ИСТИНА

Софронова Алина Андреевна пользователь

МГУ имени М.В. Ломоносова, Факультет биоинженерии и биоинформатики, аспирант, с 1 октября 2019

Соавторы: Ivanenkov Y.A., Yamidanov R.S., Донцова О.А., Остерман И.А., Сергиев П.В., Aladinskaya A.V., Комарова Е.С., Безруков Д.С., Скворцов Д.А., Терентьев В.А., Veselov M.S., Айгинин А.А., Мачулкин А.Э. показать полностью..., Aladinskiy V.A., Baimiev A.K., Deyneka E., Filkov G.I., PUCHNINA E., Мажуга А.Г., Петров Р.А., Семенюк П.И., Муронец В.И., Koteliansky V., Vakhitova Y.V., Зикеева Е.О., Лукьянов Д.А., Малышев А.С., Трофименко А.В., Чемерис А.С., Изумрудов В.А., Kartsev V.G., Maviza T.P., Белоглазкина Е.К., Бирюков М.В., Гаранина А.С., Евстафьева Д.Б., Загрибельный Б.А., Закалюкина Ю.В., Зык Н.В., Иваненков Я.А., Киреев И.И., Маклакова С.Ю., Успенская А.А., Ширяев Д.И., Ямансаров Э.Ю., Aladinskaya A., Beloglazkin E.K., Kalinina M.A., Khven I.M., Kovalyev S.V., Malyshev A.N., Saltykova I.V., Sergeeva O.V., Shvets K., VV, Vorobyeva N.S., vv k.n., Алиева И.Б., Баринова К.В., Безрук И.А., Богданов А.А., Воробьева Н.А., Жаворонков А.И., З Г., Зацепин Т.С., Иваненко Ю.А., Ковалев С.В., Маклаков С.А., Марина В.И., Матниязов Р.Т., Новоторцев В.К., Петров С.А., Петров С.А., Поздышев Д.В., Пушин А.Н., Рябых Г.К., Салтыков Е.Г., Сергеева О.В., Скворцов Д.В., Филатов В.Е.

21 статья, 6 докладов на конференциях, 1 тезисы доклада, 3 НИР, 1 диссертация

Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 76, Scopus: 99

IstinaResearcherID (IRID): 55848460

Деятельность

• Статьи в журналах

  • • Synthesis and biological evaluation of novel dispiro-oxindoles with anticancer activity
    • Kukushkin Maksim E., Beloglazkina Elena K., Skvortsov Dmitry A., Dontsova Olga A., Zyk Nikolay V., Filkov Gleb I., Ayginin Andrey A., Veselov Mark S., Filatov Vadim E., Novotortsev Vladimir K., Yamidanov Renat S., Shafikov Radik R., Kalinina Marina A., Sofronova Alina A., Majouga Alexander G.
    • в журнале Bioorganic and Medicinal Chemistry, издательство Pergamon Press Ltd. (United Kingdom)
  • 
    • 2021 Glycation of glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase inhibits the binding with α-synuclein and RNA
    • Sofronova Alina A., Pozdyshev Denis V., Barinova Kseniya V., Muronetz Vladimir I., Semenyuk Pavel I.
    • в журнале Archives of Biochemistry and Biophysics, издательство Academic Press (United States), том 698 DOI
  • 
    • 2021 Nybomycin inhibits both types of E. coli DNA gyrase – fluoroquinolone-sensitive and fluoroquinolone-resistant
    • Shiriaev Dmitrii I., Sofronova Alina A., Berdnikovich Ekaterina A., Lukianov Dmitrii A., Komarova Ekaterina S., Marina Valeria I., Zakalyukina Yuliya V., Biryukov Mikhail V., Maviza Tinashe P., Ivanenkov Yan A., Sergiev Petr V., Osterman Ilya A., Dontsova Olga A.
    • в журнале Antimicrobial Agents and Chemotherapy, издательство American Society for Microbiology (United States), с. 1-13 DOI
  • 
    • 2020 Identification of pyrrolo-pyridine derivatives as novel class of antibacterials
    • Veselov Mark S., Ivanenkov Yan A., Yamidanov Renat S., Osterman Ilya A., Sergiev Petr V., Aladinskiy Vladimir A., Aladinskaya Anastasia V., Terentiev Victor A., Ayginin Andrey A., Skvortsov Dmitry A., Komarova Katerina S., Chemeris Alexey V., Baimiev Alexey Kh, Sofronova Alina A., Machulkin Alexey E., Petrov Rostislav A., Maklakova Svetlana Yu, Bezrukov Dmitry S., Filkov Gleb I., Zainullina Liana F., Maximova Marina A., Zileeva Zulfiya R., Kartsev Victor G., Vakhitova Yulia V., Dontsova Olga A.
    • в журнале Molecular Diversity, издательство Springer Nature (Switzerland), том 24, № 1, с. 233-239 DOI
  • 
    • 2020 Tetrahydrocarbazoles as Novel Class of DNA Biosynthesis Inhibitors in Bacteria
    • Ivanenkov Yan A., Osterman Ilya A., Komarova Ekaterina S., Bogdanov Alexey A., Sergiev Petr V., Dontsova Olga A., Sofronova Alina A., Terentiev Victor A., Filkov Gleb I., Yamidanov Renat S., Majouga Alexander G., Bezrukov Dmitry S., Deyneka Ekaterina V., Skvortsov Dmitry A.
    • в журнале Anti-Infective Agents in Medicinal Chemistry, издательство Bentham Science Publishers (Netherlands), том 18, № 2, с. 121-127 DOI
  • • 2020 Влияние гликирования на взаимодействие глицеральдегид-3-фосфат-дегидрогеназы с партнерами, вовлеченными в развитие нейродегенерации
    • Семенюк П.И., Софронова а.а.
    • в журнале Гены и клетки, издательство Общество с ограниченной ответственностью «Гены и Клетки» (Москва), том 15, № 3, с. 174
  • 
    • 2019 2-Pyrazol-1-yl-thiazole derivatives as novel highly potent antibacterials
    • Ivanenkov Yan A., Yamidanov Renat S., Osterman Ilya A., Sergiev Petr V., Aladinskiy Vladimir A., Aladinskaya Anastasia V., Terentiev Victor A., Veselov Mark S., Ayginin Andrey A., Skvortsov Dmitry A., Komarova Katerina S., Sadovnikov Sergey V., Rustam Matniyazov, Sofronova Alina A., Malyshev Alexander S., Machulkin Alexey E., Petrov Rostislav A., Dmitrii Lukianov, Svetlana Iarovenko, Bezrukov Dmitry S., Baymiev Andrey Kh, Dontsova Olga A.
    • в журнале Journal of Antibiotics, издательство Japan Antibiotics Research Association/Nihon Koseibusshitsu Gakujutsu Kyogikai (Japan), том 72, с. 827-833 DOI
  • 
    • 2019 DNA replication machinery and topoisomerases – good targets for new antibiotics development
    • OstermanI I., Shiriaev D., Sofronova A., Khven I., Lukianov D., Komarova E., Zakalyukina Y., Maviza T., Birykov M., Ivanenkov Y., Sergiev P., Dontsova O.
    • в журнале FEBS open bio, издательство John Wiley & Sons Inc. (United States), том 9, с. 149-149 DOI
  • 
    • 2019 Identification of N-Substituted Triazolo-azetidines as Novel Antibacterials using pDualrep2 HTS Platform
    • Ivanenkov Yan A., Yamidanov Renat S., Osterman Ilya A., Sergiev Petr V., Aladinskiy Vladimir A., Aladinskaya Anastasia V., Terentiev Victor A., Veselov Mark S., Ayginin Andrey A., Skvortsov Dmitry A., Komarova Katerina S., Chemeris Alexey V., Baimiev Alexey Kh, Sofronova Alina A., Malyshev Alexander S., Machulkin Alexey E., Petrov Rostislav A., Bezrukov Dmitry S., Filkov Gleb I., Puchinina Maria M., Zainullina Liana F., Maximova Marina A., Zileeva Zulfiya R., Vakhitova Yulia V., Dontsova Olga A.
    • в журнале Combinatorial Chemistry and High Throughput Screening, издательство Bentham Science Publishers (Netherlands), том 22, № 5, с. 346-354 DOI
  • 
    • 2019 Identification of Novel Antibacterials Using Machine Learning Techniques
    • Ivanenkov Yan A., Zhavoronkov Alex, Yamidanov Renat S., Osterman Ilya A., Sergiev Petr V., Aladinskiy Vladimir A., Aladinskaya Anastasia V., Terentiev Victor A., Veselov Mark S., Ayginin Andrey A., Kartsev Victor G., Skvortsov Dmitry A., Chemeris Alexey V., Baimiev Alexey Kh, Sofronova Alina A., Malyshev Alexander S., Filkov Gleb I., Bezrukov Dmitry S., Zagribelnyy Bogdan A., Putin Evgeny O., Puchinina Maria M., Dontsova Olga A.
    • в журнале Frontiers in pharmacology, издательство Frontiers Media] ([Lausanne, Switzerland), том 10, с. e913 DOI
  • • 2019 Large-scale high-throughput screening revealed 5'-(carbonylamino)-2,3'-bithiophene-4'-carboxylate as novel template for antibacterial agents
    • Ivanenkov YA, Yamidanov RS, Osterman IA, Sergiev PV, Aladinskiy VA, Aladinskaya AV, Terentiev VA, Veselov MS, Ayginin AA, Skvortsov DA, Komarova ES, Zagribelnyy BA, Baimiev AK, Shvetc KY, Sofronova AA, Machulkin AE, Petrov RA, Zainullina LF, Maximova MA, Zileeva ZR, Vakhitova YV, Bezrukov DS, Puchinina MM, Dontsova OA
    • в журнале Current Drug Discovery Technologies, издательство Bentham Science Publishers (Netherlands) DOI
  • 
    • 2019 N-Pyridyl-Substituted Carboxypiperidine Amides: A New Class of Prokaryote Translation Inhibitors
    • Ivanenkov Ya A., Komarova (Andreyanova) E.S., Osterman I.A., Sergiev P.V., Yamidanov R.S., Deineka E.V., Terent’ev V.A., Fil’kov G.I., Sofronova A.A., Mazhuga A.G., Dontsova O.A.
    • в журнале Pharmaceutical Chemistry Journal, издательство Kluwer Academic/Plenum Publishers (United States), том 53, № 3, с. 225-229 DOI
  • 
    • 2019 Substituted Furanocoumarins as Novel Class of Antibacterial Translation Inhibitors
    • Ivanenkov Yan A., Yamidanov Renat S., Osterman Ilya A., Sergiev Petr V., Ayginin Andrey A., Aladinskiy Vladimir A., Aladinskaya Anastasia V., Terentiev Victor A., Veselov Mark S., Skvortsov Dmitry A., Komarova Katerina S., Chemeris Alexey V., Zainullina Liana F., Maximova Marina A., Zileeva Zulfiya R., Vakhitova Yulia V., Baimiev Alexey Kh, Sofronova Alina A., Machulkin Alexey E., Petrov Rostislav A., Bezrukov Dmitry S., Puchinina Maria M., Dmitrii Lukianov A., Dontsova Olga A.
    • в журнале Combinatorial Chemistry and High Throughput Screening, издательство Bentham Science Publishers (Netherlands), том 22, № 6, с. 400-410 DOI
  • 
    • 2019 Synthesis and Biological Evaluation of Doxorubicin-containing Conjugate targeting PSMA
    • Ivanenkov Yan, Machulkin Alexey, Garanina Anastasia, Skvortsov Dmitry, Uspenskaya Anastasia, Deyneka Ekaterina, Alexander Trofimenko, Beloglazkina Elena, Zyk Nikolay, Koteliansky Victor, Bezrukov Dmitry, Aladinskaya Anastasia, Vorobyeva Nataliya, Puchinina Maria, Riabykh Grigory, Sofronova Alina, Malyshev Alexander, Majouga Alexander
    • в журнале Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters, издательство Pergamon Press Ltd. (United Kingdom), том 29, № 10, с. 1246-1255 DOI
  • 
    • 2019 Synthesis and biological evaluation of Doxorubicin-containing conjugate targeting PSMA
    • Ivanenkov Yan A., Machulkin Alexey E., Garanina Anastasia S., Skvortsov Dmitry A., Uspenskaya Anastasia A., Deyneka Ekaterina, V, Trofimenko Alexander, V, Beloglazkin Elena K., Zyk Nikolay, V, Koteliansky Victor E., Bezruko Dmitry S., Aladinskaya Anastasia V., Vorobyeva Nataliya S., Puchinina Maria M., Ryabykh Grigory K., Sofronova Alina A., Malyshev Alexander S., Majouga Alexander G.
    • в журнале Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters, издательство Pergamon Press Ltd. (United Kingdom), том 29, № 10, с. 1246-1255 DOI
  • 
    • 2019 The influence of beta-casein glycation on its interaction with natural and synthetic polyelectrolytes
    • Sofronova Alina, Semenyuk Pavel, Muronetz Vladimir
    • в журнале Food Hydrocolloids, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 89, с. 425-433 DOI
  • 
    • 2018 Synthesis and Biological Evaluation of Novel Mono- and Bivalent ASGP-R-targeted Drug-conjugates
    • Petrov Rostislav A., Maklakova Svetlana Yu, Ivanenkov Yan A., Petrov Stanislav A., Sergeeva Olga V., Yamansarov Emil Yu, Saltykova Irina V., Kireev Igor I., Alieva Irina B., Deyneka Ekaterina V., Sofronova Alina A., Aladinskaia Anastasiia V., Trofimenko Alexandre V., Yamidanov Renat S., Kovalev Sergey V., Kotelianski Victor E., Zatsepin Timofey S., Beloglazkina Elena K., Majouga Alexander G.
    • в журнале Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters, издательство Pergamon Press Ltd. (United Kingdom), том 28, № 3, с. 382-387 DOI
  • 
    • 2017 Protein-polyelectrolyte complexes: Molecular dynamics simulations and experimental study
    • Sofronova Alina A., Evstafyeva Diana B., Izumrudov Vladimir A., Muronetz Vladimir I., Semenyuk Pavel I.
    • в журнале Polymer, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 113, с. 39-45 DOI
  • 
    • 2017 Similarly charged polyelectrolyte can be the most efficient suppressor of the protein aggregation
    • Sofronova Alina A., Izumrudov Vladimir A., Muronetz Vladimir I., Semenyuk Pavel I.
    • в журнале Polymer, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 108, с. 281-287 DOI
  • • 2017 Synthesis and Biological Evaluation of Novel Mono- and Bivalent ASGP-R-targeted Drug-conjugates
    • Петров Р.А., Маклакова С.Ю., Иваненков Ю.А., Петров С.А., Сергеева О.В., Ямансаров Е.Ю., Салтыкова И.В., Киреев И.И., Алиева И.Б., Дейнека Е.В., Софронова А.А., Аладинская А.В., Трофименко А.В., Ямиданов Р.С., Ковалев С.В., Котельянский В.Е.
    • в журнале Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters, издательство Pergamon Press Ltd. (United Kingdom) DOI
  • • 2016 Белок-полиэлектролитные комплексы для контроля функционального состояния и агрегации фермента
    • Семенюк П.И., Софронова А.А., Евстафьева Д.Б., Изумрудов В.А., Муронец В.И.
    • в журнале Acta Naturae (русскоязычная версия), издательство Парк-медиа (М.), том 2, с. 100-101

• Доклады на конференциях

  • • 2020 Влияние гликирования на взаимодействие глицеральдегид-3-фосфат-дегидрогеназы с партнерами, вовлеченными в развитие нейродегенерации (Приглашенный)
    • Авторы: Семенюк П.И., Софронова А.А.
    • VII Молодёжная школа-конференция по молекулярной и клеточной биологии Института цитологии РАН, Санкт-Петербург, Россия, 12-15 октября 2020
  • • 2019 Роль пост-трансляционных модификаций белков, связанных с изменением заряда, в белок-белковых взаимодействиях (Устный)
    • Авторы: Семенюк П.И., Софронова А.А., Муронец В.И.
    • II Объединенный научный форум, включающий VI Cъезд физиологов СНГ, VI Съезд биохимиков России и IX Российский симпозиум «Белки и пептиды», Дагомыс, Россия, 1-6 октября 2019
  • • 2018 Modeling of protein interaction with charged polymers: from model polymers and nucleic acids to posttranslational modifications of amyloid proteins (Устный)
    • Авторы: Pavel Semenyuk, Alina Sofronova, Ivan Skakov, Vladimir Muronetz
    • 14th Rencontres du Vietnam: Computational Biophysics at the Molecular and Mesoscales, Куинен, Вьетнам, 27-31 октября 2018
  • • 2017 The influence of glycation of beta-casein on its interaction with natural and synthetic polyelectrolytes (Стендовый)
    • Авторы: Sofronova A.A., Semenyuk P.I., Muronetz V.I.
    • 11-я Международная конференция Биокатализ-2017, Москва, Россия, 25-30 июня 2017
  • • 2016 Белок-полиэлектролитные комплексы для контроля функционального состояния и агрегации фермента (Устный)
    • Авторы: Семенюк П.И., Евстафьева Д.Б., Изумрудов В.А., Муронец В.И., Софронова А.А.
    • V Съезд физиологов СНГ, V Съезд Биохимиков России, Сочи, Россия, 4-8 октября 2016
  • • 2016 Полиэлектролиты как универсальный инструмент для подавления агрегации белков (Стендовый)
    • Автор: Софронова А.А.
    • XXVIII Зимняя молодежная научная школа "Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии", Институт Биоорганической Химии РАН, Россия, 8-11 февраля 2016

• Тезисы докладов

  • • 2016 Полиэлектролиты как универсальный инструмент для подавления агрегации белков
    • Софронова А.А.
    • в сборнике Материалы XXVIII Зимней молодежной научной школы «Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии», 8-11 февраля 2016, Москва, место издания Москва, тезисы, с. 70-70

• НИРы

  • • 20 ноября 2019 - 1 декабря 2021 Полиэлектролитные комплексы для адресной доставки белков и нуклеиновых кислот
    • Отдел биохимии животной клетки
    • Руководитель: Семенюк П.И. Участники НИР: Баринова К.В., Курочкина Л.П., Поздышев Д.В., Сорокина С.А., Софронова А.А.
  • • 1 июля 2019 - 30 июня 2021 Роль пост-трансляционных модификаций белков, связанных с изменением заряда, в белок-белковых взаимодействиях
    • Отдел биохимии животной клетки
    • Руководитель: Семенюк П.И. Участник НИР: Софронова А.А.
  • • 1 января 2015 - 31 декабря 2017 Исследование механизмов контроля амилоидогенных превращений белков, вызывающих нейродегенеративные заболевания, с помощью линейных и дендримерных полиэлектролитов
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Семенюк П.И. Участники НИР: Баринова К.В., Евстафьева Д.Б., Кудрявцева С.С., Куравский М.Л., Мараховская А.С., Мичурина В.Н., Сорокина С.А., Софронова А.А.

• Диссертация

  • • 2022 Взаимодействие белков с синтетическими и природными полиэлектролитами и влияние на него посттрансляционных модификаций
    • Кандидатская диссертация по специальности 03.01.08 - Биоинженерия (биол. науки)
    • Автор: Софронова Алина Андреевна, МГУ имени М.В. Ломоносова
    • Научный руководитель: Семенюк Павел Игоревич, к.б.н., МГУ имени М.В. Ломоносова
    • Защищена в совете МГУ.015.10(03.04) МГУ имени М.В. Ломоносова, Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Организация, в которой выполнялась работа: МГУ имени М.В. Ломоносова
    • Оппоненты: Левицкий Дмитрий Иванович, Митькевич Владимир Александрович, Цветков Владимир Борисович