Неэмпирическое описание процессов переноса энергии и релаксации в фотосинтетических системах пурпурных бактерийНИР

Ab initio description of relaxation and energy transfer dynamics in photosynthetic systems of purple bacteria

Источник финансирования НИР

грант РФФИ

Этапы НИР

# Сроки Название
1 3 февраля 2016 г.-31 декабря 2016 г. Неэмпирическое описание процессов переноса энергии и релаксации в фотосинтетических системах пурпурных бактерий 1
Результаты этапа: Мы показали, что для проведения корректного расчета экситонных состояний в базис экситонного гамильтониана необходимо вносить функции, которые согласованно описывают основное и низшие возбужденные состояния. Для этого мы провели ряд расчетов экситонных гамильтонианов, базис которых включал: 1) функции, в которых только один бактериохлорофилл находится в первом возбужденном состоянии; 2) функции, в которых один или два бактериохлорофилла находятся в первом возбужденном состоянии; 3) функции, в которых один, два или три бактериохлорофилла находятся в первом возбужденном состоянии; 4) функции, в которых только один бактериохлорофилл находится либо в первом либо во втором возбужденном состоянии; 5) функции 4) и функции, в которых два бактериохлорофилла находятся в возбужденных состояниях, но эти состояния отличаются. Расчет указанных экситонных гамильтонианов был проведен на основе расчетов энергий возбуждения отдельных молекул бактериохлорофиллов, полученных с помощью метода XMCQDPT с использованием атомного базиса 6-31G*(d), и на основе TrCAMM разложений, рассчитанных на основе волновых функций метода МКССП в полном активном пространстве. Расчет спектральных свойств был проведен в рамках координатного и импульсного представлений. Проведя расчет в рамках метода Poisson-TrESP, мы показали, что влияние поляризации белка невелико. Варьируя атомный базис и активное пространство в методе МКССП, мы показали, что для корректного описания свойств отдельных молекул необходимо использовать достаточно крупные атомные базисы и достаточно большие активные пространства. Помимо этого мы показали, что эти свойства (TrCAMM) необходимо рассчитывать на основе волновых функций метода XMCQDPT. Мы провели расчет экситонных состояний комплекса LH1 и рассчитали линейчатые спектры поглощения, кругового и магнитного кругового дихроизма с учетом неэквивалентности молекл бактериохлорофиллов. Для этого был построен экситонный гамильтониан в базисе 5). Энергии и TrCAMM разложения были определены с помощью метода XMCQDPT, основанном на расчете методом CASSCF с активным пространством, включавшем 6 электронов и 6 орбиталей, и с использованием атомного базиса Def2-SVP. Используя предложенный нами метод описания колебательных состояний, соответствующих различным экситонным состояниям, мы рассчитали уширения и сдвиги спектральных линий.
2 1 января 2017 г.-31 декабря 2017 г. Неэмпирическое описание процессов переноса энергии и релаксации в фотосинтетических системах пурпурных бактерий 2
Результаты этапа: В результате выполнения второго этапа: - был проведен неэмпирический расчет параметров, необходимых для моделирования диссипативной динамики и для описания форм спектральных линий; - был проведен расчет форм линий спектров поглощения и флуоресценции комплекса LH1. Результаты расчетов согласуются с экспериментальными данными; - на основе рассчитанных параметров было проведено моделирование динамики заселенностей возбужденных состояний комплекса LH1, следующей за его фотовозбуждением. Результаты моделирования согласуются с экспериментальными данными; - был проведен расчет времен переноса энергии возбуждения с комплекса LH1 на реакционный центр и объяснена температурная зависимость этого процесса. Результаты моделирования согласуются с экспериментальными данными;

Прикрепленные к НИР результаты

Для прикрепления результата сначала выберете тип результата (статьи, книги, ...). После чего введите несколько символов в поле поиска прикрепляемого результата, затем выберете один из предложенных и нажмите кнопку "Добавить".