Разработка системы молекулярного узнавания комплекса интегразы ВИЧ-1 и клеточного белка Ku70 как новой мишени для создания анти-ВИЧ препаратов на основе биоподобных структурНИР

The investigation of molecular recognition in the complex between HIV-1 integrase and the cellular Ku70 protein that is a new target for the development of bio-similar anti-HIV drugs

Источник финансирования НИР

грант РФФИ

Этапы НИР

# Сроки Название
1 17 июля 2018 г.-31 декабря 2018 г. Разработка системы молекулярного узнавания комплекса интегразы ВИЧ-1 и клеточного белка Ku70 как новой мишени для создания анти-ВИЧ препаратов на основе биоподобных структур
Результаты этапа: 1. Методом молекулярного моделирования выявлены участки N-концевого домена Ku70, потенциально способные взаимодействовать с участком интегразы 200-220; 2. получены препараты рекомбинантных белков и разработан скрининговый протокол определения активности ингибиторов связывания интегразы и Ku70; 3. синтезирован набор конъюгатов 11-звенного олигонуклеотида с разными красителями, которые были введены в процессе олигонуклеотидного синтеза.
2 1 января 2019 г.-31 декабря 2019 г. Разработка системы молекулярного узнавания комплекса интегразы ВИЧ-1 и клеточного белка Ku70 как новой мишени для создания анти-ВИЧ препаратов на основе биоподобных структур
Результаты этапа: 1. Проведен поиск пептидов, способных связываться с интегразой, после расщепления Ku70 трипсином. Получены мутантные варианты Ku70 на основе полученных данных. 2. Проверена способность мутантных вариантов N-концевого домена Ku70 связываться с интегразой с целью валидации сайта в составе Ku70, взаимодействующего с интегразой. Установлены замены в составе N-концевого домена Ku70, ухудшающие его связвание интегразой. Получена конструкция для синтеза соответствующего мутантного варианта полноразмерного белка Ku70. 3. Построена модель комплекса интегразы и Ku70 методами компьютерного моделирования. 4. Ведется поиск in silico низкомолекулярных веществ и олигомерных конструкций, способных связываться с комплексом интегразы и Ku70 и препятствовать его образованию. 5. Синтезировано 6 конъюгатов красителя НЕХ, в олигонуклеотидной части которых модифицированы или удалены гетероциклические основания и фосфатные остатки. 6. Проверена способность синтезированных соединений ингибировать взаимодействие интегразы и Ku70.
3 1 января 2020 г.-31 декабря 2020 г. Разработка системы молекулярного узнавания комплекса интегразы ВИЧ-1 и клеточного белка Ku70 как новой мишени для создания анти-ВИЧ препаратов на основе биоподобных структур
Результаты этапа: Исследована структура комплекса ИН и Ku70 методами молекулярного моделирования и сайт-направленного мутагенеза. Предложена модель этого комплекса. Получены олигонуклеотидные ингибиторы взаимодействия интегразы ВИЧ-1 и клеточного белка Ku70
4 1 января 2021 г.-31 декабря 2021 г. Разработка системы молекулярного узнавания комплекса интегразы ВИЧ-1 и клеточного белка Ku70 как новой мишени для создания анти-ВИЧ препаратов на основе биоподобных структур
Результаты этапа:

Прикрепленные к НИР результаты

Для прикрепления результата сначала выберете тип результата (статьи, книги, ...). После чего введите несколько символов в поле поиска прикрепляемого результата, затем выберете один из предложенных и нажмите кнопку "Добавить".