ИСТИНА

Вишня обыкновенная (Prunus cerasus) - самая распространенная в России косточковая культура. За исключением вируса оспы сливы (Plum pox virus, PPV), вирусные заболевания вишни в России не изучены и могут представлять потенциальную угрозу для перспективного сортимента и дальнейшей селекционной и биотехнологической работы. Проект имеет целью изучение видового состава и молекулярно-биологический анализ вирусов вишни на территории Европейской России, а также их возможного влияния на плодоношение зараженных растений. Объектами анализа будут являться PPV, считающийся самым вредоносным вирусом косточковых культур, а также иларвирусы Prunus necrotic ringspot virus (PNRSV), Prune dwarf virus (PDV), American plum line pattern virus (APLPV), Apple mosaic virus (ApMV) и неповирус Cherry leaf roll virus (CLRV) как наиболее распространенные в насаждениях вишни за рубежом в силу их способности передаваться пыльцой и семенами. Посредством секвенирования нового поколения будут определены и охарактеризованы геномы необычных изолятов PPV, которые, согласно результатам иммунохимических и молекулярных тестов, не могут быть отнесены ни к одному из известных штаммов вируса, и, видимо, представляют собой новые формы PPV. Анализ полных геномов позволит определить таксономический статус необычных изолятов и изучить их родственные связи с другими штаммами PPV, адаптированными к вишне. Детальный анализ новых последовательностей, их сопоставление с последовательностями, доступными в международных базах данных, позволит полнее охарактеризовать молекулярно-биологические свойства вишневых штаммов PPV, сформулировать обоснованные предположения об их происхождении и эволюции. Cопоставление аминокислотных последовательностей необычных изолятов и изолятов других вишневых штаммов (С, CR, CV) будут способствовать изучению генетических факторов, определяющих способность PPV системно заражать вишню и, возможно, позволит выявить вирусспецифические детерминанты, определяющие круг хозяев. Впервые будет изучена распространенность и генетическое разнообразие PPV на Среднем и Южном Урале. Будет проведено метагеномное секвенирование библиотек кДНК, полученных на матрице двунитевой РНК (dsRNA) из зараженных растений вишни, что, возможно, приведет к открытию новых вирусов этой культуры. Впервые будет проведена диагностика PNRSV, PDV, APLPV, ApMV и CLRV с помощью иммуноферментного анализа и полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией в насаждениях вишни на территории Европейской России, изучено их генетическое разнообразие путем анализа геномов выявленных изолятов. Будет изучено влияние PPV и других вирусных инфекций на плодоношение ряда сортов вишни, находящихся в хозяйственном обороте. В силу экономической значимости этой культуры, полученные результаты могут иметь важное значение для изучения вирусных заболеваний вишни и других косточковых культур в России и иных регионах мира.

Sour cherry (Prunus cerasus) is the most common stone fruit crop in Russia. With the exception of plum pox virus (PPV), viruses infecting cherries in Russia have not been studied and may pose a potential threat for the prospective assortment and further breeding and biotechnological activities. The project aims to study the prevalence of cherry viruses in European Russia, as well as their molecular analysis and possible impact on the fruiting of infected plants. PPV, which is considered the most harmful virus of stone fruits, as well as ilarviruses prunus necrotic ringspot virus (PNRSV), prune dwarf virus (PDV), american plum line pattern virus (APLPV), apple mosaic virus (ApMV) and nepovirus cherry leafroll virus (CLRV) will be studied as the most common in cherry plantings worldwide due to their ability to be transmitted by pollen and seeds. Genomes of unusual PPV isolates, which may represent new forms of PPV, will be determined using the high-throughput sequencing. The analysis of complete genomes will allow to determine the taxonomic status of unusual isolates and to study their relationships with other cherry-adapted strains of PPV (C, CR, CV). Comparison of amino acid sequences of unusual isolates and isolates of other cherry-adapted strains may contribute to the identification of genetic factors that determine the ability of PPV to infect cherries and may reveal virus-specific host range determinants. The prevalence and genetic diversity of PPV in the Middle and Southern Urals will be studied for the first time. Metagenomic sequencing of double-stranded RNA (dsRNA) samples obtained from infected cherries may resulted in the discovery of new viruses of this crop. Diagnostics of PNRSV, PDV, APLPV, ApMV and CLRV in the cherry plantings on the territory of European Russia will be carried out for the first time using ELISA and RT-PCR followed by analysis of their genomes. The effect of PPV and other viral infections on the fruiting of a number of cherry cultivars will be studied. Due to the economic importance of this culture, the results of the project may be important for the study of the viruses of cherries and other stone fruit crops in Russia and worldwide.