • 2019 Молекулярное моделирование конформационных переходов в комплексе RAS*GAP (Стендовый)
    • Авторы: Коц Е.Д., Бабчук И.В., Алания Е.Л., Кулакова А.М.
    • XXVI международная конференция «Математика. Компьютер. Образование» (Пущино, 28 января — 2 февраля 2019 г.)., Пущино, Россия, 28 января - 2 февраля 2019
  • • 2019 Роль электронной плотности в описании реакционных интермедиатов ферментативных процессов (Стендовый)
    • Авторы: Хренова М.Г., Коц Е.Д.
    • XXVI международная конференция «Математика. Компьютер. Образование» (Пущино, 28 января — 2 февраля 2019 г.)., Пущино, Россия, 28 января - 2 февраля 2019
  • • 2018 Моделирование конформационных переходов в белке H-RAS (Стендовый)
    • Авторы: Коц Е.Д., Алания Екатерина Левановна, Кулакова А.М., Бабчук И.В.
    • XVIII Ежегодная молодежная конференция c международным участием ИБХФ РАН-ВУЗы "Биохимическая физика", Москва, Россия, 13-15 ноября 2018
  • • 2018 Определение сайтов аллостерической регуляции белка RAS методами молекулярного моделирования (Стендовый)
    • Авторы: Брехов А.Т., Коц Е.Д., Кулакова А.М., Савилова Наталия Павловна
    • XVIII Ежегодная молодежная конференция c международным участием ИБХФ РАН-ВУЗы "Биохимическая физика", Москва, Россия, 13-15 ноября 2018
  • • 2018 Молекулярное моделирование механизмов регуляции активности ферментов (Устный)
    • Авторы: Немухин А.В., Коц Е.Д., Варфоломеев С.Д.
    • XXX Симпозиум "Современная химическая физика", Пансионат МАЯК г. Туапсе, Россия, 16-27 сентября 2018
  • • 2018 Molecular modeling of dynamic properties of the carrier protein from the yellow mealworm Tenebrio molitor (Устный)
    • Авторы: Arslan Kusmaev, Ekaterina Kots, Karina Kienskaya, Makar Sardushkin
    • 7th International Conference on Mathematical Modeling in Physical Sciences, Москва, Россия, 27-31 августа 2018
  • • 2018 Молекулярное моделирование динамических свойств белка-переносчика большого мучного жука Tenebrio molitor (Стендовый)
    • Авторы: Кусмаев А.М., Коц Е.Д., Киенская К.И.
    • V Всероссийский конкурс научных докладов студентов «ФУНКЦИОНАЛЬНЫЕ МАТЕРИАЛЫ: РАЗРАБОТКА, ИССЛЕДОВАНИЕ, ПРИМЕНЕНИЕ", Томск, Россия, 22-23 мая 2018
  • • 2018 Молекулярное моделирование механизмов регуляции ферментативной активности hAsp (Устный)
    • Авторы: Коц Е.Д., Хренова М.Г., Немухин А.В.
    • МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ 2018, Дубна, Россия, 29 января - 3 февраля 2018
  • • 2017 Молекулярное моделирование механизмов регуляции ферментативной активности Аспартоацилазы (Устный)
    • Автор: Коц Е.Д.
    • XVII Ежегодная молодежная конференция c международным участием ИБХФ РАН-ВУЗы "Биохимическая физика", Москва, Россия, 13-15 ноября 2017
  • • 2017 Computational modeling of molecular processes in proteins (Приглашенный)
    • Авторы: Nemukhin A.V., Kots E.D., Grigorenko B.L., Khrenova M.G.
    • 11th Triennial Congress of the World Association of Theoretical and Computational Chemists, 27 Aug – 1 Sep 2017 in Munich, Germany, Мюнхен, Германия, 27 августа - 1 сентября 2017
  • • 2017 Molecular modeling approach to understand the activity control mechanisms of hAsp (Устный)
    • Авторы: Коц Е.Д., Хренова М.Г., Немухин А.В., Варфоломеев С.Д.
    • Biocatalysis-2017: Fundamentals & applications. June 25-30, 2017, Moscow Region, Russian Federation., Истра, Россия, 25-30 июля 2017
  • • 2017 QM-MM описание каталитических циклов в ферментативном катализе (Устный)
    • Авторы: Коц Е.Д., Хренова М.Г., Немухин А.В., Варфоломеев С.Д., Лущекина С.В.
    • IX Международный конгресс «Биотехнологии: состояние и перспективы развития», Гостиный Двор, ул. Ильинка, 4, Россия, 21-22 февраля 2017
  • • 2016 Молекулярная динамика в задачах ферментативного катализа (Устный)
    • Авторы: Коц Е.Д., Хренова М.Г., Лущекина С.В., Немухин А.В., Варфоломеев С.Д.
    • XXXIV Всероссийский симпозиум молодых ученых по химической кинетике, Московская область, Россия, 14-17 ноября 2016
  • • 2016 Применение молекулярного моделирования для изучения кинетики ферментативной реакции карбоксилэстеразы-1 человека (Устный)
    • Авторы: Коц Е.Д., Кулакова А.М.
    • XXXIV Всероссийский симпозиум молодых ученых по химической кинетике, Московская область, Россия, 14-17 ноября 2016
  • • 2016 Изоморфизм карбоксилэстеразы-1 человека (Устный)
    • Авторы: Коц Е.Д., Кулакова А.М.
    • XVI Ежегодная международная молодежная конференция Биохимическая физика ИБХФ РАН-ВУЗы, г. Москва, ИБХФ им. Н.М. Эмануэля РАН, ул. Косыгина д.4, Россия, 24-26 октября 2016
  • • 2016 Компьютерное моделирование полного каталитического цикла Аспартоацилазы. (Устный)
    • Авторы: Коц Е.Д., Хренова М.Г., Немухин А.В., Лущекина С.В., Варфоломеев С.Д.
    • Физико-химия наноструктурированных катализаторов, г. Звенигород, Россия, 11-15 апреля 2016
  • • 2016 Механизм реакции гидролиза гуанозинтрифосфата в белковом комплексе Arl3-RP2 по результатам молекулярного моделирования (Устный)
    • Авторы: Коц Е.Д., Миронов В.А., Григоренко Б.Л., Хренова М.Г.
    • МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ. МКО-2016, Дубна, Россия, 25-30 января 2016
  • • 2015 Molecular modeling of mechanism of action of anti-myasthenia gravis slowbinding inhibitor of acetylcholinesterase (Устный)
    • Авторы: Kots E.D., Lushchekina S.V., Kharlamova A., Petrov K., Masson P.
    • Evidence-Based Medicine: Achievements and Barriers, Казань, Россия, 7 декабря 2015
  • • 2015 Molecular modeling of mechanism of action of anti-myasthenia gravis slow-binding inhibitor of acetylcholinesterase (Стендовый)
    • Авторы: Masson P., PETROV K., Kharlamova A., Kots E.D., Lushchekina S.V.
    • 12th International Meeting of Cholinesterases - 6 th -Paraoxonase Conference, Elche, Испания, 27 сентября - 2 октября 2015
  • • 2015 Catalytic cycle of aspartoacylase by the results of molecular dynamics and QM/MM simulations (Устный)
    • Авторы: Lushchekina Sofya V., Kots Ekaterina D., Nemukhin Alexander V., Varfolomeev Sergey D.
    • Biocatalysis 2015, Истра, Россия, 21-26 июня 2015
  • • 2015 Компьютерное моделирование реакции ферментативного гидролиза аспартоацилазы и её мутантного аналога Е285А (Устный)
    • Автор: Коц Е.Д.
    • ЛОМОНОСОВ 2015. XXII международная конференция студентов, аспирантов и молодых учёных. Секция «Химия», МГУ имени М.В. Ломоносова, Химический факультет, Россия, 13-17 апреля 2015
  • • 2014 МОДЕЛИРОВАНИЕ ИНГИБИРОВАНИЯ АЦЕТИЛХОЛИНЭСТЕРАЗЫ (АХЭ) ПЕРСПЕКТИВНЫМ ПРЕПАРАТОМ ТЕРАПЕВТИЧЕСКОГО ЛЕЧЕНИЯ БОЛЕЗНИ АЛЬЦГЕЙМЕРА (Стендовый)
    • Авторы: Лущекина С.В., Коц Е.Д.
    • БИОХИМИЧЕСКАЯ ФИЗИКА, Москва, Россия, 28-30 октября 2014
  • • 2010 Calorimetric Study of Hydrogen Interaction with CaSi. (Стендовый)
    • Авторы: Коц Е.Д., Аникина Е.Ю., Вербецкий В.Н.
    • International Symposium on Metal-Hydrogen Systems, Moscow, Russia, Россия, 19-23 июля 2010

• Тезисы докладов

  • • 2019 Application of Markov State Model to Discovery of Potential Allosteric Sites on the Surface of RAS Protein
    • Kots E.D., Kulakova A.M., Brekhov A.T.
    • в сборнике 26 Международная Конференция "Математика. Компьютер. Образование.", серия 26, место издания АНО "Ижевский институт компьютерных исследований" Ижевск, тезисы, с. 72-72
  • • 2019 Молекулярное моделирование конформационных переходов в комплексе RAS*GAP
    • Кулакова А.М., Алания Е.Л., Бабчук И.В., Коц Е.Д.
    • в сборнике 26 Международная Конференция "Математика. Компьютер. Образование.", серия 26, место издания АНО "Ижевский институт компьютерных исследований" Ижевск, тезисы, с. 47-47
  • • 2019 Роль электронной плотности в описании реакционных интермедиатов ферментативных процессов
    • Коц Е.Д., Хренова М.Г.
    • в сборнике 26 Международная Конференция "Математика. Компьютер. Образование.", серия 26, место издания АНО "Ижевский институт компьютерных исследований" Ижевск, тезисы, с. 42-42
  • • 2018 Молекулярное моделирование механизмов регуляции активности ферментов
    • Немухин А.В., Коц Е.Д., Варфоломеев С.Д.
    • в сборнике Сборник тезисов XXX Симпозиума "Современная химическая физика", тезисы, с. 33-33
  • • 2018 Молекулярное моделирование механизмов регуляции ферментативной активности hAsp
    • Коц Е.Д., Хренова М.Г., Немухин А.В.
    • в сборнике МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ. тезисы XXV международной конференции, место издания R&G Dynamics Москва, тезисы, с. 67-67
  • • 2017 Computational modeling of molecular processes in proteins
    • Alexander Nemukhin, Bella Grigorenko, Maria Khrenova, Sofya Lushchekina, Ekaterina Kots
    • в сборнике WATOC 2017 11th Triennial Congress of the World Association of Theoretical and Computational Chemists, Munich, Germany, 27 August – 1 September 2017, место издания Munich, Germany, тезисы, с. I-105
  • • 2017 Molecular modeling approach to understand the activity control mechanisms of hAsp
    • Коц Е.Д., Хренова М.Г., Немухин А.В., Варфоломеев С.Д.
    • в сборнике Biocatalysis-2017: Abstracts of 11th International Conference “Biocatalysis: Fundamentals and Applications” / Editors V. Tishkov and V. Fedorchuk, место издания Innovations and High Technologies MSU Ltd, Moscow, тезисы
  • • 2017 QM-MM описание каталитических циклов в ферментативном катализе
    • Коц Е.Д., Хренова М.Г., Лущекина С.В., Варфоломеев С.Д., Немухин А.В.
    • в сборнике IIX Международный конгресс «Биотехнологии: состояние и перспективы развития» Москва, 20-22 февраля 2017, место издания Москва, тезисы
  • • 2017 Изоморфизм карбоксилэстеразы-1 человека
    • Кулакова А.М., Коц Е.Д.
    • в сборнике ТРУДЫ XVI ЕЖЕГОДНОЙ МЕЖДУНАРОДНОЙ МОЛОДЕЖНОЙ КОНФЕРЕНЦИИ ИБХФ РАН-ВУЗЫ, место издания Москва : РУДН Москва, тезисы, с. 60-61
  • • 2016 Компьютерное моделирование полного каталитического цикла Аспартоацилазы
    • Коц Е.Д., Хренова М.Г., Лущекина С.В., Немухин А.В., Варфоломеев С.Д.
    • в сборнике Сборник тезисов докладов конференции "Физико-химия наноструктурированных катализаторов", место издания ИХФ РАН, ООО " ОЛВИГ" Москва, тезисы, с. 25-25
  • • 2016 Молекулярная динамика в задачах ферментативного катализа
    • Коц Е.Д., Хренова М.Г., Лущекина С.В., Немухин А.В., Варфоломеев С.Д.
    • в сборнике // Сборник тезисов XXXIV Всероссийского симпозиума молодых ученых по химической кинетике, 14-17 ноября 2016 г. Московская обл., пансионат "Берёзки", место издания Издательство МГУ г. Москва, тезисы
  • • 2016 Применение молекулярного моделирования для изучения кинетики ферментативной реакции карбоксилэстеразы-1 человека
    • Кулакова А.М., Коц Е.Д.
    • в сборнике // Сборник тезисов XXXIV Всероссийского симпозиума молодых ученых по химической кинетике, 14-17 ноября 2016 г. Московская обл., пансионат "Берёзки", место издания Издательство МГУ г. Москва, тезисы
  • • 2015 Catalytic cycle of aspartoacylase by the results of molecular dynamics and QM/MM simulations
    • Kots Ekaterina D., Lushchekina Sofya V., Varfolomeev Sergey D., Nemukhin Alexander V.
    • в сборнике 10-th International Conference "BIOCATALYSIS-2015", место издания Москва, тезисы
  • • 2010 Calorimetric Study of Hydrogen Interaction with CaSi
    • Devyatkina E.D., Anikina E.Yu, Verbetsky V.N.
    • в сборнике Book of Abstracts of International symposium "Metal-hydrogen systems. Fundamentals and applications", part 2, 2010, место издания Moscow, Russia, тезисы, с. 155-155

• НИРы

  • • 1 марта 2019 - 30 декабря 2022 Суперкомпьютерное моделирование биомолекулярных систем на основе квантово-химических и молекулярно-динамических методов: от ферментативного катализа до оптогенетики
    • ИБХФ РАН
    • Руководитель: Немухин А.В. Ответственные исполнители: Коц Е.Д., Лущекина С.В., Московский А.А. Участники НИР: Григоренко Б.Л., Лычко Л.А., Миронов В.А., Поляков И.В.
  • • 23 марта 2018 - 19 марта 2019 Молекулярное моделирование медленных процессов конформационных переходов в системах ферментативных комплексов на примере комплекса RAS-GAP
    • НИЛ химической кибернетики
    • Руководитель: Коц Е.Д. Ответственный исполнитель: Кулакова А.М.
  • • 16 апреля 2017 - 28 декабря 2018 Суперкомпьютерное моделирование молекулярного полиморфизма ферментов человека
    • ИБХФ РАН
    • Руководитель: Немухин А.В. Ответственный исполнитель: Московский А.А. Участники НИР: Григоренко Б.Л., Коц Е.Д., Кулакова А.М., Лычко Л.А., Миронов В.А., Поляков И.В., Хренова М.Г.
  • • 1 января 2017 - 31 декабря 2019 Моделирование строения и свойств биомолекул для многоцветной флуоресцентной визуализации в живых системах
    • Кафедра физической химии
    • Руководитель: Григоренко Б.Л. Ответственный исполнитель: Хренова М.Г. Участники НИР: Капуста Д.П., Коц Е.Д., Кулакова А.М., Лычко Л.А., Метелешко Ю.И., Миронов В.А., Поляков И.В.
  • • 1 января 2016 - 31 декабря 2020 Строение и динамика атомно-молекулярных систем
    • Кафедра физической химии
    • Руководители: Немухин А.В., Степанов Н.Ф. Ответственный исполнитель: Безруков Д.С. Участники НИР: Абраменков А.В., Абрамович А.И., Агеев Г.Г., Адамсон С.О., Алексеев Е.С., Альтова Е.П., Банару А.М., Батаев В.А., Баум Е.А., Бедняков А.С., Безруков Д.С., Белега Е.Д., Белов А.С., Белова М.В., Богатова Т.В., Богдан Т.В., Бохан Д.А., Боченкова А.В., Бучаченко А.А., Вилкова А.Л., Глебов И.О., Годунов И.А., Головкин А.В., Григоренко Б.Л., Грикина О.Е., Гринева О.В., Давыдова И.Б., Дмитриенко А.О., Дорофеева О.В., Еремин В.В., Ермилов А.Ю., Засурская Л.А., Захарова Т.М., Иванов А.А., Исаева Е.В., Капуста Д.П., Клещина Н.Н., Князева М.А., Ковтун Д.М., Колесникова И.Н., Королева Л.А., Коц Е.Д., Крамаренко С.С., Краснощеков С.В., Кузьменко Н.Е., Кулакова А.М., Курамшина Г.М., Лазарев А.В., Ланшина Л.В., Ларин А.В., Лысенко К.А., Львова Е.Ю., Майорова А.Ф., Макухин Н.Н., Марочкин И.И., Миронов В.А., Митин А.В., Моисеева Н.Ф., Московский А.А., Немухин А.В., Новаковская Ю.В., Осин С.Б., Пазюк Е.А., Панченко Ю.Н., Петров С.В., Пичугина Д.А., Поддубный В.В., Поляков И.В., Прибытков А.В., Пупышев В.И., Рыбаков А.А., Рыжова О.Н., Рыков А.Н., Сенявин В.М., Словохотов Ю.Л., Степанов Н.Ф., Степанова А.В., Татаренко К.А., Терентьев Р.В., Тихонов Д.С., Трубников Д.Н., Тукачев Н.В., Устынюк Л.Ю., Филимонова М.А., Хайкин Л.С., Хренова М.Г., Христенко Л.В., Хрустов В.Ф., Чемлева Т.А., Шергольд И.А., Шишков И.Ф., Щербинин А.В., Яковлев Н.Н.
  • • 1 января 2016 - 31 декабря 2018 Моделирование перспективных вариантов фотоактивных белков методами квантовой теории
    • ИБХФ РАН
    • Руководитель: Немухин А.В. Ответственный исполнитель: Московский А.А. Участники НИР: Анучин Н.М., Коц Е.Д., Лущекина С.В., Поляков И.В.
  • • 12 мая 2015 - 31 декабря 2016 Квантово-химическое моделирование таутомерных превращений аминокислотных остатков с карбоксамидной функциональной группой - аспарагина и глютамина
    • Кафедра физической химии
    • Руководитель: Хренова М.Г. Участники НИР: Григоренко Б.Л., Коц Е.Д., Кулакова А.М., Миронов В.А., Поляков И.В.
  • • 1 января 2014 - 31 декабря 2016 Суперкомпьютерное моделирование молекулярного полиморфизма ферментов человека
    • ИБХФ РАН
    • Руководитель: Немухин А.В. Участники НИР: Григоренко Б.Л., Коц Е.Д., Кулакова А.М., Лычко Л.А., Миронов В.А., Московский А.А., Новичкова Д.А., Поляков И.В., Хренова М.Г.
  • • 1 января 2011 - 31 декабря 2015 Строение и динамика атомно-молекулярных систем
    • Кафедра физической химии
    • Руководитель: Степанов Н.Ф. Участники НИР: Абраменков А.В., Абрамович А.И., Адамсон С.О., Аксенов С.М., Алексеев Е.С., Альтова Е.П., Банару А.М., Батаев В.А., Баум Е.А., Безруков Д.С., Белега Е.Д., Белов А.С., Белова М.В., Богатова Т.В., Богдан Т.В., Бохан Д.А., Боченкова А.В., Бучаченко А.А., Вилкова А.Л., Воронцов А.В., Глебов И.О., Годунов И.А., Головкин А.В., Григоренко Б.Л., Грикина О.Е., Гринева О.В., Давыдова И.Б., Дорофеева О.В., Еремин В.В., Ермилов А.Ю., Засурская Л.А., Иванов А.А., Исаева Е.В., Карасев Н.М., Князева М.А., Ковтун Д.М., Колесникова И.Н., Королева Л.А., Коц Е.Д., Крамаренко С.С., Краснощеков С.В., Кузьменко Н.Е., Курамшина Г.М., Лазарев А.В., Ланшина Л.В., Ларин А.В., Львова Е.Ю., Майорова А.Ф., Макухин Н.Н., Макухин Н.Н., Марочкин И.И., Миронов В.А., Митин А.В., Моисеева Н.Ф., Московский А.А., Немухин А.В., Новаковская Ю.В., Осин С.Б., Пазюк Е.А., Панченко Ю.Н., Петров С.В., Пичугина Д.А., Прибытков А.В., Пупышев В.И., Рыбаков А.А., Рыжова О.Н., Рыков А.Н., Сенявин В.М., Серебренников Л.В., Словохотов Ю.Л., Степанова А.В., Татаренко К.А., Терентьев Р.В., Трубников Д.Н., Тукачев Н.В., Филимонова М.А., Хайкин Л.С., Хренова М.Г., Христенко Л.В., Хрустов В.Ф., Чемлева Т.А., Шергольд И.А., Шишков И.Ф., Щербинин А.В., Яковлев Н.Н.

• Награды и премии

  • • 2017 Стипендия Президента Российской Федерации в 2018-2020 годах для молодых ученых и аспирантов, осуществляющих перспективные научные исследования и разработки по приоритетным направлениям модернизации российской экономики
    • Лауреат: Коц Е.Д.
  • • 2016 Стипендия Московского государственного университета имени М.В. Ломоносова для молодых преподавателей и учёных, добившихся значительных результатов в преподавательской и научной деятельности
    • Лауреат: Коц Е.Д.
    • Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова, Россия

• Диссертация

  • • 2018 Молекулярное моделирование механизмов регуляции активности ферментов человека
    • Кандидатская диссертация по специальности 02.00.17 - Математическая и квантовая химия (физ.-мат. науки)
    • Автор: Коц Екатерина Дмитриевна, к.ф.-м.н.
    • Научный руководитель: Немухин А.В., д.х.н., проф.
    • Защищена в совете МГУ.02.02 МГУ имени М.В. Ломоносова, Химический факультет
    • Организация, в которой выполнялась работа: МГУ имени М.В. Ломоносова
    • Оппоненты: Тихонов Александр Николаевич, Чугунов Антон Олегович, Цирельсон Владимир Григорьевич

• Руководство дипломными работами

  • • 2018 Определение потенциальных сайтов регуляции ферментативной активности на поверхности гуанозинтрифосфат-связывающего белка
    • Научный руководитель: Коц Е.Д.
    • Автор: Савилова Наталия Павловна (Специалист)
  • • 2018 Моделирование конформационных переходов гуанозинтрифосфат-связывающих белков
    • Научный руководитель: Коц Е.Д.
    • Автор: Алания Екатерина Левановна (Специалист)

• Руководство курсовыми работами

  • • 2016 Определение констант протонирования ингибитора АХЭ методом молекулярной динамики
    • Научный руководитель: Коц Е.Д.
    • Автор: Савилова Наталия Павловна (Специалист)
  • • 2015 Определение констант протонирования ингибитора АХЭ методом молекулярной динамики
    • Научный руководитель: Коц Е.Д.
    • Автор: Капуста Д.П., (Специалист)

• Преподавание учебных курсов

  • • 9 сентября 2016 - 23 декабря 2016 Молекулярное моделирование. Часть первая
    • МГУ имени М.В. Ломоносова, Химический факультет, Кафедра физической химии
    • обязательная, по выбору (спецкурс), семинары, 72 часов
  • • 17 ноября 2014 - 31 декабря 2014 Физическая химия
    • МГУ имени М.В. Ломоносова, Химический факультет, Кафедра физической химии
    • обязательная, базовой части, практические занятия, 32 часов
  • • 3 ноября 2014 - 31 декабря 2014 Математические методы в химии
    • МГУ имени М.В. Ломоносова, Химический факультет, Кафедра физической химии
    • обязательная, базовой части, практические занятия, 112 часов

---