Выберите категорию обращения:
Общие вопросы
Отчеты
Рейтинги
Мониторинговый отчёт
Диссертационные советы
Конкурсы
Ввод данных
Структура организаций
Аспирантура
Научное оборудование
Импорт педагогической нагрузки
Журналы и импакт-факторы
Тема обращения:
Описание проблемы:
Введите почтовый адрес:
ИСТИНА
Войти в систему
Регистрация
ИПМех РАН
Главная
Поиск
Статистика
О проекте
Помощь
В связи с техническими работами в центре обработки данных, часть прикреплённых файлов в настоящее время недоступна.
скрыть
отправить сообщение
Осолодкин Дмитрий Иванович
пользователь
кандидат химических наук с 2011 года
Прежние места работы
(Нажмите для отображения)
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Химический факультет
,
Кафедра органической химии
, научный сотрудник, 31 мая 2005 - 31 августа 2014
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Химический факультет
,
Кафедра медицинской химии и тонкого органического синтеза
,
НИЛ медицинской химии
, научный сотрудник, 1 сентября 2014 - 3 апреля 2015
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Химический факультет
,
Кафедра медицинской химии и тонкого органического синтеза
,
НИЛ медицинской химии
, научный сотрудник, 6 апреля 2015 - 31 декабря 2021, по совместительству
ФГБНУ ИПВЭ им. М.П. Чумакова
Соавторы:
Палюлин В.А.
,
Зефиров Н.С.
,
Козловская Л.И.
,
Орлов А.А.
,
Карганова Г.Г.
,
Дуева Е.В.
,
Ishmukhametov A.
,
Аверина Е.Б.
,
Никитина А.А.
,
Коршун В.А.
,
Радченко Е.В.
,
Седенкова К.Н.
,
Chistov A.A.
показать полностью...
,
Уварова В.И.
,
Кузнецова Т.С.
,
Милаева Е.Р.
,
Фомина А.Д.
,
Гришин Ю.К.
,
Егоров А.М.
,
Романов Г.А.
,
Aralov A.V.
,
Lomin S.N.
,
Василенко Д.А.
,
Грачева Ю.А.
,
Елецкая А.А.
,
Соснина Е.А.
,
Rogova Y.V.
,
Доценко В.В.
,
Жеребкер А.Я.
,
Перминова И.В.
,
Соснин С.Б.
,
Устинов А.В.
,
Brylev V.A.
,
Chupakhin V.I.
,
Danilenko V.N.
,
Kutyakov S.V.
,
Pentkovski V.M.
,
Proskurin G.V.
,
Vorovitch M.F.
,
Моисеенко А.В.
,
Слесарчук Н.А.
,
Хватов Е.В.
,
Шпаковский Д.Б.
,
Шульга Д.А.
,
Drenichev M.S.
,
Frolov K.A.
,
Oliferenko A.A.
,
Steklov M.Y.
,
Varnek A.
,
Антоненко Т.А.
,
Баскин И.И.
,
Волок В.П.
,
Зефирова О.Н.
,
Михайлов С.Н.
,
Назарова А.А.
,
Орлова С.И.
,
Ословский В.Е.
,
Савельева Е.М.
,
Соколова О.С.
,
Тучинская К.К.
,
Хватов Е.В.
,
Шайтан К.В.
,
Шевцова А.С.
,
Шевцова Е.Ф.
,
Arkhipov D.V.
,
Frolenko V.S.
,
Horvath D.
,
Ignatova A.A.
,
Jegorov A.V.
,
Krivokolysko S.G.
,
Krivosheev D.M.
,
Myakushina Y.A.
,
Ovcharenko V.I.
,
Romanova L.I.
,
Snoeck R.
,
Streshnev P.P.
,
Zakharevich N.V.
,
Авдеев Д.В.
,
Апарин И.О.
,
Аралов А.В.
,
Багров Д.В.
,
Беляев Е.С.
,
Бибилашвили Р.Ш.
,
Бутов Г.М.
,
Гетман И.А.
,
Зайцев П.А.
,
Зефиров Н.А.
,
Кирпичников М.П.
,
Коручеков А.А.
,
Матюгина Е.С.
,
Моисеева А.А.
,
Молокоедов А.С.
,
Никитин Н.А.
,
Никитин Т.Д.
,
Николаев Е.Н.
,
Николаева Ю.В.
,
Овчинников М.В.
,
Палькеева М.Е.
,
Писарев С.А.
,
Проскурин Г.В.
,
Сапожникова К.А.
,
Сидорова М.В.
,
Сухоруков М.В.
,
Тюрин В.Ю.
,
Феофанов А.В.
,
Фроленко В.С.
,
Холодилов И.С.
,
Царева Д.А.
,
Штиль А.А.
,
Штро А.А.
,
Яшин Н.В.
,
Agramonte N.M.
,
Ales C.
,
Anastasia G.
,
Anisimov V.N.
,
Bayurova E.
,
Bernier U.R.
,
Dodina M.S.
,
Dzhivanian T.I.
,
Eugene K.
,
Eugene N.
,
Fedoros E.I.
,
Fedorov M.
,
Fursova E.Y.
,
Goryashenko A.S.
,
Grishin K.V.
,
Gubareva E.A.
,
Gunnar W.
,
Ivanova A.L.
,
Izotova E.I.
,
Joanna Z.
,
Karapetian R.N.
,
Karpov P.V.
,
Kashchenko A.V.
,
Katritzky A.R.
,
Khlevin D.A.
,
Kolachevskaya O.O.
,
Konyushko O.I.
,
Korshun V.A.
,
Kozhokar U.S.
,
Krasnov K.A.
,
Lakatosh S.A.
,
Linthicum K.J.
,
Litvinov D.S.
,
Lyapustin V.N.
,
Maduar V.V.
,
Marcou G.
,
Maydin M.A.
,
Mikhura I.V.
,
Morozkin E.S.
,
Oksanich A.S.
,
Oliferenko P.V.
,
Panchenko A.V.
,
Paulavets V.V.
,
Pigarev S.E.
,
Pillai G.G.
,
Poda G.
,
Porozov Y.B.
,
Preobrazhenskaya M.N.
,
Rathi B.
,
Romanova E.G.
,
Savelyev E.N.
,
Schmülling T.
,
Shishova A.A.
,
Shmanai V.V.
,
Tatjana A.Ž.
,
Tsikolia M.
,
Tuchynska K.
,
Tyurin A.P.
,
Vladimir O.
,
Zakharova M.Y.
,
Överby A.K.
,
Алферова В.А.
,
Андриасов К.С.
,
Артамонова И.И.
,
Беришвили В.П.
,
Бриджеш Р.
,
Брылёв В.А.
,
Брылёв В.А.
,
Веселов М.М.
,
Владимиров С.А.
,
Волков М.Б.
,
Воронков А.Э.
,
Габибов А.Г.
,
Галочкина А.В.
,
Глазунова В.А.
,
Глухов Г.С.
,
Гмыль А.П.
,
Даниленко В.Н.
,
Егоров А.М.
,
Жернов Ю.В.
,
Захаревич Н.В.
,
Зиппль В.
,
Ивин Ю.Ю.
,
Калиберда Е.Г.
,
Карань Л.С.
,
Карлов Д.С.
,
Карлова М.Г.
,
Кнорре В.Д.
,
Ковпак А.А.
,
Кожокарь У.С.
,
Колпакова Е.С.
,
Константинов А.И.
,
Костюкевич Ю.И.
,
Кочетков С.Н.
,
Кузнецов Н.А.
,
Куляев П.О.
,
Кучина В.В.
,
Лавров М.И.
,
Логинов С.В.
,
Лозинская Н.А.
,
Макенов М.Т.
,
Мелешонкова Н.Н.
,
Михновец И.Э.
,
Морозов А.С.
,
Неганова М.Е.
,
Нидхи Д.
,
Олиференко А.А.
,
Орлинсон Б.С.
,
Орлов А.А.
,
Охезин Е.В.
,
Парфёнова Е.В.
,
Парфёнова Е.В.
,
Пейсикова А.В.
,
Пешич А.
,
Пиванова Г.П.
,
Пиняева А.Н.
,
Полякова М.В.
,
Порозов Ю.Б.
,
Проскурнина М.В.
,
Роньян Д.
,
Рубекина А.А.
,
Рыбаков В.Б.
,
Садовников К.С.
,
Семенов В.В.
,
Семенова М.Н.
,
Сидоров Г.В.
,
Смирнов И.В.
,
Сольев П.Н.
,
Сосонюк С.Е.
,
Стороженко П.А.
,
Стрелков С.В.
,
Стрешнев Ф.П.
,
Тутушкина А.В.
,
Тындык M.Л.
,
Улащик Е.А.
,
Федорова О.С.
,
Федотов А.Ю.
,
Фолькерс Г.
,
Хёльтье Х.Д.
,
Чернохаева Л.Л.
,
Чистов А.А.
,
Чумаков С.П.
,
Чупахин В.И.
,
Шевцов П.Н.
,
Ширшин Е.А.
,
Шустова Е.Ю.
75 статей
,
1 книга
,
91 доклад на конференциях
,
55 тезисов докладов
,
14 НИР
,
5 патентов
,
1 членство в редколлегии журнала
,
1 членство в редколлегии сборника
,
1 членство в программном комитете
,
2 диссертации
,
8 дипломных работ
,
1 курсовая работа
,
1 учебный курс
Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 775, Scopus: 792
РИНЦ:
IstinaResearcherID (IRID): 445222
ResearcherID:
D-6732-2011
Scopus Author ID:
16040145000
ORCID:
0000-0002-0462-2945
Деятельность
Статьи в журналах
2023
5-(Perylen-3-ylethynyl)uracil as an antiviral scaffold: Potent suppression of enveloped virus reproduction by 3-methyl derivatives in vitro
Chistov Alexey A.
,
Chumakov Stepan P.
,
Mikhnovets Igor E.
,
Nikitin Timofei D.
,
Slesarchuk Nikita A.
,
Uvarova Victoria I.
,
Rubekina Anna A.
,
Nikolaeva Yulia V.
,
Radchenko Eugene V.
,
Khvatov Evgeny V.
,
Orlov Alexey A.
, Frolenko Vasilisa S.,
Sukhorukov Maksim V.
,
Kolpakova Ekaterina S.
,
Shustova Elena Yu
,
Galochkina Anastasiya V.
,
Streshnev Philipp P.
, Osipov Eugene M.,
Sapozhnikova Ksenia A.
,
Moiseenko Andrey V.
,
Brylev Vladimir A.
,
Proskurin Gleb V.
, Dokukin Yuri S.,
Kutyakov Sergey V.
,
Aralov Andrey V.
,
Korshun Vladimir A.
,
Strelkov Sergei V.
,
Palyulin Vladimir A.
,
Ishmukhametov Aydar A.
,
Shirshin Evgeny A.
,
Osolodkin Dmitry I.
,
Shtro Anna A.
,
Kozlovskaya Liubov I.
,
Alferova Vera A.
,
Ustinov Alexey V.
в журнале
Antiviral Research
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 209
DOI
2023
Charge-changing point mutations in the E protein of tick-borne encephalitis virus
Kozlovskaya Liubov I.
,
Osolodkin Dmitry I.
,
Tuchynskaya Ksenia K.
,
Shevtsova Anastasia S.
,
Okhezin Egor V.
,
Palyulin Vladimir A.
,
Nikitin Nikolai A.
,
Karganova Galina G.
в журнале
Archives of Virology
, издательство
Springer Verlag
(Germany)
, том 168, № 3
DOI
2023
Tetrahydroquinazoline N-oxide derivatives inhibit reproduction of tick-borne and mosquito-borne flaviviruses
Sedenkova K.N.
,
Uvarova V.I.
,
Nazarova A.A.
,
Peisikova A.V.
,
Khvatov E.V.
,
Sukhorukov M.V.
,
Frolenko V.S.
, Goryashchenko A.S.,
Kholodilov I.S.
,
Grishin Y.K.
,
Rybakov V.B.
,
Makenov M.T.
,
Morozkin E.S.
,
Karan L.S.
,
Kozlovskaya L.I.
,
Ishmukhametov A.A.
,
Osolodkin D.I.
,
Averina E.B.
в журнале
Archiv der Pharmazie
, издательство
John Wiley & Sons Ltd.
(United Kingdom)
DOI
2022
Cytotoxicity reduction by O-nicotinoylation of antiviral 6-benzylaminopurine ribonucleosides
Zenchenko Anastasia A.,
Oslovsky Vladimir E.
, Varizhuk Irina V., Karpova Evgenia V.,
Osolodkin Dmitry I.
,
Kozlovskaya Liubov I.
,
Ishmukhametov Aydar A.
,
Drenichev Mikhail S.
в журнале
Toxicology in Vitro
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 82
DOI
2022
Properties and Activity of Peptide Derivatives of ACE2 Cellular Receptor and Their Interaction with SARS-CoV-2 S Protein Receptor-Binding Domain
Sidorova M.V.
,
Bibilashvili R.S.
,
Avdeev D.V.
,
Kozhokar U.S.
,
Palkeeva M.E.
,
Ovchinnikov M.V.
,
Molokoedov A.S.
, Shirokov D.A., Semyonova A.V.,
Uvarova V.I.
, Kulyaev P.O.,
Khvatov E.V.
,
Ignatova A.A.
,
Feofanov A.V.
,
Osolodkin D.I.
,
Porozov Yu B.
,
Kozlovskaya L.I.
,
Ishmukhametov A.A.
,
Parfyonova Ye V.
,
Egorov A.M.
в журнале
Doklady Biochemistry and Biophysics
, издательство
M A I K Nauka - Interperiodica
(Russian Federation)
, том 507, с. 455-459
DOI
2022
Size Distribution of Inactivated Tick-Borne Encephalitis Virus Particles Revealed by a Comprehensive Physicochemical Approach
Moiseenko Andrey V.
,
Bagrov Dmitry V.
,
Vorovitch Mikhail F.
,
Uvarova Victoria I.
,
Veselov Maxim M.
,
Kashchenko Anastasia V.
,
Ivanova Alla L.
,
Osolodkin Dmitry I.
,
Egorov Alexey M.
,
Ishmukhametov Aydar A.
,
Shaitan Konstantin V.
,
Sokolova Olga S.
в журнале
BIOMEDICINES
, том 10, № 10, с. 2478
DOI
2022
Structural characterization of β‐propiolactone inactivated severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS‐CoV‐2) particles
Bagrov Dmitry V.
,
Glukhov Grigory S.
,
Moiseenko Andrey V.
,
Karlova Maria G.
,
Litvinov Daniil S.
,
Zaitsev Petr А.
,
Kozlovskaya Liubov I.
,
Shishova Anna A.
,
Kovpak Anastasia A.
,
Ivin Yury Y.
,
Piniaeva Anastasia N.
,
Oksanich Alexey S.
,
Volok Viktor P.
,
Osolodkin Dmitry I.
,
Ishmukhametov Aydar A.
,
Egorov Alexey M.
,
Shaitan Konstantin V.
,
Kirpichnikov Mikhail P.
,
Sokolova Olga S.
в журнале
Microscopy Research and Technique
, издательство
John Wiley & Sons Inc.
(United States)
, том 85, № 2, с. 562-569
DOI
2022
СВОЙСТВА И АКТИВНОСТЬ ПЕПТИДОВ НА ОСНОВЕ КЛЕТОЧНОГО РЕЦЕПТОРА АСЕ2 И ИХ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ С РЕЦЕПТОР-СВЯЗЫВАЮЩИМ ДОМЕНОМ БЕЛКА S ВИРУСА SARS-COV-2
Сидорова М.В.
,
Бибилашвили Р.Ш.
,
Авдеев Д.В.
,
Кожокарь У.С.
,
Палькеева М.Е.
,
Овчинников М.В.
,
Молокоедов А.С.
, Широков Д.А., Семенова А.В.,
Уварова В.И.
,
Куляев П.О.
,
Хватов Е.В.
,
Игнатова А.А.
,
Феофанов А.В.
,
Осолодкин Д.И.
,
Порозов Ю.Б.
,
Козловская Л.И.
,
Ишмухаметов А.А.
,
Парфёнова Е.В.
,
Егоров А.М.
в журнале
Доклады Российской академии наук. Науки о жизни
, издательство
Российская академия наук
(Москва)
, том 507, № 1, с. 455-459
DOI
2021
Effect of immature tick-borne encephalitis virus particles on antiviral activity of 5-aminoisoxazole-3-carboxylic acid adamantylmethyl esters
Tuchynskaya K.K.
,
Fomina A.D.
,
Nikitin N.A.
,
Illarionova V.V.
,
Volok V.P.
,
Kozlovskaya L.I.
, Rogova A.A.,
Vasilenko D.A.
,
Averina E.B.
,
Osolodkin D.I.
,
Karganova G.G.
в журнале
Journal of General Virology
, издательство
Society for General Microbiology
(United Kingdom)
, том 102, № 9
DOI
2021
Estimation of the structural heterogeneity of Tick-Borne Encephalitis vaccine particles
Moiseenko Andrey
,
Zaitsev Petr
,
Vorovitch Mikhail
,
Osolodkin Dmitry
,
Ishmukhametov Aidar
,
Egorov Alexey
,
Shaitan Konstantin
,
Kirpichnikov Mikhail
,
Sokolova Olga
в журнале
Microscopy and Microanalysis
, издательство
Cambridge University Press
(United Kingdom)
, том 27, № S1, с. 84-86
DOI
2021
Phenoxazine nucleoside derivatives with a multiple activity against RNA and DNA viruses
Kozlovskaya Liubov I.
,
Volok Viktor P.
,
Shtro Anna A.
,
Nikolaeva Yulia V.
,
Chistov Alexey A.
,
Matyugina Elena S.
,
Belyaev Evgeny S.
,
Jegorov Artjom V.
,
Snoeck Robert
,
Korshun Vladimir A.
, Andrei Graciela,
Osolodkin Dmitry I.
,
Ishmukhametov Aydar A.
,
Aralov Andrey V.
в журнале
European Journal of Medicinal Chemistry
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 220
DOI
2021
Pre-Steady-State Kinetics of the SARS-CoV-2 Main Protease as a Powerful Tool for Antiviral Drug Discovery
Zakharova Maria Yu
, Kuznetsova Alexandra A.,
Uvarova Victoria I.
,
Fomina Anastasiia D.
,
Kozlovskaya Liubov I.
,
Kaliberda Elena N.
, Kurbatskaia Inna N.,
Smirnov Ivan V.
, Bulygin Anatoly A.,
Knorre Vera D.
,
Fedorova Olga S.
,
Varnek Alexandre
,
Osolodkin Dmitry I.
,
Ishmukhametov Aydar A.
,
Egorov Alexey M.
,
Gabibov Alexander G.
,
Kuznetsov Nikita A.
в журнале
Frontiers in pharmacology
, издательство
Frontiers Media]
([Lausanne, Switzerland)
, том 12
DOI
2020
A Chemographic Audit of anti-Coronavirus Structure-Activity Information from Public Databases (ChEMBL)
Horvath Dragos
,
Orlov Alexey
,
Osolodkin Dmitry I.
,
Ishmukhametov Aydar A.
,
Marcou Gilles
,
Varnek Alexandre
в журнале
Molecular informatics
, издательство
Wiley-VCH Verlag
(Weinheim, Germany, Germany)
, том 39, с. 2000080
DOI
2020
Recommender Systems in Antiviral Drug Discovery
Sosnina Ekaterina A.
,
Sosnin Sergey
,
Nikitina Anastasia A.
, Nazarov Ivan,
Osolodkin Dmitry I.
,
Fedorov Maxim V.
в журнале
ACS Omega
, том 5, № 25, с. 15039-15051
DOI
2020
Simplistic perylene-related compounds as inhibitors of tick-borne encephalitis virus reproduction
Slesarchuk Nikita A.
,
Khvatov Evgeny V.
,
Chistov Alexey A.
,
Proskurin Gleb V.
,
Nikitin Timofei D.
, Lazarevich Anastasiya I., Ulanovskaya Angelina A.,
Ulashchik Egor A.
,
Orlov Alexey A.
,
Jegorov Artjom V.
,
Ustinov Alexey V.
,
Tyurin Anton P.
,
Shmanai Vadim V.
,
Ishmukhametov Aydar A.
,
Korshun Vladimir A.
,
Osolodkin Dmitry I.
,
Kozlovskaya Liubov I.
,
Aralov Andrey V.
в журнале
Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters
, издательство
Pergamon Press Ltd.
(United Kingdom)
, том 30, № 10, с. 127100
DOI
2020
Spectrum of antiviral activity of 4-aminopyrimidine N-oxides against a broad panel of tick-borne encephalitis virus strains
Dueva E.V.
, Tuchynskaya K.K.,
Kozlovskaya L.I.
,
Osolodkin D.I.
,
Sedenkova K.N.
,
Averina E.B.
,
Palyulin V.A.
,
Karganova G.G.
в журнале
Antiviral Chemistry and Chemotherapy
, издательство
International Medical Press
(United Kingdom)
, том 28, с. 1-10
DOI
2019
ABSTRACT P-28: PROTOCOL OF TICK-BORNE ENCEPHALITIS VIRUS SAMPLE PREPARATION FOR STRUCTURAL STUDIES
Fedotov A.Y.
,
Vorovitch M.F.
,
Tuchinskaya K.K.
,
Grishin K.V.
,
Konyushko O.I.
,
Osolodkin D.I.
,
Ishmukhametov A.A.
,
Egorov A.M.
в журнале
International Journal of Biomedicine
, том 9, № 1, с. 29-29
2019
Antiviral activity spectrum of phenoxazine nucleoside derivatives
Kozlovskaya Liubov I.
, Graciela Andrei,
Orlov Alexey A.
, Khvatov Evgeny V.,
Koruchekov Alexander A.
,
Belyaev Evgeny S.
,
Nikolaev Evgeny N.
,
Korshun Vladimir A.
,
Robert Snoeck
,
Osolodkin Dmitry I.
,
Matyugina Elena S.
,
Aralov Andrey V.
в журнале
Antiviral Research
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 163, с. 117-124
DOI
2019
Compounds based on 5-(perylen-3-ylethynyl)uracil scaffold: High activity against tick-borne encephalitis virus and non-specific activity against enterovirus A
Chistov Alexey A.
,
Orlov Alexey A.
,
Streshnev Philipp P.
,
Slesarchuk Nikita A.
,
Aparin Ilya O.
,
Brijesh Rathi
,
Brylev Vladimir A.
,
Kutyakov Sergey V.
,
Mikhura Irina V.
,
Ustinov Alexey V.
,
Gunnar Westman
,
Palyulin Vladimir A.
, Nidhi Jain,
Osolodkin Dmitry I.
,
Kozlovskaya Liubov I.
,
Korshun Vladimir A.
в журнале
European Journal of Medicinal Chemistry
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 171, с. 93-103
DOI
2019
Enhanced taxonomy annotation of antiviral activity data from ChEMBL
Nikitina Anastasia A.
,
Orlov Alexey A.
,
Kozlovskaya Liubov I.
,
Palyulin Vladimir A.
,
Osolodkin Dmitry I.
в журнале
Database : the journal of biological databases and curation
, издательство
Oxford Journals
(Oxford, England)
, том 2019, с. bay139
DOI
2019
Examination of molecular space and feasible structures of bioactive components of humic substances by FTICR MS data mining in ChEMBL database
Orlov Alexey A.
,
Zherebker Alexander
,
Eletskaya Anastasia A.
, Chernikov Viktor S.,
Kozlovskaya Liubov I.
,
Zhernov Yury V.
,
Kostyukevich Yury
,
Palyulin Vladimir A.
,
Nikolaev Eugene N.
,
Osolodkin Dmitry I.
,
Perminova Irina V.
в журнале
Scientific reports
, издательство
Nature Publishing Group
(United Kingdom)
, том 9, с. 12066
DOI
2019
Getting to Know the Neighbours with GTM: the Case of Antiviral Compounds
Orlov Alexey A.
, Khvatov Evgeny V.,
Koruchekov Alexander A.
,
Nikitina Anastasia A.
, Zolotareva Anastasia D.,
Eletskaya Anastasia A.
,
Kozlovskaya Liubov I.
,
Palyulin Vladimir A.
,
Horvath Dragos
,
Osolodkin Dmitry I.
,
Varnek Alexandre
в журнале
Molecular informatics
, издательство
Wiley-VCH Verlag
(Weinheim, Germany, Germany)
, том 38, с. 1800166
DOI
2019
Modeling of Protein–Protein Interactions in Cytokinin Signal Transduction
Arkhipov Dmitry V.
,
Lomin Sergey N.
,
Myakushina Yulia A.
,
Savelieva Ekaterina M.
,
Osolodkin Dmitry I.
,
Romanov Georgy A.
в журнале
International Journal of Molecular Sciences
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 20, № 9, с. 2096
DOI
2019
Ramified derivatives of 5-(perylen-3-ylethynyl)uracil-1-acetic acid and their antiviral properties
Sapozhnikova Ksenia A.
,
Slesarchuk Nikita A.
,
Orlov Alexey A.
, Khvatov Evgeny V.,
Radchenko Eugene V.
,
Chistov Alexey A.
,
Ustinov Alexey V.
,
Palyulin Vladimir A.
,
Kozlovskaya Liubov I.
,
Osolodkin Dmitry I.
,
Korshun Vladimir A.
,
Brylev Vladimir A.
в журнале
RSC advances
, издательство
Royal Society of Chemistry
(United Kingdom)
, том 9, № 45, с. 26014-26023
DOI
2019
Synthesis and cytotoxicity of novel simplified eleutherobin analogues as potential antitumor agents
Sosonyuk Sergey E.
,
Anita Peshich
,
Tutushkina Anastasia V.
,
Khlevin Dmitry A.
,
Lozinskaya Natalia A.
,
Gracheva Yulia A.
,
Glazunova Valeria A.
,
Osolodkin Dmitry I.
,
Semenova Marina N.
,
Semenov Victor V.
,
Palyulin Vladimir A.
,
Proskurnina Marina V.
,
Shtil Alexander A.
,
Zefirov Nikolay S.
в журнале
Organic and Biomolecular Chemistry
, издательство
Royal Society of Chemistry
(United Kingdom)
, том 17, с. 2792-2797
DOI
2019
Tick-borne encephalitis in Europe and Russia: Review of pathogenesis, clinical features, therapy, and vaccines
Daniel Ruzek,
Tatjana Avšič Županc
, Johannes Borde,
Ales Chrdle
, Ludek Eyer,
Galina Karganova
,
Ivan Kholodilov
, Nataša Knap,
Liubov Kozlovskaya
, Andrey Matveev, Miller Andrew D.,
Osolodkin Dmitry I.
,
Överby Anna K.
, Nina Tikunova, Sergey Tkachev,
Joanna Zajkowska
в журнале
Antiviral Research
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
DOI
2019
Tick-borne flavivirus reproduction inhibitors based on isoxazole core linked with adamantane
Vasilenko Dmitry A.
,
Dueva Evgenia V.
,
Kozlovskaya Liubov I.
,
Zefirov Nikolay A.
,
Grishin Yuri K.
,
Butov Gennady M.
,
Palyulin Vladimir A.
,
Kuznetsova Tamara S.
,
Karganova Galina G.
,
Zefirova Olga N.
,
Osolodkin Dmitry I.
,
Averina Elena B.
в журнале
Bioorganic Chemistry
, издательство
Academic Press
(United States)
, том 87, с. 629-637
DOI
2018
3′-O-Substituted 5-(perylen-3-ylethynyl)-2′-deoxyuridines as tick-borne encephalitis virus reproduction inhibitors
Proskurin Gleb V.
,
Orlov Alexey A.
,
Brylev Vladimir A.
,
Kozlovskaya Liubov I.
,
Chistov Alexey A.
,
Karganova Galina G.
,
Palyulin Vladimir A.
,
Osolodkin Dmitry I.
,
Korshun Vladimir A.
,
Aralov Andrey V.
в журнале
European Journal of Medicinal Chemistry
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 155, с. 77-83
DOI
2018
A facile metal-free approach to N,N’-bis(1-oxidopyrimidin-4-yl)diamines with promising biological activity
Sedenkova K.N.
,
Nazarova A.A.
, Khatov E.V.,
Dueva E.V.
,
Orlov A.A.
,
Osolodkin D.I.
,
Grishin Yu K.
,
Kuznetsova T.S.
,
Palyulin V.A.
,
Averina E.B.
в журнале
Mendeleev Communications
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 28, № 6, с. 592-594
DOI
2018
Cytokinin Perception in Potato: New Features of Canonic Players
Lomin Sergey N.
,
Myakushina Yulia A.
,
Kolachevskaya Oksana O.
,
Getman Irina A.
,
Arkhipov Dmitry V.
,
Savelieva Ekaterina M.
,
Osolodkin Dmitry I.
,
Romanov Georgy A.
в журнале
Journal of Experimental Botany
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
, том 69, № 16, с. 3839-3853
DOI
2018
Cytokinin activity of N6-benzyladenine derivatives assayed by interaction with the receptors in planta, in vitro, and in silico
Savelieva Ekaterina M.
,
Oslovsky Vladimir E.
,
Karlov Dmitry S.
, Kurochkin Nikolay N.,
Getman Irina A.
,
Lomin Sergey N.
,
Sidorov Georgy V.
,
Mikhailov Sergey N.
,
Osolodkin Dmitry I.
,
Romanov Georgy A.
в журнале
Phytochemistry
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 149, с. 161-177
DOI
2018
Experimental Evaluation of the Protective Efficacy of Tick-Borne Encephalitis (TBE) Vaccines Based on European and Far-Eastern TBEV Strains in Mice and in Vitro
Chernokhaeva Liubov L.
,
Rogova Yulia V.
,
Kozlovskaya Liubov I.
,
Romanova Lidiya I.
,
Osolodkin Dmitry I.
,
Vorovitch Mikhail F.
,
Karganova Galina G.
в журнале
Frontiers in microbiology
, издательство
Frontiers Research Foundation
(Switzerland)
, том 9, с. 1487
DOI
2018
Influence of Descriptor Implementation on Compound Ranking Based on Multi-Parameter Assessment
Sosnina Ekaterina A.
,
Osolodkin Dmitry I.
,
Radchenko Eugene V.
,
Sergey Sosnin
,
Palyulin Vladimir A.
в журнале
Journal of Chemical Information and Modeling
, издательство
American Chemical Society
(United States)
, том 58, № 5, с. 1083-1093
DOI
2018
Novel water-soluble lignin derivative BP-Cx-1: identification of components and screening of potential targets in silico and in vitro
Fedoros Elena I.
,
Orlov Alexey A.
,
Zherebker Alexander
,
Gubareva Ekaterina A.
,
Maydin Mikhail A.
,
Konstantinov Andrey I.
,
Krasnon Konstantin A.
,
Karapetian Ruben N.
,
Izotova Ekaterina I.
,
Pigarev Sergey E.
,
Panchenko Andrey V.
,
Tyndyk Margarita L.
,
Osolodkin Dmitry I.
,
Nikolaev Evgeny N.
,
Perminova Irina V.
,
Anisimov Vladimir N.
в журнале
Oncotarget
, издательство
Impact Journals
(Albany, N.Y., United States)
, том 9, с. 18578-18593
DOI
2018
Probing chemical space of tick‐borne encephalitis virus reproduction inhibitors with organoselenium compounds
Orlov Alexey A.
,
Eletskaya Anastasia A.
,
Frolov Konstantin A.
, Golinets Anastasia D.,
Palyulin Vladimir A.
,
Krivokolysko Sergey G.
,
Kozlovskaya Liubov I.
,
Dotsenko Victor V.
,
Osolodkin Dmitry I.
в журнале
Archiv der Pharmazie
, издательство
John Wiley & Sons Ltd.
(United Kingdom)
, том 351, № 6, с. e1700353
DOI
2018
Selective Inhibition of Enterovirus A Species Members’ Reproduction by Furano[2,3-d]pyrimidine Nucleosides Revealed by Antiviral Activity Profiling against (+)ssRNA Viruses
Kozlovskaya Liubov I.
, Golinets Anastasia D.,
Eletskaya Anastasia A.
,
Orlov Alexey A.
,
Palyulin Vladimir A.
,
Kochetkov Sergey N.
, Alexandrova Liudmila A.,
Osolodkin Dmitry I.
в журнале
ChemistrySelect
, том 3, № 8, с. 2321-2325
DOI
2017
New Tools in Nucleoside Toolbox of Tick-Borne Encephalitis Virus Reproduction Inhibitors
Orlov Alexey A.
,
Drenichev Mikhail S.
,
Oslovsky Vladimir E.
, Kurochkin Nikolay N.,
Solyev Pavel N.
,
Kozlovskaya Liubov I.
,
Palyulin Vladimir A.
,
Karganova Galina G.
,
Mikhailov Sergey N.
,
Osolodkin Dmitry I.
в журнале
Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters
, издательство
Pergamon Press Ltd.
(United Kingdom)
, том 27, № 5, с. 1267-1273
DOI
2017
Perylenyltriazoles inhibit reproduction of enveloped viruses
Aralov Andrey V.
,
Proskurin Gleb V.
,
Orlov Alexey A.
,
Kozlovskaya Liubov I.
,
Chistov Alexey A.
,
Kutyakov Sergey V.
,
Karganova Galina G.
,
Palyulin Vladimir A.
,
Osolodkin Dmitry I.
,
Korshun Vladimir A.
в журнале
European Journal of Medicinal Chemistry
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 138, с. 293-299
DOI
2017
Redox-active metal complexes with 2,2΄-dipicolylamine containing ferrocenyl moiety: synthesis, electrochemical behavior and biological activity
Milaeva Elena R.
,
Tyurin Vladimir Yu
,
Shpakovsky Dmitry B.
,
Moiseeva Anna A.
,
Gracheva Yulia A.
,
Antonenko Taisiya A.
,
Maduar Viktoria V.
,
Osolodkin Dmitry I.
,
Palyulin Vladimir A.
,
Shevtsova Elena F.
в журнале
Journal of Organometallic Chemistry
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 839, с. 60-70
DOI
2017
Synthesis of novel non-natural spiro[2.3]hexane amino acids, the conformationally restricted analogs of γ-aminobutyric acid
Yashin N.V.
,
Averina E.B.
,
Vasilenko D.A.
,
Grishin Yu K.
,
Osolodkin D.I.
,
Palyulin V.A.
,
Kuznetsova T.S.
,
Zefirov N.S.
в журнале
Russian Chemical Bulletin
, издательство
Springer Nature
(Switzerland)
, том 66, № 8, с. 1483-1490
DOI
2017
Синтез новых неприродных спиро[2.3]гексановых аминокислот – конформационно-жестких аналогов γ-аминомасляной кислоты
Яшин Н.В.
,
Аверина Е.Б.
,
Василенко Д.А.
,
Гришин Ю.К.
,
Осолодкин Д.И.
,
Палюлин В.А.
,
Кузнецова Т.С.
,
Зефиров Н.С.
в журнале
Известия Академии наук. Серия химическая
, издательство
Наука
(М.)
, № 8, с. 1483-1490
2016
Rigid amphipathic nucleosides suppressing reproduction of tick-borne encephalitis virus
Orlov Alexey A.
,
Chistov Alexey A.
,
Kozlovskaya Liubov I.
,
Ustinov Alexey V.
,
Korshun Vladimir A.
,
Karganova Galina G.
,
Osolodkin Dmitry I.
в журнале
MedChemComm
, издательство
Royal Society of Chemistry
(United Kingdom)
, том 7, № 3, с. 495-499
DOI
2015
Plant membrane assays with cytokinin receptors underpin the unique role of free cytokinin bases as biologically active ligands
Lomin Sergey N.
,
Krivosheev Dmitry M.
,
Steklov Mikhail Yu
, Arkhipov Dmitry V.,
Osolodkin Dmitry I.
,
Schmülling Thomas
,
Romanov Georgy A.
в журнале
Journal of Experimental Botany
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
, том 66, № 7, с. 1851-1863
DOI
2015
Progress in visual representations of chemical space
Osolodkin Dmitry I.
,
Radchenko Eugene V.
,
Orlov Alexey A.
,
Voronkov Andrey E.
,
Palyulin Vladimir A.
,
Zefirov Nikolay S.
в журнале
Expert Opinion on Drug Discovery
, издательство
Informa Healthcare
(United Kingdom)
, том 10, № 9, с. 959-973
DOI
2015
Some insight into the mode of cytotoxic action of organotin compounds with protective 2,6-di-tert-butylphenol fragments
Milaeva E.R.
,
Shpakovsky D.B.
,
Gracheva Y.A.
,
Antonenko T.A.
,
Osolodkin D.I.
,
Palyulin V.A.
,
Shevtsov P.N.
,
Neganova M.E.
, Vinogradova D.V.,
Shevtsova E.F.
в журнале
Journal of Organometallic Chemistry
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 782, с. 96-102
DOI
2015
Synthesis and assessment of 4-aminotetrahydroquinazoline derivatives as tick-borne encephalitis virus reproduction inhibitors
Sedenkova Kseniya N.
,
Dueva Evgenia V.
,
Averina Elena B.
,
Grishin Y.K.
,
Osolodkin Dmitry I.
,
Kozlovskaya Liubov I.
,
Palyulin Vladimir A.
,
Savelyev Evgenii N.
,
Orlinson Boris S.
, Novakov Ivan A.,
Butov Gennady M.
,
Kuznetsova Tamara S.
,
Karganova Galina G.
,
Zefirov Nikolay S.
в журнале
Organic and Biomolecular Chemistry
, издательство
Royal Society of Chemistry
(United Kingdom)
, том 13, № 11, с. 3406-3415
DOI
2014
Interaction of Flaviviruses with Reproduction Inhibitors Binding in β-OG Pocket: Insights from Molecular Dynamics Simulations
Dueva E.V.
,
Osolodkin D.I.
,
Kozlovskaya L.I.
,
Palyulin V.A.
,
Pentkovski V.M.
,
Zefirov N.S.
в журнале
Molecular informatics
, издательство
Wiley-VCH Verlag
(Weinheim, Germany, Germany)
, том 33, № 10, с. 695-708
DOI
2013
Glycogen synthase kinase 3 as an anticancer drug target: Novel experimental findings and trends in the design of inhibitors
Osolodkin DI
,
Palyulin VA
,
Zefirov NS
в журнале
Current Pharmaceutical Design
, издательство
Bentham Science Publishers
(Netherlands)
, том 19, № 4, с. 665-679
DOI
2013
Inhibitors of Tick-Borne Flavivirus Reproduction from Structure-Based Virtual Screening
Osolodkin D.I.
,
Kozlovskaya L.I.
,
Dueva E.V.
,
Dotsenko V.V.
,
Rogova Y.V.
, Frolov K.A.,
Krivokolysko S.G.
,
Romanova E.G.
,
Morozov A.S.
,
Karganova G.G.
,
Palyulin V.A.
,
Pentkovski V.M.
,
Zefirov N.S.
в журнале
ACS Medicinal Chemistry Letters
, издательство
American Chemical Society
(United States)
, том 4, № 9, с. 869-874
DOI
2013
Promising Aedes aegypti Repellent Chemotypes Identified through Integrated QSAR, Virtual Screening, Synthesis, and Bioassay
Oliferenko Polina V.
,
Oliferenko Alexander A.
,
Poda Gennadiy I.
,
Osolodkin Dmitry I.
,
Pillai Girinath G.
,
Bernier Ulrich R.
,
Tsikolia Maia
,
Agramonte Natasha M.
, Clark Gary G.,
Linthicum Kenneth J.
,
Katritzky Alan R.
в журнале
PLoS ONE
, издательство
Public Library of Science
(United States)
, том 8, № 9, с. e64547
DOI
2013
Structural basis for cytokinin receptor signaling: an evolutionary approach
Steklov Mikhail Yu
,
Lomin Sergey N.
,
Osolodkin Dmitry I.
,
Romanov Georgy A.
в журнале
Plant Cell Reports
, издательство
Springer Verlag
(Germany)
, том 32, № 6, с. 781-793
DOI
2013
Анализ молекулярной динамики белков Е вариантов ВКЭ на основе разности корреляционных матриц
Козловская Л.И.
,
Осолодкин Д.И.
,
Карганова Г.Г.
в журнале
Медицинская вирусология
, том 27, № 2, с. 42-53
DOI
2012
A molecular model and Monte Carlo simulation of flavivirus envelope building block
Osolodkin D.I.
,
Kozlovskaya L.I.
,
Palyulin V.A.
,
Pentkovski V.M.
,
Karganova G.G.
,
Zefirov N.S.
в журнале
Biochemical and Biophysical Research Communications
, издательство
Academic Press
(United States)
, том 425, № 2, с. 207-211
DOI
2012
Polytopic zinc dipicolylamine complex containing a ferrocene moiety as a new lipoxygenase LOX I-B inhibitor
Milaeva E.R.
,
Meleshonkova N.N.
,
Shpakovsky D.B.
,
Paulavets V.V.
,
Orlova S.I.
,
Osolodkin D.I.
,
Palyulin V.A.
,
Loginov S.V.
,
Storozhenko P.A.
,
Zefirov N.S.
в журнале
Doklady Chemistry
, издательство
Pleiades Publishing, Ltd
(Road Town, United Kingdom)
, том 443, № 1, с. 77-79
DOI
2012
Receptor Properties and Features of Cytokinin Signaling
Lomin S.N.
,
Krivosheev D.M.
,
Steklov M.Yu
,
Osolodkin D.I.
,
Romanov G.A.
в журнале
Acta Naturae (англоязычная версия)
, издательство
Park Media Ltd
(Moscow, Russia (Federation))
, том 4, № 3, с. 31-45
2012
Signatures of the ATP-binding pocket as a basis for structural classification of the serine/threonine protein kinases of gram-positive bacteria
Zakharevich Natalia V.
,
Osolodkin Dmitry I.
,
Artamonova Irena I.
,
Palyulin Vladimir A.
,
Zefirov Nikolay S.
,
Danilenko Valery N.
в журнале
Proteins: Structure, Function and Bioinformatics
, издательство
Wiley-Liss Inc
(United States)
, том 80, № 5, с. 1363-1376
DOI
2012
Simulation of Intramolecular Hydrogen Bond Dynamics in Manzamine A as a Sensitive Test for Charge Distribution Quality
Shulga D.A.
,
Osolodkin D.I.
,
Palyulin V.A.
,
Zefirov N.S.
в журнале
Natural product communications
, издательство
Natural Product Communications
(United States)
, том 7, № 3, с. 295-299
2011
Bacterial Eukaryotic Type Serine-Threonine Protein Kinases: From Structural Biology to Targeted Anti-Infective Drug Design
Danilenko V.N.
,
Osolodkin D.I.
,
Lakatosh S.A.
,
Preobrazhenskaya M.N.
,
Shtil A.A.
в журнале
Current Topics in Medicinal Chemistry
, издательство
Bentham Science Publishers
(Netherlands)
, том 11, № 11, с. 1352-1369
DOI
2011
Bioinformatic analysis of glycogen synthase kinase 3: human versus parasite kinases
Osolodkin Dmitry I.
,
Zakharevich Natalia V.
,
Palyulin Vladimir A.
,
Danilenko Valery N.
,
Zefirov Nikolay S.
в журнале
Parasitology
, издательство
Cambridge University Press
(United Kingdom)
, том 138, № 6, с. 725-735
DOI
2011
Computational Studies of Flaviviruses: Approaching to Novel Fusion Inhibitors
Osolodkin D.I.
,
Kozlovskaya L.I.
,
Karganova G.G.
,
Dueva E.V.
,
Palyulin V.A.
,
Zefirov N.S.
,
Pentkovski V.M.
в журнале
Journal of Cheminformatics
, издательство
Chemistry Central
(United Kingdom)
, том 4, с. P29-P29
DOI
2011
Copper complexes with nitronylnitroxyl radicals as lipoxygenase inhibitors with antioxidant activity
Milaeva E.R.
,
Orlova S.I.
,
Osolodkin D.I.
,
Palyulin V.A.
,
Fursova E.Y.
,
Ovcharenko V.I.
,
Zefirov N.S.
в журнале
Russian Chemical Bulletin
, издательство
Springer Nature
(Switzerland)
, том 60, № 12, с. 2564-2571
DOI
2011
General Purpose Electronegativity Relaxation Charge Models Applied to CoMFA and CoMSIA Study of GSK-3 Inhibitors
Tsareva Daria A.
,
Osolodkin Dmitry I.
,
Shulga Dmitry A.
,
Oliferenko Alexander A.
,
Pisarev Sergey A.
,
Palyulin Vladimir A.
,
Zefirov Nikolay S.
в журнале
Molecular informatics
, издательство
Wiley-VCH Verlag
(Weinheim, Germany, Germany)
, том 30, № 2-3, с. 169-180
DOI
2011
One-class classification as a novel method of ligand-based virtual screening: The case of glycogen synthase kinase 3 beta inhibitors
Karpov Pavel V.
,
Osolodkin Dmitry I.
,
Baskin Igor I.
,
Palyulin Vladimir A.
,
Zefirov Nikolay S.
в журнале
Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters
, издательство
Pergamon Press Ltd.
(United Kingdom)
, том 21, № 22, с. 6728-6731
DOI
2011
Structure-Based Virtual Screening of Glycogen Synthase Kinase 3 beta Inhibitors: Analysis of Scoring Functions Applied to Large True Actives and Decoy Sets
Osolodkin Dmitry I.
,
Palyulin Vladimir A.
,
Zefirov Nikolay S.
в журнале
Chemical Biology and Drug Design
, издательство
Blackwell
(United Kingdom)
, том 78, № 3, с. 378-390
DOI
2011
Комплексы меди с нитронилнитроксильными радикалами – ингибиторы липоксигеназы с антиоксидантной активностью
Милаева Е.Р.
,
Орлова С.И.
,
Осолодкин Д.И.
,
Палюлин В.А.
, Фурсова Е.Ю.,
Овчаренко В.И.
,
Зефиров Н.С.
в журнале
Известия Академии наук. Серия химическая
, издательство
Наука
(М.)
, № 12, с. 2514-2521
2010
GAG-binding variants of tick-borne encephalitis virus
Kozlovskaya L.I.
,
Osolodkin D.I.
,
Shevtsova A.S.
,
Romanova L.I.
,
Rogova Y.V.
,
Dzhivanian T.I.
,
Lyapustin V.N.
,
Pivanova G.P.
,
Gmyl A.P.
,
Palyulin V.A.
,
Karganova G.G.
в журнале
Virology
, издательство
Academic Press
(United States)
, том 398, № 2, с. 262-272
DOI
2010
Interaction of manzamine A with glycogen synthase kinase 3 beta: a molecular dynamics study
Osolodkin D.I.
,
Shulga D.A.
,
Palyulin V.A.
,
Zefirov N.S.
в журнале
Russian Chemical Bulletin
, издательство
Springer Nature
(Switzerland)
, том 59, № 10, с. 1983-1993
DOI
2010
New Test System for Serine/Threonine Protein Kinase Inhibitors Screening: E. coli APHVIII/Pk25 design
Bekker O.B., Alekseeva M.G.,
Osolodkin D.I.
,
Palyulin V.A.
, Elizarov S.M.,
Zefirov N.S.
,
Danilenko V.N.
в журнале
Acta Naturae (англоязычная версия)
, издательство
Park Media Ltd
(Moscow, Russia (Federation))
, том 2, № 3, с. 110-121
DOI
2010
The choice of atomic charges calculation scheme in 3D-QSAR modelling of GSK-3β inhibition by paullones
Osolodkin D.I.
,
Shulga D.A.
,
Tsareva D.A.
,
Oliferenko A.A.
,
Palyulin V.A.
,
Zefirov N.S.
в журнале
Doklady Biochemistry and Biophysics
, издательство
M A I K Nauka - Interperiodica
(Russian Federation)
, том 434, № 1, с. 274-278
DOI
2009
Molecular modeling of ligand-receptor interactions in GABA(C) receptor
Osolodkin D.I.
,
Chupakhin V.I.
,
Palyulin V.A.
,
Zefirov N.S.
в журнале
Journal of Molecular Graphics and Modelling
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 27, № 7, с. 813-821
DOI
2007
Modeling and analysis of ligand-receptor interactions in the GABA(c) receptor
Osolodkin D.I.
,
Chupakhin V.I.
,
Palyulin V.A.
,
Zefirov N.S.
в журнале
Doklady Biochemistry and Biophysics
, издательство
M A I K Nauka - Interperiodica
(Russian Federation)
, том 412, № 1, с. 25-28
DOI
Статьи в сборниках
2022
COMPETITION AND COLLABORATION OF IN SILICO AND IN VITRO SCREENING IN THE SEARCH FOR NEW ANTIVIRAL COMPOUNDS
Osolodkin Dmitry I.
,
Kozlovskaya Liubov I.
в сборнике
Proceedings book of the XXVIII Symposium on Bioinformatics and Computer-Aided Drug Discovery
, место издания
Institute of Biomedical Chemistry Moscow
, с. 26-26
DOI
2022
Discovery of small molecule antivirals targeting tick-borne encephalitis virus
Goryashchenko Alexander S.
,
Uvarova Victoria I.
,
Osolodkin Dmitry I.
,
Ishmukhametov Aydar A.
в сборнике
Medicinal Chemistry of Tick-Borne Encephalitis
, серия
Annual Reports in Medicinal Chemistry
, издательство
Academic Press
(United States)
, том 58, с. 1-54
DOI
редактор
Осолодкин Дмитрий Иванович
2019
Analysis of Chemical Spaces: Implications for Drug Repurposing
Orlov Alexey A.
,
Berishvili Vladimir P.
,
Nikitina Anastasia A.
,
Osolodkin Dmitry I.
,
Radchenko Eugene V.
,
Palyulin Vladimir A.
в сборнике
In Silico Drug Design
, издательство
Academic Press
(United States)
, с. 359-395
DOI
2013
Новые структурные мотивы лиганд-связывающего модуля рецепторов цитокининов
Стеклов М.Ю., Ломин С.Н.,
Осолодкин Д.И.
,
Романов Г.А.
в сборнике
Рецепторы и внутриклеточная сигнализация. Сборник статей
, место издания
М.: ООО "ИД В. Ема" Москва
, том 1, с. 157-161
Книги
2013
Молекулярное моделирование. Теория и практика
Хёльтье Х.Д.
,
Зиппль В.
,
Роньян Д.
,
Фолькерс Г.
,
Олиференко А.А.
,
Осолодкин Д.И.
,
Писарев С.А.
,
Чупахин В.И.
,
Палюлин В.А.
,
Радченко Е.В.
место издания
Бином Москва
, ISBN 978-5-9963-1070-8, 319 с.
Доклады на конференциях
2022
Прогнозирование активности ингибиторов Mpro SARS-CoV-2 на основе ансамблевого докинга и машинного обучения
(Устный)
Авторы:
Фомина Анастасия Дмитриевна
,
Осолодкин Дмитрий Иванович
Конференция молодых учёных и специалистов ФНЦИРИП им. М.П. Чумакова РАН (Институт полиомиелита)
, Москва, Россия, 2 сентября 2022
2022
ACTIVITY PREDICTION OF SARS-COV-2 MPRO INHIBITORS BASED ON ENSEMBLE DOCKING AND MACHINE LEARNING
(Устный)
Авторы:
Fomina Anastasia D.
,
Osolodkin Dmitry I.
BIOINFORMATICS AND COMPUTER-AIDED DRUG DISCOVERY
, Москва, Россия, 24-26 мая 2022
2022
Новые методы синтеза и функционализации производных изоксазола. Поиск соединений с различными типами биологической активности
(Устный)
Авторы:
Аверина Е.Б.
,
Василенко Д.А.
,
Садовников К.С.
,
Седенкова К.Н.
,
Осолодкин Д.И.
,
Зефирова О.Н.
,
Палюлин В.А.
,
Милаева Е.Р.
5-я Российская конференция МедХим-Россия 2021
, Волгоград, Россия, 16-19 мая 2022
2022
Разработка метода ансамблевого докинга ингибиторов протеазы 3CLpro SARS-CoV-2
(Стендовый)
Авторы:
Фомина А.Д.
,
Осолодкин Д.И.
5-я Российская конференция МедХим-Россия 2021
, Волгоград, Россия, 16-19 мая 2022
2022
Синтетические подходы к новым производным пиримидина с биологической активностью и флуоресцентными свойствами
(Устный)
Авторы:
Седенкова К.Н.
,
Назарова А.А.
,
Осолодкин Д.И.
,
Палюлин В.А.
,
Зефиров Н.А.
,
Зефирова О.Н.
,
Грачева Ю.А.
,
Милаева Е.Р.
,
Аверина Е.Б.
5-я Российская конференция МедХим-Россия 2021
, Волгоград, Россия, 16-19 мая 2022
2022
Single Particle X-Ray Imaging of Tick-Borne Encephalitis Virus at the European XFEL (SPB/SFX experiment 2671)
(Стендовый)
Авторы:
Osolodkin D.I.
,
Vorovich M.F.
,
Round E.
,
Bean R.
,
Bielecki J.
,
Khvatov E.V.
,
Ivanova A.L.
,
Uvarova V.I.
,
Assalauova D.
,
Ignatenko A.
,
Bobkov S.
,
Kurta R.
,
Armeev G.
,
Tesluyk A.
,
Sobolev E.
,
Moiseenko A.V.
,
Sokolova O.S.
,
Bagrov D.V.
,
Ilyin V.A.
,
Rychev M.
,
Vartanyants I.A.
,
Mancuso A.P.
,
Egorov A.M.
,
Ishmukhametov A.A.
European XFEL Users' Meeting 2022/DESY Photon Science Users' Meeting 2022
, Hamburg (online), Германия, 21-28 января 2022
2021
Синтез и биологическая активность 3-замещенных циклооктансодержащих изоксазолинов
(Устный)
Авторы:
Андриасов К.С.
,
Еременко М.Г.
,
Седенкова К.Н.
,
Грачева Ю.А.
,
Осолодкин Д.И.
,
Аверина Е.Б.
IX Молодежная конференция ИОХ РАН, посвященная 160-летию со дня рождения академика Н.Д. Зелинского
, Москва, Россия, 11-12 ноября 2021
2021
Структурная гетерогенность популяции вируса клещевого энцефалита как фактор снижения эффективности профилактических и лечебных препаратов
(Устный)
Авторы:
Тучинская К.К.
,
Волок В.П.
,
Илларионова В.В.
,
Осолодкин Д.И.
,
Козловская Л.И.
,
Карганова Г.Г.
Всероссийская научно-практическая конференция с международным участием «Современная иммунопрофилактика: вызовы, возможности, перспективы»
, Россия, Москва, Россия, 7-8 октября 2021
2021
ВИРТУАЛЬНЫЙ СКРИНИНГ ИНГИБИТОРОВ ПРОТЕАЗЫ 3CLPRO КОРОНАВИРУСА SARS-COV-2 НА ОСНОВЕ АНСАМБЛЕВОГО ДОКИНГА
(Устный)
Авторы:
Фомина А.Д.
,
Осолодкин Д.И.
XXVII Симпозиум "Биоинформатика и компьютерное конструирование лекарств"
, Онлайн на базе платформы zoom, Россия, 5-8 апреля 2021
2021
Structural Characterisation of Inactivated SARS-CoV-2 Particles for a Vaccine Preparation
(Стендовый)
Авторы:
Kozlovskaya L.
,
Bagrov D.
,
Gluhov G.
,
Karlova M.
,
Moiseenko A.
,
Litvinov D.
,
Shishova A.
,
Kovpak A.
,
Ivin Y.
,
Piniaeva A.
,
Osolodkin D.
,
Shaitan K.
,
Sokolova O.S.
,
Kirpichnikov M.
,
Egorov A.M.
,
Ishmukhametov A.
34th International Conference on Antiviral Research (ICAR2021)
, онлайн, США, 22-25 марта 2021
2021
SARS-CoV-2 Virion Samples for Single Particle Imaging at the European XFEL
(Стендовый)
Авторы:
Bagrov D.V.
,
Gluhov G.S.
,
Karlova M.G.
,
Moiseenko A.V.
,
Litvinov D.S.
,
Kirpichnikov M.P.
,
Shaitan K.V.
,
Sokolova O.S.
,
Kozlovskaya L.I.
,
Shishova A.A.
,
Kovpak A.A.
,
Ivin Y.Y.
,
Piniaeva A.N.
,
Osolodkin D.I.
,
Ishmukhametov A.A.
,
Egorov A.M.
European XFEL Users' Meeting 2021
, Гамбург, Германия, 25-29 января 2021
2020
Search for small molecule binding sites in Flavivirus NS1 protein
(Стендовый)
Авторы:
Fomina A.D.
,
Palyulin V.A.
,
Osolodkin D.I.
5th Advanced in silico Drug Design workshop/challenge
, Оломоуц, Чехия, 3-7 февраля 2020
2019
Противовирусные препараты широкого спектра действия
(Устный)
Авторы:
Проскурин Г.В.
,
Слесарчук Н.А.
,
Никитин Т.Д.
,
Чистов А.А.
,
Сапожникова К.А.
, Хватов Е.В.,
Орлов А.А.
,
Чекерда Е.В.
,
Галочкина А.В.
,
Штро А.А.
,
Брылев В.А.
,
Коршун В.А.
,
Аралов А.В.
,
Осолодкин Д.И.
,
Устинов А.В.
Юбилейная V Междисциплинарная конференция «Молекулярные и биологические аспекты химии, фармацевтики и фармакологии» (МОБИ-ХимФарма2019)
, Судак, Крым, Россия, 15-18 сентября 2019
2018
Противовирусные свойства производных перилена
(Устный)
Авторы:
Чистов А.А.
,
Проскудин Г.В.
,
Слесарчук Н.А.
,
Ширшин Е.А.
,
Рубекина А.А.
,
Сапожникова К.А.
,
Орлов А.А.
,
Брылёв В.А.
,
Коршун В.А.
,
Осолодкин Д.И.
,
Устинов А.В.
IV Междисциплинарный симпозиум по медицинской, органической, биологической химии и фармацевтике МОБИ-ХимФарма2018
, Новый Свет, Крым, Россия, 23-26 сентября 2018
2018
Endeavor to analyze antiviral activity data: large-scale analysis of virus-related information allows to find new inhibitors of flavivirus and enterovirus reproduction
(Стендовый)
Авторы:
Nikitina A.
,
Orlov A.
,
Khvatov E.
,
Kozlovskaya L.
,
Palyulin V.
,
Osolodkin D.
22nd European Symposium on Quantitative Structure-Activity Relationships EuroQSAR2018, Thessaloniki, Greece, September 16-20, 2018
, Thessaloniki, Греция, 16-20 сентября 2018
2018
Design and antiviral activity evaluation of small molecule compounds against viruses from Flavivirus and Enterovirus genera
(Устный)
Авторы:
Alexey Orlov
,
Mikhail Drenichev
,
Vladimir Oslovsky
,
Konstantin Frolov
,
Anastasia Nikitina
,
Eugene Khvatov
,
Anastasia Eletskaya
,
Anastasia Golinec
,
Mikhailov Sergey N.
,
Vladimir Palyulin
,
Galina Karganova
,
Victor Dotsenko
,
Liubov Kozlovskaya
,
Osolodkin Dmitry I.
256th ACS National Meeting
, Бостон, США, 19-23 августа 2018
2018
Virtual screening of small molecule libraries based on antiviral chemical space analysis
(Стендовый)
Авторы:
Nikitina A.
,
Orlov A.
,
Horvath D.
,
Palyulin V.
,
Varnek A.
,
Osolodkin D.
6th Chemoinformatics Strasbourg Summer School
, Страсбург, Франция, 25-29 июня 2018
2018
Влияние точечных мутаций на динамическое поведение белков Е оболочки вирионов вирусов клещевого энцефалита и Повассан
(Устный)
Авторы:
Владимиров С.А.
,
Орлов А.А.
,
Палюлин В.А.
,
Осолодкин Д.И.
XXV Российский национальный конгресс "Человек и лекарство"
, Москва, Россия, 9-12 апреля 2018
2018
КАРТИРОВАНИЕ ХИМИЧЕСКОГО ПРОСТРАНСТВА ИНГИБИТОРОВ РЕПРОДУКЦИИ ФЛАВИВИРУСОВ - НИЗКОМОЛЕКУЛЯРНЫХ ОРГАНИЧЕСКИХ СОЕДИНЕНИЙ И КОМПОНЕНТОВ ГУМИНОВЫХ СИСТЕМ НА ОСНОВЕ БАЗЫ ДАННЫХ VIRALCHEMBL И ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫХ ДАННЫХ
(Устный)
Авторы:
ОРЛОВ А.А.
,
НИКИТИНА А.А.
,
ЖЕРЕБКЕР А.Я.
,
ПАЛЮЛИН В.А.
,
ПЕРМИНОВА И.В.
,
ОСОЛОДКИН Д.И.
XXV Российский национальный конгресс "Человек и лекарство"
, Москва, Россия, 9-12 апреля 2018
2017
ViralChEMBL: Enhancement of antiviral activity data from ChEMBL
(Устный)
Авторы:
Osolodkin D.I.
,
Nikitina A.A.
,
Orlov A.A.
,
Kozlovskaya L.I.
,
Palyulin V.A.
3rd Russian Conference on Medicinal Chemistry/3-я Российская конференция по медицинской химии
, Казань, Россия, 28 сентября - 3 ноября 2017
2017
ViralChEMBL: Purification and enhancement of antiviral activity data from ChEMBL
(Устный)
Авторы:
Dmitry Osolodkin
,
Anastasia Nikitina
,
Alexey Orlov
254th ACS National Meeting & Exposition, Washington, DC, USA, August 20-24, 2017
, Washington, DC, USA, США, 20-24 августа 2017
2017
ANALYSIS OF SMALL MOLECULES BINDING WITH DENGUE VIRUS ENVELOPE PROTEIN TRIMER
(Стендовый)
Авторы:
Volkov M.B.
,
Orlov A.A.
,
Osolodkin D.I.
,
Palyulin V.A.
,
Zefirov N.S.
3rd Kazan Summer School on Chemoinformatics
, Казань, Россия, 5-7 июля 2017
2017
ChEMBL antiviral data analysis
(Устный)
Авторы:
Nikitina Anastasia A.
,
Orlov Alexey A.
,
Osolodkin Dmitry I.
,
Palyulin Vladimir A.
,
Zefirov Nikolay S.
3rd Kazan Summer School on Chemoinformatics
, Казань, Россия, 5-7 июля 2017
2017
EXPLORING CHEMICAL SPACE OF HUMIC SUBSTANCES THROUGH ESI FTICR MS ANALYSIS AND SIMILARITY SEARCHING
(Стендовый)
Авторы:
Orlov A.A.
,
Zherebker A.Ya
,
Eletskaya A.A.
,
Kozlovskaya L.I.
,
Perminova I.V.
,
Osolodkin D.I.
3rd Kazan Summer School on Chemoinformatics
, Казань, Россия, 5-7 июля 2017
2017
Анализ способа связывания низкомолекулярных соединений с тримером белка оболочки E вируса денге
(Устный)
Авторы:
Волков М.Б.
,
Орлов А.А.
,
Осолодкин Д.И.
,
Палюлин В.А.
,
Зефиров Н.С.
XXIV Российский национальный конгресс "Человек и лекарство"
, Москва, Россия, 10-13 апреля 2017
2016
Analysis of antiviral chemical space based on ChEMBL data
(Устный)
Авторы:
Orlov Alexey A.
,
Nikitina Anastasia A.
,
Osolodkin Dmitry I.
,
Palyulin Vladimir A.
,
Zefirov Nikolay S.
12th German Conference on Chemoinformatics
, Fulda, Германия, 6-8 ноября 2016
2016
Computational studies of interactions between flavivirus E proteins and small molecule reproduction inhibitors
(Стендовый)
Авторы:
Dueva E.
,
Osolodkin D.
,
Kozlovskaya L.
,
Karganova G.
,
Palyulin V.
,
Zefirov N.
,
Tuchynska K.
4th Antivirals Congress 2016
, Sitges, Испания, 18-21 сентября 2016
2016
Analysis and visualization of antiviral chemical space
(Стендовый)
Авторы:
Nikitina A.A.
,
Orlov A.A.
,
Osolodkin D.I.
,
Palyulin V.A.
,
Zefirov N.S.
21st European Symposium on Quantitative Structure-Activity Relationship: Where Molecular Simulations Meet Drug Discovery, Verona, Italy, September 4-8, 2016
, Verona, Италия, 4 сентября - 8 октября 2016
2016
Fusion inhibitors of tick-borne flaviviruses: identification and mode of action study
(Устный)
Авторы:
Dueva E.V.
,
Osolodkin D.I.
,
Kozlovskaya L.I.
,
Karganova G.G.
,
Palyulin V.A.
,
Zefirov N.S.
21st European Symposium on Quantitative Structure-Activity Relationship: Where Molecular Simulations Meet Drug Discovery, Verona, Italy, September 4-8, 2016
, Verona, Италия, 4 сентября - 8 октября 2016
2016
Influence of molecular descriptor calculation schemes on multiparameter optimization based virtual screening
(Стендовый)
Авторы:
Sosnina E.A.
,
Osolodkin D.I.
,
Sosnin S.B.
,
Radchenko E.V.
,
Palyulin V.A.
,
Zefirov N.S.
21st European Symposium on Quantitative Structure-Activity Relationship: Where Molecular Simulations Meet Drug Discovery, Verona, Italy, September 4-8, 2016
, Verona, Италия, 4 сентября - 8 октября 2016
2016
Molecular motions and reproduction inhibitors of tick-borne encephalitis virus
(Стендовый)
Авторы:
Osolodkin D.I.
,
Dueva E.V.
,
Orlov A.A.
,
Palyulin V.A.
,
Zefirov N.S.
,
Kozlovskaya L.I.
,
Karganova G.G.
21st European Symposium on Quantitative Structure-Activity Relationship: Where Molecular Simulations Meet Drug Discovery, Verona, Italy, September 4-8, 2016
, Verona, Италия, 4 сентября - 8 октября 2016
2016
Redox-active metal complexes with 2,2΄-dipicolylamine containing ferrocenyl moiety: synthesis, electrochemical behaviour and biological activity
(Стендовый)
Авторы:
Milaeva E.
,
Tyurin V.
,
Shpakovsky D.
,
Moiseeva A.
,
Gracheva Y.
,
Antonenko T.
,
Palyulin V.
,
Osolodkin D.
,
Shevtsova E.
The 8th International Symposium on Bioorganometallic Chemistry, ISBOMC16
, Москва, Россия, 4-8 сентября 2016
2016
PERYLENE DERIVATIVES OF NUCLEOSIDES: SYNTHESIS AND ANTIVIRAL PROPERTIES
(Устный)
Авторы:
Proskurin G.V.
,
Chistov A.A.
,
Orlov A.A.
,
Aralov A.V.
,
Brylev V.A.
,
Tyurin A.P.
,
Prokhorenko I.A.
,
Kutyakov S.V.
,
Aparin I.O.
,
Ivanov N.M.
,
Ulashchik E.A.
,
Streshnev F.P.
,
Sapozhnikova K.A.
,
Korelskaya K.S.
,
Myasoutova A.A.
,
Shmanai V.V.
,
Ustinov A.V.
,
Osolodkin D.I.
,
Korshun V.A.
Химическая биология. Международная конференция посвященная 90-летию академика Д.Г.Кнорре.
, Новосибирск, Россия, 24-28 июля 2016
2016
СИНТЕЗ 5-(ПЕРИЛЕН-3-ИЛЭТИНИЛ)УРАЦИЛ УКСУСНОЙ КИСЛОТЫ И ЕЁ АМИДОВ ДЛЯ ИЗУЧЕНИЯ БИОЛОГИЧЕСКОЙ АКТИВНОСТИ ПРОТИВ ОБОЛОЧЕЧНЫХ ВИРУСОВ
(Стендовый)
Авторы:
Стрешнев Ф.П.
,
Чистов А.А.
,
Апарин И.О.
,
Сапожникова К.А.
,
Орлов А.А.
,
Коршун В.А.
,
Козловская Л.И.
,
Осолодкин Д.И.
,
Бриджеш Р.
,
Нидхи Д.
,
Брылёв В.А.
Химическая биология. Международная конференция посвященная 90-летию академика Д.Г.Кнорре.
, Новосибирск, Россия, 24-28 июля 2016
2016
Влияние методов расчета дескрипторов на мультипараметрическую оценку терапевтического потенциала соединения
(Устный)
Авторы:
Соснина Е.А.
,
Осолодкин Д.И.
,
Радченко Е.В.
,
Соснин С.Б.
,
Палюлин В.А.
,
Зефиров Н.С.
XXIII Российский национальный Конгресс «Человек и лекарство»
, Москва, Россия, 11-14 апреля 2016
2016
СОЗДАНИЕ ВЫСОКОКАЧЕСТВЕННО АННОТИРОВАННОЙ БИБЛИОТЕКИ СОЕДИНЕНИЙ, ТЕСТИРОВАННЫХ НА ПРОТИВОВИРУСНУЮ АКТИВНОСТЬ
(Устный)
Авторы:
НИКИТИНА А.А.
,
ОРЛОВ А.А.
,
ОСОЛОДКИН Д.И.
,
ПАЛЮЛИН В.А.
,
ЗЕФИРОВ Н.С.
XXIII Российский национальный Конгресс «Человек и лекарство»
, Москва, Россия, 11-14 апреля 2016
2016
Can we turn the histidine switch off? Molecular dynamics simulations of flavivirus envelope proteins
(Устный)
Авторы:
Osolodkin D.I.
,
Dueva E.V.
,
Palyulin V.A.
,
Zefirov N.S.
251st American Chemical Society National Meeting & Exposition
, Сан Диего, Калифорния, США, 13-17 марта 2016
2016
Dependence of multiparameter optimization results on descriptors variation
(Устный)
Авторы:
Sosnina E.A.
,
Osolodkin D.I.
,
Radchenko E.V.
,
Palyulin V.A.
,
Zefirov N.S.
251st American Chemical Society National Meeting & Exposition
, Сан Диего, Калифорния, США, 13-17 марта 2016
2016
Small molecules against tick-borne flaviviruses
(Стендовый)
Авторы:
Dmitry Osolodkin
,
Evgenia Dueva
,
Alexey Orlov
,
Liubov Kozlovskaya
,
Vladimir Palyulin
,
Galina Karganova
,
Nikolay Zefirov
251st American Chemical Society National Meeting & Exposition
, Сан Диего, Калифорния, США, 13-17 марта 2016
2015
Novel Chemotypes of Reproduction Inhibitors for Flaviviruses
(Стендовый)
Авторы:
Osolodkin D.I.
,
Dueva E.V.
,
Sedenkova K.S.
,
Averina E.B.
,
Kozlovskaya L.I.
,
Karganova G.G.
,
Palyulin V.A.
,
Zefirov N.S.
Frontiers in Medicinal Chemistry 2015
, Антверпен, Бельгия, 14-16 сентября 2015
2015
QSAR study of Glycogen Synthase Kinase 3 inhibitors
(Стендовый)
Авторы:
Sosnina E.A.
,
Osolodkin D.I.
,
Radchenko E.V.
,
Sosnin S.B.
,
Palyulin V.A.
,
Zefirov N.S.
Second Kazan Summer School on Chemoinformatics, July 6-9, 2015, Kazan, Russia
, Kazan, Россия, 6-9 июля 2015
2015
Discovery of Small Molecule Inhibitors of Tick-Borne Flaviviruses Reproduction
(Устный)
Авторы:
Osolodkin D.I.
,
Kozlovskaya L.I.
,
Palyulin V.A.
,
Karganova C.G.
,
Zefirov N.S.
2nd Russian Conference on Medicinal Chemistry MedChemRussia 2015; Novosibirsk, Russia, 5-10 July 2015
, Новосибирск, Россия, 5-10 июля 2015
2015
Synthesis and anti-TBEV Properties of 4-Aminopirimidine N-oxides
(Стендовый)
Авторы:
Sedenkova K.N.
,
Dueva E.V.
,
Osolodkin D.I.
,
Averina E.B.
,
Palyulin V.A.
,
Grishin Yu K.
,
Kuznetzova T.S.
,
Zefirov N.S.
2nd Russian Conference on Medicinal Chemistry MedChemRussia 2015; Novosibirsk, Russia, 5-10 July 2015
, Новосибирск, Россия, 5-10 июля 2015
2015
Synthesis and assessment of novel 5-aminoisoxazole and4-aminopyrimidine derivatives as antiviral agents
(Стендовый)
Авторы:
Kuznetsova T.S.
,
Averina E.B.
,
Sedenkova K.N.
,
Zefirov N.S.
,
Vasilenko D.A.
,
Osolodkin D.I.
,
Palyulin V.A.
,
Dueva E.V.
Anatolian Conference on Synthetic Organic Chemistry
, Анталия, Турция, 16-19 марта 2015
2014
Analysis of the Binding Mode of Antiviral Peptides to the Flavivirus Envelope Protein E Based on Protein—Protein Docking
Авторы:
Orlov Alexey A.
,
Osolodkin Dmitry I.
,
Palyulin Vladimir A.
,
Zefirov Nikolay S.
The 9th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology — BGRS\SB-2014
, Novosibirsk, Akademgorodok, 2014
2014
Computational and experimental studies of flavivirus envelope proteins as promising drug targets
Авторы:
Osolodkin Dmitry I.
,
Kozlovskaya Liubov I.
,
Dueva Evgenia V.
,
Zefirov Nikolay S.
,
Palyulin Vladimir A.
,
Karganova Galina G.
,
Orlov Alexey A.
20th European Symposium on Quantitative Structure-Activity Relationships EuroQSAR2014, August 31 – September 4, 2014
, St. Petersburg, Russia, Россия, 2014
2014
Elucidation of intrinsic determinants of fusion initiation in flavivirus envelope proteins through molecular dynamics simulations
Авторы:
Osolodkin Dmitry I.
,
Kozlovskaya Liubov I.
,
Dueva Evgenia V.
,
Karganova Galina G.
,
Palyulin Vladimir A.
,
Zefirov Nikolay S.
3rd Annual CCP-BioSim Conference, Frontiers of Biomolecular Simulation
, Edinburgh, UK, 2014
2014
Flavivirus Envelope Proteins as Targets of Novel Antiviral Compounds
Авторы:
Dmitry Osolodkin
,
Liubov Kozlovskaya
,
Evgenia Dueva
,
Nikolay Zefirov
,
Vladimir Palyulin
,
Galina Karganova
,
Alexey Orlov
23rd International Symposium on Medicinal Chemistry EFMC-ISMC 2014
, Lisbon, Portugal, Португалия, 2014
2014
Molecular Dynamics Simulations of Flavivirus Envelope Proteins
(Устный)
Авторы:
Osolodkin Dmitry I.
,
Kozlovskaya Liubov I.
,
Dueva Evgenia V.
,
Orlov Alexey A.
,
Karganova Galina G.
,
Palyulin Vladimir A.
,
Zefirov Nikolay S.
10th Congress of the World Association of Theoretical and Computational Chemists (WATOC)
, Santiago, Chile, Чили, 2014
2014
Novel Antiviral Compounds Targeting Flavivirus Envelope Proteins
Авторы:
Dmitry Osolodkin
,
Liubov Kozlovskaya
,
Evgenia Dueva
,
Alexey Orlov
,
Vladimir Palyulin
,
Galina Karganova
,
Nikolay Zefirov
1st EFMC-young Medicinal Chemist Symposium
, Lisbon, Portugal, Португалия, 2014
2014
On the Way to Fusion Inhibitors for Tick-Borne Flaviviruses: Identification of Lead Compounds and Mechanism Studies
Авторы:
Osolodkin Dmitry I.
,
Kozlovskaya Liubov I.
,
Dueva Evgenia V.
,
Dotsenko Victor V.
,
Orlov Alexey A.
,
Rogova Yulia V.
,
Palyulin Vladimir A.
,
Karganova Galina G.
,
Zefirov Nikolay S.
248th American Chemical Society National Meeting & Exposition
, San Francisco, CA, USA, США, 2014
2014
The prefusion and postfusion forms of the envelope protein E as targets for the development of Flavivirus inhibitors
(Стендовый)
Авторы:
Orlov Alexey A.
,
Osolodkin Dmitry I.
,
Kozlovskaya Liubov I.
,
Dotsenko Victor V.
,
Frolov Konstantin A.
,
Rogova Yulia V.
,
Karganova Galina G.
,
Palyulin Vladimir A.
,
Zefirov Nikolay S.
3rd Antivirals Congress
, NH Grand Krasnaplosky, Amsterdam, The Netherlands, Нидерланды, 2014
2014
Cинтез новых биологически активных 4-аминозамещенных пиримидинов и пиримидин N-оксидов
(Стендовый)
Авторы:
Седенкова К.Н.
,
Аверина Е.Б.
,
Дуева Е.В.
,
Осолодкин Д.И.
,
Палюлин В.А.
,
Кузнецова Т.С.
,
Зефиров Н.С.
3 Всероссийская научная конференция с международным участием «Успехи синтеза и комплексообразования
, г. Москва, РУДН, 21-25 апреля 2014 г., Россия, 21-25 апреля 2014
2014
Новый Метод Синтеза Функционализированных 5-Аминоизоксазолов и Изучение их Биоактивности.
(Стендовый)
Авторы:
Аверина Е.Б.
,
Кузнецова Т.С.
,
Дуева Е.В.
,
Василенко Д.А.
,
Осолодкин Д.И.
,
Палюлин В.А.
,
Зефиров Н.С.
3 Всероссийская научная конференция с международным участием «Успехи синтеза и комплексообразования
, г. Москва, РУДН, 21-25 апреля 2014 г., Россия, 21-25 апреля 2014
2013
Experimental tick-borne encephalitis with ongoing doxycycline treatment
Авторы:
Rogova Y.V.
,
Kozlovskaya L.I.
,
Dueva E.V.
,
Osolodkin D.I.
,
Palyulin V.A.
,
Karganova G.G.
XII International Jena symposium on tick-bone diseases(IJSTD-XII2013)
, Weimar, Germany, Германия, 2013
2013
Tick-borne encephalitis virus fusion inhibitors
Авторы:
Dueva E.V.
,
Osolodkin D.I.
,
Kozlovskaya L.I.
,
Rogova Y.V.
,
Zefirov N.S.
,
Pentkovski V.M.
,
Palyulin V.A.
,
Karganova G.G.
,
Dotsenko V.V.
XII International Jena symposium on tick-bone diseases(IJSTD-XII2013)
, Weimar, Germany, Германия, 2013
2013
Анализ способа связывания противофлавивирусных пептидов
Авторы:
Орлов А.А.
,
Осолодкин Д.И.
,
Палюлин В.А.
,
Зефиров Н.С.
Актуальные проблемы клещевого энцефалита
, Москва, Россия, 2013
2013
Изучение взаимодействий белков оболочки Е флавивирусов со связывающимися в гидрофобном кармане ингибиторами методом молекулярной динамики
Авторы:
Дуева Е.В.
,
Осолодкин Д.И.
,
Козловская Л.И.
,
Палюлин В.А.
,
Карганова Г.Г.
,
Пентковский В.М.
,
Зефиров Н.С.
Актуальные проблемы клещевого энцефалита
, Москва, Россия, 2013
2013
Моделирование молекулярной динамики белков оболочки вируса клещевого энцефалита: на пути к атомистическому описанию взаимодействия вируса с клеткой
Авторы:
Осолодкин Д.И.
,
Дуева Е.В.
,
Козловская Л.И.
,
Карганова Г.Г.
,
Палюлин В.А.
,
Зефиров Н.С.
Актуальные проблемы клещевого энцефалита
, Москва, Россия, 2013
2013
Молекулярный дизайн ингибиторов серин-треониновых протеинкиназ mycobacterium tuberculosis
Авторы:
Михайлова Е.Б.
,
Зефиров Н.С.
,
Палюлин В.А.
,
Осолодкин Д.И.
XX всероссийский конгресс "Человек и лекарство"
, Москва, Россия, 2013
2013
Experimental tick-borne encephalitis under treatment with several antibiotics
Авторы:
Rogova Y.V.
,
Kozlovskaya L.I.
,
Osolodkin D.I.
,
Dueva E.V.
,
Palyulin V.A.
,
Zefirov N.S.
,
Karganova G.G.
Первая Российская конференция по медицинской химии (MedChem Russia) с международным участием
, г. Москва, Россия, 8-15 сентября 2013
2013
Interaction between the Stem Helices and Ectodomains of the Flavivirus Envelope Proteins
(Стендовый)
Авторы:
Orlov Alexey A.
,
Osolodkin Dmitry I.
,
Palyulin Vladimir A.
,
Zefirov Nikolay S.
Первая Российская конференция по медицинской химии (MedChem Russia) с международным участием
, г. Москва, Россия, 8-15 сентября 2013
2013
New Inhibitors of Mycobacterium tuberculosis Protein Kinase PknB from Structure-Based Virtual Screening
Авторы:
Osolodkin Dmitry I.
,
Mikhaylova Ekaterina B.
,
Zhukova Yulia N.
,
Tyutyunnik Lubava L.
,
Semenov Victor V.
,
Palyulin Vladimir A.
,
Zefirov Nikolay S.
,
Danilenko Valery N.
Первая Российская конференция по медицинской химии (MedChem Russia) с международным участием
, г. Москва, Россия, 8-15 сентября 2013
2013
Small Molecule Inhibitors of Tick-Borne Flaviviruses
Авторы:
Dueva E.V.
,
Osolodkin D.I.
,
Kozlovskaya L.I.
,
Dotsenko V.V.
,
Karganova G.G.
,
Palyulin V.A.
,
Pentkovski V.M.
,
Zefirov N.S.
Первая Российская конференция по медицинской химии (MedChem Russia) с международным участием
, г. Москва, Россия, 8-15 сентября 2013
2012
Design of fusion inhibitors of flaviviruses
Авторы:
Осолодкин Д.И.
,
Kozlovskaya L.I.
,
Rogova Y.V.
,
Dotsenko V.V.
,
Дуева Е.В.
,
Pentkovski V.M.
,
Karganova G.G.
,
Зефиров Н.С.
,
Палюлин В.А.
ISMC EFMC, XXIInd International Symposium on Medicinal Chemistry
, Berlin, Germany, Германия, 2012
2012
Explanation of the ligand-binding preferences of six different cytokinin receptors from arabidopsis and maize based on structural peculiarities of their CHASE domains
Авторы:
Steklov M.Y.
,
Осолодкин Д.И.
,
Krivosheev D.M.
,
Lomin S.N.
,
Михайлов С.Н.
,
Палюлин В.А.
,
Зефиров Н.С.
,
Романов Г.А.
3rd International Symposium "Intracellular Signalling and Bioactive Molecules Design"
, Lviv, Ukraine, Украина, 2012
2012
Flavivirus envelope proteins as a target of novel antiviral leads: lead indentification and molecular dynamics studies.
Авторы:
Осолодкин Д.И.
,
Kozlovskaya L.I.
,
Rogova Y.V.
,
Dotsenko V.V.
,
Дуева Е.В.
,
Палюлин В.А.
,
Pentkovski V.M.
,
Karganova G.G.
,
Зефиров Н.С.
19th European Symposium on Quantitative Structure-Activity Relationships
, Vienna, Austria, Австрия, 2012
2012
Influence of point charge-changing mutations on E protein structure and virion properties of tick-borne encephalitis virus
Авторы:
Kozlovskaya L.I.
,
Осолодкин Д.И.
,
Shevtsova A.S.
,
Romanova L.I.
,
Палюлин В.А.
,
Зефиров Н.С.
,
Karganova G.G.
Tick-borne encephalitis and other tick-borne infections
, Irkutsk, Russia, Россия, 2012
2012
Molecular design of flaviviral fusion inhibitors
Авторы:
Kozlovskaya L.I.
,
Дуева Е.В.
,
Палюлин В.А.
,
Pentkovski V.M.
,
Karganova G.G.
,
Зефиров Н.С.
,
Осолодкин Д.И.
Tick-borne encephalitis and other tick-borne infections
, Irkutsk, Russia, Россия, 2012
2012
Molecular design of fusion inhibitors for flaviviruses
Авторы:
Дуева Е.В.
,
Осолодкин Д.И.
,
Kozlovskaya L.I.
,
Палюлин В.А.
,
Karganova G.G.
,
Зефиров Н.С.
26th Molecular Modeling Workshop
, Erlangen, Germany, Германия, 2012
2012
Молекулярный дизайн ингибиторов слияния для флавивирусов
Авторы:
Дуева Е.В.
,
Осолодкин Д.И.
,
Козловская Л.И.
,
Карганова Г.Г.
,
Палюлин В.А.
,
Зефиров Н.С.
XIX Российский национальный конгресс "Человек и лекарство"
, Москва, Россия, 2012
2012
Поиск ингибиторов слияния вируса клещевого энцефалита
Авторы:
Дуева Е.В.
,
Осолодкин Д.И.
,
Козловская Л.И.
,
Доценко В.В.
,
Палюлин В.А.
,
Карганова Г.Г.
IV Ежегодный всероссийский конгресс по инфекционным заболеваниям
, Москва, Россия, 2012
2012
Сравнительный анализ структуры сайтов связывания атф серин-треониновых протеинкиназ грамположительных бактерий.
Авторы:
Полякова М.В.
,
Захаревич Н.В.
,
Палюлин В.А.
,
Зефиров Н.С.
,
Осолодкин Д.И.
,
Даниленко В.Н.
XIX Российский национальный конгресс "Человек и лекарство"
, Москва, Россия, 2012
2011
Atomscale Molecular Model of Dengue Virus Envelope Proteins and Membrane
Авторы:
Осолодкин Д.И.
,
Палюлин В.А.
,
Зефиров Н.С.
,
Pentkovski V.M.
4th International Symposium “Methods and Applications of Computational Chemistry”
, Lviv, Украина, 2011
2011
Computational studies of flaviviruses: approaching to novel fusion inhibitors
Авторы:
Osolodkin D.I.
,
Kozlovskaya L.I.
,
Karganova G.G.
,
Дуева Е.В.
,
Палюлин В.А.
,
Зефиров Н.С.
,
Pentkovski V.M.
7th German conference on chemoinformatics
, Goslar, Germany, Германия, 2011
2011
Molecular basis of several tick-borne encephalitis virus virion properties
Авторы:
Козловская Л.И.
,
Осолодкин Д.И.
,
Шевцова А.С.
,
Романова Л.Ю.
,
Палюлин В.А.
,
Карганова Г.Г.
XI International Jena Simposium on Tick-borne Diseases (IJSTD-XI2011)
, Weimar, Germany, Германия, 2011
2011
Structural basis of tick-borne encephalitis virus virion properties revealed by MD simulation
Авторы:
Осолодкин Д.И.
,
Kozlovskaya L.I.
,
Shevtsova A.S.
,
Romanova L.I.
,
Karganova G.G.
,
Палюлин В.А.
,
Зефиров Н.С.
5th Theoretical Biophysics International Symposium «THEOBio2011»
, Madeira, Portugal, Португалия, 2011
2010
Virtual screening workflow for glycogen synthase kinase 3β inhibitors: convergence of ligand-based and structure-based approaches
Авторы:
Палюлин В.А.
,
Осолодкин Д.И.
,
Зефиров Н.С.
6th German conference on chemoinformatics
, Goslar, Germany, Германия, 2010
2010
Виртуальный скрининг ингибиторов киназы гликогенсинтазы 3β: подходы, основанные на структурах лигандов и биомишени
Авторы:
Палюлин В.А.
,
Осолодкин Д.И.
,
Зефиров Н.С.
2-й Международный Конгресс по биотехнологии и биоэнергетике «ЕвразияБио-2010»
, Москва, Россия, 2010
2010
Классификация бактериальных серин-треониновых протеинкиназ эукариотического типа — биомишеней для создания новых лекарств
Авторы:
Захаревич Н.В.
,
Осолодкин Д.И.
,
Артамонова И.И.
,
Палюлин В.А.
,
Даниленко В.Н.
2-й Международный Конгресс по биотехнологии и биоэнергетике «ЕвразияБио-2010»
, Москва, Россия, 2010
2010
Классификация бактериальных серин-треониновых протеинкиназ эукариотического типа — биомишеней для создания новых лекарств
Авторы:
Даниленко В.Н.
,
Захаревич Н.В.
,
Осолодкин Д.И.
,
Артамонова И.И.
,
Палюлин В.А.
,
Зефиров Н.С.
XVII Российский национальный конгресс «Человек и лекарство»
, Москва, Россия, Россия, 8-12 апреля 2010
2010
Роль частичных атомных зарядов в моделировании 3D QSAR
Авторы:
Царева Д.А.
,
Осолодкин Д.И.
,
Шульга Д.А.
,
Олиференко А.А.
,
Палюлин В.А.
,
Зефиров Н.С.
XVII Российский национальный конгресс «Человек и лекарство»
, Москва, Россия, Россия, 8-12 апреля 2010
2009
Ionotropic GABA Receptors: Modelling and Design of Selective Ligands
(Стендовый)
Авторы:
Палюлин В.А.
,
Радченко Е.В.
,
Осолодкин Д.И.
,
Chupakhin V.I.
,
Зефиров Н.С.
5th German conference on chemoinformatics
, Goslar, Germany, Германия, 2009
2009
Исследование взаимодействия манзамина А с киназой гликогенсинтазы 3
Авторы:
Осолодкин Д.И.
,
Шульга Д.А.
,
Палюлин В.А.
,
Зефиров Н.С.
XVI Российский национальный конгресс “Человек и лекарство”
, Москва, Россия, 2009
2009
Исследование взаимодействия манзамина А с киназой гликогенсинтазы 3 методом молекулярной динамики
Автор:
Осолодкин Д.И.
XVI Международная конференция студентов, аспирантов и молодых учёных «Ломоносов»
, Москва, Россия, 2009
2009
Computer Molecular Design of Neuroprotectors
Авторы:
Палюлин В.А.
,
Баскин И.И.
,
Радченко Е.В.
,
Chupakhin V.I.
,
Осолодкин Д.И.
,
Лавров М.И.
,
Зефиров Н.С.
1st Turkish-Russian Joint Meeting on Organic and Medicinal Chemistry, Antalya, Turkey, October 14-17, 2009
, Antalya, Турция, 14-17 октября 2009
2008
Molecular design of new selective and non-selective inhibitors of glycogen synthase kinase 3
Автор:
Осолодкин Д.И.
European School of Medicinal Chemistry (XXVIII edition)
, Urbino, Italy, Италия, 2008
2008
GABAA and GABAC Receptors: Molecular Modelling and QSAR Analysis of Selective Ligands
Авторы:
Палюлин В.А.
,
Chupakhin V.I.
,
Осолодкин Д.И.
,
Радченко Е.В.
,
Зефиров Н.С.
17th EuroQSAR2008 Omics Technologies & Systems Biology, Uppsala, Sweden, September 21-26, 2008
, Uppsala, Швеция, 21-26 сентября 2008
2006
Моделирование и анализ механизма связывания лигандов GABAC рецептора
Авторы:
Чупахин В.И.
,
Осолодкин Д.И.
,
Палюлин В.А.
,
Зефиров Н.С.
XIII Российский национальный конгресс “Человек и лекарство”
, Москва, Россия, 2006
2006
Моделирование лиганд-связывающего домена GABAC рецептора и изучение лиганд-рецепторных взаимодействий
Авторы:
Осолодкин Д.И.
,
Палюлин В.А.
,
Зефиров Н.С.
,
Чупахин В.И.
Биологические мишени для действия лекарственных препаратов нового поколения. Перспективы интеграции российских учёных в международную кооперацию
, Химки, 2006
2005
A New Homology Model for GABAC ρ1 Receptor Including Transmembrane Domain: Structural and Docking Analysis
Авторы:
Chupakhin V.I.
,
Осолодкин Д.И.
,
Баскин И.И.
,
Зефиров Н.С.
,
Палюлин В.А.
International Moscow Conference on Computational Molecular Biology, Moscow, Russia, July 18-21, 2005
, Moscow, Россия, 2005
Тезисы докладов
2022
ACTIVITY PREDICTION OF SARS-COV-2 MPRO INHIBITORS BASED ON ENSEMBLE DOCKING AND MACHINE LEARNING
Fomina A.D.
,
Osolodkin D.I.
в сборнике
Proceedings book of the XXVIII Symposium on Bioinformatics and Computer-Aided Drug Discovery
, место издания
Institute of Biomedical Chemistry Moscow
, тезисы, с. 72-72
DOI
2022
Прогнозирование активности ингибиторов Mpro SARS-CoV-2 на основе ансамблевого докинга и машинного обученияПрогнозирование активности ингибиторов Mpro SARS-CoV-2 на основе ансамблевого докинга и машинного обучения
Фомина Анастасия Дмитриевна
,
Осолодкин Дмитрий Иванович
,
Палюлин Владимир Александрович
в сборнике
Тезисы докладов конференции молодых ученых и специалистов "ФГАНУ ФНЦИРИП им. М.П. Чумакова" (Институт полиомиелита)
, место издания
Москва
, тезисы, с. 23
2021
SCREENING OF TICK-BORNE ENCEPHALITIS VIRUS METHYLTRANSFERASE INHIBITORS IN VITRO AND IN SILICO
Frolenko V.S.
,
Uvarova V.I.
,
Nikitina A.A.
,
Khvatov E.V.
,
Dodina M.
,
Bayurova E.
,
Kozlovskaya L.I.
,
Osolodkin D.I.
в сборнике
Сборник тезисов 5-я Российской конференции по медицинской химии с международным участием «МедХим-Россия 2021»
, место издания
Издательство ВолгГМУ Волгоград
, тезисы
DOI
2021
ВИРТУАЛЬНЫЙ СКРИНИНГ ИНГИБИТОРОВ МЕТИЛТРАНСФЕРАЗЫ ВИРУСА КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА НА ОСНОВЕ МЕТОДОВ МАШИННОГО ОБУЧЕНИЯ
Фроленко В.С.
,
Никитина А.А.
,
Осолодкин Д.И.
в сборнике
XXVII СИМПОЗИУМ «БИОИНФОРМАТИКА И КОМПЬЮТЕРНОЕ КОНСТРУИРОВАНИЕ ЛЕКАРСТВ». Сборник научных трудов
, место издания
Москва: Институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича
, тезисы, с. 71-71
DOI
2021
Виртуальный скрининг ингибиторов протеазы 3CLpro коронавируса SARS-CoV-2 на основе ансамблевого докинга
Фомина А.Д.
,
Осолодкин Д.И.
в сборнике
XXVII СИМПОЗИУМ «БИОИНФОРМАТИКА И КОМПЬЮТЕРНОЕ КОНСТРУИРОВАНИЕ ЛЕКАРСТВ». Сборник научных трудов
, место издания
Москва: Институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича
, тезисы, с. 70
DOI
2021
КОМПЛЕКСНЫЙ ПОДХОД К СКРИНИНГУ IN VITRO И IN SILICO – СТРАТЕГИЯ ПОИСКА НОВЫХ ПРОТИВОВИРУСНЫХ СОЕДИНЕНИЙ
Осолодкин Д.И.
,
Никитина А.А.
,
Орлов А.А.
,
Уварова В.И.
,
Фомина А.Д.
,
Фроленко В.С.
,
Хватов Е.В.
,
Козловская Л.И.
,
Ишмухаметов А.А.
,
Егоров А.М.
в сборнике
5-я Российская конференция по медицинской химии с международным участием «МедХим-Россия 2021»
, место издания
ВолгГМУ, 2021 Волгоград
, том 1, тезисы
DOI
2021
Новые методы синтеза и функционализации производных изоксазола. Поиск соединений с различными типами биологической активности
Аверина Е.Б.
,
Василенко Д.А.
,
Садовников К.С.
,
Седенкова К.Н.
,
Осолодкин Д.И.
,
Зефирова О.Н.
,
Палюлин В.А.
,
Милаева Е.Р.
в сборнике
MedChem-Russia 2021. 5-я Российская конференция по медицинской химии с международным участием «МедХим-Россия 2021»
, издательство
ВолгГТУ
(Волгоград)
, том 1, тезисы, с. 27-27
DOI
2021
РАЗРАБОТКА МЕТОДА АНСАМБЛЕВОГО ДОКИНГА ИНГИБИТОРОВ ПРОТЕАЗЫ 3CLPRO SARS-COV-2
Фомина А.Д.
,
Осолодкин Д.И.
в сборнике
Сборник тезисов 5-я Российской конференции по медицинской химии с международным участием «МедХим-Россия 2021»
, место издания
Издательство ВолгГМУ Волгоград
, тезисы, с. 322
DOI
2021
Синтез и биологическая активность 3-замещенных циклооктансодержащих изоксазолинов
Андриасов К.С.
, Еременко М.Г.,
Седенкова К.Н.
,
Грачева Ю.А.
,
Осолодкин Д.И.
,
Аверина Е.Б.
в сборнике
IX Молодёжная конференция ИОХ РАН
, место издания
Москва
, тезисы, с. 12-12
2021
Синтетические подходы к новым производным пиримидина с биологической активностью и флуоресцентными свойствами
Седенкова К.Н.
,
Назарова А.А.
,
Осолодкин Д.И.
,
Палюлин В.А.
,
Зефиров Н.А.
,
Зефирова О.Н.
,
Грачева Ю.А.
,
Милаева Е.Р.
,
Аверина Е.Б.
в сборнике
5-я Российская конференция по медицинской химии с международным участием «МедХим-Россия 2021»
, место издания
ВолгГМУ, 2021 Волгоград
, том 1, тезисы, с. 39-39
2020
Search for small molecule binding sites in Flavivirus NS1 protein
Fomina A.D.
,
Palyulin V.A.
,
Osolodkin D.I.
в сборнике
5th Advanced in silico Drug Design workshop/challenge Book of Abstracts
, место издания
Olomouc, Czech Republic
, тезисы, с. 3-3
2018
Design and antiviral activity evaluation of small molecule compounds against viruses from Flavivirus and Enterovirus genera
Alexey Orlov
,
Anastasia Eletskaya
,
Anastasia Golinec
,
Anastasia Nikitina
,
Eugene Khvatov
,
Galina Karganova
,
Konstantin Frolov
,
Liubov Kozlovskaya
,
Mikhail Drenichev
,
Mikhailov Sergey N.
,
Osolodkin Dmitry I.
,
Victor Dotsenko
,
Vladimir Oslovsky
,
Vladimir Palyulin
в сборнике
256th ACS National Meeting Book of abstracts
, тезисы
2018
Влияние точечных мутаций на динамическое поведение белков Е оболочки вирионов вирусов клещевого энцефалита и Повассан
Владимиров С.А.
,
Орлов А.А.
,
Палюлин В.А.
,
Осолодкин Д.И.
в сборнике
Сборник тезисов XXV Российского национального конгресса "Человек и Лекарство"
, тезисы, с. 63
2018
Картирование химического пространства ингибиторов репродукции флавивирусов - низкомолекулярных органических соединений и компонентов гуминовых систем на основе базы данных ViralChEMBL и экспериментальных данных
Орлов А.А.
,
Никитина А.А.
,
Жеребкер А.Я.
,
Палюлин В.А.
,
Перминова И.В.
,
Осолодкин Д.И.
в сборнике
Сборник материалов XXV Российского национального конгресса «Человек и лекарство». Тезисы докладов/ Главный редактор Чучалин А.Г
, серия
Секция "Разработка и создание новых лекарственных препаратов"
, место издания
Видокс Москва
, тезисы, с. 81
2017
ANALYSIS OF SMALL MOLECULES BINDING WITH DENGUE VIRUS ENVELOPE PROTEIN TRIMER
Volkov M.B.
,
Orlov A.A.
,
Osolodkin D.I.
,
Palyulin V.A.
,
Zefirov N.S.
в сборнике
3rd Kazan Summer School on Chemoinformatics (5-7 July 2017)
, место издания
Kazan Federal University Kazan
, тезисы
2017
ChEMBL antiviral data analysis
Nikitina Anastasia A.
,
Orlov Alexey A.
,
Osolodkin Dmitry I.
,
Palyulin Vladimir A.
,
Zefirov Nikolay S.
в сборнике
3rd Kazan Summer School on Chemoinformatics (5-7 July 2017)
, место издания
Kazan Federal University Kazan
, тезисы
2017
Chemoinformatic Approach to Identify Antiviral Components of Humic Substances
Osolodkin Dmitry I.
,
Orlov Alexey A.
,
Zherebker Alexandr Y.
,
Kozlovskaya Liubov I.
,
Perminova Irina V.
в сборнике
Book of Abstracts. Fourth International Conference of CIS IHSS on Humic Innovative Technologies «From Molecular Analysis of Humic Substances – to Nature-like Technologies» (HIT-2017)
, место издания
ООО "КЛУБ ПЕЧАТИ" Москва
, тезисы, с. 34-35
2017
EXPLORING CHEMICAL SPACE OF HUMIC SUBSTANCES THROUGH ESI FTICR MS ANALYSIS AND SIMILARITY SEARCHING
Orlov A.A.
,
Zherebker A.Ya
,
Eletskaya A.A.
,
Kozlovskaya L.I.
,
Perminova I.V.
,
Osolodkin D.I.
в сборнике
3rd Kazan Summer School on Chemoinformatics (5-7 July 2017)
, место издания
Kazan Federal University Kazan
, тезисы
2017
ViralChEMBL: Enhancement of antiviral activity data from ChEMBL
Osolodkin D.I.
,
Nikitina A.A.
,
Orlov A.A.
,
Kozlovskaya L.I.
,
Palyulin V.A.
в сборнике
3rd Russian Conference on Medicinal Chemistry, Kazan, Russia, September 28 – October 03, 2017
, место издания
Kazan, Russia
, тезисы, с. 95-95
2017
ViralChEMBL: Purification and enhancement of antiviral activity data from ChEMBL
Dmitry Osolodkin
,
Anastasia Nikitina
,
Alexey Orlov
в сборнике
Abstracts of papers of the American chemical society
, издательство
American Chemical Society
(United States)
, том 254, тезисы
2016
Analysis and visualization of antiviral chemical space
Nikitina A.A.
,
Orlov A.A.
,
Osolodkin D.I.
,
Palyulin V.A.
,
Zefirov N.S.
в сборнике
21st European Symposium on Quantitative Structure-Activity Relationship: Where Molecular Simulations Meet Drug Discovery, Verona, Italy, September 4-8, 2016
, место издания
Verona, Italy
, тезисы, с. P180
2016
Analysis of antiviral chemical space based on ChEMBL data
Orlov Alexey A.
,
Nikitina Anastasia A.
,
Osolodkin Dmitry I.
,
Palyulin Vladimir A.
,
Zefirov Nikolay S.
в сборнике
Book of Abstracts /12th German Conference on Chemoinformatics/ November 6-8, 2016/ Fulda, Germany
, место издания
Selterdruck GmbH, Selters/Ts
, тезисы, с. 38-38
2016
Computational studies of interactions between flavivirus E proteins and small molecule reproduction inhibitors
Dueva E.
,
Osolodkin D.
,
Kozlovskaya L.
,
Tuchynska K.
,
Palyulin V.
,
Zefirov N.
,
Karganova G.
в сборнике
Book of abstracts «4th Antivirals Congress 2016» September 18-21, 2016. Sitges, Spain
, место издания
September 18-21, 2016. Sitges, Spain
, тезисы, с. 1
2016
Dependence of multiparameter optimization results on descriptors variation
Sosnina E.A.
,
Osolodkin D.I.
,
Radchenko E.V.
,
Palyulin V.A.
,
Zefirov N.S.
в сборнике
251st American Chemical Society National Meeting, March 13-17, 2016, San Diego, CA, USA
, место издания
ACS
, тезисы, с. COMP674
2016
Fusion inhibitors of tick-borne flaviviruses: identification and mode of action study
Dueva E.V.
,
Osolodkin D.I.
,
Kozlovskaya L.I.
,
Karganova G.G.
,
Palyulin V.A.
,
Zefirov N.S.
в сборнике
21st European Symposium on Quantitative Structure-Activity Relationship: Where Molecular Simulations Meet Drug Discovery, Verona, Italy, September 4-8, 2016
, место издания
Verona, Italy
, тезисы, с. OC23
2016
Influence of molecular descriptor calculation schemes on multiparameter optimization based virtual screening
Sosnina E.A.
,
Osolodkin D.I.
,
Sosnin S.B.
,
Radchenko E.V.
,
Palyulin V.A.
,
Zefirov N.S.
в сборнике
21st European Symposium on Quantitative Structure-Activity Relationship: Where Molecular Simulations Meet Drug Discovery, Verona, Italy, September 4-8, 2016
, место издания
Verona, Italy
, тезисы, с. P191
2016
Molecular motions and reproduction inhibitors of tick-borne encephalitis virus
Osolodkin D.I.
,
Dueva E.V.
,
Orlov A.A.
,
Palyulin V.A.
,
Zefirov N.S.
,
Kozlovskaya L.I.
,
Karganova G.G.
в сборнике
21st European Symposium on Quantitative Structure-Activity Relationship: Where Molecular Simulations Meet Drug Discovery, Verona, Italy, September 4-8, 2016
, место издания
Verona, Italy
, тезисы, с. P190
2016
Redox-active metal complexes with 2,2'-dipicolylamine containing ferrocenyl moiety: synthesis, electrochemical behaviour and biological activity
Elena Milaeva
,
Vladimir Tyurin
,
Dmitry Shpakovsky
,
Anna Moiseeva
,
Yulia Gracheva
,
Taisiya Antonenko
,
Vladimir Palyulin
,
Dmitry Osolodkin
,
Elena Shevtsova
в сборнике
The 8th International Symposium on Bioorganometallic Chemistry, ISBOMC16
, место издания
The 8th International Symposium on Bioorganometallic Chemistry, ISBOMC16 Moscow, Russia
, тезисы, с. 63
2016
Влияние методов расчета дескрипторов на мультипараметрическую оценку терапевтического потенциала соединения
Соснина Е.А.
,
Осолодкин Д.И.
,
Радченко Е.В.
,
Соснин С.Б.
,
Палюлин В.А.
,
Зефиров Н.С.
в сборнике
XXIII Российский национальный конгресс "Человек и лекарство", 11-14 апреля 2016
, тезисы, с. 203
2016
Модификация по 3'-гидроксильной группе противовирусного нуклеозида dUY11 для модулирования биологической активности
Проскурин Г.В.
,
Брылёв В.А.
,
Орлов А.А.
,
Чистов А.А.
,
Коршун В.А.
,
Козловская Л.И.
,
Осолодкин Д.И.
,
Аралов А.В.
в сборнике
Химическая биология. Материалы международной конференции, посвященной 90-летию академика Д. Г. Кнорре. Новосибирск, 24-28 июля 2016 г. - 217 с
, место издания
Новосибирск. ЗАО Новосибирск
, тезисы, с. 183-183
2016
Новые противовирусные соединения с триазольным линкером
Проскурин Г.В.
,
Орлов А.А.
,
Чистов А.А.
,
Кутяков С.В.
,
Коршун В.А.
,
Осолодкин Д.И.
,
Аралов А.В.
в сборнике
Химическая биология. Материалы международной конференции, посвященной 90-летию академика Д. Г. Кнорре. Новосибирск, 24-28 июля 2016 г. - 217 с
, место издания
Новосибирск. ЗАО Новосибирск
, тезисы, с. 188-188
2016
СОЗДАНИЕ ВЫСОКОКАЧЕСТВЕННО АННОТИРОВАННОЙ БИБЛИОТЕКИ СОЕДИНЕНИЙ, ТЕСТИРОВАННЫХ НА ПРОТИВОВИРУСНУЮ АКТИВНОСТЬ
НИКИТИНА А.А.
,
ОРЛОВ А.А.
,
ОСОЛОДКИН Д.И.
,
ПАЛЮЛИН В.А.
,
ЗЕФИРОВ Н.С.
в сборнике
Сборник материалов XXIII Российского национального конгресса «Человек и лекарство». Тезисы докладов
, место издания
Видокс Москва
, тезисы, с. 251-251
2016
Синтез 5-(перилен-3-илэтинил)урацилуксусной кислоты и её амидов для изучения биологической активности против оболочечных вирусов
Стрешнев Ф.П.
,
Чистов А.А.
,
Апарин И.О.
, Сапожникова К.А.,
Орлов А.А.
,
Коршун В.А.
,
Козловская Л.И.
,
Осолодкин Д.И.
,
Бриджеш Ратхи
,
Нидхи Джайн
,
Брылёв В.А.
в сборнике
Химическая биология. Материалы международной конференции, посвященной 90-летию академика Д. Г. Кнорре. Новосибирск, 24-28 июля 2016 г. - 217 с
, место издания
Новосибирск. ЗАО Новосибирск
, тезисы, с. 182-182
2015
Discovery of Small Molecule Inhibitors of Tick-Borne Flaviviruses Reproduction
Osolodkin D.I.
,
Kozlovskaya L.I.
,
Palyulin V.A.
,
Karganova C.G.
,
Zefirov N.S.
в сборнике
MedChem 2015, Book of Abstracts
, место издания
Novosibirsk, Russia
, тезисы, с. 99
2015
Novel Chemotypes of Reproduction Inhibitors for Flaviviruses
Osolodkin D.I.
,
Dueva E.V.
,
Sedenkova K.S.
,
Averina E.B.
,
Kozlovskaya L.I.
,
Karganova G.G.
,
Palyulin V.A.
,
Zefirov N.S.
в сборнике
«Frontiers in Medicinal Chemistry 2015», Antwerpen, Belgium, September 14–16 2015
, тезисы, с. 225-225
2015
QSAR study of Glycogen Synthase Kinase 3 inhibitors
Sosnina E.A.
,
Osolodkin D.I.
,
Radchenko E.V.
,
Sosnin S.B.
,
Palyulin V.A.
,
Zefirov N.S.
в сборнике
Second Kazan Summer School on Chemoinformatics, Kazan, Russia, July 6-9, 2015
, место издания
Kazan, Russia
, тезисы, с. 45
2015
Synthesis and anti-TBEV Properties of 4-Aminopirimidine N-oxides
Sedenkova K.N.
,
Dueva E.V.
,
Osolodkin D.I.
,
Averina E.B.
,
Palyulin V.A.
,
Grishin Yu K.
,
Kuznetzova T.S.
,
Zefirov N.S.
в сборнике
MedChem 2015, Book of Abstracts
, место издания
Novosibirsk, Russia
, тезисы, с. 263
2015
Synthesis and assessment of novel 5-aminoisoxazole and4-aminopyrimidine derivatives as antiviral agents
Kuznetsova T.S.
,
Averina E.B.
,
Sedenkova K.N.
,
Dueva E.V.
,
Vasilenko D.A.
,
Osolodkin D.I.
,
Palyulin V.A.
,
Zefirov N.S.
в сборнике
«Anatolian Conference on Synthetic Organic Chemistry», Antalya, Turkey, March 16–19 2015
, место издания
Antalya, Turkey
, тезисы, с. 79
2015
МОДЕЛИРОВАНИЕ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ДИНАМИКИ ПЕПТИДНЫХ ИНГИБИТОРОВ СЛИЯНИЯ ФЛАВИВИРУСОВ
ОРЛОВ А.А.
,
ОСОЛОДКИН Д.И.
,
ПАЛЮЛИН В.А.
,
ЗЕФИРОВ Н.С.
в сборнике
XXII Российский национальный конгресс "Человек и лекарство", Тезисы докладов, Москва, 6-10 апреля, 2015
, место издания
Москва
, тезисы, с. 205
2014
Analysis of the Binding Mode of Antiviral Peptides to the Flavivirus Envelope Protein E Based on Protein—Protein Docking
Orlov Alexey A.
,
Osolodkin Dmitry I.
,
Palyulin Vladimir A.
,
Zefirov Nikolay S.
в сборнике
The Ninth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology — BGRS\SB-2014, Novosibirsk, June 23-28
, место издания
Publishing House of the Siberian Branch Russian Academy of Sciences Novosibirsk
, тезисы, с. 118-118
2014
Computational and experimental studies of flavivirus envelope proteins as promising drug targets
Osolodkin Dmitry I.
,
Kozlovskaya Liubov I.
,
Dueva Evgenia V.
,
Orlov Alexey A.
,
Palyulin Vladimir A.
,
Karganova Galina G.
,
Zefirov Nikolay S.
в сборнике
in 20th European Symposium on Quantitative Structure-Activity Relationships EuroQSAR2014, St. Petersburg, Russia, August 31 – September 4, 2014
, место издания
St. Petersburg, Russia
, тезисы, с. 174-174
2014
Cинтез новых биологически активных 4-аминозамещенных пиримидинов и пиримидин N-оксидов
Седенкова К.Н.
,
Аверина Е.Б.
,
Дуева Е.В.
,
Осолодкин Д.И.
,
Палюлин В.А.
,
Кузнецова Т.С.
,
Зефиров Н.С.
в сборнике
III Всероссийская научная конференция (с международным участием) «Успехи синтеза и комплексообразования». 21-25 апреля 2014. Тезисы докладов
, место издания
изд-во РУДН Москва
, том 1, тезисы, с. 279
2014
Flavivirus Envelope Proteins as Targets of Novel Antiviral Compounds
Osolodkin D.I.
,
Kozlovskaya L.I.
,
Dueva E.V.
,
Orlov A.A.
,
Palyulin V.A.
,
Karganova G.G.
,
Zefirov N.S.
в сборнике
EFMC International Symposium on Medicinal Chemistry, Book of abstracts
, издательство
Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA
(Weinheim, Germany)
, тезисы, с. 362-362
2014
Flavivirus Envelope Proteins as Targets of Novel Antiviral Compounds
Dmitry Osolodkin
,
Liubov Kozlovskaya
,
Evgenia Dueva
,
Alexey Orlov
,
Vladimir Palyulin
,
Galina Karganova
,
Nikolay Zefirov
в сборнике
23rd International Symposium on Medicinal Chemistry EFMC-ISMC 2014, Lisbon, Portugal, book of abstracts
, тезисы
2014
On the way to fusion inhibitors for tick-borne flaviviruses: Identification of lead compounds and mechanism studies
Osolodkin DI
,
Kozlovskaya LI
,
Dueva EV
,
Dotsenko VV
,
Orlov AA
,
Rogova YV
,
Palyulin VA
,
Karganova GG
,
Zefirov NS
в сборнике
ABSTRACTS OF PAPERS OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY
, место издания
American Chemical Society (United States)
, том 248, тезисы, с. 409-MEDI
2014
The prefusion and postfusion forms of the envelope protein E as targets for the development of Flavivirus inhibitors
Orlov Alexey A.
,
Osolodkin Dmitry I.
,
Kozlovskaya Liubov I.
,
Dotsenko Victor V.
,
Frolov Konstantin A.
,
Rogova Yulia V.
,
Karganova Galina G.
,
Palyulin Vladimir A.
,
Zefirov Nikolay S.
в сборнике
3rd Antivirals Congress, NH Grand Krasnaplosky, Amsterdam, The Netherlands, 2014, book of abtracts
, тезисы, с. 65-65
2014
Анализ способа связывания антифлавивирусных пептидов с тримером белка оболочки Е флавивирусов
Орлов А.А.
,
Осолодкин Д.И.
,
Палюлин В.В.
,
Зефиров Н.С.
в сборнике
Материалов конгресса "XXI Российский национальный конгресс "ЧЕЛОВЕК И ЛЕКАРСТВО""
, место издания
Москва
, тезисы, с. 303
2014
Моделирование молекулярной динамика белков оболочки флавивирусов: теоретические построения и практические результаты
Осолодкин Д.И.
,
Козловская Л.И.
,
Карганова Г.Г.
,
Палюлин В.А.
,
Зефиров Н.С.
в сборнике
Материалов конгресса "XXI Российский национальный конгресс "ЧЕЛОВЕК И ЛЕКАРСТВО""
, место издания
Москва
, тезисы, с. 303-304
2013
Interactions between the stem helices and ectodomains of the flavivirus envelope proteins
Orlov A.A.
,
Osolodkin D.I.
,
Palyulin V.A.
,
Zefirov N.S.
в сборнике
Тезисы докладов Первой Российской конференции по медицинской химии (MedChem Russia - 2013) с международным участием
, место издания
Москва
, тезисы, с. 286
2013
Анализ способа связывания противофлавивирусных пептидов
Орлов Алексей А.
,
Осолодкин Дмитрий И.
,
Палюлин Владимир А.
,
Зефиров Николай С.
в сборнике
журнал "Медицинская вирусология"
, место издания
Икар Москва
, том 27, тезисы, с. 91-91
2012
Влияние точечных изменяющих заряд мутаций на структуру белка е и свойства вирионов вируса клещевого энцефалита
Козловская Л.И.
,
Осолодкин Д.И.
,
Шевцова А.С.
,
Палюлин В.А.
,
Зефиров Н.С.
,
Карганова Г.Г.
в сборнике
Журнал инфекционной патологии
, серия
3
, том 19, тезисы, с. 30,88
2012
Молекулярный дизайн ингибиторов слияния флавивирусов
Дуева Е.В.
,
Осолодкин Д.И.
,
Козловская Л.И.
,
Карганова Г.Г.
,
Палюлин В.А.
,
Зефиров Н.С.
в сборнике
Сборник материалов XIX Российского национального конгресса
, место издания
ЗАО РИЦ"Человек и лекарство" Москва
, тезисы, с. 498-499
2012
Сравнительный анализ структуры сайтов связывания АТФ серин-треониновых протеинкиназ грамположительных бактерий
Полякова М.В.
,
Осолодкин Д.И.
,
Захаревич Н.В.
,
Даниленко В.Н.
,
Палюлин В.А.
,
Зефиров Н.С.
в сборнике
Сборник материалов XIX Российского национального конгресса
, место издания
ЗАО РИЦ"Человек и лекарство" Москва
, тезисы, с. 556-557
2009
Computer molecular design of neuroprotectors
Palyulin V.A.
,
Baskin I.I.
,
Radchenko E.V.
,
Chupakhin V.I.
,
Osolodkin D.I.
,
Lavrov M.I.
,
Zefirov N.S.
в сборнике
1st Turkish-Russian Joint Meeting on Organic and Medicinal Chemistry, 14-17 October 2009, Antalya, Turkey
, место издания
Antalya, Turkey
, тезисы, с. 24
2005
A New Homology Model for GABAC ρ1 Receptor Including Transmembrane Domain: Structural and Docking Analysis
Osolodkin D.I.
,
Chupakhin V.I.
,
Baskin I.I.
,
Palyulin V.A.
,
Zefirov N.S.
в сборнике
Proceedings of the international Moscow conference on computational molecular biology (MCCMB'05)
, место издания
Moscow, Russia
, тезисы, с. 274-275
НИРы
1 января 2016 - 31 декабря 2018
Природные гуминовые полианионы как источник потенциальных противовирусных средств
ФГБНУ ИПВЭ им. М.П. Чумакова
Руководитель:
Осолодкин Д.И.
Участники НИР:
Жеребкер А.Я.
,
Жернов Ю.В.
,
Козловская Л.И.
,
Орлов А.А.
,
Перминова И.В.
16 февраля 2015 - 31 декабря 2019
(309) без названия
НИЛ медицинской химии
Руководитель:
Палюлин В.А.
Участники НИР:
Аверина Е.Б.
,
Василенко Д.А.
,
Веремеева П.Н.
,
Дуева Е.В.
,
Заборова О.В.
,
Зефиров Н.А.
,
Зефиров Н.С.
,
Карлов Д.С.
,
Кузнецова Т.С.
,
Орлов А.А.
,
Осолодкин Д.И.
,
Радченко Е.В.
,
Седенкова К.Н.
,
Сыбачин А.В.
,
Титов О.И.
,
Ярославов А.А.
4 августа 2014 - 31 декабря 2015
Совместные научные исследования
НИЛ медицинской химии
Руководитель:
Палюлин В.А.
Участники НИР:
Зефиров Н.С.
,
Лаптева В.Л.
,
Осолодкин Д.И.
9 июля 2014 - 31 декабря 2018
Разработка новых низкомолекулярных металлосодержащих противоопухолевых соединений. Компьютерный молекулярный дизайн, направленный синтез и скрининг
Кафедра медицинской химии и тонкого органического синтеза
Руководитель:
Милаева Е.Р.
Участники НИР:
Антоненко Т.А.
,
Антонец А.А.
,
Гончар М.Р.
,
Грачева Ю.А.
,
Назаров А.А.
,
Никитин Е.А.
,
Окулова Ю.Н.
,
Осолодкин Д.И.
,
Парулава М.Д.
,
Уборский Д.В.
,
Шпаковский Д.Б.
,
Штиль А.А.
,
Шутков И.А.
6 февраля 2014 - 31 декабря 2015
Изучение молекулярного механизма ингибирования слияния мембран флавивирусов и клеток человека низкомолекулярными органическими соединениями
Кафедра медицинской химии и тонкого органического синтеза
Руководитель:
Осолодкин Д.И.
Участники НИР:
Дуева Е.В.
,
Орлов А.А.
1 января 2014 - 31 декабря 2016
Разработка метода описания галогенового связывания в оценочных функциях молекулярного докинга для дизайна лекарственных веществ
Кафедра медицинской химии и тонкого органического синтеза
Руководитель:
Палюлин В.А.
Ответственный исполнитель:
Шульга Д.А.
Участники НИР:
Иванов Н.Н.
,
Коротаев А.В.
,
Марьясина С.С.
,
Осолодкин Д.И.
,
Писарев С.А.
,
Радченко Е.В.
,
Титов О.И.
1 января 2014 - 31 декабря 2016
Структурный дизайн и новые методы синтеза функционализированных пяти- и шестичленных азотсодержащих гетероциклов с высокой физиологической активностью в ряду новых производных изоксазолов, пиримидинов и пиримидин N-оксидов
Кафедра медицинской химии и тонкого органического синтеза
Руководитель:
Аверина Е.Б.
Участники НИР:
Василенко Д.А.
,
Гришин Ю.К.
,
Дуева Е.В.
,
Зефиров Н.А.
,
Кузнецова Т.С.
,
Осолодкин Д.И.
,
Седенкова К.Н.
,
Терехин А.В.
,
Яшин Н.В.
1 января 2014 - 31 декабря 2015
Молекулярный дизайн органических структур и органических реакций, целевой поиск, синтез и тестирование органических и металлоорганических соединений
Кафедра медицинской химии и тонкого органического синтеза
Руководитель:
Зефиров Н.С.
Участники НИР:
Аверина Е.Б.
,
Алферова В.А.
,
Виноградов Д.С.
,
Волкова М.С.
,
Дорошенко И.А.
,
Зефиров А.Н.
,
Зефиров Н.А.
,
Зефирова О.Н.
,
Карлов Д.С.
,
Кривелева А.С.
,
Кудрявцев К.В.
,
Кузнецова Т.С.
,
Лавров М.И.
,
Лозинская Н.А.
,
Матвеева Е.Д.
,
Мочалов С.С.
,
Орлов А.А.
,
Осолодкин Д.И.
,
Палюлин В.А.
,
Подругина Т.А.
,
Проскурнина М.В.
,
Радченко Е.В.
,
Седенкова К.Н.
,
Селиверстов М.Ю.
,
Сосонюк С.Е.
,
Яшин Н.В.
20 июля 2012 - 19 июля 2017
Совместные научные исследования
Кафедра медицинской химии и тонкого органического синтеза
Руководители:
Зефиров Н.С.
,
Палюлин В.А.
Участники НИР:
Зефиров А.Н.
,
Лавров М.И.
,
Лаптева В.Л.
,
Осолодкин Д.И.
,
Писарев С.А.
,
Радченко Е.В.
,
Титов О.И.
,
Шульга Д.А.
1 января 2011 - 31 декабря 2015
Развитие методологии органического синтеза и медицинской химии. Направленное конструирование и синтез физиологически активных веществ с заданными целевыми свойствами на основе методов математической химии и компьютерного моделирования важнейших биомишеней человека
Кафедра медицинской химии и тонкого органического синтеза
Руководитель:
Зефиров Н.С.
Участники НИР:
1 1.
,
Аверина Е.Б.
,
Ашкинадзе Л.Д.
,
Белов Д.С.
,
Бруновленская И.И.
,
Веремеева П.Н.
,
Виноградов Д.С.
,
Воликов А.Б.
,
Волкова М.С.
,
Воскобойников А.З.
,
Грачева Ю.А.
,
Дубинина Т.В.
,
Жеребкер А.Я.
,
Заболотнев Д.В.
,
Захаров А.Н.
,
Зефиров А.Н.
,
Зефирова О.Н.
,
Измер В.В.
,
Карлов Д.С.
,
Кононович Д.С.
,
Константинов А.И.
,
Кудакина В.А.
,
Кудрявцев К.В.
,
Кузнецова Т.С.
,
Куркин А.В.
,
Лавров М.И.
,
Лаптева В.Л.
,
Лихоманова Т.И.
,
Лозинская Н.А.
,
Мамаева А.В.
,
Матвеева Е.Д.
,
Милаева Е.Р.
,
Михалёв О.В.
,
Мочалов С.С.
,
Назаров А.А.
,
Нуриева Е.В.
,
Окулова Ю.Н.
,
Орлова С.И.
,
Осолодкин Д.И.
,
Палюлин В.А.
,
Перминова И.В.
,
Подругина Т.А.
,
Проскурнина М.В.
,
Радченко Е.В.
,
Самсонов О.В.
,
Седенкова К.Н.
,
Селиверстов М.Ю.
,
Сосонюк С.Е.
,
Титов О.И.
,
Томилова Л.Г.
,
Трач С.С.
,
Трофимова Е.В.
,
Тюрин В.Ю.
,
Уборский Д.В.
,
Федотов А.Н.
,
Фирсова Ю.Н.
,
Шариков М.И.
,
Шпаковский Д.Б.
,
Шувалов М.В.
,
Шульга Д.А.
,
Яшин Н.В.
1 января 2011 - 31 декабря 2013
Новые методы синтеза функционализированных N,O-пятичленных гетероциклов на основе электрофильных алкенов и гем-дигалогенциклопропанов
Кафедра медицинской химии и тонкого органического синтеза
Руководитель:
Аверина Е.Б.
Участники НИР:
Бахтин С.Г.
,
Василенко Д.А.
,
Гришин Ю.К.
,
Кузнецова Т.С.
,
Осолодкин Д.И.
,
Седенкова К.Н.
,
Ушакова Д.А.
,
Чмовж Т.Н.
,
Яшин Н.В.
1 января 2011 - 31 декабря 2013
Развитие и реализация методов координат складчатости циклических систем для эффективного перебора конформаций циклических фрагментов молекул в виртуальном скрининге и докинге
НИЛ медицинской химии
Руководитель:
Палюлин В.А.
Участники НИР:
Карпов П.В.
,
Коротаев А.В.
,
Марьясина С.С.
,
Осолодкин Д.И.
,
Писарев С.А.
,
Радченко Е.В.
,
Титов О.И.
,
Шульга Д.А.
12 августа 2009 - 31 декабря 2011
Разработка структур низкомолекулярных соединений, которые потенциально могут использоваться для регуляции активности сигнального пути Wnt и иметь применение, как при создании лекарственных препаратов, регулирующих регенеративную активность стволовых клеток взрослого человека, так и при создании противоопухолевых лекарственных препаратов. Проблема создания лекарственных препаратов для регенеративной медицины и тканевой инженерии, а также противоопухолевых препаратов нового поколения
НИЛ медицинской химии
Руководитель:
Палюлин В.А.
Участники НИР:
Веремеева П.Н.
,
Воронков А.Э.
,
Зефиров А.Н.
,
Карпов П.В.
,
Морозов А.С.
,
Осолодкин Д.И.
,
Радченко Е.В.
,
Сафаньяев А.Я.
,
Царева Д.А.
1 января 2008 - 31 декабря 2010
Разработка масштабируемого поляризуемого силового поля для молекулярно-динамического моделирования наноразмерных биологических структур
НИЛ медицинской химии
Руководитель:
Палюлин В.А.
Участники НИР:
Баскин И.И.
,
Воронков А.Э.
,
Казачинская Е.П.
,
Карпов П.В.
,
Олиференко А.А.
,
Осолодкин Д.И.
,
Писарев С.А.
,
Радченко Е.В.
,
Царева Д.А.
,
Чупахин В.И.
,
Шульга Д.А.
Патенты
2020
Замещённые изоксазолы, фармацевтические композиции на их основе, обладающие противовирусной активностью, и способ их применения
Авторы:
Аверина Е.Б.
,
Бутов Г.М.
,
Василенко Д.А.
,
Дуева Е.В.
,
Ишмухаметов А.А.
,
Зефиров Н.А.
,
Зефирова О.Н.
,
Карганова Г.Г.
,
Козловская Л.И.
,
Осолодкин Д.И.
,
Палюлин В.А.
#2733945, 8 октября
2018
Cпособ получения 5-аминоспиро[2.3]гексан-1-карбоновой кислоты
Авторы:
Аверина Е.Б.
,
Василенко Д.А.
,
Зефиров Н.С.
,
Палюлин В.А.
,
Осолодкин Д.И.
,
Кузнецова Т.С.
,
Яшин Н.В.
#RU 2659404, 2 июля
2018
Периленилтриазолы - ингибиторы репродукции вируса клещевого энцефалита
Авторы:
Аралов Андрей Владимирович
,
Коршун Владимир Аркадьевич
,
Проскурин Глеб Витальевич
,
Чистов Алексей Александрович
,
Осолодкин Дмитрий Иванович
,
Козловская Любовь Игоревна
,
Карганова Галина Григорьевна
,
Орлов Алексей Александрович
#RU2650880, 18 апреля
2017
Спиро[2.3]гексановые аминокислоты - конформационно-жесткие аналоги гамма-аминомасляной кислоты и способы их получения
Авторы:
Аверина Е.Б.
,
Василенко Д.А.
,
Зефиров Н.С.
,
Палюлин В.А.
,
Осолодкин Д.И.
,
Кузнецова Т.С.
,
Яшин Н.В.
#2629357, 29 августа
2015
Производные 3-аминопиридин-2(1Н)-она, применимые как ингибиторы серин-треониновой протеинкиназы GSK3B в качестве лекарственных препаратов для лечения диабета II типа
Авторы:
Алексеева М.Г.
,
Даниленко В.Н.
,
Зефиров Н.С.
,
Мавлетова Д.А.
,
Морозов А.С.
,
Осолодкин Д.И.
,
Палюлин В.А.
#2570907, 20 декабря
Участие в редколлегии журналов
с 12 апреля 2018
Biomedical Chemistry: Research and Methods
Участие в редколлегии сборников
2022
Medicinal Chemistry of Tick-Borne Encephalitis
член редколлегии:
Осолодкин Д.И.
серия
Annual Reports in Medicinal Chemistry
, том 58
издательство
Academic Press
(United States)
Участие в программных комитетах конференций
17-19 сентября 2019
28th International Conference on Artificial Neural Networks (ICANN2019)
Член программного комитета
Мюнхен, Германия
Руководство диссертациями
2019
Исследование химического пространства ингибиторов репродукции вируса клещевого энцефалита in silico и in vitro
Кандидатская диссертация по специальности 02.00.16 - Медицинская химия (хим. науки)
Автор:
Орлов Алексей Александрович
Научные руководители:
Осолодкин Д.И.
, к.х.н.,
Палюлин В.А.
, к.х.н., доц., МГУ имени М.В. Ломоносова
Защищена в совете
Д 002.102.02
при ФГБУН "ИФАВ РАН"
Ведущая организация:
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича»
Оппоненты:
Офицеров Е.Н.
,
Иванов А.В.
Диссертация
2011
Молекулярный дизайн потенциальных ингибиторов киназы гликогенсинтазы 3
Кандидатская диссертация по специальности 02.00.03, 02.00.16 (хим. науки)
Автор:
Осолодкин Дмитрий Иванович
, к.х.н.
Научный руководитель:
Палюлин В.А.
, к.х.н., доц., МГУ имени М.В. Ломоносова
Защищена в совете
Д 501.001.69
при МГУ имени М.В. Ломоносова, Химический факультет
Руководство дипломными работами
2018
Молекулярный дизайн ингибиторов РНК-зависимой РНК-полимеразы вируса клещевого энцефалита
Научные руководители:
Осолодкин Д.И.
,
Орлов А.А.
Автор: Гуткин Е.М. (Специалист)
2017
Прогноз противовирусной активности низкомолекулярных органических соединений на основе анализа химического пространства
Научные руководители:
Осолодкин Д.И.
,
Орлов А.А.
Автор: А. А. Никитина (Специалист)
2014
Молекулярный дизайн ингибиторов слияния флавивирусов, действующих на тримерную форму белка оболочки вириона
Научный руководитель:
Осолодкин Д.И.
Автор: Орлов А. А. (Специалист)
2013
Молекулярный дизайн ингибиторов серин-треониновых протеинкиназ Mycobacterium tuberculosis
Научный руководитель:
Осолодкин Д.И.
Автор: Михайлова Е. Б. (Специалист)
2012
Молекулярный дизайн ингибиторов слияния для флавивирусов
Научный руководитель:
Осолодкин Д.И.
Автор: Дуева Е. В. (Специалист)
2012
Молекулярный дизайн ингибиторов слияния для вируса омской геморрагической лихорадки
Научный руководитель:
Осолодкин Д.И.
Автор: Романова Е. Г. (Специалист)
2012
Моделирование структуры и дизайн потенциальных ингибиторов серин-треониновых протеинкиназ эукариотического типа грамположительных бактерий
Научный руководитель:
Осолодкин Д.И.
Автор: Полякова М. В. (Специалист)
2009
Моделирование количественных соотношений "пространственная структура - активность" на основе различных схем расчета частичных атомных зарядов для ингибиторов киназы гликогенсинтазы 3
Научные руководители:
Палюлин В.А.
,
Осолодкин Д.И.
Автор: Царева Д. А. (Специалист)
Руководство курсовыми работами
2014
Оценка некоторых параметров классического силового поля для целей молекулярного моделирования насыщенных оловоорганических соединений
Научные руководители:
Писарев С.А.
,
Осолодкин Д.И.
Автор: Парулава М.Д., (Специалист)
Авторство учебных курсов
1999
Основы компьютерного молекулярного моделирования и QSAR
Авторы:
Палюлин В.А.
,
Радченко Е.В.
,
Осолодкин Д.И.
Преподавание учебных курсов
8 февраля 2016 - 30 июня 2016
Основы компьютерного молекулярного моделирования и QSAR
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Химический факультет
,
Кафедра медицинской химии и тонкого органического синтеза
,
НИЛ медицинской химии
обязательная, вариативной части, лекции, 4 часов
1 сентября 2010 - 31 декабря 2014
Основы компьютерного молекулярного моделирования и QSAR
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Химический факультет
обязательная, вариативной части, лекции, 4 часов