ИСТИНА

Макарова Татьяна Михайловна пользователь

кандидат химических наук с 2020 года

Прежние места работы (Нажмите для отображения)

Южно-Уральский государственный университет

Соавторы: Макаров Г.И., Богданов А.А., Коршунова Г.А., Сумбатян Н.В., Терещенков А.Г., Шишкина А.В., Bartashevich E.V., Борисенков И.К., Бородина О.С., Дьяков А.А., Учаева Е.Е.

13 статей, 5 докладов на конференциях, 1 тезисы доклада, 4 НИР, 1 диссертация

Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 28, Scopus: 33

IstinaResearcherID (IRID): 28701430

Деятельность

---

• Статьи в журналах

  • • 2021 Allosteric effects of antibiotics and resistance modifications in the exit tunnel of bacterial ribosome revealed by MD simulations
    • Makarova T.M.
    • в журнале FEBS open bio, издательство John Wiley & Sons Inc. (United States), том 11, № S1, с. 356-356 DOI
  • 
    • 2020 A noncanonical binding site of linezolid revealed via molecular dynamics simulations
    • Makarov G.I., Makarova T.M.
    • в журнале Journal of Computer-Aided Molecular Design, издательство Springer Nature (Switzerland), том 34, с. 281-291 DOI
  • 
    • 2020 Investigation of Allosteric Effect of 2,8-Dimethylation of A2503 in E. coli 23S rRNA by Molecular-Dynamics Simulations
    • Makarova T.M., Makarov G.I.
    • в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 85, № 11, с. 1458-1467 DOI
  • 
    • 2020 Исследование аллостерического эффекта 2,8-диметилирования A2503 23S рРНК E. coli методом молекулярно-динамического моделирования
    • Макарова Т.М., Макаров Г.И.
    • в журнале Биохимия, издательство ИКЦ «Академкнига» (Москва), том 85, № 11, с. 1718-1728
  • 
    • 2019 Allosteric regulation of the ribosomal A site revealed by molecular dynamics simulations
    • Makarova T.M., Bogdanov A.A.
    • в журнале Biochimie, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 167, с. 179-186 DOI
  • 
    • 2018 A noncanonical binding site of chloramphenicol revealed via molecular dynamics simulations
    • Makarov G.I., Makarova T.M.
    • в журнале Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects, том 1862, № 12, с. 2940-2947 DOI
  • 
    • 2017 The ribosome as an allosterically regulated molecular machine
    • Makarova T.M., Bogdanov A.A.
    • в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 82, с. 1557-1571 DOI
  • 
    • 2017 РИБОСОМА КАК АЛЛОСТЕРИЧЕСКИ УПРАВЛЯЕМАЯ МОЛЕКУЛЯРНАЯ МАШИНА
    • МАКАРОВА ТМ, Богданов АА
    • в журнале Успехи биологической химии, том 57, с. 3-32
  • 
    • 2016 INVESTIGATION OF A RIBOSOME USING MOLECULAR-DYNAMICS SIMULATION METHODS
    • MAKAROV G.I., MAKAROVA T.M., SUMBATYAN N.V., BOGDANOV A.A.
    • в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 81, № 13, с. 1579-1588 DOI
  • 
    • 2016 ИССЛЕДОВАНИЕ РИБОСОМЫ МЕТОДАМИ МОДЕЛИРОВАНИЯ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ДИНАМИКИ
    • МАКАРОВ Г.И., МАКАРОВА Т.М., СУМБАТЯН Н.В., БОГДАНОВ А.А.
    • в журнале Успехи биологической химии, том 56, № 13, с. 3-24
  • 
    • 2016 Моделирование взаимодействий производных эритромицина с рибосомой
    • Шишкина А.В., Макарова Т.М., Терещенков А.Г., Макаров Г.И., Коршунова Г.А., Богданов А.А.
    • в журнале Биохимия, издательство ИКЦ «Академкнига» (Москва), том 81, № 1, с. 106-114 DOI
  • 
    • 2015 Modeling interactions of erythromycin derivatives with ribosomes
    • Shishkina A.V., Makarova T.M., Tereshchenkov A.G., Makarov G.I., Korshunova G.A., Bogdanov A.A.
    • в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 80, № 11, с. 1500-1507 DOI

• Статьи в сборниках

  • • 2020 Проблемы молекулярно-динамического моделирования отверждения эпоксидно-диановой смолы ЭД-20
    • Борисенков И.К., Бородина О.С., Дьяков А.А., Учаева Е.Е., Макаров Г.И., Макарова Т.М., Барташевич Е.В.
    • в сборнике Всероссийская научно-техническая конференция «Полимерные композиционные материалы нового поколения для гражданских отраслей промышленности», место издания ФГУП «ВИАМ» Москва, с. 127-137

• Доклады на конференциях

  • • 2021 Allosteric effects of antibiotics and resistance modifications in the exit tunnel of bacterial ribosome revealed by MD simulations (Стендовый)
    • Автор: Makarova T.M.
    • FEBS 2021, Любляна, Словения, 3-7 июля 2021
  • • 2017 Investigation of nascent peptide exit tunnel by means of molecular dynamics simulations (Устный)
    • Авторы: Makarov G.I., Bogdanov A.A., Makarova T.M.
    • Molecular Simulation Studies in Material and Biological Sciences 2017, Петергоф, Россия, Россия, 7-10 сентября 2017
  • • 2017 ALLOSTERIC REGULATION OF tRNAs BINDING TO THE RIBOSOME REVEALED VIA MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS (Стендовый)
    • Автор: Макарова Татьяна Михайловна
    • The X International Conference for Young Chemists “Mendeleev 2017”, Санкт-Петербург, Россия, 3-7 апреля 2017
  • • 2016 MOLECULAR-DYNAMICS STUDY OF ALLOSTRIC PATHWAYS IN BACTERIAL RIBOSOME (Устный)
    • Автор: Макарова Татьяна Михайловна
    • International School-Seminar on Computer-Aided Molecular Design, Казань, Россия, 18-20 мая 2016
  • • 2015 MOLECULAR DYNAMICS STUDY OF ALLOSTERIC SIGNAL TRANSMISSION BETWEEN E-SITE AND ELONGATION FACTOR G BINDING SITE (Стендовый)
    • Автор: Макарова Татьяна
    • Mendeleev- 2015, Санкт-Петербург, Россия, 7-10 апреля 2015

• Тезисы докладов

  • • 2017 ALLOSTERIC REGULATION OF A-tRNA BINDING TO A RIBOSOME REVEALED VIA MOLECULAR DYNAMICS SIMULATION
    • Макарова Т.М., Богданов Алексей Алексеевич
    • в сборнике Сборник тезисов докладов "X Международной конференции молодых ученых по химии "Менделеев 2017", место издания Санкт-Петербург, тезисы, с. 382-382

• НИРы

  • • 18 января 2016 - 31 декабря 2018 Двухсайтовые ингибиторы биосинтеза белка как инструменты изучения механизма трансляции
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Сумбатян Н.В. Участники НИР: Богданов А.А., Коршунова Г.А., Макаров Г.И., Макарова Т.М., Назаров П.А., Ташлицкий В.Н., Терещенков А.Г., Хайруллина З.З., Шилова С.А., Шишкина А.В.
  • • 1 января 2016 - 1 декабря 2020 Структурно-функциональный анализ белков, нуклеиновых кислот и белково-нуклеиновых комплексов как основа для создания синтетических регуляторов экспрессии генов и лекарственных препаратов нового поколения
    • Кафедра химии природных соединений
    • Руководитель: Донцова О.А. Участники НИР: Агапкина Ю.Ю., Анисенко А.Н., Антипова О.М., Баландина Г.Н., Банникова В.А., Бачева А.В., Бизяева А.А., Богданов А.А., Буренина О.Ю., Василькова Д.П., Величко Т.И., Волков Е.М., Воробьева Н.Н., Габибов А.Г., Готманова Н.Н., Громова Е.С., Долинная Н.Г., Евфратов С.А., Елкина Д.А., Завьялова Е.Г., Зацепин Т.С., Зверева М.Э., Кирсанова О.В., Княжанская Е.С., Копылов А.М., Королев С.П., Королева О.Н., Костин Н.Н., Кочетков С.Н., Кузина Е.С., Кузнецова С.А., Лаптев И.Г., Логвина Н.А., Макаров Г.И., Макарова Т.М., Малявко А.Н., Марьясина С.С., Метелев В.Г., Монахова М.В., Никифорова (Абросимова) Л.А., Орецкая Т.С., Остерман И.А., Плетнёв Ф.И., Родина Е.В., Романов Р.С., Рубцова М.П., Руденская Г.Н., Савельев Н.В., Сергеев А.В., Сергеева О.В., Сергиев П.В., Скворцов Д.А., Смирнов И.В., Смирнова И.Г., Сумбатян Н.В., Ташлицкий В.Н., Терехов С.С., Терещенков А.Г., Терещенкова В.Ф., Устинов Н.Б., Филиппова И.Ю., Хайруллина З.З., Храброва Д.А., Чугунова А.А., Шадрина О.А., Шафиков Р.Р., Шпанченко О.В.
  • • 1 января 2013 - 31 декабря 2024 Дизайн и получение антибактериальных веществ на базе структурного анализа рибосомы. ДНК аптамеры - как перспективный класс терапевтических агентов.
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Богданов А.А. Участники НИР: Антохина О.Г., Атрохова А.В., Баранова Е.А., Баринова Н.Н., Головин А.В., Головина А.Я., Дементьева М.А., Донцова О.А., Королева С.В., Коршунова Г.А., Лаптев И.Г., Макаров Г.И., Макарова Т.М., Мельничук А.В., Нарайкина Ю.В., Николаева П.А., Остерман И.А., Петрова О.А., Сергеева О.В., Сергиев П.В., Спиридонова В.А., Терещенков А.Г., Шишкина А.В.
  • • 16 октября 2012 - 31 декабря 2013 Развитие метода поиска новых ингибиторов биосинтеза белка, основанного на знании атомной структуры рибосомы
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Шишкина А.В. Ответственный исполнитель: Терещенков А.Г. Участники НИР: Макаров Г.И., Макарова Т.М., Сергеева В.А.

• Диссертация

  • • 2020 Исследование аллостерических явлений в бактериальной рибосоме методом молекулярно-динамического моделирования
    • Кандидатская диссертация по специальности 02.00.10 - Биоорганическая химия (хим. науки)
    • Автор: Макарова Татьяна Михайловна, к.х.н.
    • Научный руководитель: Богданов Алексей Алексеевич, д.х.н., проф., акад. РАН, МГУ имени М.В. Ломоносова
    • Защищена в совете МГУ.014.2(МГУ.02.03) МГУ имени М.В. Ломоносова, Химический факультет
    • Организация, в которой выполнялась работа: МГУ имени М.В. Ломоносова
    • Оппоненты: Малыгин Алексей Аркадьевич, Миронов Андрей Александрович, Никулин Алексей Донатович

---