ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
|
ИПМех РАН |
||
Основной целью проекта является реконструкция истории формирования современного разнообразия фауны брюхоногих моллюсков Арктики на примере двух крупных филогенетически близких групп – Nudibranchia и Cephalaspidea.
During the implementation of the previous RSF grant, we obtained fundamentally new, priority results that reveal the evolutionary history of individual groups of nudibranch molluscs and cephalaspids and the ways and mechanisms of their distribution and speciation in boreal and Arctic regions. In Project 2023, we plan to deepen our understanding of the processes under study, test the proposed hypotheses using new methods and an expanded sample of taxa, and also create a fundamental reserve for taking our research to a qualitatively new level: from studying the evolutionary paths of separately selected groups of gastropods to identifying patterns of formation Arctic communities of marine invertebrates. Work on this project will be carried out in several directions. Firstly, it is the updating of data on the biodiversity and distribution of nudibranch mollusks and cephalaspids, with a focus on poorly studied regions (Kuril Islands, the Sea of Okhotsk, the Bering Sea, the high Arctic) and poorly studied taxa, including groups with an uncertain taxonomic position or in need of clarification of the species composition. Secondly, this is the study of the convergent evolution of various phylogenetic lineages of Cylichnidae s.l. A detailed study of this group is a key aspect for identifying the reasons for the formation of local species complexes of cephalaspids in the Arctic seas. For this, the morphological diversity of various phylogenetic lineages (individual families) of Cylichnidae s.l. will be studied on a large sample using the latest methods of morphological analysis, which allow obtaining high-resolution data on the morphology of the shell, gizzard plates and identifying the characteristic features of the structure of the head copulatory apparatus: computed microtomography and confocal laser scanning microscopy. Thirdly, this is the study of the phylogeography of representatives of Polyceridae, Goniodorididae, Eubranchidae, Paracoryphellidae - taxa that were not included in the sample of the previous project. The study of these groups will make it possible to practically fully cover the biodiversity of nudibranch mollusks in the region under study. The fourth direction is related to the study of the connectivity of geographically distant populations of trans-Arctic species based on genomic data. The results of the previous project indicated that the divergence of all widespread trans-Arctic nudibranch species corresponds to the paleoclimatological dynamics of the Arctic region in the Pleistocene, while during the glaciations, the Arctic-Atlantic populations were preserved in multiple refugia and were not associated with the Pacific populations. The next stage in the development of this direction should be associated with a comparative analysis of genomic data for individual populations of trans-Arctic species. Thus, for populations of species with different time of introduction into the Arctic, sequencing of sequences adjacent to restriction sites by the double restriction method (ddRADseq) will be performed. Finally, the fifth direction will be related to the study of the biology of trans-Arctic groups of nudibranchs to test the hypothesis of the ecological advantage of Pacific invaders to the Arctic and Atlantic, which is partially confirmed by preliminary data obtained during the implementation of the previous project. The scientific novelty of the proposed study lies in the fact that in terms of its complexity and coverage of the studied taxa, as well as the set of methods used, this Project has no analogues in modern studies of marine invertebrates. Successful implementation of this project will create a fundamental groundwork for transferring our research to a qualitatively new level: from studying the evolutionary paths of separately selected groups of gastropods to identifying patterns in the formation of Arctic communities of marine invertebrates.
1. Будет проведена ревизия, филогенетический и филогеографический анализ голожаберных моллюсков семейства Goniodorididae. Будет изучена внешняя и внутренняя морфология и получены генетические последовательности по пяти маркерам. На основании этих данных будут описаны новые для науки виды, получена молекулярно-филогенетическая реконструкция, реконструированы предковые ареалы, по результатам калибровки молекулярных часов будет предложена модель заселения арктического региона различными филогенетическими линиями рода. Для вида Ancula gibbosa (транс-Арктический вид) будет изучена популяционная структура по гену COI, изучена морфологическая изменчивость по всему ареалу. 2. Будет изучена морфология, систематика и филогения представителей семейства Facelinidae морей России (род Hermissenda), изучена морфологическая изменчивость, уточнено распространение видов, получена обновленная молекулярно-филогенетическая гипотеза рода Hermissenda по 5 маркерам, оценены времена дивергенции и реконструированы предковые ареалы. 3. Будет изучена видовая идентичность представителей родов Acteocina, Philinopsis фауны морей России, уточнены ареалы видов, изучена морфологическая изменчивость, изучены филогенетические отношения представителей этих родов фауны морей России. 4. Будет проведена ревизия тихоокеанских представителей Cylichnidae s.l., получена обновленная молекулярно-филогенетическая реконструкция этой группы (различных филогенетических линий), на основании новых морфологических анализов и исследований на большой выборке, будут критически переоценены используемые таксономические признаки, описано криптическое разнообразие. 5. Будет отработана методика генотипирования представителей транс-Арктических видов, проведено секвенирование последовательностей прилегающей к сайтам рестрикции методом двойной рестрикции (ddRADseq) для представителей различных популяций Eubranchus rupium, получены обновленные сети гаплотипов, составлена репрезентативная выборка образцов для ddRADseq второго года проекта. 6. Проведены исследования экологии арктических представителей семейств Dendronotidae, Cadlinidae, содержимого состава желудков морфологическими и молекулярными методами. Будут получены данные по составу жирных кислот вида Cadlina laevis.
грант РНФ |
# | Сроки | Название |
1 | 15 августа 2023 г.-30 июня 2024 г. | Сравнительная филогеография брюхоногих моллюсков Арктических морей: состав фауны, пути заселения и время формирования современных видов |
Результаты этапа: За отчетный период было выполнено 3 полевых выезда для сбора дополнительного материала по проекту, а также 1 командировка для изучения музейного материала. Проведена интегративная ревизия семейство Goniodorididae фауны морей России. Всего было изучено 48 экземпляров. Род Goniodoris имеет атлантическое происхождение, и единственный известный вид в фауне морей России – G. nodosa – не заходит дальше побережья Мурмана (Баренцево море). Род Goniodoridella представлен в фауне морей России одним видом – Goniodoridella borealis, который распространен в Японском море. Данный род имеет тропическое тихоокеанское происхождение. Род Ancula, по-видимому, имеет тихоокеанское происхождение, и демонстрирует независимое вселение в Атлантику – через Берингов пролив (группа видов Ancula gibbosa) и через Панамский перешеек (группа видов A. espinosai-A. evelinae). В составе рода Ancula было обнаружено криптическое разнообразие. Показано, что тихоокеанские формы с желтыми полосами относятся к новому для науки виду, близкому к A. pacifica, в то время как атланто-арктические морфотипы и западно-тихоокеанский морфолотип с белыми пятнами на нотуме относятся к единому амфибореальному виду Ancula gibbosa. Для этого вида была показана высокая внутривидовая изменчивость по гену COI и уникальная для голожаберных моллюсков структура гаплосети, которая может свидетельствовать о недавней митохондриальной интрогрессии тихоокеанских гаплотипов в арктический регион. Проведена ревизия, филогеографические и экологический анализ представителей рода Hermissenda. Нами было показано, что представители рода Hermissenda из Приморского края близки к представителям вида H. emurai, и характеризуются значительной вариативностью признаков внешней и внутренней морфологии, а также широким спектром питания, включающим атекатные и текатные гидроиды. Тем не менее, по данным ядерной ДНК этот вид не демонстрирует филогенетически значимых отличий с H. crassicornis, что может свидетельствовать о существующем потоке геном между этими видами и таким образом H. emurai следует считать младшим синонимом H. crassicornis. Разделение гаплотипов H. crassicornis и H. emurai произошло менее 800 тыс.л.н., кроме того, для H. crassicornis характерно очень низкое нуклеотидное разнообразие, в то время как для H. emurai и нуклеотидное и гаплотипическое разнообразие характеризуется крайне высокими значениями. Была проведена интегративная ревизия и изучена филогеография семейства Eubranchidae. Анализ проводился для 403 особей этого семейства, собранных разных регионах Мирового океана. Полученные данные позволили предложить новую систему семейства Eubranchidae. Выявлено два новых вида рода Eubranchus в Дальневосточных морях России, оба входят в состав комплекса видов Eubranchus rupium. Для семейства Eubranchidae были выявлены четкие биогеографические паттерны. Дивергенция семейства на отдельные рода приходится на средний миоцен и вероятно связана с закрытием моря Тетис. Род Eubranchus s.str. представлен двумя крупными кладами, одна из них включает комплекс видов E. rupium, распространенный в северной Пацифике, а другая – в северной Атлантике. Показано, что разделение на тихоокеанскую и атлантическую клады произошло в среднем миоцене и может быть связано с закрытием моря Тетис или миграцией предковых форм через Панамский регион до установления Панамского перешейка. Представители группы Eubranchus rupium колонизировали Арктический и Атлантический регионы в среднем плейстоцене, в то время как группа видов с атлантическим происхождением (клада Eubranchus tricolor) в Арктику не проникают и в морях России обитают исключительно в Баренцевом море на побережье Мурмана (бореальная зона). Была проведена таксономическая ревизия российских представителей родов Acteocina и Philinopsis. Установлено филогенетическое положение представителей этих родов. Показана самостоятельность вида Philinopsis gigliolii и его конспецифичность австралийскому P. taronga. Таким образом, Philinopsis gigliolii имеет антитропическое распространение, предложены гипотезы, объясняющие данный паттерн. Анализ показал значительную филогенетическую удаленность Acteocina matusimana от других представителей рода Acteocina и необходимость выделения для этого вида отдельного рода Decorifer. Для семейства Cylichnidae (представители группы Cylichna alba) получена обновленная молекулярно-филогенетическая реконструкция, которая продемонстрировала большое криптическое разнообразие этой группы в бореальных и арктических морях. Было выявлено 22 вида, значительно отличающихся по митохондриальным и ядерным маркерам. Среди них можно выявить как широко распространенные виды – амфибореальные или аркто-бореальные, так и локальные. Изучение морфологии раковин секвенированных экземпляров Cylichna alba sp. group, показывает их значительное разнообразие по цвету периостракума, характеру спиральной скульптуры, форме апекса и другим признакам. Морфологические отличия выявлены нами и во внутренней морфологии пищеварительной и половой систем (количество маргинальных зубов, форма пластинок гиззарда, форма копулятивного аппарата). На данный момент преждевременно судить о филогенетической значимости отдельных признаков, поскольку как правило отличия между видами мозаичны, и зачастую отдельные признаки имеют сходную морфологию у удаленных филогенетически видов. Была получена обновленная реконструкция сети гаплотипов Eubranchus rupium с использованием свежесобранного материала и отобран материал для ddRADseq анализа. Для них была проведена двойная рестрикция парой рестриктаз MspI-PstI и лигирование адаптеров. Библиотеки подвергались грубому отбору фрагментов подходящей для анализа длины с помощью магнитных частиц и последующей индексной ПЦР. Полученные библиотеки были проверены на BioAnalizer и отправлены в коммерческую организацию для мультиплексного секвенирования. Изучены экологические характеристики арктических представителей Dendronotidae, Cadlinidae. Проведены лабораторные эксперименты по питанию. Содержимое желудков проанализировано с помощью световой и сканирующей микроскопии, а также с применением молекулярных методов. Установлен точный спектр питания Dendoronotus frondosus, D. elegans, Cadlina laevis. Изучен состав жирных кислот в липидоме Cadlina umiushi. Продемонстрировано высокое содержание бактериальных кислот (18-22%) и некоторое количество длинных кислот с метилен неразделенной цепью, что указывает на то, что губки входят в рацион питания C. umiushi. В ходе подготовки публикации по результатам Проекта 2020 (молекулярное, генетическое разнообразие и филогеография комплекса видов Cadlina spp.) было выявлено наличие конфликта между митохондриальными и ядерными генами у данных моллюсков, а также, в ряде случаев – между двумя митохондриальными маркерами. Для образцов Cadlina spp. были получены последовательности транскрибируемых спейсеров ITS1, ITS2, показана коспецифичность ряда митохондриальных гаплогрупп («видов»), в том числе на удаленных территориях (Курильские острова, Белое море). Для образцов, показавшие конфликтный сигнал между двумя митохондриальными маркерами (23 образца из Японского моря) было проведено клонирование ПЦР-продуктов по генам COI и 16S, и выявлено две копии данных генов у большинства образцов, со значительным преобладанием одной из копий в выделенной ДНК. Основная гипотеза состоит в том, что у япономорских Cadlina spp. выявлена гетероплазмия, которая может быть связана как с наличием двух копий мт-генома в митохондриях, так и с двуродительским наследованием митохондриального генома. Была изучена коллекция голожаберных моллюсков, собранных в прибрежных водах острова Сахалин, с помощью методов интегративной таксономии, включая морфологический анализ (в том числе микротомографию) и молекулярные данные по четырем маркерам. Сделаны описания обнаруженных видов, построены молекулярно-филогенетические деревья и проведены анализы молекулярного разделения видов (ASAP). На основе собственных и опубликованных данных составлен подробный список видов голожаберных моллюсков, обнаруженных в прибрежных водах острова Сахалин за все время изучения. Обнаружено и описано два новых для науки вида, уточнены ареалы ряда видов в северо-западной части Тихого океана. Весь собранный материал и полученные сиквенсы были добавлены в базу данных, ее объем к настоящему моменту составляет 3526 образцов. Сайт, посвященный разнообразию голожаберных моллюсков морей России находится на финальных этапах подготовки. | ||
2 | 1 июля 2024 г.-30 июня 2025 г. | Сравнительная филогеография брюхоногих моллюсков Арктических морей: состав фауны, пути заселения и время формирования современных видов |
Результаты этапа: |
Для прикрепления результата сначала выберете тип результата (статьи, книги, ...). После чего введите несколько символов в поле поиска прикрепляемого результата, затем выберете один из предложенных и нажмите кнопку "Добавить".