Выберите категорию обращения:
Общие вопросы
Отчеты
Рейтинги
Мониторинговый отчёт
Диссертационные советы
Конкурсы
Ввод данных
Структура организаций
Аспирантура
Научное оборудование
Импорт педагогической нагрузки
Журналы и импакт-факторы
Тема обращения:
Описание проблемы:
Введите почтовый адрес:
ИСТИНА
Войти в систему
Регистрация
ИПМех РАН
Главная
Поиск
Статистика
О проекте
Помощь
В связи с техническими работами в центре обработки данных, часть прикреплённых файлов в настоящее время недоступна.
скрыть
отправить сообщение
открыть новую версию профиля
Тимофеев Владимир Игоревич
пользователь
Институт кристаллографии РАН
Соавторы:
Ковальчук М.В.
,
Куранова И.П.
,
Есипов Р.С.
,
Rakitina T.V.
,
Marchenkova M.A.
,
Dyakova Y.A.
,
Kuranova I.P.
,
Zhukhlistova N.E.
,
Akparov V.K.
,
Подшивалов Д.Д.
,
Abramchik Y.A.
,
Korzhenevskiy D.
,
Писаревский Ю.В.
показать полностью...
,
Попов В.О.
,
Kostromina M.
,
Pisarevskii Y.V.
,
Халиуллин И.Г.
,
Чупова Л.А.
,
Швядас В.К.
,
Talyzina A.A.
,
Благов А.Е.
,
Бойко К.М.
,
Власкина А.В.
,
Липкин А.В.
,
Самыгина В.Р.
,
Agapova Y.K.
,
Bobkova A.S.
,
Boiko K.M.
,
Kordonskaya Y.
,
Muravieva T.I.
,
Muravieva T.I.
,
Nikolaeva A.
,
Владимиров Г.К.
,
Володяев И.В.
,
Левченко И.Н.
,
Abramchik Y.
,
Altukhov D.A.
,
Bocharov E.V.
,
Gabdoulkhakov A.G.
,
Lashkov A.A.
,
Muravieva T.I.
,
Sinitsyna E.V.
,
Volkov V.V.
,
Дороватовский П.В.
,
Заец Е.А.
,
Куранова И.П.
,
Манджиева Ю.Б.
,
Петерс Г.С.
,
Ромодин Л.А.
,
Abramchik Y.
,
Agapova Y.K.
,
Agapova Y.
,
Alekseeva O.A.
,
Baĭdus’ A.N.
,
Betzel C.
,
Chestukhina G.G.
,
Chuprov-Netochin R.
,
Dorovatovskiy P.V.
,
Fateev I.
,
Fateev I.I.
,
Garipov I.F.
,
Gruzinov A.
,
Kamashev D.E.
,
Kleymenov S.Y.
,
Konarev P.V.
,
Konstantinova G.E.
,
Maghsoudi N.N.
,
Makarov D.A.
,
Mikhailov A.M.
,
Mikhailova A.G.
,
Mikheeva O.O.
,
Muravieva T.
,
Murav’eva T.I.
,
Pavlyuk B.P.
,
Pisarevsky Y.V.
,
Pisarevsky Y.V.
,
Rastorguev S.M.
,
Shabalin I.G.
,
Sidorov-Biryukov D.D.
,
Sidorov-Biryukov D.D.
,
Sidorov-Biryukov D.D.
,
Sinitsyna E.V.
,
Slutskaya E.S.
,
Sokolenko N.
,
Sosfenov N.I.
,
Stroylov V.S.
,
Tereschenko E.Y.
,
Tuzova E.S.
,
Vaĭnshteĭn B.K.
,
Абрамов Ю.А.
,
Бобкова А.С.
,
Василов Р.Г.
,
Волков В.В.
,
Горленко В.А.
,
Карлинский Д.М.
,
Качалова Г.С.
,
Конарев П.В.
,
Корженевский Д.А.
,
Корженевский Д.А.
,
Матвеев И.В.
,
Мирошников К.А.
,
Моргунова Е.П.
,
Овчинникова М.А.
,
Ракитина Т.В.
,
Румш Л.Д.
,
Серов А.Е.
,
Скиргелло О.Е.
,
Смирнова Е.В.
,
Смирнова Е.С.
,
Солдатов А.В.
,
Суханов А.Е.
,
Терещенко Е.Ю.
,
Тишков В.И.
,
горбачева м.п.
61 статья
,
6 докладов на конференциях
,
5 тезисов докладов
Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 377, Scopus: 361
IstinaResearcherID (IRID): 41004922
ResearcherID:
B-1342-2014
Деятельность
Статьи в журналах
2023
Study of the Formation of Precursor Clusters in an Aqueous Solution of KH2PO4 by Small-Angle X-ray Scattering and Molecular Dynamics
Sukhanov Andrey E.
,
Konarev Petr V.
,
Timofeev Vladimir I.
,
Garipov Ildar F.
,
Smirnova Ekaterina S.
,
Peters Georgy S.
, Ilina Kseniia B.,
Pisarevsky Yury V.
,
Alekseeva Olga A.
,
Kovalchuk Mikhail V.
в журнале
Crystals
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 13, № 11, с. 1577-1577
DOI
2022
The Role of Cations and Anions in the Formation of Crystallization Oligomers in Protein Solutions as Revealed by Combination of Small-Angle X-ray Scattering and Molecular Dynamics
Marchenkova Margarita A.
,
Konarev Petr V.
,
Kordonskaya Yuliya V.
, Ilina Kseniia B.,
Pisarevsky Yury V.
,
Soldatov Alexander V.
,
Timofeev Vladimir I.
,
Kovalchuk Mikhail V.
в журнале
Crystals
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 12, № 6
DOI
2020
Precipitant ions influence on lysozyme oligomers stability investigated by molecular dynamics simulation at different temperatures
Kordonskaya Yuliya V.
,
Marchenkova Margarita A.
,
Timofeev Vladimir I.
,
Dyakova Yulia A.
,
Pisarevsky Yurii V.
,
Kovalchuk Michael V.
в журнале
Journal of Biomolecular Structure and Dynamics
, издательство
Adenine Press
(United States)
, с. 1-8
DOI
2020
The binding of precipitant ions in the tetragonal crystals of hen egg white lysozyme
Marchenkova M.A.
, Kuranova I.P.,
Timofeev V.I.
,
Boikova A.S.
,
Dorovatovskii P.V.
,
Dyakova Y.A.
, Ilina K.B.,
Pisarevskiy Y.V.
,
Kovalchuk M.V.
в журнале
Journal of Biomolecular Structure and Dynamics
, издательство
Adenine Press
(United States)
, том 38, № 17, с. 5159-5172
2019
Dodecamers derived from the crystal structure were found in the pre-crystallization solution of the transaminase from the thermophilic bacterium Thermobaculum terrenum by small-angle X-ray scattering
Marchenkova Margarita A.
, Konarev Petr V.,
Rakitina Tatiana V.
,
Timofeev Vladimir I.
,
Boikova Anastasiia S.
,
Dyakova Yulia A.
, Ilina Kseniia B., Korzhenevskiy Dmitry A., Nikolaeva Alena Yu,
Pisarevsky Yurii V.
,
Kovalchuk Mikhail V.
в журнале
Journal of Biomolecular Structure and Dynamics
, издательство
Adenine Press
(United States)
, с. 1-6
DOI
2019
Study of the Influence of a Precipitant Cation on the Formation of Oligomers in Crystallization Solutions of Lysozyme Protein
Dyakova Yu A.
,
Boikova A.S.
, Ilina K.B., Konarev P.V.,
Marchenkova M.A.
,
Pisarevsky Yu V.
,
Timofeev V.I.
,
Kovalchuk M.V.
в журнале
Crystallography Reports
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 64, № 1, с. 11-15
DOI
2019
The nature of the ligand’s side chain interacting with the S1'-subsite of metallocarboxypeptidase T (from Thermoactinomyces vulgaris) determines the geometry of the tetrahedral transition complex
Akparov V.Kh
,
Timofeev V.I.
,
Konstantinova G.E.
,
Khaliullin I.G.
,
Kuranova I.P.
,
Rakitina T.V.
,
Švedas V.
в журнале
PLoS ONE
, издательство
Public Library of Science
(United States)
, том 14, № 12, с. e0226636
DOI
2019
ИССЛЕДОВАНИЕ ВЛИЯНИЯ КАТИОНА ОСАДИТЕЛЯ НА ОБРАЗОВАНИЕ ОЛИГОМЕРОВ В КРИСТАЛЛИЗАЦИОННЫХ РАСТВОРАХ БЕЛКА ЛИЗОЦИМА
Дьякова Ю.А.,
Бойкова А.С.
, Ильина К.Б., Конарев П.В.,
Марченкова М.А.
,
Писаревский Ю.В.
,
Тимофеев В.И.
,
Ковальчук М.В.
в журнале
Кристаллография
, издательство
ФГУП Издательство «Наука»
(Москва)
, том 64, № 1, с. 15-19
DOI
2018
An explanation for the narrow carbohydrate substrate specificity of adenine phosphoribosyltransferase from Thermus thermophilus from the model of the enzyme, substrate, and magnesium cation cofactor complex
Zayats E.A.
,
Timofeev V.I.
,
Kostromina M.A.
,
Esipov R.S.
в журнале
Journal of Biomolecular Structure and Dynamics
, издательство
Adenine Press
(United States)
2018
An explanation for the narrow carbohydrate substrate specificity of adenine phosphoribosyltransferase from Thermus thermophilus from the model of the enzyme, substrate, and magnesium cation cofactor complex
Zayats E.A.
,
Timofeev V.I.
,
Kostromina M.A.
,
Esipov R.S.
в журнале
Journal of Biomolecular Structure and Dynamics
, издательство
Adenine Press
(United States)
DOI
2018
Crystal structure of Escherichia coli purine nucleoside phosphorylase complexed with acyclovir
Timofeev Vladimir I.
,
Zhukhlistova Nadezhda E.
,
Abramchik Yuliya A.
,
Muravieva Tatiana I.
,
Esipov Roman S.
,
Kuranova Inna P.
в журнале
Acta Crystallographica Section F: Structural Biology and Crystallization Communications
, издательство
International Union of Crystallography
(United Kingdom)
, том 74, № 7, с. 402-409
DOI
2018
Crystal structure of Escherichia coli purine nucleoside phosphorylase in complex with 7-deazahypoxanthine
Timofeev Vladimir I.
,
Zhukhlistova Nadezhda E.
,
Abramchik Yuliya A.
,
Fateev Ilya I.
,
Kostromina Maria A.
,
Muravieva Tatiana I.
,
Esipov Roman S.
,
Kuranova Inna P.
в журнале
Acta Crystallographica Section F: Structural Biology and Crystallization Communications
, издательство
International Union of Crystallography
(United Kingdom)
, том 74, № 6, с. 355-362
DOI
2018
Crystal structure of mutant carboxypeptidase T from Thermoactinomyces vulgaris with an implanted S1' subsite from pancreatic carboxypeptidase B
Akparov Valery Kh
,
Timofeev Vladimir I.
,
Kuranova Inna P.
,
Rakitina Tatiana V.
в журнале
Acta Crystallographica Section F: Structural Biology and Crystallization Communications
, издательство
International Union of Crystallography
(United Kingdom)
, том 74, № 10, с. 638-643
DOI
2018
Crystal structures of carboxypeptidase T complexes with transition-state analogs
Akparov Valery Kh
,
Timofeev Vladimir I.
,
Khaliullin Ilyas G.
,
Vytas Švedas
,
Kuranova Inna P.
,
Rakitina Tatiana V.
в журнале
Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, издательство Taylor & Francis
, том 36, № 15, с. 3958-3966
DOI
2018
Discovery of Selective Inhibitors of Imidazoleglycerol-Phosphate Dehydratase from Mycobacterium tuberculosis by Virtual Screening
Podshivalov D.
,
Mandzhieva Yu B.
,
Sidorov-Biryukov D.D.
,
Timofeev V.I.
,
Kuranova I.P.
в журнале
Crystallography Reports
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 63, № 1, с. 74-78
DOI
2018
Mobile Loop in the Active Site of Metallocarboxypeptidases as an Underestimated Determinant of Substrate Specificity
Akparov V.Kh
,
Timofeev V.I.
,
Khaliullin I.G.
, Konstantinova G.E.,
Kuranova I.P.
,
Rakitina T.V.
,
Švedas and V.K
в журнале
Biochemistry (Moscow)
, издательство
Pleiades Publishing, Ltd
(Road Town, United Kingdom)
, том 83, № 12-13, с. 1594-1602
DOI
2018
Pre-crystallization phase formation of thermolysin hexamers in solution close to crystallization conditions
Kovalchuk Mikhail V.
, Boikova Anastasiia S.,
Dyakova Yulia A.
, Ilina Kseniia B., Konarev Petr V., Kryukova Alyona E.,
Marchenkova Margarita A.
,
Pisarevsky Yurii V.
,
Timofeev Vladimir I.
в журнале
Journal of Biomolecular Structure and Dynamics
, издательство
Adenine Press
(United States)
, том 37, № 12, с. 3058-3064
DOI
2018
Structural plasticity and thermal stability of the histone-like protein from Spiroplasma melliferum are due to phenylalanine insertions into the conservative scaffold
Timofeev Vladimir I.
,
Altukhov Dmitry A.
,
Talyzina Anna A.
,
Agapova Yulia K.
,
Vlaskina Anna V.
,
Korzhenevskiy Dmitry A.
,
Kleymenov Sergey Yu
,
Bocharov Eduard V.
,
Rakitina Tatiana V.
в журнале
Journal of Biomolecular Structure and Dynamics
, издательство
Adenine Press
(United States)
, том 36, № 16, с. 4392-4404
DOI
2018
Structure of the carboxypeptidase B complex with N-sulfamoyl-L-phenylalanine – a transition state analog of non-specific substrate
Akparov V.
,
Timofeev V.
,
Khaliullin I.
,
Švedas V.
,
Kuranova I.
в журнале
Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, издательство Taylor & Francis
, том 36, № 4, с. 956-965
DOI
2018
Study of the Behavior of Lysozyme Oligomers in Solutions by the Molecular Dynamics Method
Kordonskaya Yu V.
,
Timofeev V.I.
,
Dyakova Yu A.
,
Marchenkova M.A.
,
Pisarevsky Yu V.
,
Podshivalov D.D.
,
Kovalchuk M.V.
в журнале
Crystallography Reports
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 63, № 6, с. 947-950
DOI
2018
Поиск селективных ингибиторов имидазолглицеролфосфат дегидратазы из Mycobacterium Tuberculosis методом виртуального скрининга
Подшивалов Д.Д.
,
Манджиева Ю.Б.
, Сидоров-Бирюков Д.Д.,
Тимофеев В.И.
,
Куранова И.П.
в журнале
Кристаллография
, издательство
ФГУП Издательство «Наука»
(Москва)
, том 63, № 1, с. 82-87
DOI
2017
Activity modulation of the oligopeptidase B from Serratia proteamaculans by site-directed mutagenesis of amino acid residues surrounding catalytic triad histidine
Mikhailova Anna G.
,
Rakitina Tatiana V.
,
Timofeev Vladimir I.
,
Karlinsky David M.
,
Korzhenevskiy Dmitry A.
,
Agapova Yulia K.
,
Vlaskina Anna V.
,
Ovchinnikova Marina V.
,
Gorlenko Valentina A.
,
Rumsh Lev D.
в журнале
Biochimie
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 139, с. 125-136
DOI
2017
Application of virtual screening and molecular dynamics for the analysis of selectivity of inhibitors of HU proteins targeted to the DNA-recognition site
Talyzina A.A.
,
Agapova Yu K.
,
Podshivalov D.D.
,
Timofeev V.I.
,
Sidorov-Biryukov D.D.
,
Rakitina T.V.
в журнале
Crystallography Reports
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 62, № 6, с. 903-908
DOI
2017
Comparison of histone-like HU protein DNA-binding properties and HU/IHF protein sequence alignment
Kamashev Dmitri
,
Agapova Yulia
,
Rastorguev Sergey
,
Talyzina Anna A.
,
Boyko Konstantin M.
,
Korzhenevskiy Dmitry A.
,
Vlaskina Anna
,
Vasilov Raif
,
Timofeev Vladimir I.
,
Rakitina Tatiana V.
в журнале
PLoS ONE
, издательство
Public Library of Science
(United States)
, том 12, № 11, с. e0188037
DOI
2017
Crystal structure of recombinant phosphoribosylpyrophosphate synthetase 2 from Thermus thermophilus HB27 complexed with ADP and sulfate ions
Timofeev Vladimir I.
,
Sinitsyna Ekaterina V.
,
Kostromina Maria A.
,
Muravieva Tatiana I.
,
Makarov Dmitry A.
,
Mikheeva Olga O.
,
Kuranova Inna P.
,
Esipov Roman S.
в журнале
Acta Crystallographica Section F: Structural Biology and Crystallization Communications
, издательство
International Union of Crystallography
(United Kingdom)
, том 73, № 6, с. 369-375
DOI
2017
Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of recombinant phosphoribosylpyrophosphate synthetase from the Thermophilic thermus thermophilus strain HB27
Abramchik Yu A.
,
Timofeev V.I.
,
Muravieva T.I.
,
Sinitsyna E.V.
,
Esipov R.S.
,
Kuranova I.P.
в журнале
Crystallography Reports
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 62, № 1, с. 78-81
DOI
2017
Crystallization and preliminary X-ray diffraction study of recombinant adenine phosphoribosyltransferase from the thermophilic bacterium Thermus thermophilus strain HB27
Sinitsyna E.V.
,
Timofeev V.I.
,
Tuzova E.S.
,
Kostromina M.A.
,
Murav’eva T.I.
,
Esipov R.S.
,
Kuranova I.P.
в журнале
Crystallography Reports
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 62, № 4, с. 580-583
DOI
2017
Three-dimensional structure of porcine pancreatic carboxypeptidase B with an acetate ion and two zinc atoms in the active site
Akparov V.Kh
,
Timofeev V.I.
,
Maghsoudi N.N.
,
Kuranova I.P.
в журнале
Crystallography Reports
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 62, № 2, с. 249-253
DOI
2017
Virtual screening of selective inhibitors of phosphopantetheine adenylyltransferase from Mycobacterium tuberculosis
Podshivalov D.D.
,
Timofeev V.I.
,
Sidorov-Biryukov D.D.
,
Kuranova I.P.
в журнале
Crystallography Reports
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 62, № 3, с. 405-410
DOI
2017
ПОИСК СЕЛЕКТИВНЫХ ИНГИБИТОРОВ ФОСФОПАНТЕТЕИН АДЕНИЛИЛТРАНСФЕРАЗЫ ИЗ MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS МЕТОДОМ ВИРТУАЛЬНОГО СКРИНИНГА
Подшивалов Д.Д.
,
Тимофеев В.И.
, Сидоров-Бирюков Д.Д.,
Куранова И.П.
в журнале
Кристаллография
, издательство
ФГУП Издательство «Наука»
(Москва)
, том 62, № 3, с. 407-412
DOI
2016
Crystallization and preliminary X-ray diffraction study of recombinant ribokinase from Thermus Species 2.9
Abramchik Yu A.
,
Timofeev V.I.
,
Muravieva T.I.
,
Esipov R.S.
,
Kuranova I.P.
в журнале
Crystallography Reports
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 61, № 6, с. 974-978
DOI
2016
Enhanced conformational flexibility of the histone-like (HU) protein from Mycoplasma gallisepticum
Altukhov Dmitry A.
,
Talyzina Anna A.
,
Agapova Yulia K.
,
Vlaskina Anna V.
,
Korzhenevskiy Dmitry A.
,
Bocharov Eduard V.
,
Rakitina Tatiana V.
,
Timofeev Vladimir I.
,
Popov Vladimir O.
в журнале
Journal of Biomolecular Structure and Dynamics
, издательство
Adenine Press
(United States)
, том 36, № 1, с. 45-53
DOI
2016
In Situ-исследования состояния молекул лизоцима на стадии начала процесса кристаллизации методом малоуглового рентгеновского рассеяния
Марченкова М.А.
,
Волков В.В.
,
Благов А.Е.
,
Дьякова Ю.А.
, Ильина К.Б.,
Терещенко Е.Ю.
,
Тимофеев В.И.
,
Писаревский Ю.В.
,
Ковальчук М.В.
в журнале
Кристаллография
, издательство
ФГУП Издательство «Наука»
(Москва)
, том 61, № 1, с. 10-15
2016
In situ study of the state of lysozyme molecules at the very early stage of the crystallization process by small-angle X-ray scattering
Marchenkova M.A.
,
Volkov V.V.
,
Blagov A.E.
,
Dyakova Yu A.
, Ilina K.B.,
Tereschenko E.Yu
,
Timofeev V.I.
,
Pisarevsky Yu V.
,
Kovalchuk M.V.
в журнале
Crystallography Reports
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 61, № 5, с. 5-10
2016
Investigation of the Initial Crystallization Stage in Lysozyme Solutions by Small-Angle X-ray Scattering
Kovalchuk M.V.
,
Blagov A.E.
,
Dyakova Y.A.
,
Gruzinov A.Yu
,
Marchenkova M.A.
,
Peters G.S.
,
Pisarevsky Y.V.
,
Timofeev V.I.
,
Volkov V.V.
в журнале
Crystal Growth and Design
, издательство
American Chemical Society
(United States)
, том 16, № 6, с. 1792-1797
2016
Protein crystallization under microgravity conditions. Analysis of the results of Russian experiments performed n the International Space Station in 2005−2015
Boyko K.M.
,
Timofeev V.I.
,
Samygina V.R.
,
Kuranova I.P.
,
Popov V.O.
,
Kovalchuk M.V.
в журнале
Crystallography Reports
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 61, № 5, с. 718-729
DOI
2016
Three-dimensional structure of E. Coli purine nucleoside phosphorylase at 0.99 Å resolution
Timofeev V.I.
,
Abramchik Yu A.
,
Zhukhlistova N.E.
,
Muravieva T.I.
,
Esipov R.S.
,
Kuranova I.P.
в журнале
Crystallography Reports
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 61, № 2, с. 249-257
DOI
2016
Three-dimensional structure of phosphoribosyl pyrophosphate synthetase from E. coli at 2.71 Å resolution
Timofeev V.I.
,
Abramchik Yu A.
,
Zhukhlistova N.E.
,
Muravieva T.I.
,
Esipov R.S.
,
Kuranova I.P.
в журнале
Crystallography Reports
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 61, № 1, с. 44-54
DOI
2016
Кристаллизация белков в условиях микрогравитации. Анализ результатов российских экспериментов на МКС в 2005–2015 гг
Бойко К.М.
,
Тимофеев В.И.
,
Самыгина В.Р.
,
Куранова И.П.
,
Попов В.О.
,
Ковальчук М.В.
в журнале
Кристаллография
, издательство
ФГУП Издательство «Наука»
(Москва)
, том 61, № 5, с. 691-702
DOI
2015
Crystallization and preliminary X-ray diffraction study of phosphopantetheine adenylyltransferase from M. tuberculosis crystallizing in space group P32
Timofeev V.I.
,
Chupova L.A.
,
Esipov R.S.
,
Kuranova I.P.
в журнале
Crystallography Reports
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 60, № 5, с. 682-684
DOI
2015
Crystallization and preliminary X-ray diffraction study of phosphoribosyl pyrophosphate synthetase from E. Coli
Timofeev V.I.
,
Abramchik Yu A.
,
Zhukhlistova N.E.
,
Kuranova I.P.
в журнале
Crystallography Reports
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 60, № 5, с. 685-688
DOI
2015
Crystallization and preliminary X-ray diffraction study of porcine carboxypeptidase B
Akparov V.Kh,
Timofeev V.I.
, Kuranova I.P.
в журнале
Crystallography Reports
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 60, № 3, с. 367-369
DOI
2015
Isolation, Purification, Crystallization, and Preliminary X-ray Diffraction Study of the Crystals of HU Protein from M. gallisepticum
Nikolaeva A.Yu
,
Timofeev V.I.
,
Boiko K.M.
,
Korzhenevskii D.A.
,
Rakitinaa T.V.
,
Dorovatovskii P.V.
,
Lipkin A.V.
в журнале
Crystallography Reports
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 60, № 6, с. 880-883
DOI
2015
Purification, crystallization, and preliminary X-ray diffraction study of purine nucleoside phosphorylase from E. coli
Abramchik Yu A.
,
Timofeev V.I.
,
Zhukhlistova N.E.
,
Muravieva T.I.
,
Esipov R.S.
, Kuranova I.P.
в журнале
Crystallography Reports
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 60, № 4, с. 521-524
DOI
2015
Structural insights into the broad substrate specificity of carboxypeptidase T from Thermoactinomyces vulgaris
Akparov V.K.
,
Timofeev V.I.
,
Khaliullin I.G.
,
Švedas V.
,
Chestukhina G.G.
,
Kuranova I.P.
в журнале
FEBS Journal
, издательство
Blackwell Publishing Inc.
(United Kingdom)
, том 282, № 7, с. 1214-1224
DOI
2015
Structure of recombinant prolidase from Thermococcus sibiricus in space group P21221
Timofeev V.
,
Slutskaya E.
,
Gorbacheva M.
,
Boyko K.
,
Rakitina T.
,
Korzhenevskiy D.
,
Lipkin A.
,
Popov V.
в журнале
Acta Crystallographica Section F: Structural Biology and Crystallization Communications
, издательство
International Union of Crystallography
(United Kingdom)
, том 71, № Pt 8, с. 951-957
DOI
2015
Structure of the complex of carboxypeptidase B and N-sulfamoyl-L-arginine
Akparov Valery
,
Sokolenko Nikolay
,
Timofeev Vladimir
,
Kuranova Inna
в журнале
Acta Crystallographica Section F: Structural Biology and Crystallization Communications
, издательство
International Union of Crystallography
(United Kingdom)
, том 71, № 10, с. 1335-1340
DOI
2015
ВЫДЕЛЕНИЕ, ОЧИСТКА, КРИСТАЛЛИЗАЦИЯ И ПРЕДВАРИТЕЛЬНОЕ РЕНТГЕНОВСКОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ КРИСТАЛЛОВ HU-БЕЛКА ИЗ
Николаева А.Ю.
,
Тимофеев В.И.
,
Бойко К.М.
,
Корженевский Д.А.
,
Ракитина Т.В.
,
Дороватовский П.В.
,
Липкин А.В.
в журнале
Кристаллография
, издательство
ФГУП Издательство «Наука»
(Москва)
, том 60, с. 922-925
2014
3 '-azidothymidine in the active site of Escherichia coli thymidine phosphorylase: the peculiarity of the binding on the basis of X-ray study
Timofeev Vladimir
,
Abramchik Yulia
,
Zhukhlistova Nadezda
,
Muravieva Tatiana
,
Fateev Ilya
,
Esipov Roman
,
Kuranova Inna
в журнале
Acta Crystallographica Section D: Biological Crystallography
, издательство
Blackwell Publishing Inc.
(United Kingdom)
, том 70, № 4, с. 1155-1165
DOI
2013
Three-dimensional structure of thymidine phosphorylase from E. coli in complex with 3 '-azido-2 '-fluoro-2 ',3 '-dideoxyuridine
Timofeev V.I.
,
Abramchik Yu A.
,
Fateev I.V.
,
Zhukhlistova N.E.
, Murav’eva T.I., Kuranova I.P., Esipov R.S.
в журнале
Crystallography Reports
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 58, № 6, с. 842-853
DOI
2012
Three-dimensional structure of phosphopantetheine adenylyltransferase from Mycobacterium tuberculosis in the apo form and in complexes with coenzyme A and dephosphocoenzyme A
Timofeev V.I.
, Smirnova E.A.,
Chupova L.A.
, Esipov R.S., Kuranova I.P.
в журнале
Crystallography Reports
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 57, № 1, с. 96-104
DOI
2012
X-ray study of the conformational changes in the molecule of phosphopantetheine adenylyltransferase from Mycobacterium tuberculosis during the catalyzed reaction
Timofeev Vladimir
,
Smirnova Evgenia
,
Chupova Larisa
,
Esipov Roman
,
Kuranova Inna
в журнале
Acta Crystallographica Section D: Biological Crystallography
, издательство
Blackwell Publishing Inc.
(United Kingdom)
, том 68, № 12, с. 1660-1670
DOI
2011
Crystal growth of phosphopantetheine adenylyltransferase, carboxypeptidase t, and thymidine phosphorylase on the international space station by the capillary counter-diffusion method
Kuranova I.P., Smirnova E.A., Abramchik Yu A.,
Chupova L.A.
, Esipov R.S., Akparov V.Kh,
Timofeev V.I.
,
Kovalchuk M.V.
в журнале
Crystallography Reports
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 56, № 5, с. 884-891
DOI
2011
Three-dimensional structure of recombinant carboxypeptidase T from Thermoactinomyces vulgaris without calcium ions
Akparov V.Kh,
Timofeev V.I.
, Kuranova I.P.
в журнале
Crystallography Reports
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 56, № 4, с. 596-602
DOI
2010
Preparation of the Crystal Complex of Phosphopantetheine Adenylyltransferase from Mycobacterium tuberculosis with Coenzyme A and Investigation of Its Three-Dimensional Structure at 2.1-Å Resolution
Timofeev V.I.
, Smirnova E.A.,
Chupova L.A.
, Esipov R.S., Kuranova I.P.
в журнале
Crystallography Reports
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 55, № 6, с. 1050-1059
DOI
2010
Preparation, crystallization, and preliminary X-ray diffraction study of mutant carboxypeptidase T containing the primary specificity pocket of carboxypeptidase B
Akparov V.Kh, Grishin A.M.,
Timofeev V.I.
, Kuranova I.P.
в журнале
Crystallography Reports
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 55, № 5, с. 802-805
DOI
2010
Recombinant formate dehydrogenase from Arabidopsis thaliana: Preparation, crystal growth in microgravity, and preliminary X-ray diffraction study
Shabalin I.G.
,
Serov A.E.
,
Skirgello O.E.
,
Timofeev V.I.
,
Samygina V.R.
,
Popov V.O.
,
Tishkov V.I.
,
Kuranova I.P.
в журнале
Crystallography Reports
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 55, № 5, с. 806-810
DOI
2010
X-ray investigation of gene-engineered human insulin crystallized from a solution containing polysialic acid
Timofeev V.I.
,
Chuprov-Netochin R.N.
,
Samigina V.R.
, Bezuglov V.V.,
Miroshnikov K.A.
,
Kuranova I.P.
в журнале
Acta Crystallographica Section F: Structural Biology and Crystallization Communications
, издательство
International Union of Crystallography
(United Kingdom)
, том 66, № 3, с. 259-263
2009
Protein crystal growth on the Russian segment of the International Space Station
Smirnova E.A., Kislitsyn Yu A.,
Sosfenov N.I.
, Lyashenko A.V., Popov A.N.,
Baĭdus’ A.N.
,
Timofeev V.I.
, Kuranova I.P.
в журнале
Crystallography Reports
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 54, № 5, с. 901-911
DOI
2007
Isolation, crystallization and preliminary crystallographic analysis of Salmonella typhimuriumuridine phosphorylase crystallized with 2,2 '-anhydrouridine
Timofeev Vladimir I.
,
Lashkov Alexander A.
,
Gabdoulkhakov Azat G.
,
Pavlyuk Bogdan Ph
,
Kachalova Galina S.
,
Betzel Christian
,
Morgunova Ekaterina Yu
,
Zhukhlistova Nadezhda E.
, Mikhailov Al'bert M.
в журнале
Acta Crystallographica Section F: Structural Biology and Crystallization Communications
, издательство
International Union of Crystallography
(United Kingdom)
, том 63, № 10, с. 852-854
DOI
2007
Structure of the homodimer of uridine phosphorylase from Salmonella typhimurium in the native state at 1.9 Å resolution
Timofeev V.I.
, Pavlyuk B.F.,
Lashkov A.A.
, Seregina T.A.,
Gabdulkhakov A.G.
,
Vaĭnshteĭn B.K.
,
Mikhaĭlov A.M.
в журнале
Crystallography Reports
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 52, № 6, с. 1072-1078
DOI
Доклады на конференциях
2023
МАТЕМАТИЧЕСКОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ КВАНТОВЫХ ВЫХОДОВ АКТИВИРОВАННОЙ КУМАРИНАМИ С‒334 и С‒525 ХЕМИЛЮМИНЕСЦЕНЦИИ ПОД ДЕЙСТВИЕМ КОМПЛЕКСА ЦИТОХРОМА С С КАРДИОЛИПИНОМ
(Устный)
Авторы:
Левченко И.Н.
,
Владимиров Г.К.
,
Володяев И.В.
,
Тимофеев В.И.
МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ. МКО-2023
, Россия, 23-27 января 2023
2017
«ПРЕДВАРИТЕЛЬНОЕ РЕНТГЕНОСТРУКТУРНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ КРИСТАЛЛА МУТАНТНОЙ ФОРМЫ V23Q K24T L-АСПАРАГИНАЗЫ WOLINELLA SUCCINOGENES»
(Устный)
Авторы:
Куранова И.П.
,
Тимофеев В.И.
,
Манджиева Ю.Б.
Юбилейная XV Курчатовская междисциплинарная молодежная научная школа
, Москва, Россия, 14-17 ноября 2017
2017
COMPUTER-AIDED SEARCH OF RIBOSE 5-PHOSPHATE AND ATP CONFORMATION IN THE ACTIVE SITE OF THE PHOSPHORYBOSYLPYROPHOSPHATE SYNTHETASE FROM THERMOPHILIC THERMUS THERMOPHILUS
(Стендовый)
Авторы:
Sidorov-Biryukov D.
,
Podshivalov D.
,
Mandzhieva J.
,
Timofeev V.
,
Esipov R.
,
Kuranova I.
3rd Kazan Summer School on Chemoinformatics
, Казань, Россия, 5-7 июля 2017
2017
STRUCTURE-BASED VIRTUAL SCREENING OF NEW SELECTIVE INHIBITORS OF IMIDAZOLEGLYCEROL-PHOSPHATE DEHYDRATASE FROM MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS
(Стендовый)
Авторы:
Mandzhieva J.
,
Podshivalov D.
, Sidorov-Biryukov D.,
Timofeev V.
3rd Kazan Summer School on Chemoinformatics
, Казань, Россия, 5-7 июля 2017
2017
Поиск новых ингибиторов имидазолглицерол-фосфат дегидратаза из mycobacteruim tuberculosis методом виртуального скрининга
(Стендовый)
Авторы:
Манджиева Ю.Б.
,
Тимофеев В.И.
,
Подшивалов Д.Д.
XXIV Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых ученых "Ломоносов – 2017"
, МГУ имени М.В.Ломоносова, Россия, 20 апреля 2017
2016
Механизм действия бактериальных олигопептидаз В. Роль солевых мостов в активации фермента
(Устный)
Авторы:
Агапова Ю.Е.
,
Власкина А.В.
,
Овчинникова М.В.
,
Горленко В.А.
,
Румш Л.Д.
,
Корженевский Д.А.
,
Тимофеев В.И.
,
Карлинский Д.М.
,
Михайлова А.Г.
,
Ракитина Т.В.
V Съезд физиологов СНГ, V Съезд Биохимиков России
, Сочи, Россия, 4-8 октября 2016
Тезисы докладов
2023
Thermodynamic parameters of chemiluminescence activated by coumarin c-525 under the action of cytochrome C complex with cardiolipin
Levchenko I.N.
,
Vladimirov G.K.
,
Romodin L.A.
,
Volodyaev I.V.
,
Timofeev V.I.
в сборнике
МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ 30:
, серия
МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ
, место издания
РХД Москва-Ижевск
, том 30, тезисы
2023
МАТЕМАТИЧЕСКОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ КВАНТОВЫХ ВЫХОДОВ АКТИВИРОВАННОЙ КУМАРИНАМИ С‒314 и С‒525 ХЕМИЛЮМИНЕСЦЕНЦИИ ПОД ДЕЙСТВИЕМ КОМПЛЕКСА ЦИТОХРОМА С С КАРДИОЛИПИНОМ
Левченко И.Н.
,
Владимиров Г.К.
,
Ромодин Л.А.
,
Володяев И.В.
,
Тимофеев В.И.
в сборнике
МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ 30:
, серия
МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ
, место издания
РХД Москва-Ижевск
, том 30, тезисы
2023
МАТЕМАТИЧЕСКОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ КВАНТОВЫХ ВЫХОДОВ АКТИВИРОВАННОЙ КУМАРИНАМИ С‒334 и С‒525 ХЕМИЛЮМИНЕСЦЕНЦИИ ПОД ДЕЙСТВИЕМ КОМПЛЕКСА ЦИТОХРОМА С С КАРДИОЛИПИНОМ
Левченко И.Н.
,
Владимиров Г.К.
,
Володяев И.В.
,
Тимофеев В.И.
в сборнике
МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ 30:, серия МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ, место издания РХД Москва-Ижевск, том 30, тезисы
, серия
МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ
, место издания
РХД Москва-Ижевск
, том 30, тезисы
2016
Исследование поведения олигомеров белка лизоцима в растворах методом молекулярной динамики
Подшивалов Д.Д.
,
Благов А.Е.
,
Дьякова Ю.А.
,
Марченкова М.А.
,
Писаревский Ю.В.
,
Тимофеев В.И.
,
Ковальчук М.В.
в сборнике
Сборник тезисов Первого российского кристаллографического конгресса, Москва, ВДНХ, 21-26 ноября 2016 г
, место издания
ООО "НП-Принт" СПб
, тезисы, с. 255-255
2015
Development of new antibacterial drugs based on inhibitors of histone-like HU-proteins
Boyko K.
,
Nikolaeva A.
,
Rakitina T.
,
Korgenevsky D.
,
Stroylov V.
,
Timofeev V.
,
Lipkin A.
,
Popov V.
в сборнике
FEBS Journal
, серия
Special Issue: 40th FEBS Congress, The Biochemical Basis of Life
, том 281, тезисы, с. 388-388