ИСТИНА

Диброва Дарья Владимировна пользователь

МГУ имени М.В. Ломоносова, Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского, Отдел математических методов в биологии, старший научный сотрудник, с 14 октября 2014

кандидат биологических наук с 2013 года

Соавторы: Мулкиджанян А.Я., Galperin M.Y., Шалаева Д.Н., Кунин Е.В., Климчук О.И., Черепанов Д.А., Kozlova M.I., Nikolaeva A., Perekhvatov V.V., Беляева Ю.Д., Бычков А.Ю., Коновалов К.А., Попинако А.В. показать полностью..., Скулачев К.В., Bezsudnova E.Y., Bushmakin I.M., Khrustalev V., Khrustaleva T., Kozlova M.I., Makarova K.S., Novakovsky G.E., Popov V.O., Rakitina T.V., Алексеева А.А., Антонов М.Ю., Бойко К.М., Бушмакин И.М., Козлова М.И., Нилов Д.К., Новаковский Г.Э., Попов В.О., Скулачев В.П., Соколова О.С., Тишков В.И., Чемерис А.С., Чудецкий М.Ю., Швядас В.К., Шиловский Г.А., Юрченко Т.С.

25 статей, 13 докладов на конференциях, 8 НИР, 1 членство в научном обществе, 1 диссертация, 4 дипломные работы, 28 курсовых работ, 4 учебных курса

Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 426, Scopus: 400
РИНЦ:

IstinaResearcherID (IRID): 6618382

ResearcherID: C-6003-2014

Scopus Author ID: 36508578300

ORCID: 0000-0002-6954-6437

Деятельность

---

• Статьи в журналах

  • • 2023 Regulation of Cell Proliferation and Nrf2-Mediated Antioxidant Defense: Conservation of Keap1 Cysteines and Nrf2 Binding Site in the Context of the Evolution of KLHL Family
    • Shilovsky Gregory A., Dibrova Daria V.
    • в журнале Life, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 13, № 4, с. 1045 DOI
  • • 2022 Common Mechanism of Activated Catalysis in P-Loop Fold Nucleoside Triphosphatases—United in Diversity
    • Kozlova Maria I., Shalaeva Daria N., Dibrova Daria V., Mulkidjanian Armen Y.
    • в журнале Biomolecules, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 12, № 10, с. 1346 DOI
  • • 2022 Common Patterns of Hydrolysis Initiation in P-loop Fold Nucleoside Triphosphatases
    • Kozlova Maria I., Shalaeva Daria N., Dibrova Daria V., Mulkidjanian Armen Y.
    • в журнале Biomolecules, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 12, № 10, с. 1345 DOI
  • 
    • 2022 The role of Tyr102 residue in the functioning of bacterial NAD+-dependent formate dehydrogenase of Pseudomonas sp. 101
    • Popinako A.V., Pometun A.A., Nilov D.K., Dibrova D.V., Khrustalev V.V., Khrustaleva T.A., Iurchenko T.S., Nikolaeva A.Yu, Švedas V.K., Boyko K.M., Tishkov V.I., Popov V.O.
    • в журнале Biochemical and Biophysical Research Communications, издательство Academic Press (United States), том 616, с. 134-139 DOI
  • 
    • 2020 Expansion of the “Sodium World” through Evolutionary Time and Taxonomic Space
    • Kozlova M.I., Bushmakin I.M., Belyaeva J.D., Shalaeva D.N., Dibrova D.V., Cherepanov D.A., Mulkidjanian A.Y.
    • в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 85, № 12, с. 1518-1542 DOI
  • • 2020 Экспансия «Натриевого мира» сквозь эволюционное время и таксономическое пространство
    • Козлова М.И., Бушмакин И.М., Беляева Ю.Д., Шалаева Д.Н., Диброва Д.В., Черепанов Д.А., Мулкиджанян А.Я.
    • в журнале Биохимия, издательство ИКЦ «Академкнига» (Москва), том 85, № 12, с. 1788-1815 DOI
  • 
    • 2018 Analysis of the interactions between GMF and Arp2/3 complex in two binding sites by molecular dynamics simulation
    • Popinako A., Antonov M., Dibrova D., Chemeris A., Sokolova O.S.
    • в журнале Biochemical and Biophysical Research Communications, издательство Academic Press (United States), том 496, № 2, с. 529-535 DOI
  • 
    • 2018 Identification of branched-chain amino acid aminotransferases active towards (R)-(+)-1-phenylethylamine among PLP fold type IV transaminases
    • Bezsudnova E.Yu, Dibrova D.V., Nikolaeva A.Yu, Rakitinaa T.V., Popov V.O.
    • в журнале Journal of Biotechnology, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 271, с. 26-28 DOI
  • • 2017 COGNAT: A web service for comparative analysis of genomic neighborhoods
    • Klimchuk O.I., Konovalov KA, Perekhvatov V.V., Skulachev KV, Dibrova DV, Mulkidjanian AY
    • в журнале Biology Direct, издательство BioMed Central (London), том 12, № 26 DOI
  • • 2017 COGcollator: A web service for analysis of distant relationships between homologous protein families
    • Dibrova DV, Konovalov KA, Perekhvatov V.V., Skulachev KV, Mulkidjanian AY
    • в журнале Biology Direct, издательство BioMed Central (London), том 12, № 29 DOI
  • 
    • 2017 Emergence of cytochrome bc complexes in the context of photosynthesis
    • Dibrova D.V., Shalaeva D.N., Galperin M.Y., Mulkidjanian A.Y.
    • в журнале Physiologia Plantarum, издательство Blackwell Publishing Inc. (United Kingdom), том 161, № 1, с. 150-170 DOI
  • 
    • 2016 Phylogenomic analysis identifies a sodium-translocating decarboxylating oxidoreductase in thermotogae
    • Klimchuk OI, Dibrova DV, Mulkidjanian AY
    • в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 81, № 5, с. 481-490 DOI
  • 
    • 2016 Phylogenomic analysis of type 1 NADH:Quinone oxidoreductase
    • Novakovsky G.E., Dibrova D.V., Mulkidjanian A.Y.
    • в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 81, № 7, с. 770-784 DOI
  • • 2016 Натрий-переносящая декарбоксилирующая оксидоредуктаза у термотог?
    • Климчук О.И., Диброва Д.В., Мулкиджанян А.Я.
    • в журнале Биохимия, издательство ИКЦ «Академкнига» (Москва), том 81, № 5, с. 644-654
  • • 2016 Филогеномный анализ НАДН:хинон оксидоредуктаз типа I
    • Новаковский Г.Э., Диброва Д.В., Мулкиджанян А.Я.
    • в журнале Биохимия, издательство ИКЦ «Академкнига» (Москва), том 81, № 6, с. 813-829
  • 
    • 2015 Ancient Systems of Sodium/Potassium Homeostasis as Predecessors of Membrane Bioenergetics
    • Dibrova DV, Galperin MY, Koonin EV, Mulkidjanian AY
    • в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 80, № 5, с. 495-516 DOI
  • • 2015 Modeling of interaction between cytochrome c and the WD domains of Apaf-1: bifurcated salt bridges underlying apoptosome assembly
    • Shalaeva DN, Dibrova DV, Galperin MY, Mulkidjanian AY
    • в журнале Biology Direct, издательство BioMed Central (London), том 10, № 29 DOI
  • 
    • 2014 Phylogenomic reconstruction of archaeal fatty acid metabolism
    • Dibrova D.V., Galperin M.Y., Mulkidjanian A.Y.
    • в журнале Environmental Microbiology, издательство Blackwell Publishing Inc. (United Kingdom), том 16, № 4, с. 907-918 DOI
  • 
    • 2013 Evolution of cytochrome bc complexes: from membrane-anchored dehydrogenases of ancient bacteria to triggers of apoptosis in vertebrates
    • Dibrova D.V., Cherepanov D.A., Galperin M.Y., Skulachev V.P., Mulkidjanian A.Y.
    • в журнале Biochimica et Biophysica Acta - General Subjects, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 1827, № 11-12, с. 1407-1427 DOI
  • 
    • 2012 Comparative analysis of lipid biosynthesis in archaea, bacteria and eukaryotes: What was the structure of the first membrane lipids?
    • Dibrova Daria V., Makarova Kira S., Galperin Michael Y., Koonin Eugene V., Mulkidjanian Armen Y.
    • в журнале Biochimica et Biophysica Acta - Bioenergetics, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 1817, с. S154 DOI
  • • 2012 Open Questions on the Origin of Life at Anoxic Geothermal Fields
    • Mulkidjanian A.Y., Bychkov A.Y., Dibrova D.V., Galperin M.Y., Koonin E.V.
    • в журнале Origins of Life and Evolution of the Biosphere, издательство Springer Nature (Switzerland) DOI
  • 
    • 2012 Origin of first cells at terrestrial, anoxic geothermal fields
    • Mulkidjanian Armen Y., Bychkov Andrew Yu, Dibrova Daria V., Galperin Michael Y., Koonin Eugene V.
    • в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, издательство National Academy of Sciences (United States), том 109, № 14, с. E821-E830 DOI
  • 
    • 2012 The Role of Energy in the Emergence of Biology from Chemistry
    • Dibrova D.V., Chudetsky M.Y., Galperin M.Y., Koonin E.V., Mulkidjanian A.Y.
    • в журнале Origins of Life and Evolution of the Biosphere, издательство Springer Nature (Switzerland) DOI
  • 
    • 2012 The cytochrome bc(1) complex and the evolution of membrane bioenergetics
    • Dibrova Daria V., Galperin Michael Y., Mulkidjanian Armen Y.
    • в журнале Biochimica et Biophysica Acta - Bioenergetics, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 1817, с. S91 DOI
  • 
    • 2010 Characterization of the N-ATPase, a distinct, laterally transferred Na+-translocating form of the bacterial F-type membrane ATPase
    • Dibrova Daria V., Galperin Michael Y., Mulkidjanian Armen Y.
    • в журнале Bioinformatics, издательство Oxford University Press (United Kingdom), том 26, № 12, с. 1473-1476 DOI

• Доклады на конференциях

  • • 2018 Bioinformatic analysis of prokaryotic F-type ATP synthase operons (Стендовый)
    • Авторы: Фенюк Б.А., Диброва Д.В., Холина Т.Д.
    • 20th European Bioenergetics Conference, Будапешт, Венгрия, 25-30 августа 2018
  • • 2018 Inspecting COGs with COGcollator as a method to avoid pitfalls in phylogenomic analysis (Стендовый)
    • Авторы: Perekhvatov V.V., Dibrova D.V., Mulkidjanian A.Y., Skulachev K.V., Konovalov K.A.
    • V Moscow International Conference «MOLECULAR PHYLOGENETICS AND BIODIVERSITY BIOBANKING», МГУ имени М.В.Ломоносова, Россия, 25-29 августа 2018
  • • 2016 Emergence of cytochrome bc complexes in the context of photosynthesis (Устный)
    • Авторы: Dibrova D.V., Mulkidjanian A.Y.
    • Международная конференция Photosynthetic and Respiratory complexes: from structure to function, Вервьерс, Бельгия, 13 августа 2016 - 15 января 2017
  • • 2015 Role of monovalent cations in P-loop nucleoside triphosphatases (Стендовый)
    • Авторы: Cherepanov D.A., Shalaeva D.N., Dibrova D.V., Galperin M.Y., Mulkidjanian A.Y.
    • 6th European Conference on Prokaryotic and Fungal Genomics, Goettingen, Германия, 29 сентября - 2 октября 2015
  • • 2015 OLESA: Operon Loci Examination and Sorting Application (Стендовый)
    • Авторы: Klimchuk O.I., Mulkidjanian A.Y., Dibrova D.V.
    • Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB'15), Москва, МГУ им. М.В. Ломоносова, Россия, 16-19 июля 2015
  • • 2015 Phylogenomic analysis of the type I NADH:quinone-oxidoreductase (Стендовый)
    • Авторы: Novakovsky G.E., Mulkidjanian A.Y., Dibrova D.V.
    • Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB'15), Москва, МГУ им. М.В. Ломоносова, Россия, 16-19 июля 2015
  • • 2015 Emergence of Membrane Bioenergetics and Its Coupling to Redox and Photosynthetic Enzymes (Приглашенный)
    • Авторы: Mulkidjanian A.Y., Galperin M.Y., Dibrova D.V.
    • 2nd Astrobiology Science Conference, Чикаго, США, 15-19 июня 2015
  • • 2014 Archaeal pathway(s) of fatty acid metabolism and lipids of the Last Universal Cellular Ancestor (Устный)
    • Авторы: Dibrova D.V., Mulkidjanian A.Y., Galperin M.Y.
    • 10-th International Congress on Extremophiles, St.Petersburg, 7-11 September, 2014 , 2014
  • • 2014 Reconstruction of the primordial "Sodium World" (Стендовый)
    • Авторы: Mulkidjanian A.Y., Dibrova D.V.
    • 18-th European Bioenergetics Conference , Lisbon, Portugal, Португалия, 12-17 июля 2014
  • • 2013 Сomparative analysis of lipid biosynthesis in bacteria and archaea: an update on co-evolution of membranes and membrane bioenergetics (Устный)
    • Авторы: Dibrova D.V., Makarova K.S., Mulkidjanian A.Y., Koonin E.V., Galperin M.Y.
    • Proceedings of the 3rd D/UK Conference on Bioenergetics (DUKBEC), Rauischholzhausen, Germany, Германия, 2013
  • • 2012 Comparative analysis of lipid biosynthesis in archaea, bacteria and eukaryotes: What was the structure of the first membrane lipids? (Устный)
    • Авторы: Dibrova D.V., Makarova K.S., Mulkidjanian A.Y., Koonin E.V., Galperin M.Y.
    • European Bioenergetic Conference (EBEC), Freiburg, Germany, Германия, 2012
  • • 2012 Comparative analysis of lipid biosynthesis in archaea, bacteria and eukaryotes: What was the structure of the first membrane lipids? (Устный)
    • Авторы: Dibrova D.V., Makarova K.S., Mulkidjanian A.Y., Koonin E.V., Galperin M.Y.
    • The 3rd Moscow International Conference "Molecular Phylogenetics"(MolPhy-3), Moscow, Россия, 2012
  • • 2012 The cytochrome bc1 complex and the evolution of membrane bioenergetics (Устный)
    • Авторы: Dibrova D.V., Galperin M.Y., Mulkidjanian A.Y.
    • European Bioenergetic Conference (EBEC), Freiburg, Germany, Германия, 2012

• НИРы

  • • 1 января 2019 - 31 декабря 2025 Изучение внутри- и межклеточных взаимодействий методами молекулярной и клеточной биологии, физиологии, математики и биоинформатики
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Алексеевский А.В. Ответственные исполнители: Дугина В.Б., Плетюшкина О.Ю., Попова Л.Б., Потапова Т.В., Спирин С.А. Участники НИР: Баринова О.А., Бойцова Л.Ю., Вирясова Г.М., Воейкова А.В., Волобуева Т.А., Воронов Д.А., Галкин И.И., Головин А.В., Диброва Д.В., Домнина Л.В., Дугина В.Б., Дунина-Барковская А.Я., Ершова А.С., Занегина О.Н., Зиновкин Р.А., Иванова О.Ю., Игнатова Т.Ю., Карягина-Жулина А.С., Кирпиченко А.О., Кондратенко Н.Д., Леонтович А.М., Макарикова О.Л., Макиевская К.И., Мейзеров Е.С., Мошенский Д.М., Павлова Г.А., Павлюченкова А.Н., Панчин Ю.В., Пирожков Е.В., Пирусская А.М., Плетюшкина О.Ю., Попов Д.А., Попова Е.Н., Попова Л.Б., Потапова Т.В., Приходько А.С., Романов А.В., Русинов И.С., Савченко И.М., Самохина М.Е., Самохина (Волобуева) М.Е., Синещекова Д.А., Смиренина Л.К., Смолина Г.Б., Сорочкина А.И., Спирин С.А., Титова Е.В., Фетисова Е.К., Челомбитько М.А., Черкашина А.А., Чернявский Д.А., Чуркина (Таран) А.С., Шагиева Г.С., Штратникова В.Ю., Яшанова Л.А.
  • • 1 января 2017 - 31 декабря 2021 Новые витальные флуоресцентные зонды для изучения перекисного окисления кардиолипина во внутренней мембране митохондрий: от модельных мембран до живых клеток
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Мулкиджанян А.Я. Ответственные исполнители: Диброва Д.В., Лямзаев К.Г., Сумбатян Н.В. Участники НИР: Пантелеева А.А., Токарчук А.В., Шалаева Д.Н.
  • • 1 января 2015 - 31 декабря 2018 Научные основы создания Национального банка-депозитария живых систем
    • Ректорат
    • Руководитель: Садовничий В.А. Ответственный исполнитель: Каменский П.А. Участники НИР: Cоина В.С., Абрамов С.М., Аверина О.А., Агеева Л.В., Адельянов А.М., Азовский А.И., Акопян Ж.А., Аксенова А.А., Аксенова В.А., Аксянов Е.А., Аласания К.Ю., Александров В.В., Александрова А.В., Александрушкина Н.И., Александрушкина Н.А., Алексеевский А.В., Аляутдинов А.Р., Алёшин В.В., Андреева Т.В., Антал Т.К., Антонова И.И., Антоновская А.А., Антохина О.Г., Арифулин Е.А., Армеев Г.А., Артюшин И.В., Арушанян И.О., Ахметжанова А.А., Ашапкин В.В., Бабенко В.А., Бакеева Л.Е., Балацкий А.В., Банникова А.А., Баринова Н.Н., Баулина О.И., Бацевич В.А., Бедарева И.В., Белевич Т.А., Беме И.Р., Бенедиктов А.А., Березина Н.Я., Биланенко Е.Н., Бисерова Н.М., Благовещенская Е.Ю., Боброва В.К., Бондарева Э.А., Бондаренко Г.Н., Борисанова А.О., Брагина Е.Е., Брызгалина Е.В., Бубнова Е.Н., Бугров Д.И., Бушуев А.В., Бызов Б.А., Бычков А.Ю., Бычкова Е.Ю., Вайпан Д.В., Вайс В.Б., Вальехо-Роман К.М., Вангели И.М., Ванюшин Б.Ф., Варлыгина Т.И., Вархотов Т.А., Васильев А.Н., Васильева Е.Д., Васильева С.Г., Вилкул Е.А., Виноградова Е.Н., Виноградская М.И., Владыченская И.П., Водопьянов С.С., Волкова О.А., Волкова О.С., Волцит О.В., Воробьева Е.А., Воронина Е.Ю., Воронко О.В., Ворцепнева Е.В., Высоких М.Ю., Гавриленко С.М., Галинская Т.В., Галкин И.И., Галоян Э.А., Ганчарова О.С., Гаранина А.С., Георгиев А.А., Герасимов Е.С., Глаголева Е.С., Глушакова А.М., Гмошинский В.И., Гоголева С.С., Година Е.З., Головин А.В., Гололобова М.А., Гомыранов И.А., Горелова О.А., Горшкова Е.А., Горюнов Д.В., Гофман Д.К., Григорьев Ф.В., Григорьева А.А., Григорьева О.А., Грицышин В.А., Груздева М.А., Грум-Гржимайло О.А., Гусев Ф.Е., Данилович И.Л., Дегтярева Г.В., Диброва Д.В., Добров Б.В., Добровольская Т.Г., Дроздова О.Ю., Дуброва М.С., Дудов С.В., Дудова К.В., Дыйканов Д.Т., Дьяков М.Ю., Евтеев А.А., Ежова О.В., Екимова И.А., Еланский С.Н., Елумеева Т.Г., Емельянова Л.Г., Еремичев Р.Ю., Ерохина М.В., Ефименко А.Ю., Ефимов С.В., Жадан А.Э., Жирков И.А., Зайцева А.А., Захаров К.В., Землемерова Е.Д., Зернов А.С., Зубкова Е.Н., Иваненко В.Н., Иваницкая О.Н., Иваницкий В.В., Иванов А.О., Иванова А.Е., Игнатов М.С., Игнатова Е.А., Ильина И.Ю., Ильинская О.П., Калякин М.В., Камалов А.А., Карапетян М.К., Касумян А.О., Каткова Е.В., Качалкин А.В., Квятковский А.Л., Квятковский А.Я., Керимов А.Б., Климович П.С., Климчук О.И., Клёнова А.В., Кнорре Д.А., Князева А.А., Кобельков Г.М., Кобельков С.Г., Кокаева Л.Ю., Колбасов Г.А., Колбасова Г.Д., Колесниченко К.А., Кондакова О.А., Коновалова О.П., Конюхов И.В., Копылов-Гуськов Ю.О., Королев Д.Е., Королева А.Т., Корсуновская О.С., Коршунова Г.А., Коршунова Т.А., Кочкин Д.В., Кошелева Н.В., Крайнов В.Н., Крамина Т.Е., Кремнёв С.В., Криницына А.А., Крупицкий А.В., Крускоп С.В., Кручинин П.А., Кручинина А.П., Кузищин К.В., Кузнецов А.Г., Кулебякин К.Ю., Кулебякина М.А., Куприянова Е.В., Кураков А.В., Кутов Д.К., Кутуева Л.И., Кутузова И.А., Кушунина М.А., Лазарев Е.Н., Лапашина А.С., Лапыгина Е.В., Лебедев В.С., Левик Л.Ю., Лемак С.С., Леонтьева О.А., Лисенкова А.А., Лисовский А.А., Лобакова Е.С., Логачёва М.Д., Лопатина Ю.В., Лубнина Н.В., Лукашевич Н.В., Лукьянов А.А., Лысак Л.В., Лысков Д.Ф., Мазей Ю.А., Макарова Н.Е., Максимова И.А., Малахов В.В., Малютина А.М., Манахов А.Д., Манских В.Н., Манучарова Н.А., Маркина М.М., Маркова О.В., Марова-Кляйнбуб И.М., Мартынов А.В., Марфенина О.Е., Маслакова А.А., Мелихова Е.В., Мельникова М.Н., Милютина И.А., Михайлов К.В., Михайлов К.Г., Морковин А.А., Москаленко В.Н., Мохова Е.Н., Мулкиджанян А.Я., Мунтян М.С., Мурашев В.В., Мурашев И.А., Нагаев Б.Э., Назаров П.А., Назаров Р.А., Нанова О.Г., Недоспасов С.А., Неретин Н.Ю., Неретина Т.В., Нестеренко А.М., Нетрусов А.И., Никитин М.А., Николаева О.В., Нилова М.В., Нимирицкий П.П., Новаковский Г.Э., Новаковский Г.Э., Новоселецкая Е.С., Новоселецкий В.Н., Носов А.М., Оболенская Е.В., Овченков Е.А., Огурцов С.В., Озеров А.Л., Озрина Р.Д., Олейникова О.В., Олейникова О.В., Онипченко В.Г., Онищенко Г.Е., Орлов Д.С., Орловский И.В., Павлинов И.Я., Павлов Д.С., Павлов С.Д., Павлова Н.С., Панина О.Б., Панютина А.А., Парфёнова Е.В., Пенин А.А., Перехватов В.В., Петракова О.С., Петров Н.Б., Петров П.Н., Петушкова Ю.А., Пивоваров Е.А., Плетюшкина О.Ю., Плеханова О.С., Погосян С.И., Поздняков Л.А., Полевова С.В., Полилов А.А., Поляков М.П., Полянская Л.М., Попеленский Ф.Ю., Попкова Е.Г., Попов В.С., Попова Е.Н., Попова С.С., Поярков Н.А., Просвиров А.С., Птушенко В.В., Пугачева Т.Т., Рамонова А.А., Распопова А.А., Ревина Д.Б., Редькин Я.А., Решетников Р.В., Римская-Корсакова Н.Н., Рогаев Е.И., Романов А.А., Романова Е.С., Романова Е.С., Рубина К.А., Румянцев В.Ю., Русин Л.Ю., Русинов И.С., Рыжов А.Л., Рысенкова К.Д., Савилова З.Д., Савицкая М.А., Савицкий В.Ю., Савкин И.А., Савченко А.С., Самигуллин Т.Х., Самойлов К.Ю., Самоходская Л.М., Самсонов Т.Е., Северова Е.Э., Селях И.О., Семенова А.В., Семенова Л.Р., Семенова М.Л., Семин В.Н., Семина Е.В., Сенченков Е.П., Сенчукова А.Л., Серегин А.П., Сидоренко Г.Ю., Симоненко Е.Ю., Симонян Р.А., Синев А.Ю., Скулачев В.П., Скулачев К.В., Слободкина Е.А., Смирнова Е.А., Соловченко А.Е., Соловьева Е.Н., Сорокин М.И., Сото Э., Спасская Н.Н., Сперанская А.С., Спирин С.А., Стамбольский Д.В., Старостина Е.Е., Степанов А.Л., Сулимов А.В., Сулимов В.Б., Сумбатян Н.В., Суханова Е.С., Сухоруков А.П., Сысоева В.Ю., Тарнопольская М.Е., Тащилова А.С., Твердислов В.А., Темерева Е.Н., Терентьева Е.И., Терехова В.А., Тимошенко В.Ю., Титова М.В., Тихонов В.В., Тишечкин Д.Ю., Токарчук А.В., Томкович П.С., Троицкий А.В., Тужилин А.А., Тузов К.А., Федоров А.В., Федоров В.В., Федорова А.В., Федосеева (Бандолина) Е.В., Федосов В.Э., Фенюк Б.А., Фетисова Е.К., Флегонтов П.Н., Фырнин Д.М., Хайлова Л.С., Храмова Ю.В., Цетлин А.Б., Чеканов К.А., Челомбитько М.А., Черепанов Д.А., Чернов И.Ю., Черняк Б.В., Чертополохов В.А., Чертопруд Е.С., Чесунов А.В., Чивкунова О.Б., Чотчаева Ф.Р., Чубатова Н.В., Чудаев Д.А., Чурикова О.А., Шагиева Г.С., Шайтан А.К., Шайтан К.В., Шалаева Д.Н., Шаранова Н.Э., Шаталкин А.И., Шаталова Н.Н., Шафеи Р.А., Шахпаронов В.В., Шведчикова Н.К., Шестаков А.И., Шилов Е.С., Шиловский Г.А., Шнырева А.В., Штратникова В.Ю., Шубина Е.А., Шуленина Н.Э., Щелкунов М.И., Щербаков П.Н., Эльдаров Ч.М., Юрцева О.В., Яворская М.И., Яковенко С.А., Якушев А.В., Якушев А.Г., Яровая Е.Б.
  • • 25 августа 2014 - 31 декабря 2018 Молекулярные механизмы преобразования энергии при бактериальном окислительном фосфорилировании
    • Отдел молекулярной энергетики микроорганизмов
    • Руководитель: Богачев А.В. Участники НИР: Анашкин В.А., Байков А.А., Берцова Ю.В., Диброва Д.В., Кнорре Д.А., Костырко В.А., Лапашина А.С., Мамедов А., Приходько А.С., Романов Р.С., Серебрякова М.В., Фенюк Б.А.
  • • 1 мая 2014 - 1 мая 2017 Реконструкция эволюции биологических мембран методом филогеномного анализа
    • Фонд Дмитрия Зимина «Династия»
    • Руководитель: Диброва Д.В.
  • • 1 января 2013 - 31 декабря 2018 Математика и её применение в биологии и медицине. Биоинформатика
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Алексеевский А.В. Участники НИР: Аксянов Е.А., Андреева Н.В., Баринова О.А., Головин А.В., Диброва Д.В., Ершова А.С., Занегина О.Н., Карягина-Жулина А.С., Королев Д.Е., Леонтович А.М., Мейзеров Е.С., Мошенский Д.М., Попов Д.А., Русинов И.С., Сафонов Н.А., Спирин С.А., Хачатурян М.А., Чернявский Д.А., Штратникова В.Ю.
  • • 23 июня 2010 - 31 декабря 2012 Нано-электростатика границ раздела фаз в биологических объектах
    • Руководитель: Скулачев В.П. Участники НИР: Боздаганян М.Е., Диброва Д.В., Кирилюк И.А., Лохматиков А.В., Федоркин О.Н., Черепанов Д.А.
  • • 1 июня 2010 - 31 декабря 2011 Разработка методов исследования взаимодействия кардиолипина с цитохромным bc1 комплексом митохондрий млекопитающих
    • Руководитель: Мулкиджанян А.Я. Участники НИР: Боздаганян М.Е., Диброва Д.В., Замятнин А.А., Лохматиков А.В., Лямзаев К.Г., Пустовидко А.В., Симонян Р.А., Ташлицкий В.Н., Терещенков А.Г., Федоркин О.Н., Черепанов Д.А., Шайтан А.К.

• Членство в научных обществах

  • • с 2014 Межрегиональная общественная организация "Микробиологическое общество"
    • Россия

• Диссертация

  • • 2013 Phylogenomic analysis of energy converting enzymes (Филогеномный анализ энергопреобразующих ферментов)
    • Кандидатская диссертация по специальности 03.01.09 - Математическая биология, биоинформатика (биол. науки)
    • Автор: Диброва Д.В., к.б.н., МГУ имени М.В. Ломоносова
    • Научный руководитель: Мулкиджанян А.Я., д.б.н., доц., МГУ имени М.В. Ломоносова
    • Защищена в совете при Университет г. Оснабрюка (Osnabrück University)
    • Организация, в которой выполнялась работа: Университет г. Оснабрюка (Osnabrück University)

• Руководство дипломными работами

  • • 2019 Биоинформатический анализ прокариотических АТФаз F- и N-типа
    • Научные руководители: Фенюк Б.А., Диброва Д.В.
    • Автор: Холина Татьяна Дмитриевна (Специалист)
  • • 2018 Применение полуавтоматической классификации способов связывания наиболее распространенных белковых кофакторов для характеристики универсальных и вариабельных паттернов связывания
    • Научный руководитель: Диброва Дарья Владимировна
    • Автор: Козлова Мария Ильинична (Специалист)
  • • 2017 Улучшение алгоритма построения множественного выравнивания для мембранных белков с использование вероятностного подхода
    • Научные руководители: Дарья Владимировна Диброва, Армен Яковлевич Мулкиджанян
    • Автор: Герман Эдуардович Новаковский (Специалист)
  • • 2017 Разработка программы для сравнительного анализа геномного контекста прокариотических генов и ее использование для предсказания новых белковых комплексов
    • Научные руководители: Дарья Владимировна Диброва, Армен Яковлевич Мулкиджанян
    • Автор: Олеся Игоревна Климчук (Специалист)

• Руководство курсовыми работами

  • • 2023 Филогеномный и сравнительно-структурный анализ мембранной субъединицы натриевой декарбоксилазы
    • Научные руководители: Мулкиджанян А.Я., Диброва Д.В.
    • Автор: Агеева Виктория Сергеевна (Специалист)
  • • 2023 Филогеномный анализ эукариотических обонятельных рецепторов, сопряженных с G-белком
    • Научные руководители: Диброва Дарья Владимировна, Мулкиджанян А.Я.
    • Автор: Рохин Илья Андреевич (Специалист)
  • • 2023 Филогеномный анализ переносящих ионы мембранных субъединиц НАДН:хинон оксидоредуктазы 1 типа
    • Научные руководители: Диброва Д.В., Мулкиджанян А.Я.
    • Автор: Михайлова Екатерина Сергеевна (Специалист)
  • • 2023 Филогеномный анализ коротких мембранных субъединиц НАДН:хинон оксидоредуктазы 1 типа
    • Научные руководители: Диброва Д.В., Мулкиджанян А.Я.
    • Автор: Ерина Алина Вячеславовна (Специалист)
  • • 2023 Филогеномный анализ каталитической α1-субъединицы натрий-транслоцирующей декарбоксилазы
    • Научные руководители: Диброва Д.В., Мулкиджанян А.Я.
    • Автор: Ахтямова Карина Тимуровна (Специалист)
  • • 2023 Филогеномный анализ каталитической α1-субъединицы натрий-транслоцирующей декарбоксилазы
    • Научные руководители: Диброва Д.В., Мулкиджанян А.Я.
    • Автор: Ахтямова Карина Тимуровна (Специалист)
  • • 2023 Филогеномное исследование мембранных а/I-субъединиц роторной АТФазы
    • Научные руководители: Диброва Д.В., Мулкиджанян А.Я.
    • Автор: Сафонова Варвара Павловна (Специалист)
  • • 2021 Филогеномный анализ переносчиков натрия у прокариот
    • Научные руководители: Диброва Д.В., Мулкиджанян А.Я.
    • Автор: Бушмакин Илья Михайлович (Специалист)
  • • 2020 Сравнительный структурный анализ катион-переносящих мембранных субъединиц роторных АТФаз бактерий и эукариот
    • Научные руководители: Диброва Д.В., Мулкиджанян А.Я.
    • Автор: Антоненкова Юлия Станиславовна (Специалист)
  • • 2019 Филогеномный анализ ферментов биосинтеза мембранных липидов у суперфилума Асгард
    • Научные руководители: Диброва Д.В., Мулкиджанян А.Я.
    • Автор: Потапенко Елена Юрьевна (Специалист)
  • • 2019 Поиск корреляций между кластерами ортологичных групп и типом биоэнергетики организма
    • Научные руководители: Диброва Д.В., Мулкиджанян А.Я.
    • Автор: Бушмакин Илья Михайлович (Специалист)
  • • 2019 Анализ эволюционных взаимоотношений Melainabacteria, Cyanobacteria, Margulisbacteria и Sericytochromatia на основании анализа сайта связывания катиона в с-субъединице роторных мембранных АТФаз
    • Научные руководители: Диброва Д.В., Мулкиджанян А.Я.
    • Автор: Беляева Юлия Дмитриевна (Специалист)
  • • 2019 Анализ сайта связывания катиона в I-субъединице роторных мембранных V-АТФаз
    • Научные руководители: Диброва Д.В., Мулкиджанян А.Я.
    • Автор: Антоненкова Юлия Станиславовна (Специалист)
  • • 2017 Описание, классификация и эволюция способов связывания основных белковых кофакторов
    • Научный руководитель: Дарья Владимировна Диброва
    • Автор: Мария Ильинична Козлова (Специалист)
  • • 2016 Филогеномный анализ симпортеров сахаров и моновалентных катионов (ионов Na+ или протонов)
    • Научные руководители: Дарья Владимировна Диброва, Армен Яковлевич Мулкиджанян
    • Автор: Анастасия Александровна Князева (Специалист)
  • • 2016 Филогеномный анализ симпортеров желчных кислот и моновалентных катионов (ионов Na+ или протонов)
    • Научный руководитель: Дарья Владимировна Диброва
    • Автор: Дарья Викторовна Горбачева (Специалист)
  • • 2016 Филогеномный анализ симпортеров дикарбоновых кислот и моновалентных катионов (ионов Na+ или протонов)
    • Научные руководители: Дарья Владимировна Диброва, Армен Яковлевич Мулкиджанян
    • Автор: Надежда Евгеньевна Макарова (Специалист)
  • • 2016 Полуавтоматический анализ конформаций редокс-кофакторов и их окружения в трехмерных структурах белков
    • Научный руководитель: Дарья Владимировна Диброва
    • Автор: Мария Ильинична Козлова (Специалист)
  • • 2016 Отработка алгоритма построения множественного выравнивания для мембранных белков
    • Научные руководители: Дарья Владимировна Диброва, Армен Яковлевич Мулкиджанян
    • Автор: Герман Эдуардович Новаковский (Специалист)
  • • 2016 Исследование возможности повышения качества множественного выравнивания в локальных участках за счет алгоритма последовательного добавления новых последовательностей к выравниванию меньшего объема
    • Научный руководитель: Дарья Владимировна Диброва
    • Автор: Алексей Владимирович Елисеев (Специалист)
  • • 2016 Анализ и сравнение работы программ, предсказывающих границы генов
    • Научный руководитель: Дарья Владимировна Диброва
    • Автор: Анна Алексеевна Желудкевич (Специалист)
  • • 2016 Анализ геномного контекста ферментов дыхательных цепей прокариот
    • Научные руководители: Дарья Владимировна Диброва, Армен Яковлевич Мулкиджанян
    • Автор: Олеся Игоревна Климчук (Специалист)
  • • 2015 Филогеномный анализ домена NB-ARC из белка Apaf-1
    • Научный руководитель: Дарья Владимировна Диброва
    • Автор: Мария Ильинична Козлова (Специалист)
  • • 2015 Филогеномный анализ НАДН:хинон оксидоредуктазы I типа
    • Научные руководители: Дарья Владимировна Диброва, Армен Яковлевич Мулкиджанян
    • Автор: Герман Эдуардович Новаковский (Специалист)
  • • 2015 Филогеномный анализ FpoF субъединицы F420 дегидрогеназы
    • Научный руководитель: Дарья Владимировна Диброва
    • Автор: Анна Алексеевна Желудкевич (Специалист)
  • • 2015 Разработка программы OLESA (Operon Loci Examination and Sorting Application) для анализа расположения генов в прокариотических геномах
    • Научные руководители: Дарья Владимировна Диброва, Армен Яковлевич Мулкиджанян
    • Автор: Олеся Игоревна Климчук (Специалист)
  • • 2015 Анализ коррелирующих мутаций в каталитических субъединицах роторной мембранной АТФ-синтазы
    • Научные руководители: Дарья Владимировна Диброва, Армен Яковлевич Мулкиджанян
    • Автор: Филипп Олегович Гусев (Специалист)
  • • 2014 Филогеномный анализ мембранных Na+-транслоцирующих декарбоксилаз
    • Научные руководители: Дарья Владимировна Диброва, Армен Яковлевич Мулкиджанян
    • Автор: Олеся Игоревна Климчук (Специалист)

• Авторство учебных курсов

  • • 2014 МФК Биоинформатика
    • Авторы: Алексеевский А.В., Спирин С.А., Карягина-Жулина А.С., Гельфанд М.С., Потапова Н.А., Жарикова А.А., Диброва Д.В., Злобин А.С.
  • • 2012 Практическая информатика
    • Авторы: Алексеевский А.В., Спирин С.А., Диброва Д.В., Митрофанов С.И.
  • • 2003 Биоинформатика 1 курс
    • Авторы: Алексеевский А.В., Спирин С.А., Аксянов Е.А., Диброва Д.В., Нагаев Б.Э., Русинов И.С.

• Преподавание учебных курсов

  • • 1 сентября 2022 - 31 декабря 2022 Практическая биоинформатика
    • МГУ имени М.В. Ломоносова, Факультет биоинженерии и биоинформатики
    • обязательная, базовой части, лекции, 16 часов

---