Изучение морфологических и генетических основ реверсий у цветковых растений на примере изменения типа листа в роде CurioНИР

Study of the morphological and genetic grounds of evolutionary revercies in angiosperms on the example of leaf transformations in the genus Curio

Источник финансирования НИР

грант РФФИ

Этапы НИР

# Сроки Название
1 1 января 2019 г.-31 декабря 2019 г. Изучение морфологических и генетических основ реверсий у цветковых растений на примере изменения типа листа в роде Curio
Результаты этапа: Разработаны протоколы эффективного масс-клонального размножения in vitro 3 исследуемых видов Curio и 1 вида Baculellum (базальная группа родства Curio). Морфолого-анатомическими методами изучено развитие субунифациальных листьев 3 видов Curio и листьев с унифациальным черешком и бифациальной листовой пластинкой у 1 вида Curio. Модифицирована методика выделения РНК, позволяющая получать РНК c показателем качества RIN > 8,5. Приготовлены библиотеки для секвенирования РНК и ДНК на платформах Illumina и Oxford Nanopore Technologies. Собраны риды с использованием платформ Illumina и Oxford Nanopore Technologies. Собран материал для последующего анализа дифференциальной экспрессии генов дорсовентральной поляризации листа в абаксиальной и адаксиальной частях листовых примордиев у 4 видов Curio.
2 1 января 2020 г.-26 декабря 2020 г. Изучение морфологических и генетических основ реверсий у цветковых растений на примере изменения типа листа в роде Curio
Результаты этапа: На основании определения средней частоты аллельных вариантов сделано заключение, что в исследованной выборке присутствуют ди-, тетра- и октоплоидные виды. Построенное филогенетическое дерево диплоидных видов показывает, что первым этапом эволюционного преобразования фациальной структуры листа у них скорее всего была глубокая редукция адаксиальной стороны с образованием субунифациальных листьев на базе которых возникали пельтатные и унифациальные листья. Эволюционные преобразования фациальности листа включали реверсии и гомоплазии. Вторично бифациальные листья вероятнее всего возникли из унифациальных, хотя не исключено их возникновение и из субунифациальных листьев. Показано, что полностью бифациальный лист Curio muirii и унифациальные листья C. citirformis и C. talinoides закладываются как доросвентально поляризованные примордии и до стадии дифференциации двух доменов развиваются типичным для бифациальных листьев образом. Проксимальный домен (Unterblatt) растет преимущественно латерально и имеет типичную бифациальную структуру. Латеральный рост дистального домена (Oberblatt) не выражен, он растет интеркалярно в своем основании и становится игловидным. В дистальном домене листового примордия C. citirformis закладывается адаксиальная меристема, которая функционирует как меристема округления, обусловливающая преобразование этого домена в унифациальный зачаток листовой пластинки. В листовом примордии C. talinoides адаксиальная меристема закладывается по всей длине, но только в дистальном домене становится меристемой округления, преобразующей этот домен в унифациальный зачаток листовой пластинки, а в проксимальном домене она обусловливает утолщение основания листа, остающегося бифациальным. Формирование унифациальной пластинки вследствие деятельности меристемы округления типично для унифациальных листьев однодольных и кардинально отличается от развития унифациальных листьев у модельных объектов мутантов Arabidopsis thaliana и Antirrhinum majus. У C. muirii в дистальном домене дифференцируются адаксиальная и абаксиальная меристемы, но ни одна из них не функционирует как меристема округления, и дистальный домен остается бифациальным. На нем латерально закладываются зачатки листовой пластинки, почти сразу же переходящей от маргинального роста к плоскостному. Формирование унифациальной структуры листьев исследованных видов обусловлено функционированием меристемы округления. Различия в фациальной структуре исследованных листьев обусловлены разным функционированием адаксиальной меристемы у разных видов и в разных доменах листового зачатка.
3 1 января 2021 г.-30 декабря 2021 г. Изучение морфологических и генетических основ реверсий у цветковых растений на примере изменения типа листа в роде Curio
Результаты этапа: Было проведено фазирование полученных транскриптомных данных. На основе генов BUSCO было построено финальное филогенетическое дерево для диплоидов, после чего в дерево были добавлены полиплоиды на основе кластеризации их генов с генами диплоидов. Были выделены дифференциально экспрессирующиеся гены на основе транскриптомов апексов побегов. Построенное филогенетическое дерево диплоидных видов показывает, что первым этапом эволюционного преобразования фациальной структуры листа скорее всего была глубокая редукция адаксиальной стороны с образованием субунифациальных листьев, на базе которых возникали пельтатные и унифациальные листья. Эволюционные преобразования фациальности листа включали реверсии и гомоплазии. Вторично бифациальные листья, вероятнее всего, возникли из унифациальных, хотя не исключено их возникновение и из субунифациальных листьев. Сопоставление данных о локализации и деятельности меристем и данных о морфологии листовых примордиев унифациальных листьев позволило сделать вывод о том, что у изученных представителей рода Curio развитие таких листьев происходит по типу, характерному для однодольных растений.

Прикрепленные к НИР результаты

Для прикрепления результата сначала выберете тип результата (статьи, книги, ...). После чего введите несколько символов в поле поиска прикрепляемого результата, затем выберете один из предложенных и нажмите кнопку "Добавить".