Семашко Татьяна Александровна
пользователь
кандидат химических наук с 2011 года
Федеральный научно-клинический центр физико-химической медицины Федерального Медико-биологического Агентства", научный сотрудник лаборатории протеомного анализа отдела молекулярной биологии и генетики
Количество цитирований статей в журналах по данным
Web of Science: 334,
Scopus: 184
РИНЦ:
IstinaResearcherID (IRID): 579271
Деятельность
Статьи в журналах
2020
Influence of the spacer region between the Shine-Dalgarno box and the start codon for fine-tuning of the translation efficiency in Escherichia coli
Komarova Ekaterina S. ,
Chervontseva Zoya S. ,
Osterman Ilya A. ,
Evfratov Sergey A. ,
Rubtsova Maria P. ,
Zatsepin Timofei S. ,
Semashko Tatiana A. ,
Kostryukova Elena S. ,
Bogdanov Alexey A. ,
Gelfand Mikhail S. ,
Dontsova Olga A. ,
Sergiev Petr V.
в журнале Microbial Biotechnology , издательство Blackwell Publishing Inc. (United Kingdom)
DOI
2018
Stress effects of cyanotoxin β-methylamino-L-alanine (BMAA) on cyanobacterial heterocyst formation and functionality
Popova Alexandra A. ,
Ulla Rasmussen ,
Semashko Tatiana A. ,
Govorun Vadim M. ,
Koksharova Olga A.
в журнале Environmental microbiology reports , издательство Society for Applied Microbiology and Blackwell Pub. ([Hoboken, N.J.], United States) , том 10, № 3, с. 369-377
DOI
2018
The cyanotoxin BMAA induces heterocyst specific gene expression in Anabaena sp. PCC 7120 under repressive conditions
Popova Alexandra ,
Semashko Tatiana ,
Kostina Natalia ,
Rasmussen Ulla ,
Govorun Vadim ,
Koksharova Olga
в журнале Toxins , издательство MDPI (Basel, Switzerland) , том 10, № 11, с. 1-13
DOI
2017
Application of sorting and next generation sequencing to study 5'-UTR influence on translation efficiency in Escherichia coli
Evfratov SA ,
Osterman IA ,
Komarova ES ,
Pogorelskaya AM ,
Rubtsova MP ,
Zatsepin TS ,
Semashko TA ,
Kostryukova ES ,
Mironov AA ,
Burnaev E.,
Krymova E.,
Gelfand MS ,
Govorun VM ,
Bogdanov AA ,
Sergiev PV ,
Dontsova OA
в журнале Nucleic Acids Research , издательство Oxford University Press (United Kingdom) , том 45, № 6, с. 3487-3502
2017
Genome analysis of E. coli isolated from Crohn’s disease patients
Rakitina D.V.,
Manolov A.I.,
Kanygina A.V.,
Garushyants S.K. ,
Baikova J.P.,
Alexeev D.G.,
Ladygina V.G.,
Kostryukova E.S.,
Larin A.K.,
Semashko T.A. ,
Karpova I.Y.,
Babenko V.V.,
Ismagilova R.K.,
Malanin S.Y. ,
Gelfand M.S. ,
Ilina E.N.,
Gorodnichev R.B. ,
Lisitsyna E.S.,
Aleshkin G.I.,
Scherbakov P.L.,
Khalif I.L.,
Shapina M.V.,
Maev I.V.,
Andreev D.N.,
Govorun V.M.
в журнале BMC Genomics , издательство BioMed Central (London) , том 18, № 1, с. 544
DOI
2016
Manifestation of Huntington's disease pathology in human induced pluripotent stem cell-derived neurons
Nekrasov E.D. ,
Vigont V.A. ,
Klyushnikov S.A. ,
Lebedeva O.S.,
Vassina E.M. ,
Bogomazova A.N. ,
Chestkov I.V. ,
Semashko T.A. ,
Suldina E. ,
Bobrovsky P.A. ,
Zimina O.A. ,
Ryazantseva M.A. ,
Skopin A.Y. ,
Illarioshkin S.N. ,
Kaznacheyeva E.V. ,
Lagarkova M.A. ,
Kiselev S.L.
в журнале Molecular Neurodegeneration , издательство BioMed Central (London) , том 11, с. 27
DOI
2016
Phase Transition of the Bacterium upon Invasion of a Host Cell as a Mechanism of Adaptation: a Mycoplasma gallisepticum Model
Matyushkina D. ,
Pobeguts O. ,
Butenko I. ,
Vanyushkina A. ,
Anikanov N. ,
Bukato O. ,
Evsyutina D. ,
Bogomazova A. ,
Lagarkova M. ,
Semashko T. ,
Garanina I. ,
Babenko V. ,
Vakhitova M.,
Ladygina V. ,
Fisunov G. ,
Govorun V.
в журнале Scientific reports , издательство Nature Publishing Group (United Kingdom) , том 6
DOI
2015
Specific pools of endogenous peptides are present in gametophore, protonema, and protoplast cells of the moss Physcomitrella patens
Fesenko I.A. ,
Arapidi G.P. ,
Skripnikov A.Yu ,
Alexeev D.G. ,
Kostryukova E.S. ,
Manolov A.I. ,
Altukhov I.A. ,
Khazigaleeva R.A. ,
Seredina A.V. ,
Kovalchuk S.I. ,
Ziganshin R.H. ,
Zgoda V.G. ,
Novikova S.E.,
Semashko T.A. ,
Slizhikova D.K. ,
Ptushenko V.V. ,
Gorbachev A. ,
Govorun V.M. ,
Ivanov V.T.
в журнале BMC Plant Biology , издательство BioMed Central (London) , том 15, № 87
DOI
2014
Highly selective peptide substrates for the assay of cysteine peptidases from the C1 family
Elpidina E.N. ,
Filippova I.Yu ,
Semashko T.A. ,
Vorotnikova E.A. ,
Sharikova V.F. ,
Vinokurov K.S. ,
Fallis L. ,
Oppert B.
в журнале Protein Science , издательство Cold Spring Harbor Laboratory Press (United States) , том 23, № S1, с. 199-199
2014
RNA-Seq gene expression profiling of HepG2 cells: the influence of experimental factors and comparison with liver tissue
Tyakht A.V. ,
Ilina E.N. ,
Alexeev D.G. ,
Ischenko D.S. ,
Gorbachev A.Y. ,
Semashko T.A. ,
Larin A.K. ,
Selezneva O.V. ,
Kostryukova E.S. ,
Karalkin P.A. ,
Vakhrushev I.V. ,
Kurbatov L.K.,
Archakov A.I. ,
Govorun V.M.
в журнале BMC Genomics , издательство BioMed Central (London) , том 15, с. 1108
2014
Selective chromogenic and fluorogenic peptide substrates for the assay of cysteine peptidases in complex mixtures
Semashko Tatiana A. ,
Vorotnikova Elena A. ,
Sharikova Valeriya F.F ,
Vinokurov Konstantin S. ,
Smirnova Yulia A. ,
Dunaevsky Yakov E. ,
Belozersky Mikhail A. ,
Brenda Oppert ,
Elpidina Elena N. ,
Filippova Irina Y.
в журнале Analytical Biochemistry , издательство Academic Press (United States) , том 449, с. 179-187
DOI
2014
Transcriptome analysis reveals novel regulatory mechanisms in a genome-reduced bacterium
Mazin P.V. ,
Fisunov G.Y. ,
Gorbachev A.Y. ,
Kapitskaya K.Y. ,
Altukhov I.A. ,
Semashko T.A. ,
Alexeev D.G. ,
Govorun V.M.
в журнале Nucleic Acids Research , издательство Oxford University Press (United Kingdom) , том 42, № 21, с. 13254-13268
2013
Draft Genome of the Nitrogen-Fixing Bacterium Pseudomonas stutzeri Strain KOS6 Isolated from Industrial Hydrocarbon Sludge
Grigoryeva T.V. ,
Laikov A.V. ,
Naumova R.P.,
Manolov A.I. ,
Larin A.K. ,
Karpova I.Y. ,
Semashko T.A. ,
Alexeev D.G. ,
Kostryukova E.S. ,
Müller R. ,
Govorun V.M.
в журнале Genome Announcements , том 1, с. e00072
2013
Human gut microbiota community structures in urban and rural populations in Russia
Tyakht A.V. ,
Kostryukova E.S. ,
Popenko A.S. ,
Belenikin M.S.,
Pavlenko A.V.,
Larin A.K. ,
Karpova I.Y. ,
Selezneva O.V. ,
Semashko T.A. ,
Ospanova E.A. ,
Babenko V.V. ,
Maev I.V. ,
Cheremushkin S.V. ,
Kucheryavyy Y.A. ,
Shcherbakov P.L.,
Grinevich V.B. ,
Efimov O.I.,
Sas E.I.,
Abdulkhakov R.A. ,
Abdulkhakov S.R. ,
Lyalyukova E.A. ,
Livzan M.A. ,
Vlassov V.V.,
Sagdeev R.Z.,
Tsukanov V.V. ,
Osipenko M.F.,
Kozlova I.V.,
Tkachev A.V.,
Sergienko V.I.,
Alexeev D.G. ,
Govorun V.M.
в журнале Nature communications , издательство Nature Pub. Group (United Kingdom) , том 4, с. 2469
2012
Cysteine digestive peptidases function as post-glutamine cleaving enzymes in tenebrionid stored product pests
Goptar I.A. ,
Semashko T.A. ,
Danilenko S.A. ,
Lysogorskaya E.N. ,
Oksenoit E.S. ,
Zhuzhikov D.P. ,
Belozersky M.A. ,
Dunaevsky Y.E. ,
Oppert B. ,
Filippova I.Yu ,
Elpidina E.N.
в журнале Comparative Biochemistry and Physiology - B Biochemistry and Molecular Biology , издательство Elsevier BV (Netherlands) , том 161, № 2, с. 148-154
DOI
2011
Influenza virus hemagglutinin spike neck architectures and interaction with model enzymes evaluated by MALDI-TOF mass spectrometry and bioinformatics tools
Serebryakova M.V. ,
Kordyukova L.V. ,
Semashko T.A. ,
Ksenofontov A.L. ,
Rudneva I.A. ,
Kropotkina E.A. ,
Filippova I.Y. ,
Veit M. ,
Baratova L.A.
в журнале Virus Research , издательство Elsevier BV (Netherlands) , том 160, № 1-2, с. 294-304
DOI
2006
Субтилизин Карлсберг, нативный и модифицированный, эффективный катализатор синтеза пептидной связи в органической среде
Аникина О.М. ,
Семашко Т.А. ,
Оксенойт Е.С. ,
Лысогорская Е.Н. ,
Филиппова И.Ю.
в журнале Биоорганическая химия , издательство Наука (М.) , том 32, № 2, с. 130-136
Статьи в сборниках
Доклады на конференциях
2018
Secreted and surface-associated proteins of Mycoplasma gallisepticum
(Стендовый)
Авторы:
Evsyutina D. ,
Pobeguts O. ,
Butenko I. ,
Govorun V. ,
Ladygina V. ,
Garanina I. ,
Fisunov G. ,
Semashko T.
The 43rd FEBS Congress Prague 7-12 July, 2018 , Prague, Чехия, 7-12 июля 2018
2014
Синтез и применение селективных хромогенных и флуорогенных пептидных субстратов для анализа цистеиновых пептидаз семейства папаина
(Устный)
Авторы:
Семашко Т.А. ,
Воротникова Е.А. ,
Шарикова В.Ф. ,
Винокуров К.С. ,
Смирнова Ю.А. ,
Баландина Г.Н. ,
Элпидина Е.Н. ,
Филиппова И.Ю.
VII Всероссийская конференция «Протеолитические ферменты: структура, функции, эволюция» 30 июня-04 июля 2014 г. , г. Петрозаводск, Республика Карелия, 2014
2013
Глутамин- и пролин-специфичные пептидазы насекомых-вредителей зерновых запасов и аутоиммунное заболевание целиакия.
(Устный)
Авторы:
Элпидина Е.Н. ,
Филиппова И.Ю. ,
Гоптарь И.А. ,
Шарикова В.Ф. ,
Мартынов А.Г. ,
Смирнова Ю.А. ,
Воротникова Е.А. ,
Семашко Т.А.
VI Российский симпозиум «Белки и пептиды», , Уфа, 2013
2009
Molecular Evolution of Influenza A Virus Hemagglutinin in consideration of Enzyme Proteolysis, Mass Spectrometry and Phylogeny Analysis Data.
(Устный)
Авторы:
Smirnova Yu A. ,
Lebedev V.I. ,
Semashko T.A. ,
Kropotkina E.A. ,
Kordyukova L.V. ,
Serebryakova M.V.
Moscow Conference on Computational Molecular Biology, MCCMB’09 , Москва, Россия, Россия, 2009
2006
Производство высокоспецифичных хромогенных и флуорогенных пептидных субстратов протеиназ с использованием уникальной экологически безопасной технологии
Авторы:
Филиппова И.Ю. ,
Лысогорская Е.Н. ,
Оксенойт Е.С. ,
Бачева А.В. ,
Семашко Т.А. ,
Аникина О.М. ,
Элпидина Е.Н. ,
Дунаевский Я.Е. ,
Белозерский М.А. ,
Жужиков Д.П. ,
Баландина Г.Н. ,
Гоптарь И.А. ,
Винокуров К.С.
3-я Международная научно-практическая школа-конференция МЕДБИОТЕК "Актуальные вопросы инновационной деятельности в биологии и медицине , Москва, Россия, 2006
Тезисы докладов
2014
Highly Selective Peptide Substrates For The Assay Of Cysteine Peptidases From The C1 Family
Elpidina Elena N. ,
Filippova Irina Y. ,
Semashko Tatiana A. ,
Vorotnikova Elena A. ,
Sharikova Valeriya F. ,
Vinokurov Konstantin S. ,
Lyndsey Fallis ,
Brenda Oppert
в сборнике The 28th Annual Symposium of The Protein Society July 27–30, 2014 • San Diego, CA PROGRAM & ABSTRACTS , тезисы, с. 199-199
2014
Синтез и применение селективных хромогенных и флуорогенных пептидных субстратов для анализа цистеиновых пептидаз семейства папаина
Семашко Т.А. ,
Воротникова Е.А. ,
Шарикоава В.Ф. ,
Винокуров К.С. ,
Смирнова Ю.А. ,
Баландина Г.Н. ,
Элпидина Е.Н. ,
Филиппова И.Ю.
в сборнике Материалы VII Всероссийской конференции "Протеолитические ферменты: структура, функции, эволюция" , место издания Карельский научный центр РАН, редакционно-издательский отдел Петрозаводск , тезисы, с. 108-108
2013
Глутамин- и пролин-специфичные пептидазы насекомых-вредителей зерновых запасов и аутоиммунное заболевание целиакия
Элпидина Е.Н. ,
Филиппова И.Ю. ,
Гоптарь И.А. ,
Семашко Т.А. ,
Мартынов А.Г. ,
Смирнова Ю.А. ,
Воротникова Е.А. ,
Шарикова В.Ф.
в сборнике Материалы VI Российского симпозиума «Белки и пептиды» , место издания ИСЭИ УНЦ РАН Уфа , тезисы, с. 101-101
НИРы
Диссертация
Руководство дипломными работами