ИСТИНА

Поликанов Юрий Сергеевич пользователь

кандидат биологических наук с 2008 года

University of Illinois at Chicago

Соавторы: Остерман И.А., Сергиев П.В., Konevega A., Богданов А.А., Студитский В.М., Донцова О.А., Комарова Е.С., Хабибуллина Н.Ф., Терещенков А.Г., Paleskava A., Steitz T., Kulaeva O.I., Melnikov S.V. показать полностью..., Манькин А.С., Серебрякова М.В., Сумбатян Н.В., Ташлицкий В.Н., Ширяев Д.И., Blanchard S., Clauvelin N., Juette M., Kartsev V.G., Kasatsky P.S., Maviza T.P., Metelev M., Nizovtseva E., Olson W.K., Severinov K., Söll D., Vázquez-Laslop N., Лукьянов Д.А., Рубцов М.А., Травин Д.Ю., Aleksashin N.A., Almutairi M., Arenz S., Artamonova T.O., Beckmann R., Bondarenko V.A., Bondarenko V.A., Bulkley D., Burnett B., Buschauer R., Cate J., Chen C., Cheng J., Colasanti A.V., DiMaio D., Dinos G., Dobosz-Bartoszek М., Efremenkova O.V., Elisabeth M., Engelman D., Fabbretti A., Gagnon M.G., Gaykalova D.A., Ghilarov D., Grachev A.A., Gray M.D., Gualerzi C., Hansen D., Huter P., Innis C., Jiang Y.I., Karabadzhak A., Khodorkovskii M.A., Khven I.M., Klepacki D., La Barbera F., Leyn S.A., Lu W., Luse D.S., Lutter L.C., Malanicheva I., Marks J., Mergaert P., Micura R., Mukhopadhyay S., Nguyen F., Oscar V., Paranjpe M.N., Reynolds K., Reynolds N.M., Rodnina M., Sengupta A.M., Shabalin K., Shaw K., Shiozuka M., Starosta A.L., Steele L.M., Svetlov M., Syroegin E.A., Söll D., Tchernaenko V., Terry D., Todolli S., Tolicheva O.A., Ujvari A., Vologodskii A., Ward F., Watson Z., Wengrzynek S., Wieland M., Wilson D.N., Zheng G., Zlamal J.E., and W.D., Бирюков М.В., Дмитриев С.Е., Закалюкина Ю.В., Касацкий П.С., Кулаева О.И., Кусочек П.А., Лашкевич К.А., Макаров Г.И., Марина В.И., Мясников А.Г., Остерман А.Л., Павлова Ю.А., Пичкур Е.Б., Польшаков В.И., Родин И.А., Сергеева В.А., Скворцов Д.А., Ставрианиди А.Н., Ульянов С.В., Уткина И.В., Хайруллина З.З., Чугунова А.А., Ш Д.В.

32 статьи, 8 докладов на конференциях, 1 тезисы доклада

Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 1098, Scopus: 1086

IstinaResearcherID (IRID): 8441529

ORCID: 0000-0002-5064-0327

Деятельность

• Статьи в журналах

  • • 2022 Insights into the molecular mechanism of translation inhibition by the ribosome-targeting antibiotic thermorubin
    • Paranjpe Madhura N., Marina Valeria I., Grachev Aleksandr A., Maviza Tinashe P., Tolicheva Olga A., Paleskava Alena, Osterman Ilya A., Sergiev Petr V., Konevega Andrey L., Polikanov Yury S., Gagnon Matthieu G.
    • в журнале Nucleic Acids Research, издательство Oxford University Press (United Kingdom) DOI
  • 
    • 2021 Binding and Action of Triphenylphosphonium Analog of Chloramphenicol upon the Bacterial Ribosome
    • Chen C-W, Pavlova JA, Lukianov DA, Tereshchenkov AG, Makarov GI, Khairullina ZZ, Tashlitsky VN, Paleskava A., Konevega AL, Bogdanov AA, Osterman IA, Sumbatyan NV, Polikanov YS
    • в журнале Antibiotics, издательство MDPI Publishing (Basel, Switzerland, Switzerland), том 10, № 4 DOI
  • 
    • 2020 Insights into the improved macrolide inhibitory activity from the high-resolution cryo-EM structure of dirithromycin bound to the E. coli 70S ribosome
    • Pichkur Evgeny B., Paleskava Alena, Tereshchenkov Andrey G., Kasatsky Pavel, Komarova Ekaterina, Shiriaev Dmitrii, Bogdanov Alexey, Dontsova Olga A., Osterman Ilya, Sergiev Petr V., Polikanov Yury S., Myasnikov Alexander G., Konevega Andrey L.
    • в журнале RNA, с. rna.073817.119 DOI
  • 
    • 2020 Tetracenomycin X inhibits translation by binding within the ribosomal exit tunnel
    • Osterman Ilya A., Wieland Maximiliane, Maviza Tinashe P., Lashkevich Kseniya A., Lukianov Dmitrii A., Komarova Ekaterina S., Zakalyukina Yuliya V., Buschauer Robert, Shiriaev Dmitrii I., Leyn Semen A., Zlamal Jaime E., Biryukov Mikhail V., Skvortsov Dmitry A., Tashlitsky Vadim N., Polshakov Vladimir I., Cheng Jingdong, Polikanov Yury S., Bogdanov Alexey A., Osterman Andrei L., Dmitriev Sergey E., Beckmann Roland, Dontsova Olga A., Wilson Daniel N., Sergiev Petr V.
    • в журнале Nature Chemical Biology, издательство Nature Publishing Group (United Kingdom), том 16, с. 1071-1077 DOI
  • 
    • 2019 Mechanistic insights into the slow peptide bond formation with D-amino acids in the ribosomal active site
    • Melnikov Sergey V., Khabibullina Nelli F., Elisabeth Mairhofer, Oscar Vargas-Rodriguez, Reynolds Noah M., Ronald Micura, Dieter Söll, Polikanov Yury S.
    • в журнале Nucleic Acids Research, издательство Oxford University Press (United Kingdom), том 47, № 4, с. 2089-2100 DOI
  • 
    • 2019 Structure of Dirithromycin Bound to the Bacterial Ribosome Suggests New Ways for Rational Improvement of Macrolides
    • Khabibullina Nelli F., Tereshchenkov Andrey G., Komarova Ekaterina S., Syroegin Egor A., Shiriaev Dmitrii I., Paleskava Alena, Kartsev Victor G., Bogdanov Alexey A., Konevega Andrey L., Dontsova Olga A., Sergiev Petr V., Osterman Ilya A., Polikanov Yury S.
    • в журнале Antimicrobial Agents and Chemotherapy, издательство American Society for Microbiology (United States), том 63, № 6 DOI
  • 
    • 2019 Structure of ribosome-bound azole-modified peptide phazolicin rationalizes its species-specific mode of bacterial translation inhibition
    • Travin D.Y., Watson Z.L., Metelev M., Ward F.R., Osterman I.A., Khven I.M., Khabibullina N.F., Serebryakova M., Mergaert P., Polikanov Y.S., Cate J.H.D, Severinov K.
    • в журнале Nature communications, издательство Nature Pub. Group (United Kingdom), том 10, № 4563 DOI
  • 
    • 2018 Binding action of amino-acid analogues of chloramphenicol upon the bacterial ribosome
    • Tereshchenkov A.G., Dobosz-Bartoszek М., Osterman I.A., Marks J., Sergeeva V.A., Kasatsky P., Komarova E.S., Stavrianidi A.A., Rodin I.A., Konevega A.L., Sergiev P.V., Sumbatyan N.V., Mankin A.S., Bogdanov A.A., Polikanov Y.S.
    • в журнале Journal of Molecular Biology, издательство Academic Press (United States), том 430, № 6, с. 842-852 DOI
  • 
    • 2018 Structural and evolutionary insights into ribosomal RNA methylation
    • Sergiev Petr V., Aleksashin Nikolay A., Chugunova Anastasia A., Polikanov Yury S., Dontsova Olga A.
    • в журнале Nature Chemical Biology, издательство Nature Publishing Group (United Kingdom), том 14, № 3, с. 226-235 DOI
  • 
    • 2017 Co-produced natural ketolides methymycin and pikromycin inhibit bacterial growth by preventing synthesis of a limited number of proteins
    • Almutairi MM, Svetlov MS, Hansen DA, Khabibullina NF, Klepacki D., Sherman DH, Vázquez-Laslop N., Polikanov YS, Mankin AS
    • в журнале Nucleic Acids Research, издательство Oxford University Press (United Kingdom), том 45, № 16, с. 9573-9582
  • 
    • 2017 Klebsazolicin inhibits 70S ribosome by obstructing the peptide exit tunnel
    • Metelev Mikhail, Osterman Ilya A., Ghilarov Dmitry, Khabibullina Nelli F., Yakimov Alexander, Shabalin Konstantin, Utkina Irina, Travin Dmitry Y., Komarova Ekaterina S., Serebryakova Marina, Artamonova Tatyana, Khodorkovskii Mikhail, Konevega Andrey L., Sergiev Petr V., Severinov Konstantin, Polikanov Yury S.
    • в журнале Nature Chemical Biology, издательство Nature Publishing Group (United Kingdom) DOI
  • 
    • 2017 Madumycin II inhibits peptide bond formation by forcing the peptidyl transferase center into an inactive state
    • Osterman Ilya A., Khabibullina Nelli F., Komarova Ekaterina S., Kasatsky Pavel, Kartsev Victor G., Bogdanov Alexey A., Dontsova Olga A., Konevega Andrey L., Sergiev Petr V., Polikanov Yury S.
    • в журнале Nucleic Acids Research, издательство Oxford University Press (United Kingdom) DOI
  • 
    • 2017 Nucleosome-free DNA regions differentially affect distant communication in chromatin
    • Nizovtseva E.V., Clauvelin N., Todolli S., Polikanov Y.S., Kulaeva O.I., Wengrzynek S., Olson W.K., Studitsky V.M.
    • в журнале Nucleic Acids Research, издательство Oxford University Press (United Kingdom), том 45, № 6, с. 3059-3067 DOI
  • 
    • 2017 Two Transmembrane Dimers of the Bovine Papillomavirus E5 Oncoprotein Clamp the PDGF β Receptor in an Active Conformation
    • Karabadzhak AG, Petti LM, Barrera FN, Edwards APB, Polikanov YS, Engelman DM, DiMaio D.
    • в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, издательство National Academy of Sciences (United States), том 114, № 35, с. E7262-E7271
  • 
    • 2016 Insights into RNA binding by the anticancer drug cisplatin from the crystal structure of cisplatin-modified ribosome
    • Melnikov SV, Söll D., Steitz TA, Polikanov YS
    • в журнале Nucleic Acids Research, издательство Oxford University Press (United Kingdom), том 44, № 10, с. 4978-4987
  • 
    • 2016 Structures of the orthosomycin antibiotics avilamycin and evernimicin in complex with the bacterial 70S ribosome
    • Arenz S., Juette MF, Graf M., Nguyen F., Huter P., Polikanov YS, Blanchard SC, and Wilson DN
    • в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, издательство National Academy of Sciences (United States), том 113, № 27, с. 7527-7532
  • 
    • 2015 Acoustic vibrations contribute to the diffuse scatter produced by ribosome crystals
    • Polikanov YS, Moore PB
    • в журнале Acta Crystallographica Section D: Biological Crystallography, издательство Blackwell Publishing Inc. (United Kingdom), том 71, № Pt 10, с. 2021-2031
  • 
    • 2015 Distinct tRNA Accommodation Intermediates Observed on the Ribosome with the Antibiotics Hygromycin A and A201A
    • Polikanov YS, Starosta AL, Juette MF, Altman RB, Terry DS, Lu W., Burnett BJ, Dinos G., Reynolds K., Blanchard SC, Steitz TA, and Wilson DN
    • в журнале Molecular Cell, издательство Cell Press (United States), том 58, № 5, с. 832-844
  • 
    • 2015 Structural insights into the role of rRNA modifications in protein synthesis and ribosome assembly
    • Polikanov YS, Melnikov SV, Söll D., Steitz TA
    • в журнале Nature Structural and Molecular Biology, издательство Nature Publishing Group (United Kingdom), том 22, № 4, с. 342-344
  • 
    • 2014 A proton wire to couple aminoacyl-tRNA accommodation and peptide-bond formation on the ribosome
    • Polikanov YS, Steitz TA, Innis CA
    • в журнале Nature Structural and Molecular Biology, издательство Nature Publishing Group (United Kingdom), том 21, № 9, с. 787-793
  • • 2014 Amicoumacin A Inhibits Translation by Stabilizing mRNA Interaction with the Ribosome
    • Polikanov YS, Osterman IA, Szal T., Tashlitsky VN, Serebryakova MV, Kusochek P., Bulkley D., Malanicheva IA, Efimenko TA, Efremenkova OV, Konevega AL, Shaw KJ, Bogdanov AA, Rodnina MV, Dontsova OA, Mankin AS, Steitz TA, Sergiev PV
    • в журнале Molecular Cell, издательство Cell Press (United States) DOI
  • 
    • 2014 Negamycin interferes with decoding and translocation by simultaneous interaction with rRNA and tRNA
    • Polikanov YS, Szal T., Jiang F., Gupta P., Matsuda R., Shiozuka M., Steitz TA, Vázquez-Laslop N., Mankin AS
    • в журнале Molecular Cell, издательство Cell Press (United States), том 56, № 4, с. 541-550
  • 
    • 2014 The antibiotics dityromycin and GE82832 bind protein S12 and block EF-G-catalyzed translocation
    • Bulkley D., Brandi L., Polikanov YS, Fabbretti A., O’Connor M., Gualerzi CO, Steitz TA
    • в журнале Cell reports, издательство Cell Press (United States), том 2211, № 13, с. 00782-1
  • • 2012 Distant activation of transcription: mechanism of enhancer action
    • Kulaeva O., Nizovtseva E., Polikanov Y., Ulianov S., Studitsky V.
    • в журнале Molecular and Cellular Biology, издательство American Society for Microbiology (United States)
  • 
    • 2012 Elements of ribosomal drug resistance and specificity
    • Blaha GM, Polikanov YS, Steitz TA
    • в журнале Current Opinion in Structural Biology, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 22, № 6, с. 750-758
  • 
    • 2012 How hibernation factors RMF, HPF, and YfiA turn off protein synthesis
    • Polikanov YS, Blaha GM, Steitz TA
    • в журнале Science, издательство American Association for the Advancement of Science (United States), том 336, № 6083, с. 915-918
  • 
    • 2012 Internucleosomal interactions mediated by histone tails allow distant communication in chromatin
    • Kulaeva O.I., Zheng G., Polikanov Y.S., Colasanti A.V., Clauvelin N., Mukhopadhyay S., Sengupta A.M., Studitsky V.M., Olson W.K.
    • в журнале Journal of Biological Chemistry, издательство American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc. (United States), том 287, № 24, с. 20248-20257
  • 
    • 2009 Analysis of distant communication on defined chromatin templates in vitro
    • Polikanov Y.S., Studitsky V.M.
    • в журнале Methods in molecular and cellular biology, издательство Wiley (Singapore), том 543, с. 563-576
  • 
    • 2007 Biochemical analysis of enhancer-promoter communication in chromatin
    • Polikanov Yury S., Rubtsov Mikhail A., Studitsky Vasily M.
    • в журнале Methods, издательство Academic Press (United States), том 41, № 3, с. 250-258
  • 
    • 2007 Probability of the site juxtaposition determines the rate of protein-mediated DNA looping
    • Polikanov Y.S., Bondarenko V.A., Tchernaenko V., Jiang Y.I., Lutter L.C., Vologodskii A., Studitsky V.M.
    • в журнале Biophysical Journal, издательство Biophysical Society (United States), том 93, № 8, с. 2726-2731
  • 
    • 2006 Chromatin structure can strongly facilitate enhancer action over a distance
    • Rubtsov Mikhail A., Polikanov Yury S., Bondarenko Vladimir A., Wang Yuh-Hwa, Studitsky Vasily M.
    • в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, издательство National Academy of Sciences (United States), том 103, № 47, с. 17690-17695
  • 
    • 2006 Nucleosomes can form a polar barrier to transcript elongation by RNA polymerase II
    • Bondarenko V.A., Steele L.M., Ujvari A., Gaykalova D.A., Kulaeva O.I., Polikanov Y.S., Luse D.S., Studitsky V.M.
    • в журнале Molecular Cell, издательство Cell Press (United States), том 24, № 3, с. 469-479

• Доклады на конференциях

  • • 2019 РНК-МЕТИЛТРАНСФЕРАЗЫ МЛЕКОПИТАЮЩИХ (Приглашенный)
    • Авторы: Сергиев П.В., Лаптев И.Г., Плетнев Ф.И., Швецова Е.Т., Аверина О.А., Пермяков О.А., Серебрякова М.В., Дейкин А.В., Поликанов Ю.С., Донцова О.А.
    • VII Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы, Санкт-Петербург, Россия, 18-22 июня 2019
  • • 2019 Phasolicin – a founding member of a new group of thiazole/oxazole modified peptides inhibiting prokaryotic translation (Стендовый)
    • Авторы: Travin D.Y., Watson Z., Metelev M.V., Ward Fred, Osterman I.A., Khven I., Serebryakova M., Polikanov Y., Cate J., Severinov K.
    • 1st International RiPPs Conference, Гранада, Испания, 24 апреля - 26 сентября 2019
  • • 2018 Modification of translation apparatus: in a search for a functional role (Устный)
    • Авторы: Sergiev P.V., Osterman I.A., Golovina A.Ya, Averina O.A., Permyakov O.A., Sergeeva O.V., Nesterchuk M.V., Rubtsova M.P., Deykin A.V., Chugunova A.A., Laptev I.G., Pletnev P.I., Navalayeu T.I., Petryukov K.S., Shvetsova E.T., Loseva E.M., Bogdanov A.A., Polikanov Yu S., Dontsova O.A.
    • Ribosomes & Translation, St. Petersburg, Russia, Россия, 13-16 мая 2018
  • • 2017 Мадумицин II ингибирует образование пептидной связи, приводя пептидилтрансферазный центр в неактивное состояние (Устный)
    • Авторы: Остерман И.А., Хабибуллина Н.Ф., Комарова Е.С., Касацкий П., Поликанов Ю.С., Богданов А., Донцова О.А., Коневега А.Л., Сергиев П.В., Карцев В.Г.
    • 12th International Scientific Conference on Bioorganic Chemistry devoted to the Memory of Professor Ovchinnikov/Международная научная конференция "XII чтения памяти академика Юрия Анатольевича Овчинникова" VIII Российский симпозиум "Белки и пептиды", Москва, Россия, 18-22 сентября 2017
  • • 2017 Klebsazolicin - new translational inhibitor, that blocks the elongation of the nascent peptide (Стендовый)
    • Авторы: Khabibullina Nelli, Komarova Ekaterina, Sergiev Petr, Metelev Mikhail, Polikanov Yury, Osterman Ilya, Severinov Konstantin
    • EMBO Conference: Protein Synthesis and Translational Control, Heidelberg, Германия, 6-9 сентября 2017
  • • 2017 Klebsazolicin - new translational inhibitor, that blocks the elongation of the nascent peptide (Стендовый)
    • Авторы: Khabibullina Nelli, Komarova Ekaterina, Sergiev Petr, Metelev Mikhail, Polikanov Yury, Osterman Ilya, Severinov Konstantin
    • EMBO Conference: Protein Synthesis and Translational Control, Heidelberg, Германия, 6-9 сентября 2017
  • • 2016 Молекулярные зонды на основе хлорамфеникола для изучения рибосомного туннеля (Стендовый)
    • Авторы: Поликанов Ю.C., Остерман И.А., Сумбатян Н.В., Терещенков А.Г., Богданов А.А.
    • Научная конференция грантодержателей РНФ
 «Фундаментальные химические исследования XXI-го века», ИОХ, Россия, 20-24 ноября 2016
  • • 2016 Interaction of chloramphenicol amino acide analogs with the ribosome (Стендовый)
    • Авторы: Tereshchenkov A., Polikanov Y., Bogdanov A., Sumbatyan N., Osterman I.
    • EMBO Conference: Ribosome Structure and Function 2016 (Strasbourg, France, 06 – 10 July 2016), Страсбург, Франция, 6-10 июля 2016

• Тезисы докладов

  • • 2016 Молекулярные зонды на основе хлорамфеникола для изучения рибосомного туннеля
    • Терещенков А.Г., Поликанов Ю.C., Остерман И.А., Сумбатян Н.В., Богданов А.А.
    • в сборнике Сборник тезисов Научной конференции гратодержателей РНФ Фундаментальные химические исследования XXI-го века, тезисы