ИСТИНА

Шульга Дмитрий Александрович пользователь

МГУ имени М.В. Ломоносова, Химический факультет, Кафедра медицинской химии и тонкого органического синтеза, НИЛ медицинской химии, старший научный сотрудник, с 1 июня 2023

кандидат химических наук с 2009 года

Прежние места работы (Нажмите для отображения)

Соавторы: Палюлин В.А., Зефиров Н.С., Титов О.И., Кудрявцев К.В., Писарев С.А., Иванов Н.Н., Chupakhin V.I., Безруков Д.С., Шаймарданов А.Р., Осолодкин Д.И., Вацадзе С.З., Олиференко А.А., Datsuk N.G. показать полностью..., Fedorov M., Oliferenko A.A., Гусейнов А.Д., Заболотнев Д.В., Зарянова Е.В., Иванцова П.М., Карлов Д.С., Лозинская Н.А., Царева Д.А., Чупахин В.И., Ayan S., Dogan O., Guh J.H., Haojie Y., Ivanov N.N., Oliferenko A.A., Shulga T.N., Sitnikov G.V., Tarasov D.N., Vatsadze I.A., Wang S., Атауллаханов Ф.И., Безнос О.В., Безнос О.В., Бучаченко А.А., Коротаев А.В., Корчагина К.А., Логинова Ю.Д., Рощина Т.М., Синауридзе Е.И., Чернов Д.Д., Чеснокова Н.Б., Чеснокова Н.Б.

33 статьи, 35 докладов на конференциях, 28 тезисов докладов, 14 НИР, 1 патент, 1 диссертация, 7 дипломных работ

Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 113, Scopus: 120
РИНЦ:

IstinaResearcherID (IRID): 7892104

ResearcherID: P-4451-2014

ORCID: 0000-0001-6001-1295

Деятельность

---

• Статьи в журналах

  • 
    • 2023 Decomposition of Small Molecules for Fragment-Based Drug Design
    • Ivanov Nikita N., Shulga Dmitry A., Palyulin Vladimir A.
    • в журнале Biophysica, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 3, № 2, с. 362-372 DOI
  • • 2023 On hidden anisotropy of formally charged fragments
    • Shaimardanov Arslan R., Shulga Dmitry A., Palyulin Vladimir A.
    • в журнале Journal of Computational Chemistry, издательство John Wiley & Sons Inc. (United States), том 44, № 13, с. 1312-1315 DOI
  • 
    • 2022 Assessing How Residual Errors of Scoring Functions Correlate to Ligand Structural Features
    • Shulga Dmitry A., Shaimardanov Arslan R., Ivanov Nikita N., Palyulin Vladimir A.
    • в журнале International Journal of Molecular Sciences, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 23, № 23, с. 15018 DOI
  • 
    • 2022 In Silico Structure-Based Approach for Group Efficiency Estimation in Fragment-Based Drug Design Using Evaluation of Fragment Contributions
    • Shulga Dmitry A., Ivanov Nikita N., Palyulin Vladimir A.
    • в журнале Molecules, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 27, № 6, с. 1985 DOI
  • 
    • 2022 Investigation of the tight binding mechanism of a new anticoagulant DD217 to factor Xa by means of molecular docking and molecular dynamics
    • Shulga Dmitry A., Tserkovnikova Natalia A., Tarasov Dmitry N., Tovbin Dmitry G.
    • в журнале Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, издательство Adenine Press (United States), с. 1-11 DOI
  • • 2022 Is an Inductive Effect Explicit Account Required for Atomic Charges Aimed at Use within the Force Fields?
    • Shaimardanov Arslan R., Shulga Dmitry A., Palyulin Vladimir A.
    • в журнале The Journal of Physical Chemistry A: Molecules, Clusters, and Aerosols, издательство American Chemical Society (United States), том 126, № 36, с. 6278-6294 DOI
  • 
    • 2022 Theoretical Studies of Leu-Pro-Arg-Asp-Ala Pentapeptide (LPRDA) Binding to Sortase A of Staphylococcus aureus
    • Shulga Dmitry A., Kudryavtsev Konstantin V.
    • в журнале Molecules, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 27, № 23, с. 1-26 DOI
  • 
    • 2021 Reverse fragment based drug discovery approach via simple estimation of fragment contributions
    • Shulga D.A., Ivanov N.N., Palyulin V.A.
    • в журнале Mendeleev Communications, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 31, № 3, с. 291-293 DOI
  • 
    • 2021 Selection of Promising Novel Fragment Sized S. aureus SrtA Noncovalent Inhibitors Based on QSAR and Docking Modeling Studies
    • Shulga Dmitry A., Kudryavtsev Konstantin V.
    • в журнале Molecules, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 26, № 24, с. 7677 DOI
  • 
    • 2020 Anisotropic electrostatic models of nitrogen and phosphorus: the variation and the interpretability of the electrostatic parameters in response to structure variation
    • Shulga D.A., Shaimardanov A.R., Palyulin V.A.
    • в журнале Mendeleev Communications, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 30, № 6, с. 741-743 DOI
  • • 2019 Computational characterization of the glutamate receptor antagonist perampanel and its close analogs: density functional exploration of conformational space and molecular docking study
    • Guseynov Abdul-Akim D., Pisarev Sergey A., Shulga Dmitry A., Palyulin Vladimir A., Fedorov Maxim V., Karlov Dmitry S.
    • в журнале Journal of Molecular Modeling, издательство Springer Verlag (Germany), том 25, с. 312 DOI
  • 
    • 2019 Iterative solvers for empirical partial atomic charges: breaking the curse of cubic numerical complexity
    • Shaymardanov Arslan, Shulga Dmitry A., Palyulin Vladimir A.
    • в журнале Journal of Chemical Information and Modeling, издательство American Chemical Society (United States), том 59, № 4, с. 1434-1443 DOI
  • 
    • 2019 Lone pairs vs. covalent bonds: conformational effects in bicyclo[3.3.1]nonane derivatives
    • Pisarev Sergey A., Shulga Dmitry A., Palyulin Vladimir A., Zefirov Nikolay S.
    • в журнале Structural Chemistry, издательство Springer-Verlag (Heidelberg, Germany), том 30, № 2, с. 509-522 DOI
  • 
    • 2019 Quadrupole Correction: From Molecular Electrostatic Potential to Free Energies of Halogen Bonding
    • Titov Oleg I., Shulga Dmitry A., Palyulin Vladimir A.
    • в журнале Journal of Chemical Theory and Computation, издательство American Chemical Society (United States), том 15, № 2, с. 1159-1167 DOI
  • 
    • 2018 Multipole models of sulphur for accurate anisotropic electrostatic interactions within force fields
    • Shulga D.A., Titov O.I., Pisarev S.A., Palyulin V.A.
    • в журнале SAR and QSAR in Environmental Research, издательство Taylor & Francis (United Kingdom), том 29, № 1, с. 21-42 DOI
  • 
    • 2016 Computer modeling of ferrocene-substituted 3,7-diazabicyclo[3.3.1]nonanes as serine proteases inhibitors
    • Vatsadze Sergey Z., Shulga Dmitry A., Loginova Yulia D., Vatsadze Irina A., Wang Li, Haojie Yu, Kudryavtsev Konstantin V.
    • в журнале Mendeleev Communications, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 26, с. 212-213 DOI
  • 
    • 2016 Quadrupole correction for halogen bonding description in virtual screening and molecular docking
    • Titov O.I., Shulga D.A., Palyulin V.A., Zefirov N.S.
    • в журнале Doklady Chemistry, издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 471, № 1, с. 338-342 DOI
  • • 2016 Квадрупольная поправка для описания галогенового связывания в виртуальном скрининге и молекулярном докинге
    • Титов О.И., Шульга Д.А., Палюлин В.А., Зефиров Н.С.
    • в журнале Доклады Академии наук, издательство ФГБУ "Издательство "Наука" (Москва), том 471, № 3, с. 307-311 DOI
  • 
    • 2015 Perspectives of Halogen Bonding Description in Scoring Functions and QSAR/QSPR: Substituent Effects in Aromatic Core
    • Titov Oleg I., Shulga Dmitry A., Palyulin Vladimir A., Zefirov Nikolay S.
    • в журнале Molecular informatics, издательство Wiley-VCH Verlag (Weinheim, Germany, Germany), том 34, № 6-7, с. 404-416 DOI
  • 
    • 2014 Synthesis of novel bridged dinitrogen heterocycles and their evaluation as potential fragments for the design of biologically active compounds
    • Kudryavtsev Konstantin V., Shulga Dmitry A., Chupakhin Vladimir I., Sinauridze Elena I., Ataullakhanov Fazly I., Vatsadze Sergey Z.
    • в журнале Tetrahedron, издательство Pergamon Press Ltd. (United Kingdom), том 70, № 43, с. 7854-7864 DOI
  • 
    • 2013 Asymmetric synthesis and molecular docking study of enantiomerically pure pyrrolidine derivatives with potential antithrombin activity
    • Ayan S., Dogan O., Ivantсova P.M., Datsuk N.G., Shulga D.A., Chupakhin V.I., Zabolotnev D.V., Kudryavtsev K.V.
    • в журнале Tetrahedron Asymmetry, издательство Pergamon Press Ltd. (United Kingdom), том 24, № 13-14, с. 838-843 DOI
  • 
    • 2013 Description of Halogen Bonding on the Basis of Multicenter Multipole Expansion
    • Titov O.I., Shulga D.A., Palyulin V.A., Zefirov N.S.
    • в журнале Doklady Chemistry, издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 450, № Part 1, с. 139-143 DOI
  • • 2013 Описание галогенового связывания на основе многоцентрового мультипольного разложения
    • Титов О.И., Шульга Д.А., Палюлин В.А., Зефиров Н.С.
    • в журнале Доклады Академии наук, издательство ФГБУ "Издательство "Наука" (Москва), том 450, № 3, с. 299-303 DOI
  • 
    • 2012 Simulation of Intramolecular Hydrogen Bond Dynamics in Manzamine A as a Sensitive Test for Charge Distribution Quality
    • Shulga D.A., Osolodkin D.I., Palyulin V.A., Zefirov N.S.
    • в журнале Natural product communications, издательство Natural Product Communications (United States), том 7, № 3, с. 295-299
  • 
    • 2011 Design of small-molecule thrombin inhibitors based on the cis-5-phenylproline scaffold
    • Kudryavtsev K.V., Shulga D.A., Chupakhin V.I., Churakov A.V., Datsuk N.G., Zabolotnev D.V., Zefirov N.S.
    • в журнале Russian Chemical Bulletin, издательство Springer Nature (Switzerland), том 60, № 4, с. 685-693 DOI
  • 
    • 2011 General Purpose Electronegativity Relaxation Charge Models Applied to CoMFA and CoMSIA Study of GSK-3 Inhibitors
    • Tsareva Daria A., Osolodkin Dmitry I., Shulga Dmitry A., Oliferenko Alexander A., Pisarev Sergey A., Palyulin Vladimir A., Zefirov Nikolay S.
    • в журнале Molecular informatics, издательство Wiley-VCH Verlag (Weinheim, Germany, Germany), том 30, № 2-3, с. 169-180 DOI
  • 
    • 2010 Interaction of manzamine A with glycogen synthase kinase 3 beta: a molecular dynamics study
    • Osolodkin D.I., Shulga D.A., Palyulin V.A., Zefirov N.S.
    • в журнале Russian Chemical Bulletin, издательство Springer Nature (Switzerland), том 59, № 10, с. 1983-1993 DOI
  • 
    • 2010 The choice of atomic charges calculation scheme in 3D-QSAR modelling of GSK-3β inhibition by paullones
    • Osolodkin D.I., Shulga D.A., Tsareva D.A., Oliferenko A.A., Palyulin V.A., Zefirov N.S.
    • в журнале Doklady Biochemistry and Biophysics, издательство M A I K Nauka - Interperiodica (Russian Federation), том 434, № 1, с. 274-278 DOI
  • 
    • 2008 Fast tools for calculation of atomic charges well suited for drug design
    • Shulga D.A., Oliferenko A.A., Pisarev S.A., Palyulin V.A., Zefirov N.S.
    • в журнале SAR and QSAR in Environmental Research, издательство Taylor & Francis (United Kingdom), том 19, № 1-2, с. 153-165 DOI
  • 
    • 2008 Parameterization of empirical schemes of partial atomic charge calculation for reproducing the molecular electrostatic potential
    • Shulga D.A., Oliferenko A.A., Pisarev S.A., Palyulin V.A., Zefirov N.S.
    • в журнале Doklady Chemistry, издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 419, с. 57-61 DOI
  • 
    • 2006 Modeling of atomic RESP charges with the use of topological calculation schemes
    • Shul'ga D.A., Oliferenko A.A., Pisarev S.A., Palyulin V.A., Zefirov N.S.
    • в журнале Doklady Chemistry, издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 408, с. 76-79 DOI

• Статьи в сборниках

  • 
    • 2013 Anisotropic electrostatics approaches in description of halogen bonding within intermolecular potentials
    • Titov O.I., Shulga D.A., Palyulin V.A., Zefirov N.S.
    • в сборнике In MODELS IN BIOSCIENCE AND MATERIALS RESEARCH: MOLECULAR DYNAMICS AND RELATED TECHNIQUES, место издания Nova Science Publishers, Inc United States, с. 49-70
  • 
    • 2010 A route to molecular electrostatics through atomic charges generated by means of fast and robust empirical schemes
    • Shulga D.A., Oliferenko A.A., Pisarev S.A., Palyulin V.A., Zefirov N.S.
    • в сборнике Electrostatics: Theory and Applications, издательство Nova Science Publishers (Hauppauge, NY, United States), с. 309-324

• Доклады на конференциях

  • • 2023 Отбор перспективных мод связывания соединений хитов на основании вкладов фрагментов (Стендовый)
    • Авторы: Чернов Д.Д., Иванов Н.Н., Шульга Д.А.
    • XXX Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых учёных «Ломоносов-2023», г. Москва, МГУ имени М.В. Ломоносова, Россия, 10-21 апреля 2023
  • • 2023 Оценка значимости явного учёта эффекта поляризации в эмпирических методах расчёта зарядов (Стендовый)
    • Авторы: Фролов В.С., Шаймарданов А.Р., Шульга Д.А., Палюлин В.А.
    • XXX МЕЖДУНАРОДНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ СТУДЕНТОВ, АСПИРАНТОВ И МОЛОДЫХ УЧЁНЫХ «ЛОМОНОСОВ», Московский государственный университет имени М.В.Ломоносова, Россия, 10-21 апреля 2023
  • • 2022 The Philosophy And Prospects Of Fragment Contribution Estimations In Drug Discovery (Устный)
    • Авторы: Shulga Dmitry A., Ivanov Nikita N., Palyulin Vladimir A.
    • BIOINFORMATICS AND COMPUTER-AIDED DRUG DISCOVERY, Москва, Россия, 24-26 мая 2022
  • • 2022 Systematic in silico exploration of chemical space around drug candidate DD217, a potent anticoagulant targeting factor Xa (Устный)
    • Авторы: Shulga Dmitry A., Tserkovnikova Natalia A., Tarasov Dmitry N., Tovbon Dmitry G.
    • 5-я Российская конференция МедХим-Россия 2021, Волгоград, Россия, 16-19 мая 2022
  • • 2021 IN SILICO ИССЛЕДОВАНИЕ СТРУКТУРНЫХ ДЕТЕРМИНАНТ СВЯЗЫВАНИЯ DD-217 С АНТИКОАГУЛЯНТНОЙ МИШЕНЬЮ FXA (Устный)
    • Авторы: Шульга Д.А., Церковникова Н.А., Тарасов Д.Н., Товбин Д.Г.
    • VII Междисциплинарная конференция Молекулярные и биологические аспекты химии, фармацевтики и фармакологии МОБИ-ХимФарма 2021, г. Москва, Россия, 12-14 октября 2021
  • • 2020 Анализ вклада бензазепинового скаффолда в связывание с SrtA s. Aureus при моделировании и разработке потенциальных ингибиторов (Стендовый)
    • Авторы: Шульга Д.А., Иванцова П.М., Кудрявцев К.В.
    • VI Междисциплинарная конференция "Молекулярные и биологические аспекты химии, фармацевтики и фармакологии" МОБИ-ХИМФАРМА 2020, Нижний Новгород, Россия, 27-30 сентября 2020
  • • 2020 Скаффолд-бережливая разработка лекарств для малых медхимических университетских групп с применением анализа вкладов фрагментов (Устный)
    • Авторы: Шульга Д.А., Иванов Н.Н., Палюлин В.А.
    • VI Междисциплинарная конференция "Молекулярные и биологические аспекты химии, фармацевтики и фармакологии" МОБИ-ХИМФАРМА 2020, Нижний Новгород, Россия, 27-30 сентября 2020
  • • 2019 Glutamate Receptor Antagonist Perampanel: Quantum Chemistry and Molecular Docking Studies (Стендовый)
    • Авторы: Guseynov Abdul-Akim D., Pisarev Sergey A., Shulga Dmitry A., Palyulin Vladimir A., Fedorov Maxim V., Karlov Dmitry S.
    • 15th German Conference on Cheminformatics, Atrium Hotel Mainz, Flugplatzstr. 44, 55126 Mainz, Germany, Германия, 3-5 ноября 2019
  • • 2019 Accounting for the anisotropy of electrostatic potential of heteroatoms in drug design (Устный)
    • Авторы: Palyulin V.A., Titov O.I., Pisarev S.A., Shulga D.A.
    • XXI Менделеевский съезд по общей и прикладной химии, г. Санкт-Петербург, Россия, 8-13 сентября 2019
  • • 2018 СТРУКТУРНЫЙ ДИЗАЙН, СИНТЕЗ И ИЗУЧЕНИЕ БИОЛОГИЧЕСКОЙ АКТИВНОСТИ НОВЫХ АМИНОПРОИЗВОДНЫХ 2-ОКСИНДОЛА (Стендовый)
    • Авторы: Сосонюк С.Е., Иванов Н.Н., Шульга Д.А., Проскурнина М.В., Чеснокова Н.Б., Захарова Д.В., Лозинская Н.А., Безнос О.В.
    • V Всероссийская конференция с международным участием по органической химии, Владикавказ, Россия, 10-14 сентября 2018
  • • 2018 SPEEDING UP CALCULATION OF EMPIRICAL ATOMIC CHARGES BY MEANS OF ITERATIVE LINEAR SYSTEM SOLVERS (Стендовый)
    • Авторы: Шаймарданов А.Р., Палюлин В.А., Шульга Д.А.
    • Third International School-Seminar "From Empirical to Predictive Chemistry", Казань, Россия, 5-7 апреля 2018
  • • 2018 The estimation and application of fragments' contributions to the ligand binding energy (Стендовый)
    • Авторы: Palyulin V., Ivanov N., Shulga D.
    • Third International School-Seminar "From Empirical to Predictive Chemistry", Казань, Россия, 5-7 апреля 2018
  • • 2017 Modeling of Halogen Bonding and Electrostatic Noncovalent Sulfur Interactions in Drug Design (Устный)
    • Авторы: Palyulin V.A., Titov O.I., Shulga D.A., Zefirov N.S.
    • 9th International Symposium on Computational Methods in Toxicology and Pharmacology Integrating Internet Resources CMTPI 2017, Goa, India, 27-30 October 2017, Goa, India, Индия, 27-30 октября 2017
  • • 2017 Oxindole derivatives with antiglaucomatous activity (Устный)
    • Авторы: Zaryanova E.V., Lozinskaya N.A., Ivanov N.N., Zefirov N.S., Beznos O.V., Chesnokova N.B., Shulga D.A.
    • 3rd Russian Conference on Medicinal Chemistry/3-я Российская конференция по медицинской химии, Казань, Россия, 28 сентября - 3 октября 2017
  • • 2017 Квадрупольная модель галогенового связывания для разработки лекарств (Устный)
    • Авторы: Титов О.И., Зефиров Н.С., Палюлин В.А., Шульга Д.А.
    • XXIV Российский национальный конгресс "Человек и лекарство", Москва, Россия, 10-13 апреля 2017
  • • 2017 ПРОИЗВОДНЫЕ 2-ОКСИНДОЛА С АНТИГЛАУКОМНОЙ АКТИВНОСТЬЮ (Устный)
    • Авторы: Зарянова Е.В., Лозинская Н.А., Иванов Н.Н., Зефиров Н.С., Безнос О.В., Чеснокова Н.Б., Шульга Д.А.
    • X Международная конференция молодых учёных по химии «Менделеев-2017», Санкт-Петербург, Россия, 4-7 апреля 2017
  • • 2016 Quadrupole-based correction for halogen bonding des­cription in Autodock-XB scoring function (Устный)
    • Авторы: Titov O.I., Zefirov N.S., Palyulin V.A., Shulga D.A.
    • International School-Seminar on Computer-Aided Molecular Design, Казань, Россия, 18-20 мая 2016
  • • 2015 Моделирование простагландинового рецептора EP1 человека для применения в качестве лекарственной мишени для гастропротекторной активности (Устный)
    • Авторы: Шульга Д.А., Кудрявцев К.В., Зефиров Н.С.
    • Всероссийская Симпозиум : Второй Междисциплинарный Симпозиум по медицинской, органической и биологической химии - 2015, Новый Свет, Крым, Россия, 27 сентября - 1 октября 2015
  • • 2015 Perspectives of direct modeling of halogen bonding in early drug discovery (Устный)
    • Авторы: Titov O.I., Zefirov N.S., Palyulin V.A., Shulga D.A.
    • Second Kazan Summer School on Chemoinformatics (kpfu.ru), Alexander Butlerov Institute of Chemistry of KFU, Россия, 6-9 июля 2015
  • • 2014 HALOGEN BONDING IN MEDICINAL CHEMISTRY: PROSPECTS AND QUANTITATIVE DESCRIPTION (Стендовый)
    • Авторы: Shulga Dmitry A., Zefirov Nikolay S., Palyulin Vladimir A., Titov Oleg I.
    • 20th EuroQSAR Understanding Chemical-Biological Interactions, St. Petersburg, Russia - August 31-September 4, Россия, 2014
  • • 2014 PERSPECTIVES OF HALOGEN BONDING DESCRIPTION IN SCORING FUNCTIONS: SUBSTITUENT EFFECT IN AROMATIC CORE (Стендовый)
    • Авторы: Titov Oleg I., Zefirov Nikolay S., Palyulin Vladimir A., Shulga Dmitry A.
    • 20th EuroQSAR Understanding Chemical-Biological Interactions, St. Petersburg, Russia - August 31-September 4, Россия, 2014
  • • 2014 HOMOLOGY MODELS OF PROSTAGLANDIN EP1, EP2, EP3 AND EP4 RECEPTORS FOR DEVELOPMENT OF GASTROPROTECTIVE MEDICINES (Стендовый)
    • Авторы: Shulga Tatyana N., Shulga Dmitry A.
    • 20th EuroQSAR2014 Understanding Chemical-Biological Interactions, St. Petersburg, Russia, August 31 - September 4, 2014, St. Petersburg, Россия, 31 августа - 4 сентября 2014
  • • 2013 Bridged dinitrogen heterocycles as novel scaffolds for thrombin inhibitors (Устный)
    • Авторы: Vatsadze S.Z., Kudryavtsev K.V., Chupakhin V.I., Shulga D.A.
    • 9th AFMS International Medicinal Chemistry Symposium, Taiwan, Taipei, 2013
  • • 2013 Novel fragment-sized heterocyclic entities as a source for Aurora-A kinase inhibitors (Устный)
    • Авторы: Kudryavtsev K.V., Chupakhin V.I., Shulga D.A., Guh J.H.
    • 9th AFMS International Medicinal Chemistry Symposium, Taiwan, Taipei, 2013
  • • 2013 ЭФФЕКТИВНОЕ ОПИСАНИЕ СТЕКИНГ-ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ МЕЖДУ АМИДНЫМИ ФРАГМЕНТАМИ БЕЛКА И ГЕТЕРОАРОМАТИЧЕСКИМИ ГРУППАМИ ЛИГАНДОВ В РАМКАХ СИЛОВЫХ ПОЛЕЙ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ АТОМНЫХ ЗАРЯДОВ (Устный)
    • Авторы: Марьясина С.С., Шульга Д.А., Палюлин В.А., Зефиров Н.С.
    • VI Всероссийская молодежная школа-конференция "Квантово-химические расчеты: структура и реакционная способность органических и неорганических молекул", Иваново, 2013
  • • 2013 Comparison of electrostatic approaches to halogen bonding description (Устный)
    • Авторы: Titov Oleg I., Shulga Dmitry A., Palyulin Vladimir A., Zefirov Nikolay S.
    • 27th Molecular Modelling Workshop 2013, Erlangen, Германия, 25-27 февраля 2013
  • • 2012 HALOGEN BONDING: NATURE, ROLE AND ROUTES TO SUCCESSFUL SIMULATION (Пленарный)
    • Авторы: Zefirov N.S., Palyulin V.A., Titov O.I., Shulga D.A.
    • 5th Japan-Russia International Workshop MSSMBS'11 “Molecular Simulation Studies in Material and Biological Sciences”, Дубна, Россия, 9-12 сентября 2012
  • • 2012 Простагландиновые рецепторы как составные элементы гастропротективной и адаптивной гастропротективной систем (Устный)
    • Авторы: Шульга Д.А., Кудрявцев К.В., Чупахин В.И.
    • «Адаптационные стратегии живых систем». Междисциплинарная научная конференция. 11-16 июня 2012 г. Новый Свет, Крым, Украина. 2012, г. Новый Свет, Крым, Украина, 11-16 июня 2012
  • • 2012 Квантово-химическая модель взаимодействия молекул CF4 и H2CO (Устный)
    • Авторы: Титов О.И., Безруков Д.С., Шульга Д.А.
    • V Молодежная конференция ИОХ РАН, Москва, Россия, 28 марта 2012 - 29 марта 2017
  • • 2011 Взаимодействие в системах CF4-CH3OH и CF4-H2CO: прецизионное квантовохимическое описание (Устный)
    • Авторы: Титов О.И., Безруков Д.С., Шульга Д.А.
    • V Школа-семинар молодых ученых «Квантово-химические расчеты: строение и реакционная способность органических и неорганических молекул, Иваново, 2011
  • • 2011 Квантовохимическая модель комплекса молекул формальдегида и перфторметана (Устный)
    • Авторы: Безруков Д.С., Титов О.И., Шульга Д.А.
    • IX Курчатовская молодежная научная школа, Москва, Россия, 22-25 ноября 2011
  • • 2010 Empirical account of molecular electrostatic interaction through atomic charges (Пленарный)
    • Авторы: Shulga D.A., Titov O.I., Korotaev A.V., Sitnikov G.V., Palyulin V.A., Zefirov N.S.
    • 4th Japan-Russia International Workshop MSSMBS'10 “Molecular Simulation Studies in Material and Biological Sciences”, Дубна, Россия, 27-28 сентября 2010
  • • 2010 Роль частичных атомных зарядов в моделировании 3D QSAR
    • Авторы: Царева Д.А., Осолодкин Д.И., Зефиров Н.С., Олиференко А.А., Палюлин В.А., Шульга Д.А.
    • XVII Российский национальный конгресс «Человек и лекарство», Москва, Россия, Россия, 8-12 апреля 2010
  • • 2009 Vibrational frequencies of Mn2 in argon matrix
    • Авторы: Bezrukov D.S., Buchachenko A.A., Shulga D.A.
    • 12-th V.A. Fock Meeting on Quantum and Computational Chemistry, Kaзань, 2009
  • • 2009 Исследова­ние взаимодействия манзамина А с киназой гликогенсинтазы 3
    • Авторы: Осолодкин Д.И., Зефиров Н.С., Палюлин В.А., Шульга Д.А.
    • XVI Российский национальный конгресс “Человек и лекарство”, Москва, Россия, 2009

• Тезисы докладов

  • • 2023 Отбор перспективных мод связывания соединений хитов на основании вкладов фрагментов
    • Чернов Д.Д., Иванов Н.Н., Шульга Д.А.
    • в сборнике Материалы Международного молодежного научного форума «Ломоносов-2023», издательство ООО "МАКС Пресс" (Москва), тезисы, с. 771-771
    • редакторы Алешковский Иван Андреевич, Андриянов Андрей Владимирович, Антипов Евгений Александрович, Зимакова Екатерина Игоревна
  • 
    • 2020 Анализ вклада бензазепинового скаффолда в связывание с SrtA s. Aureus при моделировании и разработке потенциальных ингибиторов
    • Шульга Д.А., Иванцова П.М., Кудрявцев К.В.
    • в сборнике Сборник тезисов докладов Шестой Междисциплинарной конференции «Молекулярные и Биологические аспекты Химии, Фармацевтики и Фармакологии», серия МОБИ-ХимФарма, издательство Общество с ограниченной ответственностью Издательство Перо (Москва), том 1, тезисы, с. 253-253
  • 
    • 2020 Скаффолд-бережливая разработка лекарств для малых медхимических университетских групп с применением анализа вкладов фрагментов
    • Шульга Д.А., Иванов Н.Н., Палюлин В.А.
    • в сборнике Сборник тезисов докладов Шестой Междисциплинарной конференции «Молекулярные и Биологические аспекты Химии, Фармацевтики и Фармакологии», серия МОБИ-ХимФарма, издательство Общество с ограниченной ответственностью Издательство Перо (Москва), том 1, тезисы, с. 122-122
  • 
    • 2019 Accounting for the anisotropy of electrostatic potential of heteroatoms in drug design
    • Palyulin V.A., Titov O.I., Pisarev S.A., Shulga D.A.
    • в сборнике ХХI Mendeleev Congress on General and Applied Chemistry, Saint Petersburg, Russia, 9-13 September 2019, место издания Saint Petersburg, Russia, том 5, тезисы, с. 89-89
  • 
    • 2019 Glutamate receptor antagonist perampanel: Quantum chemistry and molecular docking studies
    • Guseynov A.D., Pisarev S.A., Shulga D.A., Palyulin V.A., Fedorov M.V., Karlov D.S.
    • в сборнике 15th German Conference on Cheminformatics, Mainz, Germany, November 3-5, 2019, место издания Mainz, Germany, тезисы, с. 100-100
  • 
    • 2018 The estimation and application of fragments' contribution to the ligand binding energy
    • Ivanov N., Shulga D., Palyulin V.
    • в сборнике Third International School-Seminar "From Empirical to Predictive Chemistry" (April 5-7, 2018, Kazan, Russia): book of abstracts / ed. T.I. Madzhidov, V.A. Afonina, I.S. Antipin, место издания Kazan University Press Kazan, тезисы
  • • 2017 Modeling of Halogen Bonding and Electrostatic Noncovalent Sulfur Interactions in Drug Design
    • Palyulin V.A., Titov O.I., Shulga D.A., Zefirov N.S.
    • в сборнике 9th International Symposium on Computational Methods in Toxicology and Pharmacology Integrating Internet Resources CMTPI 2017, Goa, India, 27-30 October 2017, место издания Goa, India, тезисы, с. 39
  • 
    • 2017 Oxindole derivatives with antiglaucomatous activity
    • Zaryanova E.V., Lozinskaya N.A., Ivanov N.N., Shulga D.A., Beznos O.V., Chesnokova N.B., Zefirov N.S.
    • в сборнике 3rd Russian Conference on Medicinal Chemistry. Abstract book, место издания Kazan, тезисы, с. 280-280
  • • 2017 Квадрупольная модель галогенового связывания для разработки лекарств
    • Титов О.И., Шульга Д.А., Палюлин В.А., Зефиров Н.С.
    • в сборнике Сборник материалов XXIV Российского наионального конгресса "Человек и Лекарство", место издания Видокс Москва, тезисы, с. 109-110
  • 
    • 2017 ПРОИЗВОДНЫЕ 2-ОКСИНДОЛА С АНТИГЛАУКОМНОЙ АКТИВНОСТЬЮ
    • Зарянова Е.В., Лозинская Н.А., Иванов Н.Н., Шульга Д.А., Безнос О.В., Чеснокова Н.Б., Зефиров Н.С.
    • в сборнике X Международная конференция молодых учёных по химии «МЕНДЕЛЕЕВ-2017» II школа-конференция «Направленный дизайн веществ и материалов с заданными свойствами» Сборник тезисов докладов, место издания Санкт-петербург, тезисы, с. 244
  • • 2016 Quadrupole-based correction for halogen bonding des­cription in Autodock-XB scoring function
    • Titov O.I., Shulga D.A., Palyulin V.A., Zefirov N.S.
    • в сборнике Book os Abstracts Internations School-Seminar on Computer-Aided Molecular Design, место издания Kazan Federal University Kazan, Russua, тезисы, с. 15-15
  • • 2015 Perspectives of direct modeling of halogen bonding in early drug discovery
    • Shulga D., Titov O., Palyulin V., Zefirov N.
    • в сборнике Second Kazan Summer School on Chemoinformatics. Book of Abstracts and Scientific Program, место издания Kazan, тезисы, с. 26-26
  • • 2015 Моделирование простагландинового рецептора EP1 человека для применения в качестве лекарственной мишени для гастропротекторной активности
    • Шульга Д.А., Кудрявцев К.В., Зефиров Н.С.
    • в сборнике Второй Междисциплинарный Симпозиум по Медицинской, Органической и Биологической Химии – МедОргБиоХим2015 (МОБИ-Хим2015), Новый Свет, Крым, 27-30 сентября 2015, Тезисы докладов, серия МОБИ-ХимФарма, издательство Общество с ограниченной ответственностью Издательство Перо (Москва), тезисы, с. 57
  • • 2014 HOMOLOGY MODELS OF PROSTAGLANDIN EP1, EP2, EP3 AND EP4 RECEPTORS FOR DEVELOPMENT OF GASTROPROTECTIVE MEDICINES
    • Shulga Dmitry A., Shulga Tatyana N.
    • в сборнике 20th EuroQSAR. Understanding Chemical-Biological Interactions, St. Petersburg, Russia - August 31-September 4, 2014, тезисы, с. 200
  • • 2014 Halogen bonding in medicinal chemistry: prospects and quantitative description
    • Shulga Dmitry A., Titov Oleg I., Palyulin Vladimir A., Zefirov Nikolay S.
    • в сборнике Book of Abstracts 20th EuroQSAR Understanding Chemical-Biological Interactions, место издания St-Petersburg, Russia, тезисы, с. 199-199
  • • 2014 Perspectives of halogen bonding description in scoring functions: substituent effect in aromatic core
    • Titov Oleg I., Shulga Dmitry A., Palyulin Vladimir A., Zefirov Nikolay S.
    • в сборнике Book of Abstracts 20th EuroQSAR Understanding Chemical-Biological Interactions, место издания St-Petersburg, Russia, тезисы, с. 213-213
  • • 2013 Bridged dinitrogen heterocycles as novel scaffolds for thrombin inhibitors
    • Vatsadze S.Z., Shulga D.A., Chupakhin V.I., Kudryavtsev K.V.
    • в сборнике 9th AFMC International Medicinal Chemistry Symposium in 2013 (AIMECS13). Proceedings, место издания Taipei, Taiwan, тезисы, с. O-11
  • • 2013 Comparison of electrostatic approaches to halogen bonding description
    • Titov Oleg I., Shulga Dmitry A., Palyulin Vladimir A., Zefirov Nikolay S.
    • в сборнике MOLECULAR MODELLING WORKSHOP 2013, место издания Erlangen, Germany, тезисы, с. 39-39
  • • 2013 Novel fragment-sized heterocyclic entities as a source for Aurora-A kinase inhibitors
    • Kudryavtsev K.V., Chupakhin V.I., Shulga D.A., Guh J.H.
    • в сборнике 9th AFMC International Medicinal Chemistry Symposium in 2013 (AIMECS13). Proceedings, место издания Taipei, Taiwan, тезисы, с. O-25
  • • 2012 Effect of the Ar matrix on the spin-coupling in manganese dimer
    • Bezrukov D.S., Korchagina K.A., Buchachenko A.A., Shulga D.A.
    • в сборнике Book of Abstracts of 13-th V.A. Fock Meeting on Quantum and Computational Chemistry., серия V.A. Fock Meetings on Quantum and Computational Chemistry., место издания Евразийский Национальный Университет им. Л.Н. Гумилёва, Астана, Казахстан, тезисы, с. 72-72
    • редактор Чугреев Андрей Львович
  • • 2012 HALOGEN BONDING: NATURE, ROLE AND ROUTES TO SUCCESSFUL SIMULATION
    • Titov O.I., Shulga D.A., Palyulin V.A., Zefirov N.S.
    • в сборнике Сб. аннот. 5 го РОССИЙСКО - ЯПОНСКОГО М ЕЖДУНАРОДНОГО РАБОЧЕГО СОВЕЩАНИЯ MSSMBS ’ 1 2 “ Молекулярно - динамич еское моделирование в науках о веществе и биологии ”, место издания Дубна: ОИЯИ, тезисы, с. 21-22
  • • 2012 Квантово-химическая модель взаимодействия молекул CF4 и H2CO
    • Титов О.И., Безруков Д.С., Шульга Д.А.
    • в сборнике V Молодежная конференция ИОХ РАН: Сборник тезисов докладов: Москва, 28-29 марта 2012 г, место издания МАКС Пресс Москва, тезисы, с. 38-39
  • • 2012 Простагландиновые рецепторы как составные элементы гастропротективной и адаптивной гастропротективной систем
    • Шульга Д.А., Чупахин В.И., Кудрявцев К.В.
    • в сборнике Междисциплинарная научная конференция «Адаптационные стратегии живых систем». Тезисы докладов, место издания Украина, тезисы, с. 125-126
  • • 2011 Взаимодействие в системах CF4-CH3OH и CF4-H2CO: прецизионное квантовохимическое описание
    • Титов О.И., Безруков Д.С., Шульга Д.А.
    • в сборнике Квантово-химические расчеты: структура и реакционная способность органических и неорганических молекул. V школа-семинар молодых ученых. Иваново, 20-22 апреля 2011 г. Сборник статей, место издания Иваново, тезисы, с. 219-220
  • • 2011 Квантовохимическая модель комплекса молекул формальдегида и перфторметана
    • Безруков Д.С., Титов О.И., Шульга Д.А.
    • в сборнике IX Курчатовская молодежная научная школа. Сборник аннотаций, место издания Москва, Россия, тезисы, с. 252-252
  • • 2011 Поиск новых перспективных ингибиторов тромбина при помощи методов молекулярного моделирования
    • Шульга Д.А., Чупахин В.И., Кудрявцев К.В.
    • в сборнике 7-я Всероссийская конференция «Молекулярное моделирование». Тезисы докладов, место издания Москва, тезисы, с. 154
  • • 2010 Empirical account of molecular electrostatic interaction through atomic charges
    • Shulga D.A., Titov O.I., Korotaev A.V., Sitnikov G.V., Palyulin V.A., Zefirov N.S.
    • в сборнике Сб. аннот. 4 го РОССИЙСКО - ЯПОНСКОГО М ЕЖДУНАРОДНОГО РАБОЧЕГО СОВЕЩАНИЯ MSSMBS ‘ 10 ― Молекулярно - динамич еское моделирование в науках о веществе и биологии ‖, место издания Дубна: ОИЯИ, тезисы, с. 37-37
  • • 2009 Теоретическое описание сорбции органических молекул на поверхности фторированного графита
    • Ковыршин А.В., Безруков Д.С., Рощина Т.М., Шульга Д.А.
    • в сборнике Сборник материалов IV-ой школы-семинара молодых ученых «Квантово-Химические расчеты: структура и реакционная способность органических и неорганических молекул, место издания Иваново, тезисы, с. 96-98

• НИРы

  • • 28 декабря 2021 - 31 декабря 2023 Систематическое улучшение оценочных функций путем выявления фрагментов молекул, проблемных для корректного описания взаимодействий лиганд-рецептор
    • НИЛ медицинской химии
    • Руководитель: Шульга Д.А. Участники НИР: Иванов Н.Н., Чернов Д.Д., Шаймарданов А.Р.
  • • 1 января 2021 - 31 декабря 2026 Молекулярный дизайн, синтез и исследование физиологически активных веществ, развитие методологии медицинской химии, хемоинформатики и направленного химического синтеза
    • Кафедра медицинской химии и тонкого органического синтеза
    • Руководитель: Милаева Е.Р. Участники НИР: Altieri A., Аверина Е.Б., Антоненко Т.А., Антонец А.А., Безсонова Е.Н., Василенко Д.А., Веремеева П.Н., Воликов А.Б., Воскобойников А.З., Грачева Ю.А., Дорошенко И.А., Дубинина Т.В., Зефиров Н.А., Зефирова О.Н., Иванцова П.М., Измер В.В., Кононович Д.С., Константинов А.И., Косов А.Д., Кузнецова Т.С., Куркин А.В., Лавров М.И., Лозинская Н.А., Назаров А.А., Ненашев А.С., Никитин Е.А., Новосёлов А.М., Нуриева Е.В., Павлова А.С., Палюлин В.А., Перминова И.В., Писарев С.А., Подругина Т.А., Радченко Е.В., Седенкова К.Н., Сосонюк С.Е., Трофимова Е.В., Тюрин В.Ю., Уборский Д.В., Федотов А.Н., Шпаковский Д.Б., Штиль А.А., Шувалов М.В., Шульга Д.А., Шутков И.А., Юсупов И.Р.
  • • 7 февраля 2018 - 31 декабря 2020 Разработка методов учёта анизотропии электростатического потенциала гетероатомов в силовых полях для дизайна лекарственных веществ
    • Кафедра медицинской химии и тонкого органического синтеза
    • Руководитель: Палюлин В.А. Ответственный исполнитель: Шульга Д.А. Участники НИР: Иванов Н.Н., Писарев С.А., Радченко Е.В., Титов О.И., Шаймарданов А.Р.
  • • 6 апреля 2017 - 31 декабря 2017 Разработка метода описания невалентных взаимодействий атомов серы в молекулярном докинге и дизайне лекарственных веществ
    • Кафедра медицинской химии и тонкого органического синтеза
    • Руководитель: Палюлин В.А. Ответственный исполнитель: Шульга Д.А. Участники НИР: Иванов Н.Н., Карлов Д.С., Писарев С.А., Радченко Е.В., Титов О.И.
  • • 1 января 2016 - 31 декабря 2020 Развитие методологии органического синтеза и медицинской химии. Направленное компьютерное конструирование и синтез веществ с заданными целевыми свойствами
    • Кафедра медицинской химии и тонкого органического синтеза
    • Руководители: Зефиров Н.С., Милаева Е.Р. Участники НИР: Altieri A., Аверина Е.Б., Андреев И.А., Антоненко Т.А., Арутюнова А.С., Баргамов Г.Г., Белов Д.С., Василенко Д.А., Веремеева П.Н., Виноградов Д.С., Виноградова Е.А., Воликов А.Б., Воскобойников А.З., Грачева Ю.А., Дорошенко И.А., Дубинина Т.В., Жеребкер А.Я., Зарянова Е.В., Захаров А.Н., Зефиров Н.А., Зефирова О.Н., Иванцова П.М., Измер В.В., Карлов Д.С., Кононович Д.С., Константинов А.И., Кудрявцев К.В., Кузнецова Т.С., Куркин А.В., Лавров М.И., Лаптева В.Л., Лебедев В.А., Лихоманова Т.И., Лозинская Н.А., Манасова Е.В., Милаева Е.Р., Михалёв О.В., Мочалов С.С., Назаров А.А., Нуриева Е.В., Окулова Ю.Н., Павлова А.С., Палюлин В.А., Перминова И.В., Писарев С.А., Подругина Т.А., Проскурнина М.В., Радченко Е.В., Седенкова К.Н., Селиверстов М.Ю., Сосонюк С.Е., Темнов В.В., Томилова Л.Г., Трач С.С., Трофимова Е.В., Тюрин В.Ю., Уборский Д.В., Федотов А.Н., Харитонашвили Е.В., Чжан Ц., Шпаковский Д.Б., Штиль А.А., Шувалов М.В., Шульга Д.А., Шутков И.А., Яшин Н.В.
  • • 30 ноября 2015 - 31 декабря 2015 Разработка лабораторного регламента получения активной фармацевтической субстанции выбранного кандидата в лекарственное средство. Наработка необходимого количества активной фармацевтической субстанции
    • Кафедра медицинской химии и тонкого органического синтеза
    • Руководитель: Кудрявцев К.В. Участники НИР: Амочкин К.А., Заболотнев Д.В., Иванцова П.М., Соколов М.Н., Шульга Д.А.
  • • 21 июля 2015 - 31 декабря 2015 Проект организации Молодёжного Форума по Медицинской, Органической и Биологической Химии - 2015 (МОБИ-Хим2015-МФ) в рамках второго Междисциплинарного Симпозиума по Медицинской, Органической и Биологической Химии
    • Кафедра медицинской химии и тонкого органического синтеза
    • Руководитель: Зефиров Н.С. Участники НИР: Грачева Ю.А., Кудрявцев К.В., Шульга Д.А.
  • • 20 октября 2014 - 26 декабря 2014 Выбор образцов соединений фенольной природы, содержащих непосредственно связанные гетероатомные и/или гетероциклические структурные фрагменты, методом компьютерного моделирования. Разработка методик синтеза соединений фенольной природы
    • Кафедра медицинской химии и тонкого органического синтеза
    • Руководитель: Кудрявцев К.В. Участники НИР: Амочкин К.А., Заболотнев Д.В., Иванцова П.М., Шульга Д.А.
  • • 13 января 2014 - 31 декабря 2015 Создание пространственных компьютерных моделей простагландиновых рецепторов и их применение в рациональной разработке новых соединений, обладающих гастропротекторной активностью
    • Кафедра медицинской химии и тонкого органического синтеза
    • Руководитель: Шульга Д.А. Участники НИР: Амочкин К.А., Иванцова П.М.
  • • 1 января 2014 - 31 декабря 2016 Разработка метода описания галогенового связывания в оценочных функциях молекулярного докинга для дизайна лекарственных веществ
    • Кафедра медицинской химии и тонкого органического синтеза
    • Руководитель: Палюлин В.А. Ответственный исполнитель: Шульга Д.А. Участники НИР: Иванов Н.Н., Коротаев А.В., Марьясина С.С., Осолодкин Д.И., Писарев С.А., Радченко Е.В., Титов О.И.
  • • 20 июля 2012 - 19 июля 2017 Совместные научные исследования
    • Кафедра медицинской химии и тонкого органического синтеза
    • Руководители: Зефиров Н.С., Палюлин В.А. Участники НИР: Зефиров А.Н., Лавров М.И., Лаптева В.Л., Осолодкин Д.И., Писарев С.А., Радченко Е.В., Титов О.И., Шульга Д.А.
  • • 1 января 2011 - 31 декабря 2015 Развитие методологии органического синтеза и медицинской химии. Направленное конструирование и синтез физиологически активных веществ с заданными целевыми свойствами на основе методов математической химии и компьютерного моделирования важнейших биомишеней человека
    • Кафедра медицинской химии и тонкого органического синтеза
    • Руководитель: Зефиров Н.С. Участники НИР: 1 1., Аверина Е.Б., Ашкинадзе Л.Д., Белов Д.С., Бруновленская И.И., Веремеева П.Н., Виноградов Д.С., Воликов А.Б., Волкова М.С., Воскобойников А.З., Грачева Ю.А., Дубинина Т.В., Жеребкер А.Я., Заболотнев Д.В., Захаров А.Н., Зефиров А.Н., Зефирова О.Н., Измер В.В., Карлов Д.С., Кононович Д.С., Константинов А.И., Кудакина В.А., Кудрявцев К.В., Кузнецова Т.С., Куркин А.В., Лавров М.И., Лаптева В.Л., Лихоманова Т.И., Лозинская Н.А., Мамаева А.В., Матвеева Е.Д., Милаева Е.Р., Михалёв О.В., Мочалов С.С., Назаров А.А., Нуриева Е.В., Окулова Ю.Н., Орлова С.И., Осолодкин Д.И., Палюлин В.А., Перминова И.В., Подругина Т.А., Проскурнина М.В., Радченко Е.В., Самсонов О.В., Седенкова К.Н., Селиверстов М.Ю., Сосонюк С.Е., Титов О.И., Томилова Л.Г., Трач С.С., Трофимова Е.В., Тюрин В.Ю., Уборский Д.В., Федотов А.Н., Фирсова Ю.Н., Шариков М.И., Шпаковский Д.Б., Шувалов М.В., Шульга Д.А., Яшин Н.В.
  • • 1 января 2011 - 31 декабря 2013 Развитие и реализация методов координат складчатости циклических систем для эффективного перебора конформаций циклических фрагментов молекул в виртуальном скрининге и докинге
    • НИЛ медицинской химии
    • Руководитель: Палюлин В.А. Участники НИР: Карпов П.В., Коротаев А.В., Марьясина С.С., Осолодкин Д.И., Писарев С.А., Радченко Е.В., Титов О.И., Шульга Д.А.
  • • 1 января 2008 - 31 декабря 2010 Разработка масштабируемого поляризуемого силового поля для молекулярно-динамического моделирования наноразмерных биологических структур
    • НИЛ медицинской химии
    • Руководитель: Палюлин В.А. Участники НИР: Баскин И.И., Воронков А.Э., Казачинская Е.П., Карпов П.В., Олиференко А.А., Осолодкин Д.И., Писарев С.А., Радченко Е.В., Царева Д.А., Чупахин В.И., Шульга Д.А.

• Патенты

  • • 2019 «Амид-содержащие производные 2-оксиндола, способ их получения и применение в офтальмологии»
    • Авторы: Лозинская Н.А., Зарянова Е.В., Чеснокова Н.Б., Безнос О.В., Шульга Д.А., Иванов Н.Н., Захарова Д.В.
    • #2 685 501, 19 апреля

• Диссертация

  • • 2009 Разработка и параметризация методов расчета топологически симметричных атомных зарядов для целей молекулярного моделирования
    • Кандидатская диссертация по специальности 02.00.03 - Органическая химия (хим. науки)
    • Автор: Шульга Дмитрий Александрович, к.х.н., МГУ имени М.В. Ломоносова
    • Научный руководитель: Палюлин В.А., к.х.н., доц., МГУ имени М.В. Ломоносова
    • Защищена в совете Д 501.001.69 при МГУ имени М.В. Ломоносова, Химический факультет

• Руководство дипломными работами

  • • 2023 Характеризация сайтов связывания белков с помощью фрагментного базиса, отражающего основные типы химических взаимодействий в белковых структурах
    • Научный руководитель: Шульга Дмитрий Александрович
    • Автор: Моргунов Игорь Александрович (Специалист)
  • • 2023 Оценка способа корректного учета эффекта поляризации в эмпирических методах расчета зарядов
    • Научный руководитель: Шульга Дмитрий Александрович
    • Автор: Фролов Виталий Сергеевич (Специалист)
  • • 2017 Дизайн лигандов рецептора MT3 для снижения внутриглазного давления
    • Научные руководители: Шульга Дмитрий Александрович, Палюлин В.А.
    • Автор: Иванов Никита Николаевич (Специалист)
  • • 2015 Компьютерное моделирование тризамещенных 3,7-диазабицикло[3.3.1]нонанов в качестве потенциальных ингибиторов сериновых протеаз
    • Научные руководители: Вацадзе С.З., Шульга Д.А.
    • Автор: Логинова Юлия Дмитриевна (Специалист)
  • • 2015 Атомные заряды как дескрипторы в количественных корреляциях структура-свойство и структура-активность
    • Научные руководители: Палюлин В.А., Шульга Д.А.
    • Автор: Марьясина Софья Семеновна (Специалист)
  • • 2012 Эмпирические методы расчета атомных зарядов для органических структур с формально заряженными группами
    • Научные руководители: Палюлин В.А., Шульга Д.А.
    • Автор: Коротаев Александр Валерьевич (Специалист)
  • • 2012 Описание анизотропии электростатических взаимодействий органических молекул на примере галогенового связывания
    • Научные руководители: Палюлин В.А., Шульга Д.А.
    • Автор: Титов Олег Игоревич (Специалист)

---